MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus onnurineus NA1 chromosome

Total Repeats: 36505

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_011529	GAA	2	6	809111	809116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224029
16002	NC_011529	CAA	2	6	809141	809146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212224029
16003	NC_011529	CAAA	2	8	809242	809249	75 %	0 %	0 %	25 %	212224029
16004	NC_011529	GAC	2	6	809315	809320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224029
16005	NC_011529	AG	3	6	809325	809330	50 %	0 %	50 %	0 %	212224029
16006	NC_011529	AAT	2	6	809432	809437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212224029
16007	NC_011529	ACT	2	6	809524	809529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224029
16008	NC_011529	GAG	2	6	809560	809565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224029
16009	NC_011529	TTAGC	2	10	809614	809623	20 %	40 %	20 %	20 %	212224029
16010	NC_011529	CAG	2	6	809630	809635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224029
16011	NC_011529	AG	3	6	809634	809639	50 %	0 %	50 %	0 %	212224029
16012	NC_011529	GA	3	6	809652	809657	50 %	0 %	50 %	0 %	212224029
16013	NC_011529	AGA	2	6	809721	809726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224029
16014	NC_011529	GAGG	2	8	809774	809781	25 %	0 %	75 %	0 %	212224030
16015	NC_011529	ACC	2	6	809808	809813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224030
16016	NC_011529	CAC	2	6	809879	809884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224030
16017	NC_011529	GAG	2	6	809915	809920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224030
16018	NC_011529	GC	3	6	809951	809956	0 %	0 %	50 %	50 %	212224030
16019	NC_011529	CAA	2	6	810120	810125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212224030
16020	NC_011529	AGC	2	6	810135	810140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224030
16021	NC_011529	CAC	2	6	810158	810163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224030
16022	NC_011529	GA	4	8	810214	810221	50 %	0 %	50 %	0 %	212224030
16023	NC_011529	GGA	2	6	810313	810318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224031
16024	NC_011529	ACG	2	6	810443	810448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224031
16025	NC_011529	GAGTG	2	10	810493	810502	20 %	20 %	60 %	0 %	212224031
16026	NC_011529	CGC	2	6	810569	810574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224031
16027	NC_011529	A	6	6	810601	810606	100 %	0 %	0 %	0 %	212224031
16028	NC_011529	CTA	2	6	810663	810668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224031
16029	NC_011529	CAGC	2	8	810673	810680	25 %	0 %	25 %	50 %	212224031
16030	NC_011529	GTC	2	6	810733	810738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224031
16031	NC_011529	CAG	2	6	810746	810751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224031
16032	NC_011529	AGG	2	6	810832	810837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224031
16033	NC_011529	TGAGA	2	10	810841	810850	40 %	20 %	40 %	0 %	212224031
16034	NC_011529	AGCA	2	8	810946	810953	50 %	0 %	25 %	25 %	212224032
16035	NC_011529	CGT	2	6	810982	810987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224032
16036	NC_011529	ATA	2	6	811043	811048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212224032
16037	NC_011529	GAG	2	6	811256	811261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224032
16038	NC_011529	GAG	2	6	811388	811393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224032
16039	NC_011529	GAT	2	6	811424	811429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224032
16040	NC_011529	GAG	2	6	811441	811446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224032
16041	NC_011529	GTC	2	6	811576	811581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224033
16042	NC_011529	GAA	2	6	811648	811653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224033
16043	NC_011529	GGA	2	6	811737	811742	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224033
16044	NC_011529	GAG	2	6	811786	811791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224033
16045	NC_011529	AG	3	6	811795	811800	50 %	0 %	50 %	0 %	212224033
16046	NC_011529	GCG	2	6	811811	811816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224033
16047	NC_011529	AAC	2	6	811849	811854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212224033
16048	NC_011529	AGC	2	6	811872	811877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224033
16049	NC_011529	GAAG	2	8	811961	811968	50 %	0 %	50 %	0 %	212224033
16050	NC_011529	AGG	2	6	812063	812068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224033
16051	NC_011529	GGC	2	6	812131	812136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224033
16052	NC_011529	GCT	2	6	812185	812190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224033
16053	NC_011529	ACT	2	6	812279	812284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224033
16054	NC_011529	GGT	2	6	812287	812292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16055	NC_011529	TGG	2	6	812334	812339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224034
16056	NC_011529	ACT	3	9	812441	812449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224034
16057	NC_011529	AGG	2	6	812510	812515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224034
16058	NC_011529	TCG	2	6	812552	812557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224034
16059	NC_011529	CCTG	2	8	812569	812576	0 %	25 %	25 %	50 %	212224034
16060	NC_011529	ACT	2	6	812645	812650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224034
16061	NC_011529	AG	3	6	812665	812670	50 %	0 %	50 %	0 %	212224034
16062	NC_011529	GAA	2	6	812674	812679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224034
16063	NC_011529	AGA	2	6	812750	812755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224034
16064	NC_011529	GGA	2	6	812772	812777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224034
16065	NC_011529	TCG	2	6	812792	812797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224034
16066	NC_011529	ACC	2	6	812843	812848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224034
16067	NC_011529	GAG	2	6	812904	812909	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224034
16068	NC_011529	GGAG	2	8	812966	812973	25 %	0 %	75 %	0 %	212224035
16069	NC_011529	AGG	2	6	813031	813036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224035
16070	NC_011529	TGA	2	6	813164	813169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224035
16071	NC_011529	CTT	2	6	813245	813250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224035
16072	NC_011529	GAG	2	6	813318	813323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224035
16073	NC_011529	AAC	2	6	813363	813368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212224035
16074	NC_011529	ATA	2	6	813399	813404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212224035
16075	NC_011529	GTC	2	6	813429	813434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224035
16076	NC_011529	CGTA	2	8	813445	813452	25 %	25 %	25 %	25 %	212224035
