MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus onnurineus NA1 chromosome

Total Repeats: 36505

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_011529	TGA	2	6	606590	606595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223798
12002	NC_011529	GTA	2	6	606612	606617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223798
12003	NC_011529	CT	3	6	606634	606639	0 %	50 %	0 %	50 %	212223798
12004	NC_011529	CGG	2	6	606644	606649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223798
12005	NC_011529	TTC	2	6	606777	606782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12006	NC_011529	TTA	2	6	606794	606799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12007	NC_011529	CAT	2	6	606808	606813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12008	NC_011529	TGG	2	6	606820	606825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12009	NC_011529	TGA	2	6	606829	606834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223799
12010	NC_011529	GA	3	6	606840	606845	50 %	0 %	50 %	0 %	212223799
12011	NC_011529	CGC	2	6	606878	606883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223799
12012	NC_011529	TAA	2	6	606886	606891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212223799
12013	NC_011529	TGG	2	6	606938	606943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223799
12014	NC_011529	GTT	2	6	606951	606956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223799
12015	NC_011529	GAG	2	6	606999	607004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223799
12016	NC_011529	TCA	2	6	607180	607185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223799
12017	NC_011529	CTGC	2	8	607234	607241	0 %	25 %	25 %	50 %	212223799
12018	NC_011529	ATG	2	6	607260	607265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223799
12019	NC_011529	GCG	2	6	607266	607271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223799
12020	NC_011529	AGCC	2	8	607354	607361	25 %	0 %	25 %	50 %	212223799
12021	NC_011529	GCTCT	2	10	607390	607399	0 %	40 %	20 %	40 %	212223799
12022	NC_011529	GCG	2	6	607435	607440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223799
12023	NC_011529	CGA	2	6	607454	607459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223799
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12032	NC_011529	TA	3	6	607775	607780	50 %	50 %	0 %	0 %	212223799
12033	NC_011529	TC	3	6	607891	607896	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12034	NC_011529	T	6	6	607922	607927	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12040	NC_011529	GGA	2	6	608211	608216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223800
12041	NC_011529	GAG	2	6	608251	608256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223800
12042	NC_011529	GC	3	6	608337	608342	0 %	0 %	50 %	50 %	212223800
12043	NC_011529	GAT	2	6	608365	608370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223800
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12056	NC_011529	CGA	2	6	608850	608855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223800
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12058	NC_011529	GTC	2	6	608926	608931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223800
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12068	NC_011529	AACCC	2	10	609305	609314	40 %	0 %	0 %	60 %	212223801
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12098	NC_011529	AATT	2	8	611267	611274	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12099	NC_011529	AGA	2	6	611328	611333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12100	NC_011529	CCA	2	6	611400	611405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12101	NC_011529	ATC	2	6	611590	611595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223804
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12104	NC_011529	GGT	2	6	611695	611700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12105	NC_011529	ATG	2	6	611706	611711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223805
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12108	NC_011529	TGT	3	9	611951	611959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223805
12109	NC_011529	CGT	2	6	611963	611968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223805
12110	NC_011529	AGAC	2	8	612055	612062	50 %	0 %	25 %	25 %	212223805
12111	NC_011529	AG	3	6	612073	612078	50 %	0 %	50 %	0 %	212223805
12112	NC_011529	GGA	2	6	612104	612109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223805
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12115	NC_011529	AAGGA	2	10	612171	612180	60 %	0 %	40 %	0 %	212223805
12116	NC_011529	CTC	2	6	612330	612335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223805
12117	NC_011529	GAC	2	6	612342	612347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223805
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12120	NC_011529	GC	3	6	612437	612442	0 %	0 %	50 %	50 %	212223805
12121	NC_011529	ATA	2	6	612453	612458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212223805
