MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus onnurineus NA1 chromosome

Total Repeats: 36505

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16501	NC_011529	ACT	2	6	836061	836066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224053
16502	NC_011529	TCA	2	6	836135	836140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224053
16503	NC_011529	AAG	2	6	836141	836146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224053
16504	NC_011529	AGTG	2	8	836186	836193	25 %	25 %	50 %	0 %	212224053
16505	NC_011529	T	7	7	836242	836248	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16506	NC_011529	ACT	2	6	836342	836347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16507	NC_011529	TAA	2	6	836387	836392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212224054
16508	NC_011529	GAA	2	6	836438	836443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224054
16509	NC_011529	GTC	2	6	836458	836463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224054
16510	NC_011529	ACCC	2	8	836481	836488	25 %	0 %	0 %	75 %	212224054
16511	NC_011529	CA	3	6	836492	836497	50 %	0 %	0 %	50 %	212224054
16512	NC_011529	CCA	2	6	836550	836555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224054
16513	NC_011529	TCG	2	6	836585	836590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224054
16514	NC_011529	TCCA	2	8	836716	836723	25 %	25 %	0 %	50 %	212224054
16515	NC_011529	AGC	2	6	836805	836810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224054
16516	NC_011529	GCA	2	6	836815	836820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224054
16517	NC_011529	GCT	2	6	836868	836873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224054
16518	NC_011529	CCT	2	6	836904	836909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224054
16519	NC_011529	TCA	2	6	836963	836968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224054
16520	NC_011529	AGCA	2	8	837007	837014	50 %	0 %	25 %	25 %	212224054
16521	NC_011529	CAT	2	6	837042	837047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224054
16522	NC_011529	CCT	2	6	837053	837058	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224054
16523	NC_011529	GA	3	6	837087	837092	50 %	0 %	50 %	0 %	212224054
16524	NC_011529	TGG	2	6	837132	837137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224054
16525	NC_011529	CAC	2	6	837195	837200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224054
16526	NC_011529	CGT	2	6	837213	837218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224054
16527	NC_011529	CAA	2	6	837245	837250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212224054
16528	NC_011529	GTGCG	2	10	837267	837276	0 %	20 %	60 %	20 %	212224054
16529	NC_011529	AGC	2	6	837320	837325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224054
16530	NC_011529	CGG	2	6	837360	837365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224054
16531	NC_011529	CAA	2	6	837462	837467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212224054
16532	NC_011529	CAG	2	6	837475	837480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224054
16533	NC_011529	GTC	2	6	837493	837498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224054
16534	NC_011529	AAT	2	6	837723	837728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212224054
16535	NC_011529	ATC	2	6	837775	837780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224054
16536	NC_011529	GAT	2	6	837825	837830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224054
16537	NC_011529	GCA	2	6	837928	837933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224054
16538	NC_011529	GTC	2	6	837949	837954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224054
16539	NC_011529	TCG	2	6	837989	837994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224054
16540	NC_011529	CTC	2	6	838000	838005	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224054
16541	NC_011529	CTC	2	6	838012	838017	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224054
16542	NC_011529	GTC	2	6	838018	838023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224054
16543	NC_011529	CGC	2	6	838032	838037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224054
16544	NC_011529	GAA	2	6	838041	838046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224054
16545	NC_011529	GCCG	2	8	838047	838054	0 %	0 %	50 %	50 %	212224054
16546	NC_011529	CAG	2	6	838161	838166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224055
16547	NC_011529	GA	3	6	838193	838198	50 %	0 %	50 %	0 %	212224055
16548	NC_011529	CCA	2	6	838254	838259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224055
16549	NC_011529	ACG	2	6	838260	838265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224055
16550	NC_011529	GCA	2	6	838313	838318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224055
16551	NC_011529	GA	3	6	838391	838396	50 %	0 %	50 %	0 %	212224056
16552	NC_011529	ACG	2	6	838464	838469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224056
16553	NC_011529	GAA	2	6	838496	838501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224056
16554	NC_011529	TTAA	2	8	838632	838639	50 %	50 %	0 %	0 %	212224056
16555	NC_011529	GC	3	6	838925	838930	0 %	0 %	50 %	50 %	212224056
16556	NC_011529	GAG	2	6	838974	838979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224056
16557	NC_011529	AGG	2	6	838996	839001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224056
16558	NC_011529	CAA	2	6	839078	839083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212224056
16559	NC_011529	GA	3	6	839136	839141	50 %	0 %	50 %	0 %	212224056
16560	NC_011529	GAA	2	6	839156	839161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224056
16561	NC_011529	CGT	2	6	839297	839302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224056
16562	NC_011529	ACAGG	2	10	839422	839431	40 %	0 %	40 %	20 %	212224057
16563	NC_011529	GAA	2	6	839470	839475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224057
16564	NC_011529	C	6	6	839515	839520	0 %	0 %	0 %	100 %	212224057
