MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus onnurineus NA1 chromosome

Total Repeats: 36505

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_011529	TAT	2	6	783979	783984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212223995
15502	NC_011529	GGC	2	6	783985	783990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223995
15503	NC_011529	CT	3	6	784000	784005	0 %	50 %	0 %	50 %	212223995
15504	NC_011529	TC	3	6	784071	784076	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15505	NC_011529	TGTC	2	8	784242	784249	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15506	NC_011529	GAAA	2	8	784265	784272	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15507	NC_011529	GAC	2	6	784473	784478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223996
15508	NC_011529	GGC	2	6	784550	784555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223996
15509	NC_011529	TCT	2	6	784595	784600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223996
15510	NC_011529	CCTT	2	8	784675	784682	0 %	50 %	0 %	50 %	212223996
15511	NC_011529	GTA	2	6	784695	784700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223996
15512	NC_011529	AAC	2	6	784764	784769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212223996
15513	NC_011529	TA	3	6	784913	784918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15514	NC_011529	GGA	2	6	784968	784973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15515	NC_011529	GAA	2	6	785087	785092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223997
15516	NC_011529	GCTGA	2	10	785115	785124	20 %	20 %	40 %	20 %	212223997
15517	NC_011529	CCT	2	6	785141	785146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223997
15518	NC_011529	GGA	2	6	785164	785169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223997
15519	NC_011529	A	6	6	785184	785189	100 %	0 %	0 %	0 %	212223997
15520	NC_011529	ACG	2	6	785290	785295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223997
15521	NC_011529	CGG	2	6	785342	785347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223997
15522	NC_011529	GCT	2	6	785354	785359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223997
15523	NC_011529	GTTCT	2	10	785412	785421	0 %	60 %	20 %	20 %	212223997
15524	NC_011529	GAC	2	6	785430	785435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223997
15525	NC_011529	GAG	2	6	785472	785477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223997
15526	NC_011529	GA	3	6	785605	785610	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15527	NC_011529	GAA	2	6	785651	785656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15528	NC_011529	AGA	2	6	785812	785817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15529	NC_011529	GGT	2	6	785885	785890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223998
15530	NC_011529	TGAA	2	8	785914	785921	50 %	25 %	25 %	0 %	212223998
15531	NC_011529	CCT	2	6	785933	785938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223998
15532	NC_011529	CG	3	6	785951	785956	0 %	0 %	50 %	50 %	212223998
15533	NC_011529	GCG	2	6	786010	786015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223998
15534	NC_011529	ATG	2	6	786079	786084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223998
15535	NC_011529	TTC	2	6	786115	786120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223998
15536	NC_011529	TC	3	6	786207	786212	0 %	50 %	0 %	50 %	212223998
15537	NC_011529	GCTC	2	8	786284	786291	0 %	25 %	25 %	50 %	212223998
15538	NC_011529	AG	3	6	786304	786309	50 %	0 %	50 %	0 %	212223998
15539	NC_011529	GGT	2	6	786320	786325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223998
15540	NC_011529	GCC	2	6	786336	786341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223998
15541	NC_011529	AGG	2	6	786394	786399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223998
15542	NC_011529	CTT	2	6	786488	786493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223998
15543	NC_011529	GAT	2	6	786507	786512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223998
15544	NC_011529	TGG	2	6	786550	786555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223998
15545	NC_011529	TAC	2	6	786585	786590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223998
15546	NC_011529	GAG	2	6	786603	786608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223998
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15548	NC_011529	CTC	2	6	786675	786680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223998
15549	NC_011529	GAG	2	6	786756	786761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223998
15550	NC_011529	GTG	2	6	786815	786820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223998
15551	NC_011529	CTT	2	6	786980	786985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223999
15552	NC_011529	TCC	2	6	787062	787067	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223999
15553	NC_011529	CG	3	6	787078	787083	0 %	0 %	50 %	50 %	212223999
15554	NC_011529	AGA	2	6	787093	787098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223999
15555	NC_011529	GTG	2	6	787122	787127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223999
15556	NC_011529	TCG	2	6	787155	787160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223999
15557	NC_011529	TG	3	6	787168	787173	0 %	50 %	50 %	0 %	212223999
15558	NC_011529	CTC	2	6	787193	787198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223999
15559	NC_011529	TGAG	2	8	787207	787214	25 %	25 %	50 %	0 %	212223999
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15562	NC_011529	CG	3	6	787514	787519	0 %	0 %	50 %	50 %	212223999
15563	NC_011529	TTG	3	9	787521	787529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223999
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15565	NC_011529	GTG	2	6	787563	787568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223999
15566	NC_011529	CGT	2	6	787612	787617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223999
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15569	NC_011529	CCGG	2	8	787839	787846	0 %	0 %	50 %	50 %	212223999
15570	NC_011529	TCC	2	6	787899	787904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223999
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15573	NC_011529	TCC	2	6	788061	788066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223999
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15581	NC_011529	TAT	2	6	788541	788546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212224000
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15583	NC_011529	TCG	2	6	788593	788598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224000
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15590	NC_011529	TG	3	6	788877	788882	0 %	50 %	50 %	0 %	212224000
15591	NC_011529	CTC	2	6	789005	789010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224000
15592	NC_011529	CTTT	2	8	789100	789107	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15593	NC_011529	TTC	2	6	789145	789150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15594	NC_011529	AG	3	6	789206	789211	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15595	NC_011529	GGA	2	6	789251	789256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224001
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15603	NC_011529	GCC	2	6	789493	789498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224001
15604	NC_011529	TGC	2	6	789504	789509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224001
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15606	NC_011529	GTT	2	6	789722	789727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212224001
15607	NC_011529	CCT	2	6	789771	789776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15608	NC_011529	ATT	2	6	789833	789838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212224002
15609	NC_011529	CCTT	2	8	789839	789846	0 %	50 %	0 %	50 %	212224002
15610	NC_011529	CT	4	8	789900	789907	0 %	50 %	0 %	50 %	212224002
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15620	NC_011529	CTT	2	6	790665	790670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224002
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15986	NC_011529	AGA	2	6	808536	808541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224028
15987	NC_011529	AGG	2	6	808581	808586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224028
15988	NC_011529	AAG	2	6	808680	808685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224029
15989	NC_011529	GAG	3	9	808719	808727	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224029
15990	NC_011529	GAA	2	6	808731	808736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224029
15991	NC_011529	ATC	2	6	808770	808775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224029
15992	NC_011529	AG	3	6	808787	808792	50 %	0 %	50 %	0 %	212224029
15993	NC_011529	AGC	2	6	808813	808818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224029
15994	NC_011529	AGG	2	6	808881	808886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224029
15995	NC_011529	AGG	2	6	808904	808909	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224029
15996	NC_011529	ATG	2	6	808932	808937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224029
15997	NC_011529	ACC	2	6	808988	808993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224029
15998	NC_011529	CTC	2	6	809037	809042	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224029
15999	NC_011529	CGG	2	6	809066	809071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224029
16000	NC_011529	TGGCAT	2	12	809099	809110	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	212224029

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