MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus onnurineus NA1 chromosome

Total Repeats: 36505

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_011529	GTC	2	6	759062	759067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223966
15002	NC_011529	ATC	2	6	759090	759095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223966
15003	NC_011529	CAC	2	6	759100	759105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15004	NC_011529	CTCA	2	8	759164	759171	25 %	25 %	0 %	50 %	212223967
15005	NC_011529	CCT	2	6	759176	759181	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223967
15006	NC_011529	TCC	3	9	759210	759218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223967
15007	NC_011529	CGT	2	6	759266	759271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223967
15008	NC_011529	TTA	2	6	759316	759321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212223967
15009	NC_011529	TC	3	6	759418	759423	0 %	50 %	0 %	50 %	212223967
15010	NC_011529	CCTCAT	2	12	759499	759510	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	212223967
15011	NC_011529	GAG	2	6	759521	759526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223967
15012	NC_011529	CAT	2	6	759539	759544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223967
15013	NC_011529	TCA	2	6	759564	759569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223968
15014	NC_011529	ACA	2	6	759707	759712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212223968
15015	NC_011529	ACCAC	2	10	759801	759810	40 %	0 %	0 %	60 %	212223968
15016	NC_011529	T	6	6	759962	759967	0 %	100 %	0 %	0 %	212223968
15017	NC_011529	GTC	2	6	759988	759993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223968
15018	NC_011529	TCCT	2	8	760127	760134	0 %	50 %	0 %	50 %	212223968
15019	NC_011529	CTC	2	6	760156	760161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223968
15020	NC_011529	CTT	2	6	760171	760176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223968
15021	NC_011529	CT	3	6	760214	760219	0 %	50 %	0 %	50 %	212223968
15022	NC_011529	TACT	2	8	760299	760306	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15023	NC_011529	AAT	2	6	760360	760365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15024	NC_011529	GA	4	8	760434	760441	50 %	0 %	50 %	0 %	212223969
15025	NC_011529	C	6	6	760460	760465	0 %	0 %	0 %	100 %	212223969
15026	NC_011529	CAC	2	6	760476	760481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212223969
15027	NC_011529	TAT	2	6	760495	760500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212223969
15028	NC_011529	GAA	2	6	760559	760564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223969
15029	NC_011529	CCG	2	6	760781	760786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223969
15030	NC_011529	AGG	2	6	760839	760844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223969
15031	NC_011529	GC	3	6	760883	760888	0 %	0 %	50 %	50 %	212223969
15032	NC_011529	TCT	2	6	760919	760924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223969
15033	NC_011529	C	6	6	761081	761086	0 %	0 %	0 %	100 %	212223969
15034	NC_011529	AAG	2	6	761221	761226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223969
15035	NC_011529	GCA	2	6	761278	761283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223969
15036	NC_011529	GCT	2	6	761337	761342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223969
15037	NC_011529	TA	3	6	761404	761409	50 %	50 %	0 %	0 %	212223969
15038	NC_011529	CAG	2	6	761425	761430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223969
15039	NC_011529	CAA	2	6	761433	761438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212223969
15040	NC_011529	AAG	2	6	761458	761463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223969
15041	NC_011529	CCG	2	6	761491	761496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223969
15042	NC_011529	TGC	2	6	761582	761587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223969
15043	NC_011529	T	6	6	761634	761639	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15044	NC_011529	AAAG	2	8	761683	761690	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15045	NC_011529	C	6	6	761731	761736	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15046	NC_011529	GGA	2	6	761828	761833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223970
15047	NC_011529	CAGA	2	8	761934	761941	50 %	0 %	25 %	25 %	212223970
15048	NC_011529	TAT	2	6	761944	761949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212223970
15049	NC_011529	TGA	2	6	761967	761972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223970
15050	NC_011529	TTC	2	6	762070	762075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223970
15051	NC_011529	TGG	2	6	762123	762128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223970
15052	NC_011529	GAG	2	6	762202	762207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223970
15053	NC_011529	GCTCA	2	10	762232	762241	20 %	20 %	20 %	40 %	212223970
15054	NC_011529	GTC	2	6	762265	762270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223970
15055	NC_011529	GGT	2	6	762274	762279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223970
15056	NC_011529	ACG	2	6	762353	762358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223970
15057	NC_011529	AGGG	2	8	762409	762416	25 %	0 %	75 %	0 %	212223970
15058	NC_011529	CAT	2	6	762423	762428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223970
15059	NC_011529	TGA	2	6	762495	762500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223970
15060	NC_011529	ACC	3	9	762545	762553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212223970
15061	NC_011529	TCA	2	6	762575	762580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223970
15062	NC_011529	GAG	2	6	762664	762669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223970
15063	NC_011529	CCA	2	6	762711	762716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212223970
15064	NC_011529	GCC	2	6	762748	762753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223970
15065	NC_011529	CCGCT	2	10	762764	762773	0 %	20 %	20 %	60 %	212223970
15066	NC_011529	GAG	2	6	762778	762783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223970
15067	NC_011529	CAA	2	6	762798	762803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212223970
15068	NC_011529	CCT	2	6	762807	762812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223970
15069	NC_011529	AGG	2	6	762947	762952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223970
15070	NC_011529	GAA	2	6	762957	762962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223970
