MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus onnurineus NA1 chromosome

Total Repeats: 36505

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_011529	ACC	2	6	657596	657601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212223853
13002	NC_011529	GTC	2	6	657640	657645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223853
13003	NC_011529	GTT	2	6	657664	657669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223853
13004	NC_011529	GGT	2	6	657762	657767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223853
13005	NC_011529	TCA	2	6	657771	657776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223853
13006	NC_011529	TTC	2	6	657815	657820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223853
13007	NC_011529	CTT	2	6	657888	657893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223853
13008	NC_011529	TCT	2	6	657900	657905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223853
13009	NC_011529	CTG	2	6	657917	657922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223853
13010	NC_011529	GAG	2	6	657979	657984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223853
13011	NC_011529	GTC	2	6	657994	657999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223853
13012	NC_011529	CCT	2	6	658074	658079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223853
13013	NC_011529	CTT	2	6	658087	658092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223853
13014	NC_011529	GAG	2	6	658102	658107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223853
13015	NC_011529	TCT	2	6	658116	658121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223853
13016	NC_011529	TGA	2	6	658128	658133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223853
13017	NC_011529	CCT	2	6	658254	658259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223853
13018	NC_011529	TGA	2	6	658281	658286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223853
13019	NC_011529	GAT	2	6	658303	658308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223853
13020	NC_011529	GTC	2	6	658375	658380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223853
13021	NC_011529	AT	4	8	658382	658389	50 %	50 %	0 %	0 %	212223853
13022	NC_011529	GAA	2	6	658413	658418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223853
13023	NC_011529	TGTGGC	2	12	658482	658493	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	212223853
13024	NC_011529	CCT	2	6	658539	658544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223853
13025	NC_011529	GTC	2	6	658655	658660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13026	NC_011529	GAT	2	6	658699	658704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13027	NC_011529	TCCATC	2	12	658751	658762	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
13028	NC_011529	AGA	2	6	658778	658783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13029	NC_011529	TCC	2	6	658811	658816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223854
13030	NC_011529	CT	3	6	658832	658837	0 %	50 %	0 %	50 %	212223854
13031	NC_011529	TTCTC	2	10	658839	658848	0 %	60 %	0 %	40 %	212223854
13032	NC_011529	TGG	2	6	658852	658857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223854
13033	NC_011529	TC	3	6	658937	658942	0 %	50 %	0 %	50 %	212223854
13034	NC_011529	GTA	2	6	658951	658956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223854
13035	NC_011529	TCA	2	6	658974	658979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223854
13036	NC_011529	GCC	2	6	659060	659065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223854
13037	NC_011529	GTCCCT	2	12	659134	659145	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	212223854
13038	NC_011529	GCT	3	9	659213	659221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223854
13039	NC_011529	TGAG	2	8	659255	659262	25 %	25 %	50 %	0 %	212223854
13040	NC_011529	ACC	2	6	659330	659335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212223854
13041	NC_011529	CCG	2	6	659579	659584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223854
13042	NC_011529	CAG	2	6	659629	659634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223854
13043	NC_011529	GAA	2	6	659777	659782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223855
13044	NC_011529	TCCT	2	8	659785	659792	0 %	50 %	0 %	50 %	212223855
13045	NC_011529	CCG	2	6	659825	659830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223855
13046	NC_011529	ACG	2	6	660025	660030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223855
13047	NC_011529	TCC	2	6	660109	660114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223855
13048	NC_011529	CTA	2	6	660115	660120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223855
13049	NC_011529	CT	3	6	660152	660157	0 %	50 %	0 %	50 %	212223855
13050	NC_011529	CGT	2	6	660158	660163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223855
13051	NC_011529	GCTTT	2	10	660238	660247	0 %	60 %	20 %	20 %	212223855
13052	NC_011529	TACA	2	8	660259	660266	50 %	25 %	0 %	25 %	212223855
13053	NC_011529	ACC	2	6	660267	660272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13054	NC_011529	GCT	2	6	660289	660294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13055	NC_011529	CTG	2	6	660304	660309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13056	NC_011529	GCG	2	6	660418	660423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223856
13057	NC_011529	CTT	2	6	660483	660488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223856
13058	NC_011529	ATG	2	6	660505	660510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223856
13059	NC_011529	CAG	2	6	660527	660532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223856
13060	NC_011529	TGA	2	6	660587	660592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223856
13061	NC_011529	CCT	2	6	660689	660694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223856
13062	NC_011529	GCC	2	6	660696	660701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223856
13063	NC_011529	TCG	2	6	660718	660723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223856
13064	NC_011529	CCGG	2	8	660757	660764	0 %	0 %	50 %	50 %	212223856
13065	NC_011529	TCC	2	6	660778	660783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223856
13066	NC_011529	GAC	2	6	660795	660800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223856
13067	NC_011529	GC	3	6	660820	660825	0 %	0 %	50 %	50 %	212223856
13068	NC_011529	TCG	2	6	660832	660837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223856
