MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus onnurineus NA1 chromosome

Total Repeats: 36505

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_011529	GA	3	6	860406	860411	50 %	0 %	50 %	0 %	212224083
17002	NC_011529	TCC	2	6	860460	860465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224084
17003	NC_011529	CTT	2	6	860494	860499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224084
17004	NC_011529	GCA	2	6	860509	860514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224084
17005	NC_011529	GAG	2	6	860522	860527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224084
17006	NC_011529	ACC	2	6	860603	860608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224084
17007	NC_011529	CAC	2	6	860621	860626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224084
17008	NC_011529	CGA	2	6	860650	860655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224084
17009	NC_011529	AAG	2	6	860778	860783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17010	NC_011529	GGT	2	6	860820	860825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17011	NC_011529	TCA	2	6	860923	860928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224085
17012	NC_011529	AGG	2	6	860957	860962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224085
17013	NC_011529	AGCCG	2	10	861018	861027	20 %	0 %	40 %	40 %	212224085
17014	NC_011529	GAG	2	6	861043	861048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224085
17015	NC_011529	TCT	2	6	861081	861086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224085
17016	NC_011529	TCT	2	6	861137	861142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224085
17017	NC_011529	ATG	2	6	861143	861148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224085
17018	NC_011529	GAG	2	6	861166	861171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224085
17019	NC_011529	CAA	2	6	861245	861250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212224085
17020	NC_011529	GCG	2	6	861251	861256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224085
17021	NC_011529	AAG	2	6	861289	861294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224085
17022	NC_011529	ACA	2	6	861308	861313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212224085
17023	NC_011529	GCCG	2	8	861375	861382	0 %	0 %	50 %	50 %	212224085
17024	NC_011529	ACG	2	6	861436	861441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224085
17025	NC_011529	CGA	2	6	861525	861530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224085
17026	NC_011529	TGCCA	2	10	861604	861613	20 %	20 %	20 %	40 %	212224085
17027	NC_011529	GCT	2	6	861625	861630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224085
17028	NC_011529	GAGC	2	8	861813	861820	25 %	0 %	50 %	25 %	212224085
17029	NC_011529	GAA	2	6	861829	861834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224085
17030	NC_011529	GAG	2	6	861853	861858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224085
17031	NC_011529	GAG	2	6	861919	861924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224085
17032	NC_011529	CTT	2	6	861982	861987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17033	NC_011529	AAG	2	6	862008	862013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224086
17034	NC_011529	AGC	2	6	862127	862132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224086
17035	NC_011529	GTG	2	6	862241	862246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224086
17036	NC_011529	GAA	2	6	862319	862324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224086
17037	NC_011529	TCA	2	6	862339	862344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224086
17038	NC_011529	TTG	2	6	862420	862425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212224086
17039	NC_011529	ACA	2	6	862447	862452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212224086
17040	NC_011529	CTG	2	6	862470	862475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224086
17041	NC_011529	TGG	2	6	862489	862494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224086
17042	NC_011529	ACGAGG	2	12	862540	862551	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	212224086
17043	NC_011529	GGA	2	6	862634	862639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224086
17044	NC_011529	GGA	2	6	862658	862663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224086
17045	NC_011529	GCC	2	6	862686	862691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224086
17046	NC_011529	CCA	2	6	862814	862819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224086
17047	NC_011529	AGG	2	6	862834	862839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224086
17048	NC_011529	AGG	2	6	862867	862872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224086
17049	NC_011529	TCA	2	6	863035	863040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224086
17050	NC_011529	GC	4	8	863084	863091	0 %	0 %	50 %	50 %	212224086
17051	NC_011529	GGC	2	6	863124	863129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224086
17052	NC_011529	CTT	2	6	863160	863165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224086
17053	NC_011529	GCGAG	2	10	863208	863217	20 %	0 %	60 %	20 %	212224086
17054	NC_011529	GGA	2	6	863243	863248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224086