15071	NC_011529	GAAG	2	8	762969	762976	50 %	0 %	50 %	0 %	212223970
15072	NC_011529	AGGA	2	8	762988	762995	50 %	0 %	50 %	0 %	212223970
15073	NC_011529	CTA	2	6	763008	763013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223970
15074	NC_011529	AAT	2	6	763043	763048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212223970
15075	NC_011529	T	6	6	763057	763062	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15076	NC_011529	CCA	2	6	763115	763120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15077	NC_011529	T	6	6	763158	763163	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15078	NC_011529	CAT	2	6	763164	763169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15079	NC_011529	ATTC	2	8	763240	763247	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15080	NC_011529	CTTCC	2	10	763375	763384	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
15081	NC_011529	AAG	2	6	763400	763405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15082	NC_011529	GGT	2	6	763487	763492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15083	NC_011529	TAA	2	6	763531	763536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212223971
15084	NC_011529	CGG	2	6	763583	763588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223971
15085	NC_011529	ACGG	2	8	763590	763597	25 %	0 %	50 %	25 %	212223971
15086	NC_011529	AAC	2	6	763680	763685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212223971
15087	NC_011529	ATC	2	6	763788	763793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223971
15088	NC_011529	TC	4	8	763965	763972	0 %	50 %	0 %	50 %	212223972
15089	NC_011529	CTT	2	6	763979	763984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223972
15090	NC_011529	GAA	2	6	764045	764050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223972
15091	NC_011529	CCT	2	6	764110	764115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223972
15092	NC_011529	GGACT	2	10	764151	764160	20 %	20 %	40 %	20 %	212223972
15093	NC_011529	AGC	2	6	764208	764213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223972
15094	NC_011529	CCTG	2	8	764230	764237	0 %	25 %	25 %	50 %	212223972
15095	NC_011529	CCTC	2	8	764275	764282	0 %	25 %	0 %	75 %	212223972
15096	NC_011529	GTC	2	6	764297	764302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223972
15097	NC_011529	GA	3	6	764426	764431	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15098	NC_011529	GGTCTG	2	12	764487	764498	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	212223973
15099	NC_011529	CGA	2	6	764526	764531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223973
15100	NC_011529	CGA	2	6	764583	764588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223973
15101	NC_011529	AAT	2	6	764592	764597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212223973
15102	NC_011529	ACG	2	6	764660	764665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223973
15103	NC_011529	TGG	2	6	764674	764679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223973
15104	NC_011529	CGA	2	6	764700	764705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223973
15105	NC_011529	GAG	3	9	764769	764777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223974
15106	NC_011529	GAG	2	6	764826	764831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223974
15107	NC_011529	TTAT	2	8	764870	764877	25 %	75 %	0 %	0 %	212223974
15108	NC_011529	GAAA	2	8	764885	764892	75 %	0 %	25 %	0 %	212223974
15109	NC_011529	AGG	2	6	764920	764925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223974
15110	NC_011529	GCAA	2	8	764990	764997	50 %	0 %	25 %	25 %	212223975
15111	NC_011529	GGC	2	6	765010	765015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223975
15112	NC_011529	AGGA	2	8	765030	765037	50 %	0 %	50 %	0 %	212223975
15113	NC_011529	GC	3	6	765046	765051	0 %	0 %	50 %	50 %	212223975
15114	NC_011529	AAG	2	6	765161	765166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223975
15115	NC_011529	CGA	2	6	765214	765219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223975
15116	NC_011529	GTT	2	6	765335	765340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223975
15117	NC_011529	AGG	2	6	765357	765362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223975
15118	NC_011529	CCTC	2	8	765375	765382	0 %	25 %	0 %	75 %	212223975
15119	NC_011529	TCA	2	6	765423	765428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223975
15120	NC_011529	GAG	3	9	765506	765514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223975
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15122	NC_011529	TCA	2	6	765582	765587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223975
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15233	NC_011529	GTA	2	6	771373	771378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223981
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15236	NC_011529	TAA	2	6	771547	771552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15237	NC_011529	CAT	2	6	771554	771559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15240	NC_011529	AACC	2	8	771633	771640	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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15243	NC_011529	GTC	2	6	771867	771872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223982
15244	NC_011529	TCC	2	6	771928	771933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223982
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15250	NC_011529	TGG	2	6	772282	772287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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15490	NC_011529	GTA	2	6	783508	783513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223995
15491	NC_011529	GCC	2	6	783610	783615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223995
15492	NC_011529	TCCC	2	8	783661	783668	0 %	25 %	0 %	75 %	212223995
15493	NC_011529	CT	3	6	783731	783736	0 %	50 %	0 %	50 %	212223995
15494	NC_011529	TTC	2	6	783752	783757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223995
15495	NC_011529	CTTCT	2	10	783835	783844	0 %	60 %	0 %	40 %	212223995
15496	NC_011529	ATA	2	6	783881	783886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212223995
15497	NC_011529	CAG	2	6	783892	783897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223995
15498	NC_011529	T	6	6	783923	783928	0 %	100 %	0 %	0 %	212223995
15499	NC_011529	GGTT	2	8	783942	783949	0 %	50 %	50 %	0 %	212223995
15500	NC_011529	TAT	2	6	783967	783972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212223995

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