MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus onnurineus NA1 chromosome

Total Repeats: 36505

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_011529	GGA	2	6	682322	682327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223878
13502	NC_011529	TCTT	2	8	682345	682352	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13503	NC_011529	TCT	2	6	682367	682372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13504	NC_011529	GTT	2	6	682428	682433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13505	NC_011529	A	6	6	682448	682453	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13506	NC_011529	GAA	2	6	682508	682513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13507	NC_011529	CA	3	6	682532	682537	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13508	NC_011529	A	6	6	682569	682574	100 %	0 %	0 %	0 %	212223879
13509	NC_011529	AAC	2	6	682607	682612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212223879
13510	NC_011529	GTT	2	6	682728	682733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223879
13511	NC_011529	TGA	2	6	682735	682740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223879
13512	NC_011529	CTG	2	6	682771	682776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223879
13513	NC_011529	ATA	3	9	682806	682814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212223879
13514	NC_011529	GGT	2	6	682815	682820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223879
13515	NC_011529	GTG	2	6	682830	682835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223879
13516	NC_011529	GAG	2	6	682836	682841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223879
13517	NC_011529	GGT	2	6	682887	682892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223879
13518	NC_011529	TCA	2	6	682969	682974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223879
13519	NC_011529	AG	5	10	683028	683037	50 %	0 %	50 %	0 %	212223879
13520	NC_011529	GAT	2	6	683039	683044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223879
13521	NC_011529	AAC	2	6	683060	683065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212223879
13522	NC_011529	AGC	2	6	683164	683169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223879
13523	NC_011529	GAG	2	6	683256	683261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223879
13524	NC_011529	CCT	2	6	683282	683287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223879
13525	NC_011529	GA	3	6	683316	683321	50 %	0 %	50 %	0 %	212223879
13526	NC_011529	TGG	2	6	683323	683328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223879
13527	NC_011529	AAG	2	6	683371	683376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223879
13528	NC_011529	GCG	2	6	683421	683426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223879
13529	NC_011529	ATG	2	6	683496	683501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223879
13530	NC_011529	AGC	2	6	683593	683598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223879
13531	NC_011529	AAC	2	6	683616	683621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212223879
13532	NC_011529	TCC	2	6	683641	683646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223879
13533	NC_011529	ATG	2	6	683741	683746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223879
13534	NC_011529	TTTA	2	8	683769	683776	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13535	NC_011529	CTT	2	6	683782	683787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13536	NC_011529	GA	4	8	683816	683823	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13537	NC_011529	CTC	2	6	683833	683838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13538	NC_011529	GGA	2	6	683958	683963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13539	NC_011529	GTT	2	6	683988	683993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223880
13540	NC_011529	CTC	2	6	684004	684009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223880
13541	NC_011529	CTG	2	6	684013	684018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223880
13542	NC_011529	GCTGG	2	10	684056	684065	0 %	20 %	60 %	20 %	212223880
13543	NC_011529	CAC	2	6	684114	684119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212223880
13544	NC_011529	CTA	2	6	684120	684125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223880
13545	NC_011529	AGG	2	6	684140	684145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223880
13546	NC_011529	GA	3	6	684168	684173	50 %	0 %	50 %	0 %	212223880
13547	NC_011529	AGA	3	9	684171	684179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223880
13548	NC_011529	ACA	2	6	684239	684244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212223880
13549	NC_011529	CGA	2	6	684321	684326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223880
13550	NC_011529	TCG	2	6	684398	684403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223880
13551	NC_011529	GAG	2	6	684454	684459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223880
13552	NC_011529	ACC	2	6	684527	684532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212223880
13553	NC_011529	GGT	2	6	684585	684590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223880
13554	NC_011529	ACT	2	6	684599	684604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223880
13555	NC_011529	TCA	2	6	684614	684619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223880
13556	NC_011529	ATT	2	6	684721	684726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212223880