13069	NC_011529	TGA	2	6	660860	660865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223856
13070	NC_011529	CTC	2	6	660933	660938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223856
13071	NC_011529	TCC	2	6	660961	660966	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223856
13072	NC_011529	AAC	2	6	660990	660995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212223856
13073	NC_011529	CTT	2	6	661035	661040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223856
13074	NC_011529	TCA	2	6	661093	661098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223856
13075	NC_011529	TCT	2	6	661166	661171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223856
13076	NC_011529	CCT	2	6	661172	661177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223856
13077	NC_011529	TCGGTC	2	12	661228	661239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223856
13078	NC_011529	TGA	2	6	661262	661267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223856
13079	NC_011529	ACCAC	2	10	661330	661339	40 %	0 %	0 %	60 %	212223856
13080	NC_011529	GCTC	2	8	661346	661353	0 %	25 %	25 %	50 %	212223856
13081	NC_011529	CTT	2	6	661374	661379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223856
13082	NC_011529	TGT	2	6	661391	661396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223856
13083	NC_011529	CGA	2	6	661403	661408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223856
13084	NC_011529	TTC	3	9	661420	661428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223856
13085	NC_011529	TCGTCA	2	12	661534	661545	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	212223856
13086	NC_011529	GAT	2	6	661617	661622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223856
13087	NC_011529	AAG	2	6	661644	661649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223856
13088	NC_011529	CTC	2	6	661650	661655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223856
13089	NC_011529	GTA	2	6	661693	661698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223856
13090	NC_011529	CAT	2	6	661743	661748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223856
13091	NC_011529	TGG	2	6	661787	661792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223856
13092	NC_011529	ACA	2	6	661810	661815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212223856
13093	NC_011529	CAA	2	6	661829	661834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212223856
13094	NC_011529	GGT	2	6	661863	661868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223856
13095	NC_011529	AAT	2	6	661884	661889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212223856
13096	NC_011529	AAC	2	6	661959	661964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212223856
13097	NC_011529	TCC	2	6	661996	662001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13098	NC_011529	A	7	7	662067	662073	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13099	NC_011529	GA	3	6	662203	662208	50 %	0 %	50 %	0 %	212223857
13100	NC_011529	GAG	2	6	662225	662230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223857
13101	NC_011529	CCT	2	6	662236	662241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223857
13102	NC_011529	TGAT	2	8	662271	662278	25 %	50 %	25 %	0 %	212223857
13103	NC_011529	GGAAG	2	10	662296	662305	40 %	0 %	60 %	0 %	212223857
13104	NC_011529	CGA	2	6	662329	662334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223857
13105	NC_011529	TAA	2	6	662406	662411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212223857
13106	NC_011529	GA	3	6	662438	662443	50 %	0 %	50 %	0 %	212223857
13107	NC_011529	GAG	2	6	662534	662539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223858
13108	NC_011529	TCA	3	9	662568	662576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223858
13109	NC_011529	AGGA	2	8	662627	662634	50 %	0 %	50 %	0 %	212223858
13110	NC_011529	CGAGG	2	10	662647	662656	20 %	0 %	60 %	20 %	212223858
13111	NC_011529	GA	4	8	662751	662758	50 %	0 %	50 %	0 %	212223858
13112	NC_011529	CTC	2	6	662768	662773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223858
13113	NC_011529	GGA	2	6	662788	662793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223858
13114	NC_011529	ACCTGC	2	12	662964	662975	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	212223858
13115	NC_011529	AG	3	6	662979	662984	50 %	0 %	50 %	0 %	212223858
13116	NC_011529	GAG	2	6	663127	663132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223858
13117	NC_011529	ATA	2	6	663148	663153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13118	NC_011529	TCT	2	6	663155	663160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13119	NC_011529	AAAG	2	8	663175	663182	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13120	NC_011529	ATA	2	6	663190	663195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13365	NC_011529	CGT	2	6	675297	675302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223872
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13482	NC_011529	TAA	2	6	681375	681380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13483	NC_011529	GCT	2	6	681415	681420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223877
13484	NC_011529	AAT	2	6	681471	681476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212223877
13485	NC_011529	CTG	2	6	681706	681711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223877
13486	NC_011529	TGG	2	6	681729	681734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223877
13487	NC_011529	GAA	2	6	681763	681768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223877
13488	NC_011529	CCAA	2	8	681811	681818	50 %	0 %	0 %	50 %	212223877
13489	NC_011529	ACA	2	6	681882	681887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212223877
13490	NC_011529	GAT	2	6	681940	681945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223877
13491	NC_011529	CTC	2	6	681973	681978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223877
13492	NC_011529	AG	3	6	682009	682014	50 %	0 %	50 %	0 %	212223877
13493	NC_011529	AGA	2	6	682023	682028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223877
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13495	NC_011529	GAAAC	2	10	682079	682088	60 %	0 %	20 %	20 %	212223877
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13497	NC_011529	GTG	2	6	682197	682202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223878
13498	NC_011529	CT	3	6	682220	682225	0 %	50 %	0 %	50 %	212223878
13499	NC_011529	TGAAA	2	10	682253	682262	60 %	20 %	20 %	0 %	212223878
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