17055	NC_011529	AAAGA	2	10	863301	863310	80 %	0 %	20 %	0 %	212224086
17056	NC_011529	CCG	2	6	863324	863329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224086
17057	NC_011529	TAC	3	9	863343	863351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224086
17058	NC_011529	CGA	2	6	863362	863367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224086
17059	NC_011529	CGA	2	6	863429	863434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224086
17060	NC_011529	GGA	2	6	863453	863458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224086
17061	NC_011529	TGA	2	6	863473	863478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224086
17062	NC_011529	GAG	2	6	863483	863488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224086
17063	NC_011529	AG	3	6	863552	863557	50 %	0 %	50 %	0 %	212224086
17064	NC_011529	GAT	2	6	863582	863587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224086
17065	NC_011529	GAG	2	6	863715	863720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224086
17066	NC_011529	AG	3	6	863762	863767	50 %	0 %	50 %	0 %	212224086
17067	NC_011529	TCGG	2	8	863824	863831	0 %	25 %	50 %	25 %	212224086
17068	NC_011529	CTT	2	6	863843	863848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224086
17069	NC_011529	TCT	2	6	863869	863874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224086
17070	NC_011529	AAGCC	2	10	863882	863891	40 %	0 %	20 %	40 %	212224086
17071	NC_011529	CGAG	2	8	863929	863936	25 %	0 %	50 %	25 %	212224086
17072	NC_011529	GC	3	6	863985	863990	0 %	0 %	50 %	50 %	212224086
17073	NC_011529	GGA	2	6	864019	864024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224086
17074	NC_011529	TGA	2	6	864025	864030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224086
17075	NC_011529	AGG	2	6	864057	864062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224086
17076	NC_011529	AG	3	6	864157	864162	50 %	0 %	50 %	0 %	212224086
17077	NC_011529	ACTGA	2	10	864210	864219	40 %	20 %	20 %	20 %	212224086
17078	NC_011529	GA	3	6	864221	864226	50 %	0 %	50 %	0 %	212224086
17079	NC_011529	GA	4	8	864291	864298	50 %	0 %	50 %	0 %	212224086
17080	NC_011529	AGG	2	6	864321	864326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224086
17081	NC_011529	GGA	2	6	864473	864478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224086
17082	NC_011529	AGG	2	6	864529	864534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224086
17083	NC_011529	CTGAT	2	10	864565	864574	20 %	40 %	20 %	20 %	212224086
17084	NC_011529	GCG	2	6	864636	864641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224086
17085	NC_011529	GAAG	2	8	864740	864747	50 %	0 %	50 %	0 %	212224086
17086	NC_011529	AGA	2	6	864751	864756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224086
17087	NC_011529	AAT	2	6	864766	864771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212224086
17088	NC_011529	TGG	2	6	864792	864797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17089	NC_011529	TA	3	6	864804	864809	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17090	NC_011529	ATA	2	6	864816	864821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17091	NC_011529	AAG	2	6	864837	864842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17092	NC_011529	TG	4	8	864935	864942	0 %	50 %	50 %	0 %	212224087
17093	NC_011529	TCGTTC	2	12	864973	864984	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	212224087
17094	NC_011529	CGTC	2	8	865006	865013	0 %	25 %	25 %	50 %	212224087
17095	NC_011529	CTC	2	6	865145	865150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224087
17096	NC_011529	GTA	2	6	865244	865249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224087
17097	NC_011529	CTT	2	6	865325	865330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224087
17098	NC_011529	CCT	2	6	865399	865404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224087
17099	NC_011529	CCG	2	6	865530	865535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224087
17100	NC_011529	TCG	2	6	865542	865547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224087
17101	NC_011529	TTC	2	6	865595	865600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224087
17102	NC_011529	GCC	2	6	865625	865630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224087
17103	NC_011529	TCGC	2	8	865638	865645	0 %	25 %	25 %	50 %	212224087
17104	NC_011529	AGA	2	6	865720	865725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224087
17105	NC_011529	GAC	2	6	865742	865747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224087
17106	NC_011529	CGT	2	6	865783	865788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224087
17107	NC_011529	GGA	2	6	865801	865806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224087
17108	NC_011529	ATG	2	6	865812	865817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224087
17109	NC_011529	GAG	2	6	865862	865867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224087
17110	NC_011529	AAG	2	6	865871	865876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224087
17111	NC_011529	CT	3	6	865888	865893	0 %	50 %	0 %	50 %	212224087
