MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus onnurineus NA1 chromosome

Total Repeats: 36505

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_011529	TCA	2	6	909570	909575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224133
18002	NC_011529	CCT	2	6	909594	909599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224133
18003	NC_011529	AAG	2	6	909617	909622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224133
18004	NC_011529	TCT	3	9	909702	909710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224133
18005	NC_011529	CGC	2	6	909732	909737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224133
18006	NC_011529	CCA	2	6	909744	909749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224133
18007	NC_011529	CAG	2	6	909842	909847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224133
18008	NC_011529	AGC	2	6	909868	909873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224133
18009	NC_011529	CAG	2	6	909889	909894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224133
18010	NC_011529	CTC	2	6	909932	909937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224133
18011	NC_011529	TGG	2	6	909946	909951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224133
18012	NC_011529	ACT	2	6	910023	910028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224133
18013	NC_011529	TCTT	2	8	910104	910111	0 %	75 %	0 %	25 %	212224133
18014	NC_011529	ATA	2	6	910124	910129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212224133
18015	NC_011529	TCAT	2	8	910169	910176	25 %	50 %	0 %	25 %	212224133
18016	NC_011529	GGT	2	6	910190	910195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18017	NC_011529	AAT	2	6	910340	910345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212224134
18018	NC_011529	CGA	2	6	910388	910393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224134
18019	NC_011529	ACCT	2	8	910401	910408	25 %	25 %	0 %	50 %	212224134
18020	NC_011529	AAG	2	6	910506	910511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224134
18021	NC_011529	AGA	2	6	910520	910525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224134
18022	NC_011529	GAA	2	6	910532	910537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224134
18023	NC_011529	CCCA	2	8	910590	910597	25 %	0 %	0 %	75 %	212224134
18024	NC_011529	GGT	2	6	910605	910610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224134
18025	NC_011529	TCC	2	6	910663	910668	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224134
18026	NC_011529	AGG	3	9	910780	910788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224134
18027	NC_011529	TCG	2	6	910885	910890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224134
18028	NC_011529	GTC	2	6	910929	910934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224134
18029	NC_011529	TAC	2	6	910992	910997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224134
18030	NC_011529	CGA	2	6	911009	911014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224134
18031	NC_011529	CGT	2	6	911015	911020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224134
18032	NC_011529	TTCA	2	8	911072	911079	25 %	50 %	0 %	25 %	212224134
18033	NC_011529	TAC	2	6	911103	911108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224134
18034	NC_011529	CTT	2	6	911111	911116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224134
18035	NC_011529	GTC	2	6	911124	911129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224134
18036	NC_011529	AGG	2	6	911203	911208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224134
18037	NC_011529	ATA	2	6	911235	911240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212224134
18038	NC_011529	AGC	3	9	911251	911259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224134
18039	NC_011529	T	6	6	911269	911274	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18040	NC_011529	TGG	2	6	911288	911293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18041	NC_011529	GAG	2	6	911317	911322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224135
18042	NC_011529	GAG	2	6	911428	911433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224135
18043	NC_011529	CCCA	2	8	911441	911448	25 %	0 %	0 %	75 %	212224135
18044	NC_011529	AGA	2	6	911592	911597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224135
18045	NC_011529	CT	3	6	911640	911645	0 %	50 %	0 %	50 %	212224135
18046	NC_011529	AG	3	6	911664	911669	50 %	0 %	50 %	0 %	212224135
18047	NC_011529	TCC	2	6	911676	911681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224135
18048	NC_011529	CCT	3	9	911706	911714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224135
18049	NC_011529	AAG	2	6	911778	911783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224135
18050	NC_011529	CGG	2	6	911829	911834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224135
18051	NC_011529	TGGG	2	8	911862	911869	0 %	25 %	75 %	0 %	212224135
18052	NC_011529	TCA	2	6	911875	911880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224135
18053	NC_011529	AGA	2	6	911976	911981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224136
18054	NC_011529	ATA	2	6	911982	911987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212224136
18055	NC_011529	AGC	2	6	912014	912019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224136
18056	NC_011529	ACG	2	6	912027	912032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224136
18057	NC_011529	GCA	2	6	912042	912047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224136
18058	NC_011529	ACC	2	6	912051	912056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224136
18059	NC_011529	CGC	2	6	912257	912262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224136
18060	NC_011529	TTG	2	6	912280	912285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212224136
18061	NC_011529	AGGTG	2	10	912299	912308	20 %	20 %	60 %	0 %	212224136
18062	NC_011529	AGG	2	6	912337	912342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224136
18063	NC_011529	ACT	2	6	912421	912426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224136
18064	NC_011529	AGA	2	6	912430	912435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224136
18065	NC_011529	CTA	2	6	912512	912517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224136
18066	NC_011529	GA	3	6	912538	912543	50 %	0 %	50 %	0 %	212224136
18067	NC_011529	GAC	2	6	912573	912578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224136
18068	NC_011529	TCC	2	6	912628	912633	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224136
18069	NC_011529	CCG	2	6	912687	912692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224136
18070	NC_011529	TAT	2	6	912696	912701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212224136
18071	NC_011529	TCA	2	6	912751	912756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224136
18072	NC_011529	GTG	2	6	912772	912777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224136
18073	NC_011529	AGC	2	6	912799	912804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224136
18074	NC_011529	TGGA	2	8	912810	912817	25 %	25 %	50 %	0 %	212224136
18075	NC_011529	CCA	2	6	912863	912868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224136
18076	NC_011529	GGA	2	6	912897	912902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224136
18077	NC_011529	TGA	2	6	912926	912931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224136
18078	NC_011529	AAG	2	6	912951	912956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224136
18079	NC_011529	GGAA	2	8	912978	912985	50 %	0 %	50 %	0 %	212224136
