MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus onnurineus NA1 chromosome

Total Repeats: 36505

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14002	NC_011529	CCG	2	6	707740	707745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223909
14003	NC_011529	GAC	2	6	707759	707764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223909
14004	NC_011529	GTA	2	6	707786	707791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223909
14005	NC_011529	ACCGC	2	10	707814	707823	20 %	0 %	20 %	60 %	212223909
14006	NC_011529	TCT	2	6	707848	707853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223909
14007	NC_011529	GAA	2	6	707855	707860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223909
14008	NC_011529	GAG	2	6	707885	707890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223909
14009	NC_011529	CT	3	6	707917	707922	0 %	50 %	0 %	50 %	212223909
14010	NC_011529	GCC	2	6	707933	707938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223909
14011	NC_011529	TGA	2	6	707968	707973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223909
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14013	NC_011529	GTA	2	6	708160	708165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223910
14014	NC_011529	T	6	6	708337	708342	0 %	100 %	0 %	0 %	212223910
14015	NC_011529	CGG	2	6	708364	708369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223910
14016	NC_011529	TCG	2	6	708461	708466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223910
14017	NC_011529	GTT	2	6	708502	708507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223910
14018	NC_011529	GGA	2	6	708544	708549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223911
14019	NC_011529	CTT	2	6	708599	708604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223911
14020	NC_011529	CTT	2	6	708647	708652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223911
14021	NC_011529	GAG	2	6	708686	708691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223911
14022	NC_011529	CCG	2	6	708741	708746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223911
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14024	NC_011529	CAT	2	6	708824	708829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223911
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14026	NC_011529	AGT	2	6	708961	708966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223911
14027	NC_011529	GTT	2	6	709055	709060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223911
14028	NC_011529	CTT	2	6	709110	709115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223911
14029	NC_011529	CTCAG	2	10	709128	709137	20 %	20 %	20 %	40 %	212223911
14030	NC_011529	GC	3	6	709169	709174	0 %	0 %	50 %	50 %	212223911
14031	NC_011529	CTT	2	6	709175	709180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223911
14032	NC_011529	TGT	2	6	709186	709191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223911
14033	NC_011529	TCC	2	6	709401	709406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223911
14034	NC_011529	CTT	3	9	709538	709546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223911
14035	NC_011529	TCC	2	6	709632	709637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223911
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14038	NC_011529	GGACG	2	10	709685	709694	20 %	0 %	60 %	20 %	212223911
14039	NC_011529	GTC	2	6	709733	709738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223911
14040	NC_011529	CGA	2	6	709759	709764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223911
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14044	NC_011529	TTG	2	6	709847	709852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223912
14045	NC_011529	CTG	2	6	709861	709866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223912
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14052	NC_011529	CTT	2	6	710275	710280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223912
14053	NC_011529	CGA	2	6	710325	710330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223912
14054	NC_011529	CGA	2	6	710355	710360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223912
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14057	NC_011529	TTG	2	6	710597	710602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223912
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14065	NC_011529	TGGC	2	8	710905	710912	0 %	25 %	50 %	25 %	212223912
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14073	NC_011529	TGA	2	6	711244	711249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223913
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14089	NC_011529	CG	3	6	712231	712236	0 %	0 %	50 %	50 %	212223913
14090	NC_011529	CTG	2	6	712292	712297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223913
14091	NC_011529	CTCC	2	8	712415	712422	0 %	25 %	0 %	75 %	212223913
14092	NC_011529	CCT	2	6	712465	712470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223913
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14102	NC_011529	TAT	2	6	712861	712866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212223914
14103	NC_011529	CCGA	2	8	712885	712892	25 %	0 %	25 %	50 %	212223914
14104	NC_011529	CG	3	6	712908	712913	0 %	0 %	50 %	50 %	212223914
14105	NC_011529	ATG	3	9	712937	712945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223914
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14107	NC_011529	AAC	2	6	713032	713037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212223914
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14110	NC_011529	TCTT	2	8	713150	713157	0 %	75 %	0 %	25 %	212223914
14111	NC_011529	CTTT	2	8	713166	713173	0 %	75 %	0 %	25 %	212223914