17112	NC_011529	TAA	2	6	865914	865919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17113	NC_011529	CCT	2	6	865984	865989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17114	NC_011529	C	6	6	866023	866028	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
17115	NC_011529	GAA	2	6	866059	866064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224088
17116	NC_011529	CCA	2	6	866095	866100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224088
17117	NC_011529	GAG	2	6	866161	866166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224088
17118	NC_011529	AAGG	2	8	866227	866234	50 %	0 %	50 %	0 %	212224088
17119	NC_011529	ATG	2	6	866360	866365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224088
17120	NC_011529	CGA	2	6	866391	866396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224088
17121	NC_011529	AC	3	6	866471	866476	50 %	0 %	0 %	50 %	212224088
17122	NC_011529	CCG	2	6	866525	866530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224088
17123	NC_011529	GGA	2	6	866553	866558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224088
17124	NC_011529	GGA	2	6	866603	866608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224088
17125	NC_011529	GAAG	2	8	866771	866778	50 %	0 %	50 %	0 %	212224089
17126	NC_011529	CG	3	6	866803	866808	0 %	0 %	50 %	50 %	212224089
17127	NC_011529	TAC	2	6	866823	866828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224089
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17135	NC_011529	GCT	2	6	867147	867152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224090
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17141	NC_011529	CTA	2	6	867654	867659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224090
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17144	NC_011529	GAG	2	6	867790	867795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224091
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17146	NC_011529	ATTC	2	8	867848	867855	25 %	50 %	0 %	25 %	212224091
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17149	NC_011529	TCA	2	6	868116	868121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224092
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17158	NC_011529	AAG	2	6	868613	868618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224092
17159	NC_011529	CGT	2	6	868642	868647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224092
17160	NC_011529	CGA	2	6	868654	868659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224092
17161	NC_011529	CGT	2	6	868684	868689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224092
17162	NC_011529	GC	3	6	868730	868735	0 %	0 %	50 %	50 %	212224092
17163	NC_011529	CT	3	6	868828	868833	0 %	50 %	0 %	50 %	212224092
17164	NC_011529	TGGT	2	8	868866	868873	0 %	50 %	50 %	0 %	212224092
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17168	NC_011529	CGA	2	6	869053	869058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224092
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17170	NC_011529	CGA	2	6	869170	869175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224092
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17183	NC_011529	TCT	2	6	869916	869921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224093
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17197	NC_011529	GAG	2	6	870410	870415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224093
17198	NC_011529	CAA	2	6	870430	870435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212224093
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17200	NC_011529	TCA	2	6	870527	870532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17201	NC_011529	CGG	2	6	870606	870611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224094
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17203	NC_011529	ACG	2	6	870709	870714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224094
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17208	NC_011529	CGA	2	6	870824	870829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224094
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17220	NC_011529	GGC	2	6	871365	871370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224094
17221	NC_011529	TCC	2	6	871471	871476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224094
17222	NC_011529	GACCTC	2	12	871479	871490	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	212224094
17223	NC_011529	TGA	2	6	871538	871543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224094
17224	NC_011529	CCA	2	6	871562	871567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17225	NC_011529	GAA	2	6	871702	871707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224095
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17227	NC_011529	CGACCC	2	12	871759	871770	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	212224095
17228	NC_011529	GAG	2	6	871783	871788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224095
17229	NC_011529	GAAG	2	8	871807	871814	50 %	0 %	50 %	0 %	212224095
17230	NC_011529	AGA	2	6	871876	871881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224095
17231	NC_011529	GA	3	6	871929	871934	50 %	0 %	50 %	0 %	212224095
17232	NC_011529	TCA	2	6	871935	871940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224095