18080	NC_011529	TCC	2	6	913015	913020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224136
18081	NC_011529	ACC	3	9	913131	913139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224136
18082	NC_011529	CCG	2	6	913164	913169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224136
18083	NC_011529	ATGGT	2	10	913208	913217	20 %	40 %	40 %	0 %	212224136
18084	NC_011529	GAC	2	6	913269	913274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224136
18085	NC_011529	ATC	2	6	913293	913298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224136
18086	NC_011529	TC	4	8	913297	913304	0 %	50 %	0 %	50 %	212224136
18087	NC_011529	GAG	2	6	913344	913349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224136
18088	NC_011529	CCG	2	6	913354	913359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224136
18089	NC_011529	TCA	2	6	913366	913371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224136
18090	NC_011529	CCG	2	6	913417	913422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224136
18091	NC_011529	CCA	2	6	913444	913449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224136
18092	NC_011529	CGG	2	6	913469	913474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224136
18093	NC_011529	GA	3	6	913475	913480	50 %	0 %	50 %	0 %	212224136
18094	NC_011529	CTA	2	6	913493	913498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224136
18095	NC_011529	CTC	2	6	913503	913508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224136
18096	NC_011529	GGAG	2	8	913523	913530	25 %	0 %	75 %	0 %	212224136
18097	NC_011529	GTC	2	6	913545	913550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224136
18098	NC_011529	CAAG	2	8	913600	913607	50 %	0 %	25 %	25 %	212224136
18099	NC_011529	TCG	2	6	913687	913692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224136
18100	NC_011529	CAG	2	6	913855	913860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224136
18101	NC_011529	AGC	2	6	913890	913895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224136
18102	NC_011529	GA	3	6	913906	913911	50 %	0 %	50 %	0 %	212224136
18103	NC_011529	TCG	2	6	913939	913944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224136
18104	NC_011529	CTC	3	9	913962	913970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224136
18105	NC_011529	AGG	3	9	913971	913979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224136
18106	NC_011529	CTT	2	6	913991	913996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18107	NC_011529	TGG	2	6	914077	914082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224137
18108	NC_011529	GAATT	2	10	914125	914134	40 %	40 %	20 %	0 %	212224137
18109	NC_011529	TCA	2	6	914220	914225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224137
18110	NC_011529	TGA	2	6	914261	914266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224137
18111	NC_011529	AAG	2	6	914283	914288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224137
18112	NC_011529	GAG	2	6	914295	914300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224137
18113	NC_011529	GA	3	6	914316	914321	50 %	0 %	50 %	0 %	212224137
18114	NC_011529	GAA	2	6	914388	914393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224137
18115	NC_011529	TCA	2	6	914413	914418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224137
18116	NC_011529	AAG	2	6	914427	914432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224137
18117	NC_011529	GTC	2	6	914451	914456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224137
18118	NC_011529	GAC	2	6	914472	914477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224137
18119	NC_011529	AAG	2	6	914508	914513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224137
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18121	NC_011529	AG	3	6	914531	914536	50 %	0 %	50 %	0 %	212224137
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18124	NC_011529	GAG	2	6	914634	914639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224137
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18160	NC_011529	TCA	2	6	916916	916921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18192	NC_011529	CCAG	2	8	918650	918657	25 %	0 %	25 %	50 %	212224141
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18232	NC_011529	TTA	2	6	920806	920811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18233	NC_011529	CCGG	2	8	920883	920890	0 %	0 %	50 %	50 %	212224144
18234	NC_011529	GAG	2	6	920895	920900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224144
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18238	NC_011529	TCG	2	6	921121	921126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224144
18239	NC_011529	TAA	2	6	921137	921142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212224144
18240	NC_011529	TGA	2	6	921182	921187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224144
18241	NC_011529	GGT	2	6	921227	921232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224144
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18245	NC_011529	TGA	2	6	921341	921346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224145
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18262	NC_011529	CTC	2	6	922417	922422	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224146
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18274	NC_011529	GGT	2	6	922975	922980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224147
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18282	NC_011529	ACC	2	6	923219	923224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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18310	NC_011529	CTT	2	6	925016	925021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224149
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18313	NC_011529	TGG	2	6	925298	925303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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18350	NC_011529	GAG	2	6	926717	926722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224150
18351	NC_011529	GGT	3	9	926752	926760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18352	NC_011529	GGA	2	6	926874	926879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224151
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18359	NC_011529	GC	3	6	927298	927303	0 %	0 %	50 %	50 %	212224151
18360	NC_011529	GAA	2	6	927307	927312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224151
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18362	NC_011529	CAGC	2	8	927354	927361	25 %	0 %	25 %	50 %	212224151
18363	NC_011529	TCG	2	6	927362	927367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224151
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18387	NC_011529	GT	3	6	928735	928740	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18388	NC_011529	TA	3	6	928927	928932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18389	NC_011529	TTG	2	6	928961	928966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18390	NC_011529	A	6	6	929012	929017	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18391	NC_011529	TCCA	2	8	929019	929026	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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18396	NC_011529	GGT	2	6	929206	929211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18397	NC_011529	TGG	2	6	929215	929220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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18423	NC_011529	CTGCAT	2	12	930242	930253	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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