MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus onnurineus NA1 chromosome

Total Repeats: 36505

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_011529	TCGG	2	8	631904	631911	0 %	25 %	50 %	25 %	212223825
12502	NC_011529	TCT	2	6	632070	632075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223825
12503	NC_011529	T	6	6	632097	632102	0 %	100 %	0 %	0 %	212223825
12504	NC_011529	CCAG	2	8	632106	632113	25 %	0 %	25 %	50 %	212223825
12505	NC_011529	ACC	2	6	632170	632175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12506	NC_011529	TGA	2	6	632194	632199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12507	NC_011529	GGT	2	6	632241	632246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12508	NC_011529	AAG	2	6	632277	632282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12509	NC_011529	CAC	2	6	632328	632333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12510	NC_011529	ACA	2	6	632374	632379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12511	NC_011529	CG	3	6	632433	632438	0 %	0 %	50 %	50 %	212223826
12512	NC_011529	CTA	2	6	632439	632444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223826
12513	NC_011529	TATC	2	8	632451	632458	25 %	50 %	0 %	25 %	212223826
12514	NC_011529	TCG	2	6	632495	632500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223826
12515	NC_011529	ACG	2	6	632516	632521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223826
12516	NC_011529	CGG	2	6	632590	632595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223826
12517	NC_011529	GAG	2	6	632626	632631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223826
12518	NC_011529	AG	4	8	632660	632667	50 %	0 %	50 %	0 %	212223826
12519	NC_011529	ATT	2	6	632787	632792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212223826
12520	NC_011529	TCG	2	6	632831	632836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223826
12521	NC_011529	TGA	2	6	632865	632870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223826
12522	NC_011529	GA	3	6	632883	632888	50 %	0 %	50 %	0 %	212223826
12523	NC_011529	TCG	2	6	632909	632914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223826
12524	NC_011529	GGAG	2	8	632927	632934	25 %	0 %	75 %	0 %	212223826
12525	NC_011529	GCCA	2	8	632944	632951	25 %	0 %	25 %	50 %	212223826
12526	NC_011529	ATCC	2	8	632983	632990	25 %	25 %	0 %	50 %	212223826
12527	NC_011529	TCAC	2	8	633014	633021	25 %	25 %	0 %	50 %	212223826
12528	NC_011529	TGCT	2	8	633059	633066	0 %	50 %	25 %	25 %	212223826
12529	NC_011529	CGA	2	6	633078	633083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223826
12530	NC_011529	AG	3	6	633107	633112	50 %	0 %	50 %	0 %	212223826
12531	NC_011529	TCC	2	6	633193	633198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223826
12532	NC_011529	TGA	2	6	633314	633319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223827
12533	NC_011529	CGAG	2	8	633446	633453	25 %	0 %	50 %	25 %	212223827
12534	NC_011529	CCT	2	6	633488	633493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223827
12535	NC_011529	TCA	2	6	633616	633621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223827
12536	NC_011529	GC	3	6	633632	633637	0 %	0 %	50 %	50 %	212223827
12537	NC_011529	GTT	2	6	633702	633707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223827
12538	NC_011529	AGA	2	6	633716	633721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223827
12539	NC_011529	GAT	2	6	633840	633845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223827
12540	NC_011529	CCTT	2	8	633848	633855	0 %	50 %	0 %	50 %	212223827
12541	NC_011529	TGCC	2	8	633899	633906	0 %	25 %	25 %	50 %	212223827
12542	NC_011529	CGA	2	6	633926	633931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223827
12543	NC_011529	CTC	3	9	633942	633950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223827
12544	NC_011529	GTA	2	6	633960	633965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223827
12545	NC_011529	AC	3	6	634115	634120	50 %	0 %	0 %	50 %	212223828
12546	NC_011529	CTT	2	6	634240	634245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223828
12547	NC_011529	GCT	2	6	634278	634283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223828
12548	NC_011529	TAG	2	6	634521	634526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223828
12549	NC_011529	CTGT	2	8	634545	634552	0 %	50 %	25 %	25 %	212223828
12550	NC_011529	CT	3	6	634569	634574	0 %	50 %	0 %	50 %	212223828
12551	NC_011529	CTG	2	6	634620	634625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223828
12552	NC_011529	TGT	2	6	634660	634665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223828
12553	NC_011529	TGA	2	6	634798	634803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223828
12554	NC_011529	AG	3	6	634807	634812	50 %	0 %	50 %	0 %	212223828
12555	NC_011529	CTT	3	9	634848	634856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223828
12556	NC_011529	GAG	2	6	634931	634936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223828
12557	NC_011529	CCT	2	6	634992	634997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223829
12558	NC_011529	AAGCC	2	10	635090	635099	40 %	0 %	20 %	40 %	212223829
12559	NC_011529	CCG	2	6	635115	635120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223829
12560	NC_011529	GGA	2	6	635172	635177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223829
12561	NC_011529	TCG	2	6	635192	635197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223829
12562	NC_011529	ACG	2	6	635234	635239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223829
12563	NC_011529	AGC	2	6	635294	635299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223829
12564	NC_011529	TCC	2	6	635349	635354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223829
