MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus onnurineus NA1 chromosome

Total Repeats: 36505

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17501	NC_011529	AT	3	6	884459	884464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17502	NC_011529	CCA	2	6	884551	884556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17503	NC_011529	TGA	2	6	884561	884566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17504	NC_011529	AAGG	2	8	884568	884575	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17505	NC_011529	GGT	2	6	884675	884680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17506	NC_011529	ATG	2	6	884682	884687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224110
17507	NC_011529	AAG	2	6	884781	884786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224110
17508	NC_011529	AAG	2	6	884835	884840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224110
17509	NC_011529	AAG	2	6	884871	884876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224110
17510	NC_011529	GTT	2	6	884910	884915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212224110
17511	NC_011529	TTC	2	6	884988	884993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224110
17512	NC_011529	CGA	2	6	885014	885019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224110
17513	NC_011529	AGC	2	6	885101	885106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224110
17514	NC_011529	GA	3	6	885107	885112	50 %	0 %	50 %	0 %	212224110
17515	NC_011529	CTC	2	6	885117	885122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224110
17516	NC_011529	CCG	2	6	885147	885152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224110
17517	NC_011529	GCG	2	6	885178	885183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224110
17518	NC_011529	AGC	2	6	885254	885259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224110
17519	NC_011529	GAG	2	6	885323	885328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224110
17520	NC_011529	TGGA	2	8	885369	885376	25 %	25 %	50 %	0 %	212224110
17521	NC_011529	CAT	2	6	885386	885391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224110
17522	NC_011529	ACG	2	6	885480	885485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224110
17523	NC_011529	ACG	2	6	885523	885528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224110
17524	NC_011529	CGA	2	6	885590	885595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224110
17525	NC_011529	TTC	2	6	885630	885635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224110
17526	NC_011529	GAAG	2	8	885674	885681	50 %	0 %	50 %	0 %	212224110
17527	NC_011529	GGA	2	6	885686	885691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224110
17528	NC_011529	GAC	2	6	885768	885773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224110
17529	NC_011529	CA	3	6	885865	885870	50 %	0 %	0 %	50 %	212224110
17530	NC_011529	TCGGCC	2	12	885877	885888	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	212224110
17531	NC_011529	TCG	2	6	885898	885903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224110
17532	NC_011529	CT	3	6	885940	885945	0 %	50 %	0 %	50 %	212224110
17533	NC_011529	AAT	2	6	886070	886075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212224111
17534	NC_011529	AAC	2	6	886094	886099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212224111
17535	NC_011529	ATT	2	6	886167	886172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212224111
17536	NC_011529	TTG	2	6	886184	886189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212224111
17537	NC_011529	AAC	2	6	886286	886291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17538	NC_011529	AATTT	2	10	886314	886323	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17539	NC_011529	T	6	6	886474	886479	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17540	NC_011529	CGT	2	6	886499	886504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17541	NC_011529	AGA	2	6	886585	886590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17542	NC_011529	CGG	2	6	886659	886664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17543	NC_011529	GAA	2	6	886770	886775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17544	NC_011529	GAA	3	9	886780	886788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17545	NC_011529	CCT	3	9	886796	886804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224112
17546	NC_011529	AGG	2	6	886806	886811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224112
17547	NC_011529	GGT	2	6	886886	886891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224112
17548	NC_011529	TTC	2	6	886968	886973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224112
17549	NC_011529	TTG	2	6	887052	887057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212224112
17550	NC_011529	CCT	2	6	887098	887103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224112
17551	NC_011529	TGA	2	6	887107	887112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224112
17552	NC_011529	CTT	2	6	887126	887131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224112
17553	NC_011529	CCT	2	6	887194	887199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224112
17554	NC_011529	GTT	2	6	887225	887230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212224112
17555	NC_011529	GCA	2	6	887247	887252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224112
17556	NC_011529	AGT	2	6	887362	887367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224112
17557	NC_011529	GTC	2	6	887375	887380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224112
17558	NC_011529	AGG	2	6	887403	887408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224112
17559	NC_011529	GAT	2	6	887444	887449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224112
17560	NC_011529	TGA	2	6	887473	887478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224112
17561	NC_011529	CGG	2	6	887495	887500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224112
17562	NC_011529	TGT	2	6	887668	887673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212224112
17563	NC_011529	CGA	3	9	887680	887688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224112
17564	NC_011529	CCA	2	6	887813	887818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224112
17565	NC_011529	GCA	2	6	887859	887864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224112
17566	NC_011529	ACT	2	6	887901	887906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224112
17567	NC_011529	AAT	2	6	887966	887971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17568	NC_011529	TAA	2	6	887988	887993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17569	NC_011529	AGC	2	6	888084	888089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224113
17570	NC_011529	CAG	2	6	888117	888122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224113
17571	NC_011529	ACTC	2	8	888141	888148	25 %	25 %	0 %	50 %	212224113
17572	NC_011529	AAG	2	6	888189	888194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224113
17573	NC_011529	GGA	2	6	888203	888208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224113
17574	NC_011529	TA	4	8	888215	888222	50 %	50 %	0 %	0 %	212224113
17575	NC_011529	GAT	2	6	888297	888302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224113
17576	NC_011529	TGG	2	6	888335	888340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224113
17577	NC_011529	CAGG	2	8	888362	888369	25 %	0 %	50 %	25 %	212224113
17578	NC_011529	CGA	3	9	888449	888457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224113