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14121	NC_011529	CTC	2	6	713658	713663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223915
14122	NC_011529	GTT	2	6	713688	713693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223915
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14230	NC_011529	GA	3	6	719361	719366	50 %	0 %	50 %	0 %	212223921
14231	NC_011529	ACT	2	6	719377	719382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223921
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14235	NC_011529	TCT	2	6	719627	719632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223922
14236	NC_011529	TTC	2	6	719670	719675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223922
14237	NC_011529	CTTTTT	2	12	719712	719723	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	212223922
14238	NC_011529	G	6	6	719726	719731	0 %	0 %	100 %	0 %	212223922
14239	NC_011529	CGGCG	2	10	719751	719760	0 %	0 %	60 %	40 %	212223922
14240	NC_011529	CCCA	2	8	719796	719803	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
14241	NC_011529	TCC	2	6	719835	719840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14242	NC_011529	AT	3	6	719862	719867	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14243	NC_011529	ATTT	2	8	719921	719928	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14244	NC_011529	GGA	2	6	720106	720111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223923
14245	NC_011529	CTT	2	6	720138	720143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223923
14246	NC_011529	ACG	2	6	720202	720207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223923
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14249	NC_011529	GAA	2	6	720390	720395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223923
14250	NC_011529	GCTCAA	2	12	720413	720424	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	212223923
14251	NC_011529	GA	3	6	720520	720525	50 %	0 %	50 %	0 %	212223923
14252	NC_011529	GCA	2	6	720531	720536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223923
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14254	NC_011529	TCT	2	6	720829	720834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223923
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14257	NC_011529	GCG	2	6	720994	720999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223923
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14266	NC_011529	CATA	2	8	721570	721577	50 %	25 %	0 %	25 %	212223923
14267	NC_011529	AG	3	6	721606	721611	50 %	0 %	50 %	0 %	212223923
14268	NC_011529	GCT	2	6	721649	721654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223923
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14272	NC_011529	GAAA	2	8	721808	721815	75 %	0 %	25 %	0 %	212223924
14273	NC_011529	AGG	2	6	721817	721822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223924
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14344	NC_011529	TGG	2	6	724789	724794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223925
14345	NC_011529	GTA	2	6	724806	724811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223925
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14348	NC_011529	GAC	2	6	724872	724877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14349	NC_011529	CAG	2	6	724878	724883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14350	NC_011529	TGGG	2	8	724906	724913	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
14351	NC_011529	AAC	2	6	724914	724919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14352	NC_011529	GC	3	6	724999	725004	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14353	NC_011529	CCT	2	6	725012	725017	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14354	NC_011529	GGC	2	6	725071	725076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223926
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14356	NC_011529	AAG	2	6	725129	725134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223926
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14358	NC_011529	A	6	6	725149	725154	100 %	0 %	0 %	0 %	212223926
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14483	NC_011529	TGA	2	6	732129	732134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223932
14484	NC_011529	CAGT	2	8	732137	732144	25 %	25 %	25 %	25 %	212223932
14485	NC_011529	GAG	2	6	732151	732156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223932
14486	NC_011529	TA	3	6	732268	732273	50 %	50 %	0 %	0 %	212223932
14487	NC_011529	CAC	2	6	732282	732287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212223932
14488	NC_011529	CCG	2	6	732288	732293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223932
14489	NC_011529	AAAG	2	8	732334	732341	75 %	0 %	25 %	0 %	212223932
14490	NC_011529	GCC	2	6	732376	732381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223932
14491	NC_011529	CAA	2	6	732414	732419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212223932
14492	NC_011529	ATC	2	6	732434	732439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223932
14493	NC_011529	ATTCCC	2	12	732440	732451	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	212223932
14494	NC_011529	ATC	2	6	732452	732457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223932
14495	NC_011529	TC	4	8	732496	732503	0 %	50 %	0 %	50 %	212223932
14496	NC_011529	CAT	2	6	732504	732509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223932
14497	NC_011529	TCC	2	6	732524	732529	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223933
14498	NC_011529	T	6	6	732591	732596	0 %	100 %	0 %	0 %	212223933
14499	NC_011529	TTG	2	6	732626	732631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223933
14500	NC_011529	GAA	2	6	732775	732780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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