16077	NC_011529	GCA	2	6	813466	813471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224035
16078	NC_011529	ATA	2	6	813579	813584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212224035
16079	NC_011529	ACC	2	6	813586	813591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224035
16080	NC_011529	CGAG	2	8	813745	813752	25 %	0 %	50 %	25 %	212224035
16081	NC_011529	TGA	2	6	813766	813771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224035
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16084	NC_011529	ACG	2	6	813877	813882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224035
16085	NC_011529	ATC	2	6	813932	813937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224036
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16087	NC_011529	TGA	2	6	814087	814092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224036
16088	NC_011529	GAA	2	6	814300	814305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224036
16089	NC_011529	ACG	2	6	814530	814535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224036
16090	NC_011529	TTGG	2	8	814589	814596	0 %	50 %	50 %	0 %	212224036
16091	NC_011529	ATT	2	6	814621	814626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212224036
16092	NC_011529	TGG	2	6	814683	814688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224037
16093	NC_011529	GGA	2	6	814739	814744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224037
16094	NC_011529	TCA	2	6	814787	814792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224037
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16096	NC_011529	AG	3	6	814870	814875	50 %	0 %	50 %	0 %	212224037
16097	NC_011529	GAA	2	6	815041	815046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224037
16098	NC_011529	TGA	2	6	815100	815105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224037
16099	NC_011529	TGG	2	6	815184	815189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224037
16100	NC_011529	GGGT	2	8	815195	815202	0 %	25 %	75 %	0 %	212224037
16101	NC_011529	CGC	2	6	815226	815231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224037
16102	NC_011529	AG	3	6	815268	815273	50 %	0 %	50 %	0 %	212224037
16103	NC_011529	AGG	2	6	815316	815321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224037
16104	NC_011529	GGA	2	6	815349	815354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224037
16105	NC_011529	AAT	2	6	815373	815378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212224037
16106	NC_011529	AGT	2	6	815435	815440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224037
16107	NC_011529	A	6	6	815536	815541	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16108	NC_011529	AT	4	8	815620	815627	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16109	NC_011529	TAC	2	6	815633	815638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16110	NC_011529	TTA	2	6	815647	815652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16111	NC_011529	AGT	2	6	815657	815662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16112	NC_011529	GA	3	6	815680	815685	50 %	0 %	50 %	0 %	212224038
16113	NC_011529	CGGGAA	2	12	815768	815779	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	212224038
16114	NC_011529	GAC	2	6	815905	815910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224038
16115	NC_011529	ATT	2	6	816047	816052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212224038
16116	NC_011529	GGA	2	6	816201	816206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224038
16117	NC_011529	ACGG	2	8	816251	816258	25 %	0 %	50 %	25 %	212224038
16118	NC_011529	TGA	2	6	816303	816308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224038
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16120	NC_011529	AAT	2	6	816355	816360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212224038
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16247	NC_011529	GAG	2	6	822822	822827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224042
16248	NC_011529	GAAAG	2	10	822930	822939	60 %	0 %	40 %	0 %	212224042
16249	NC_011529	AAG	2	6	822949	822954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224042
16250	NC_011529	TCT	2	6	822957	822962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224042
16251	NC_011529	AG	3	6	822982	822987	50 %	0 %	50 %	0 %	212224042
16252	NC_011529	ACG	2	6	823007	823012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224042
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16259	NC_011529	AAGA	2	8	823469	823476	75 %	0 %	25 %	0 %	212224043
16260	NC_011529	GAC	2	6	823536	823541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224043
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16262	NC_011529	TGT	2	6	823706	823711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212224043
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16267	NC_011529	TTC	2	6	824042	824047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224044
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16276	NC_011529	GAC	2	6	824366	824371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224044
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16282	NC_011529	CCAT	2	8	824717	824724	25 %	25 %	0 %	50 %	212224045
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16289	NC_011529	AT	3	6	825126	825131	50 %	50 %	0 %	0 %	212224045
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16319	NC_011529	AG	3	6	826913	826918	50 %	0 %	50 %	0 %	212224047
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16333	NC_011529	CTT	2	6	827405	827410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224047
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16351	NC_011529	TG	3	6	828184	828189	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16352	NC_011529	GCCC	2	8	828203	828210	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
16353	NC_011529	TG	3	6	828249	828254	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16354	NC_011529	GCG	2	6	828264	828269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16355	NC_011529	CTAAC	2	10	828274	828283	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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16357	NC_011529	TGA	2	6	828345	828350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16359	NC_011529	TG	3	6	828458	828463	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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16362	NC_011529	TG	3	6	828527	828532	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16363	NC_011529	TG	3	6	828594	828599	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16364	NC_011529	TG	3	6	828670	828675	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16365	NC_011529	AAC	2	6	828678	828683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16366	NC_011529	AGT	2	6	828706	828711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16367	NC_011529	AGCT	2	8	828750	828757	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16368	NC_011529	GCT	2	6	828864	828869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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