17579	NC_011529	CCT	2	6	888529	888534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224113
17580	NC_011529	GTA	2	6	888573	888578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224113
17581	NC_011529	CGT	2	6	888635	888640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224113
17582	NC_011529	TTC	2	6	888688	888693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224113
17583	NC_011529	TC	3	6	888702	888707	0 %	50 %	0 %	50 %	212224113
17584	NC_011529	GCGG	2	8	888716	888723	0 %	0 %	75 %	25 %	212224113
17585	NC_011529	TGA	2	6	888729	888734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224113
17586	NC_011529	GTC	2	6	888847	888852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224113
17587	NC_011529	ACTC	3	12	888884	888895	25 %	25 %	0 %	50 %	212224113
17588	NC_011529	GAA	2	6	888930	888935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224113
17589	NC_011529	TGA	2	6	889075	889080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224114
17590	NC_011529	GCA	2	6	889089	889094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224114
17591	NC_011529	ATTA	2	8	889166	889173	50 %	50 %	0 %	0 %	212224114
17592	NC_011529	CGA	2	6	889393	889398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224114
17593	NC_011529	TCC	2	6	889401	889406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224114
17594	NC_011529	TCCT	2	8	889422	889429	0 %	50 %	0 %	50 %	212224114
17595	NC_011529	ATA	2	6	889449	889454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212224114
17596	NC_011529	CTT	2	6	889466	889471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224114
17597	NC_011529	CTTTGG	2	12	889475	889486	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	212224114
17598	NC_011529	CCT	2	6	889501	889506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224114
17599	NC_011529	CGC	2	6	889510	889515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224114
17600	NC_011529	AG	3	6	889531	889536	50 %	0 %	50 %	0 %	212224114
17601	NC_011529	TCCT	2	8	889546	889553	0 %	50 %	0 %	50 %	212224114
17602	NC_011529	CGG	2	6	889584	889589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224115
17603	NC_011529	TC	4	8	889731	889738	0 %	50 %	0 %	50 %	212224115
17604	NC_011529	GAG	2	6	889827	889832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224115
17605	NC_011529	TCC	2	6	889877	889882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224115
17606	NC_011529	AGC	2	6	889949	889954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224115
17607	NC_011529	TCT	2	6	889959	889964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224115
17608	NC_011529	TCA	2	6	889986	889991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224115
17609	NC_011529	CCT	2	6	890010	890015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224115
17610	NC_011529	TCT	2	6	890031	890036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224115
17611	NC_011529	TGC	2	6	890043	890048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224115
17612	NC_011529	TCA	2	6	890077	890082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17613	NC_011529	ACC	2	6	890102	890107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17614	NC_011529	ACC	2	6	890182	890187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17615	NC_011529	GA	4	8	890208	890215	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17616	NC_011529	GAA	2	6	890232	890237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17617	NC_011529	CTT	2	6	890287	890292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224116
17618	NC_011529	TGA	2	6	890351	890356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224116
17619	NC_011529	GCC	2	6	890391	890396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224116
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17862	NC_011529	AGC	2	6	902075	902080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224128
17863	NC_011529	TCC	2	6	902127	902132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224128
17864	NC_011529	TGG	2	6	902201	902206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224128
17865	NC_011529	TTG	2	6	902228	902233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212224128
17866	NC_011529	GGC	2	6	902293	902298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224128
17867	NC_011529	TCTG	2	8	902355	902362	0 %	50 %	25 %	25 %	212224128
17868	NC_011529	GAT	2	6	902554	902559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224128
17869	NC_011529	TCG	2	6	902588	902593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224128
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17872	NC_011529	CTC	2	6	902728	902733	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224128
17873	NC_011529	GTC	2	6	902734	902739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224128
17874	NC_011529	CTGC	2	8	902789	902796	0 %	25 %	25 %	50 %	212224128
17875	NC_011529	AGT	2	6	902805	902810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224128
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17878	NC_011529	TTG	2	6	903267	903272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212224128
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17891	NC_011529	GTC	2	6	904062	904067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224129
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17893	NC_011529	TTC	2	6	904180	904185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224129
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17896	NC_011529	TCAC	2	8	904297	904304	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
17897	NC_011529	AGT	2	6	904377	904382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224130
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17978	NC_011529	CACTG	2	10	908505	908514	20 %	20 %	20 %	40 %	212224133
17979	NC_011529	ACT	2	6	908538	908543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224133
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17981	NC_011529	CTA	2	6	908608	908613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224133
17982	NC_011529	ACG	2	6	908681	908686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224133
17983	NC_011529	GCT	2	6	908770	908775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224133
17984	NC_011529	AAG	2	6	908807	908812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224133
17985	NC_011529	TTC	2	6	908817	908822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224133
17986	NC_011529	TCA	2	6	908832	908837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224133
17987	NC_011529	TCC	2	6	908856	908861	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224133
17988	NC_011529	TCG	2	6	908895	908900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224133
17989	NC_011529	TTG	2	6	908907	908912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212224133
17990	NC_011529	GCAG	2	8	908992	908999	25 %	0 %	50 %	25 %	212224133
17991	NC_011529	GGA	2	6	909014	909019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224133
17992	NC_011529	AGC	2	6	909067	909072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224133
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17997	NC_011529	CTT	2	6	909239	909244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224133
17998	NC_011529	TCC	2	6	909426	909431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224133
17999	NC_011529	GA	3	6	909521	909526	50 %	0 %	50 %	0 %	212224133
18000	NC_011529	TCA	2	6	909528	909533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224133

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