16565	NC_011529	TGA	2	6	839619	839624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224057
16566	NC_011529	GAG	2	6	839653	839658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224057
16567	NC_011529	GCA	2	6	839765	839770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224058
16568	NC_011529	GTT	2	6	839793	839798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212224058
16569	NC_011529	CGG	2	6	839828	839833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224058
16570	NC_011529	TAC	2	6	839853	839858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224058
16571	NC_011529	ACA	2	6	839872	839877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212224058
16572	NC_011529	CTC	2	6	839943	839948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224058
16573	NC_011529	TAA	2	6	839977	839982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212224058
16574	NC_011529	CTA	2	6	840029	840034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224058
16575	NC_011529	GACGT	2	10	840127	840136	20 %	20 %	40 %	20 %	212224058
16576	NC_011529	TCG	2	6	840154	840159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224058
16577	NC_011529	CAA	2	6	840175	840180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212224058
16578	NC_011529	TGA	2	6	840229	840234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224058
16579	NC_011529	GAC	2	6	840258	840263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224058
16580	NC_011529	AAG	2	6	840301	840306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224058
16581	NC_011529	TCT	2	6	840315	840320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224058
16582	NC_011529	GTT	2	6	840446	840451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212224059
16583	NC_011529	AGGC	2	8	840513	840520	25 %	0 %	50 %	25 %	212224059
16584	NC_011529	GAA	2	6	840555	840560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224059
16585	NC_011529	GTG	2	6	840561	840566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224059
16586	NC_011529	ATT	2	6	840605	840610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212224059
16587	NC_011529	CAT	2	6	840616	840621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224059
16588	NC_011529	GAG	2	6	840623	840628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224059
16589	NC_011529	GGT	2	6	840665	840670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224059
16590	NC_011529	GATAA	2	10	840704	840713	60 %	20 %	20 %	0 %	212224059
16591	NC_011529	TCG	2	6	840720	840725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224059
16592	NC_011529	GTC	2	6	840773	840778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224059
16593	NC_011529	CTC	2	6	840842	840847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224059
16594	NC_011529	GAG	2	6	840922	840927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224059
16595	NC_011529	CA	3	6	840951	840956	50 %	0 %	0 %	50 %	212224059
16596	NC_011529	A	6	6	840966	840971	100 %	0 %	0 %	0 %	212224059
16597	NC_011529	TTG	2	6	840993	840998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212224059
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16599	NC_011529	GAA	2	6	841176	841181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224059
16600	NC_011529	AG	3	6	841191	841196	50 %	0 %	50 %	0 %	212224059
16601	NC_011529	ATCA	2	8	841207	841214	50 %	25 %	0 %	25 %	212224060
16602	NC_011529	TCT	2	6	841277	841282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224060
16603	NC_011529	CCTT	2	8	841296	841303	0 %	50 %	0 %	50 %	212224060
16604	NC_011529	TCG	2	6	841374	841379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224060
16605	NC_011529	GC	3	6	841402	841407	0 %	0 %	50 %	50 %	212224060
16606	NC_011529	CGA	2	6	841464	841469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224060
16607	NC_011529	CG	3	6	841527	841532	0 %	0 %	50 %	50 %	212224060
16608	NC_011529	GAC	2	6	841549	841554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224060
16609	NC_011529	TCG	2	6	841562	841567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224060
16610	NC_011529	GTA	2	6	841648	841653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224060
16611	NC_011529	TG	3	6	841673	841678	0 %	50 %	50 %	0 %	212224060
16612	NC_011529	CGT	2	6	841713	841718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224060
16613	NC_011529	GCT	2	6	841855	841860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224060
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16615	NC_011529	CAA	2	6	841998	842003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212224060
16616	NC_011529	TGA	2	6	842067	842072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224060
16617	NC_011529	CGC	3	9	842100	842108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224060
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16988	NC_011529	TGA	2	6	859745	859750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224083
16989	NC_011529	TTC	2	6	859840	859845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224083
16990	NC_011529	AAGG	2	8	859935	859942	50 %	0 %	50 %	0 %	212224083
16991	NC_011529	CTC	2	6	859953	859958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224083
16992	NC_011529	GACGA	2	10	859965	859974	40 %	0 %	40 %	20 %	212224083
16993	NC_011529	ACG	2	6	860020	860025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224083
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16996	NC_011529	TTC	2	6	860193	860198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224083
16997	NC_011529	GCA	2	6	860266	860271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224083
16998	NC_011529	AGG	3	9	860272	860280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224083
16999	NC_011529	GATGTC	2	12	860313	860324	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	212224083
17000	NC_011529	CAGA	2	8	860377	860384	50 %	0 %	25 %	25 %	212224083

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