12565	NC_011529	CTC	2	6	635452	635457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223829
12566	NC_011529	CGA	2	6	635538	635543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223829
12567	NC_011529	CAG	2	6	635707	635712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223829
12568	NC_011529	TGG	2	6	635748	635753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12569	NC_011529	GCG	2	6	635918	635923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223830
12570	NC_011529	TGA	2	6	635940	635945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223830
12571	NC_011529	AAG	2	6	635947	635952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223830
12572	NC_011529	TCC	2	6	635960	635965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223830
12573	NC_011529	GAG	2	6	635968	635973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223830
12574	NC_011529	CTT	2	6	636017	636022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223831
12575	NC_011529	CGG	2	6	636026	636031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223831
12576	NC_011529	ACC	2	6	636105	636110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212223831
12577	NC_011529	GAGC	2	8	636140	636147	25 %	0 %	50 %	25 %	212223831
12578	NC_011529	ACC	2	6	636280	636285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212223831
12579	NC_011529	GA	4	8	636368	636375	50 %	0 %	50 %	0 %	212223831
12580	NC_011529	CAA	2	6	636413	636418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212223831
12581	NC_011529	CA	3	6	636531	636536	50 %	0 %	0 %	50 %	212223831
12582	NC_011529	GGA	2	6	636593	636598	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223831
12583	NC_011529	TGG	2	6	636612	636617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223831
12584	NC_011529	CTG	2	6	636755	636760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223832
12585	NC_011529	GAC	2	6	636785	636790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223832
12586	NC_011529	GGC	2	6	636814	636819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223832
12587	NC_011529	CTC	2	6	636821	636826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223832
12588	NC_011529	GAG	2	6	636830	636835	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223832
12589	NC_011529	TAG	2	6	636867	636872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223832
12590	NC_011529	CGG	2	6	636910	636915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223832
12591	NC_011529	CTT	2	6	636934	636939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223832
12592	NC_011529	CTA	2	6	636940	636945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223832
12593	NC_011529	GAC	2	6	636992	636997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223832
12594	NC_011529	GGC	2	6	637004	637009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223832
12595	NC_011529	GGA	2	6	637042	637047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223832
12596	NC_011529	CCT	2	6	637063	637068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223833
12597	NC_011529	GAG	2	6	637118	637123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223833
12598	NC_011529	GGT	2	6	637357	637362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223833
12599	NC_011529	CTC	2	6	637451	637456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223833
12600	NC_011529	CTC	2	6	637529	637534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223833
12601	NC_011529	TCT	2	6	637545	637550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223833
12602	NC_011529	GGC	2	6	637748	637753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223833
12603	NC_011529	CTA	2	6	637873	637878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223834
12604	NC_011529	AAC	2	6	637926	637931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212223834
12605	NC_011529	CGT	2	6	637982	637987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223834
12606	NC_011529	TCA	2	6	638038	638043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223834
12607	NC_011529	ATC	2	6	638137	638142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223834
12608	NC_011529	TCA	2	6	638161	638166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223834
12609	NC_011529	TCA	2	6	638275	638280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223834
12610	NC_011529	CAGG	2	8	638335	638342	25 %	0 %	50 %	25 %	212223834
12611	NC_011529	CTC	2	6	638358	638363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223834
12612	NC_011529	AAC	2	6	638418	638423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212223834
12613	NC_011529	AGT	2	6	638489	638494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223834
12614	NC_011529	CT	3	6	638518	638523	0 %	50 %	0 %	50 %	212223834
12615	NC_011529	AG	3	6	638578	638583	50 %	0 %	50 %	0 %	212223834
12616	NC_011529	A	7	7	638605	638611	100 %	0 %	0 %	0 %	212223834
12617	NC_011529	T	6	6	638671	638676	0 %	100 %	0 %	0 %	212223834
12618	NC_011529	GAG	2	6	638722	638727	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223834
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12986	NC_011529	GGCC	2	8	656827	656834	0 %	0 %	50 %	50 %	212223852
12987	NC_011529	GAG	2	6	656975	656980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223852
12988	NC_011529	CGG	2	6	657025	657030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223852
12989	NC_011529	TGG	2	6	657051	657056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223852
12990	NC_011529	GCTCG	2	10	657088	657097	0 %	20 %	40 %	40 %	212223852
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12999	NC_011529	TTC	2	6	657485	657490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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