13557	NC_011529	CTTT	2	8	684808	684815	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13558	NC_011529	T	6	6	684813	684818	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13559	NC_011529	TGG	2	6	684833	684838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13560	NC_011529	GAG	2	6	684844	684849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13561	NC_011529	TTG	2	6	684880	684885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223881
13562	NC_011529	TGA	2	6	684920	684925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223881
13563	NC_011529	CTG	2	6	684948	684953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223881
13564	NC_011529	GCG	2	6	685120	685125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223881
13565	NC_011529	TGG	2	6	685177	685182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223882
13566	NC_011529	GGAT	2	8	685229	685236	25 %	25 %	50 %	0 %	212223882
13567	NC_011529	GTG	2	6	685237	685242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223882
13568	NC_011529	GC	3	6	685277	685282	0 %	0 %	50 %	50 %	212223882
13569	NC_011529	TCCTGC	2	12	685290	685301	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	212223882
13570	NC_011529	CTC	2	6	685304	685309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223882
13571	NC_011529	GCT	2	6	685321	685326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223882
13572	NC_011529	CCT	2	6	685333	685338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223882
13573	NC_011529	TGA	2	6	685416	685421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13574	NC_011529	GCT	2	6	685561	685566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223883
13575	NC_011529	TCG	2	6	685602	685607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223883
13576	NC_011529	TAT	2	6	685652	685657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212223883
13577	NC_011529	AGG	2	6	685710	685715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223883
13578	NC_011529	TGA	2	6	685718	685723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223883
13579	NC_011529	GGA	2	6	685866	685871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223884
13580	NC_011529	AC	3	6	685881	685886	50 %	0 %	0 %	50 %	212223884
13581	NC_011529	AAG	2	6	685900	685905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223884
13582	NC_011529	TGC	2	6	685923	685928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223885
13583	NC_011529	GATT	2	8	686038	686045	25 %	50 %	25 %	0 %	212223885
13584	NC_011529	TTC	2	6	686050	686055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223885
13585	NC_011529	ACG	2	6	686133	686138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223885
13586	NC_011529	GAT	2	6	686201	686206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223885
13587	NC_011529	GAAA	2	8	686344	686351	75 %	0 %	25 %	0 %	212223885
13588	NC_011529	AAT	2	6	686389	686394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212223885
13589	NC_011529	ATA	2	6	686429	686434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212223885
13590	NC_011529	GAT	2	6	686509	686514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223885
13591	NC_011529	GAAA	2	8	686665	686672	75 %	0 %	25 %	0 %	212223885
13592	NC_011529	TCA	2	6	686715	686720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223885
13593	NC_011529	GC	3	6	686727	686732	0 %	0 %	50 %	50 %	212223885
13594	NC_011529	GCC	2	6	686741	686746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223885
13595	NC_011529	AGA	2	6	686824	686829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223885
13596	NC_011529	GGAAA	2	10	686858	686867	60 %	0 %	40 %	0 %	212223885
13597	NC_011529	AG	3	6	686884	686889	50 %	0 %	50 %	0 %	212223885
13598	NC_011529	CGA	2	6	686890	686895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223885
13599	NC_011529	TCC	2	6	686942	686947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223886
13600	NC_011529	CCTT	2	8	687015	687022	0 %	50 %	0 %	50 %	212223886
13601	NC_011529	AGA	2	6	687065	687070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223886
13602	NC_011529	GCT	2	6	687143	687148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223886
13603	NC_011529	TCG	2	6	687158	687163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223886
13604	NC_011529	TCC	2	6	687173	687178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223886
13605	NC_011529	TCT	2	6	687228	687233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223886
13606	NC_011529	TC	3	6	687298	687303	0 %	50 %	0 %	50 %	212223886
13607	NC_011529	TCC	2	6	687365	687370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223886
13608	NC_011529	CTT	2	6	687414	687419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223886
13609	NC_011529	CTC	2	6	687514	687519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223886
13610	NC_011529	C	7	7	687570	687576	0 %	0 %	0 %	100 %	212223886
13611	NC_011529	TC	3	6	687616	687621	0 %	50 %	0 %	50 %	212223886
13612	NC_011529	CCT	2	6	687633	687638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223886
13613	NC_011529	GTT	2	6	687643	687648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223886
13614	NC_011529	TGC	2	6	687689	687694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223886
13615	NC_011529	CCT	2	6	687702	687707	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223886
13616	NC_011529	TTC	2	6	687710	687715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223886
13617	NC_011529	CT	3	6	687724	687729	0 %	50 %	0 %	50 %	212223886
13618	NC_011529	CACC	2	8	687786	687793	25 %	0 %	0 %	75 %	212223887
13619	NC_011529	GAT	2	6	687800	687805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223887
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