17233	NC_011529	CCT	2	6	871969	871974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224095
17234	NC_011529	AGC	2	6	872052	872057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224095
17235	NC_011529	CCT	2	6	872110	872115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224095
17236	NC_011529	GGA	2	6	872116	872121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224095
17237	NC_011529	G	6	6	872145	872150	0 %	0 %	100 %	0 %	212224095
17238	NC_011529	GCA	2	6	872276	872281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224095
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17241	NC_011529	GAG	2	6	872519	872524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224095
17242	NC_011529	ACC	2	6	872526	872531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224095
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17244	NC_011529	CCTG	2	8	872650	872657	0 %	25 %	25 %	50 %	212224095
17245	NC_011529	GATGG	2	10	872666	872675	20 %	20 %	60 %	0 %	212224095
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17250	NC_011529	TCC	2	6	872887	872892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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17253	NC_011529	GCT	2	6	872963	872968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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17273	NC_011529	A	6	6	873941	873946	100 %	0 %	0 %	0 %	212224096
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17350	NC_011529	A	6	6	877190	877195	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17351	NC_011529	TCC	2	6	877205	877210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224101
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17353	NC_011529	AGT	2	6	877283	877288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224101
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17357	NC_011529	TCC	2	6	877498	877503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224102
17358	NC_011529	TGA	2	6	877504	877509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224102
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17360	NC_011529	CGA	2	6	877582	877587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224102
17361	NC_011529	TCG	2	6	877614	877619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224102
17362	NC_011529	GTGA	2	8	877679	877686	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
17363	NC_011529	AGG	2	6	877688	877693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17364	NC_011529	GAT	2	6	877769	877774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224103
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17366	NC_011529	TCTCCT	2	12	877852	877863	0 %	50 %	0 %	50 %	212224103
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17371	NC_011529	CGG	2	6	878156	878161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17372	NC_011529	GCC	2	6	878181	878186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17373	NC_011529	CAG	2	6	878189	878194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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17375	NC_011529	ACTC	2	8	878250	878257	25 %	25 %	0 %	50 %	212224104
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17393	NC_011529	TCC	2	6	878966	878971	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224105
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17479	NC_011529	GCT	2	6	882897	882902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224108
17480	NC_011529	TCG	2	6	882935	882940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224108
17481	NC_011529	GGC	2	6	882951	882956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224108
17482	NC_011529	TCG	2	6	883085	883090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224108
17483	NC_011529	TTC	2	6	883214	883219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224109
17484	NC_011529	TC	3	6	883264	883269	0 %	50 %	0 %	50 %	212224109
17485	NC_011529	CCA	2	6	883434	883439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224109
17486	NC_011529	TGG	2	6	883441	883446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224109
17487	NC_011529	CCTC	2	8	883459	883466	0 %	25 %	0 %	75 %	212224109
17488	NC_011529	CCT	2	6	883807	883812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224109
17489	NC_011529	GA	3	6	883824	883829	50 %	0 %	50 %	0 %	212224109
17490	NC_011529	TC	3	6	883850	883855	0 %	50 %	0 %	50 %	212224109
17491	NC_011529	TTCC	2	8	883945	883952	0 %	50 %	0 %	50 %	212224109
17492	NC_011529	GAA	2	6	883961	883966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224109
17493	NC_011529	CCA	2	6	884002	884007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224109
17494	NC_011529	AGT	2	6	884083	884088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224109
17495	NC_011529	TCG	2	6	884098	884103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224109
17496	NC_011529	GCG	2	6	884147	884152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224109
17497	NC_011529	CCT	2	6	884194	884199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224109
17498	NC_011529	GTGGGT	2	12	884258	884269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224109
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