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12123	NC_011529	GA	3	6	612526	612531	50 %	0 %	50 %	0 %	212223805
12124	NC_011529	C	6	6	612691	612696	0 %	0 %	0 %	100 %	212223805
12125	NC_011529	TAGC	2	8	612700	612707	25 %	25 %	25 %	25 %	212223805
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12153	NC_011529	CAG	2	6	614009	614014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12222	NC_011529	GAT	2	6	617673	617678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223811
12223	NC_011529	TGAGC	2	10	617687	617696	20 %	20 %	40 %	20 %	212223811
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12225	NC_011529	G	6	6	617909	617914	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12226	NC_011529	TC	3	6	617932	617937	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12227	NC_011529	CG	3	6	617989	617994	0 %	0 %	50 %	50 %	212223812
12228	NC_011529	GCG	2	6	618107	618112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223812
12229	NC_011529	TACA	2	8	618117	618124	50 %	25 %	0 %	25 %	212223812
12230	NC_011529	TAC	2	6	618130	618135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223812
12231	NC_011529	GT	3	6	618184	618189	0 %	50 %	50 %	0 %	212223812
12232	NC_011529	CAA	2	6	618201	618206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212223812
12233	NC_011529	ACT	2	6	618269	618274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223812
12234	NC_011529	ACA	2	6	618396	618401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212223813
12235	NC_011529	CTA	2	6	618425	618430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223813
12236	NC_011529	ATA	2	6	618477	618482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212223813
12237	NC_011529	AGT	2	6	618644	618649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223813
12238	NC_011529	TCG	2	6	618657	618662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223813
12239	NC_011529	AT	3	6	618701	618706	50 %	50 %	0 %	0 %	212223813
12240	NC_011529	AAT	2	6	618830	618835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212223813
12241	NC_011529	CCT	3	9	618887	618895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223813
12242	NC_011529	TAC	2	6	618912	618917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223813
12243	NC_011529	TGA	2	6	618947	618952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223813
12244	NC_011529	TGCA	2	8	619077	619084	25 %	25 %	25 %	25 %	212223813
12245	NC_011529	GGA	2	6	619088	619093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223813
12246	NC_011529	AGGG	2	8	619167	619174	25 %	0 %	75 %	0 %	212223813
12247	NC_011529	GAA	2	6	619218	619223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223813
12248	NC_011529	TCC	2	6	619255	619260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223813
12249	NC_011529	ATT	2	6	619266	619271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212223813
12250	NC_011529	TGA	2	6	619305	619310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223814
12251	NC_011529	TG	3	6	619396	619401	0 %	50 %	50 %	0 %	212223814
12252	NC_011529	GTA	2	6	619440	619445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223814
12253	NC_011529	TGA	2	6	619599	619604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223814
12254	NC_011529	AGCC	2	8	619683	619690	25 %	0 %	25 %	50 %	212223814
12255	NC_011529	GCC	2	6	619718	619723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223814
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12259	NC_011529	GAT	2	6	619819	619824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223814
12260	NC_011529	CCTT	2	8	619839	619846	0 %	50 %	0 %	50 %	212223814
12261	NC_011529	TTC	2	6	620030	620035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223814
12262	NC_011529	AGT	2	6	620055	620060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223814
12263	NC_011529	AGTC	2	8	620106	620113	25 %	25 %	25 %	25 %	212223814
12264	NC_011529	ACG	2	6	620150	620155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223814
12265	NC_011529	GTC	2	6	620182	620187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223814
12266	NC_011529	TTG	2	6	620195	620200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223814
12267	NC_011529	ATC	2	6	620249	620254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223814
12268	NC_011529	TCG	2	6	620373	620378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223814
12269	NC_011529	GCC	2	6	620417	620422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223814
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12271	NC_011529	CAC	2	6	620479	620484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12272	NC_011529	T	6	6	620566	620571	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12273	NC_011529	TCG	2	6	620599	620604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12274	NC_011529	ACT	2	6	620608	620613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12275	NC_011529	GCA	2	6	620639	620644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12276	NC_011529	A	6	6	620665	620670	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12277	NC_011529	CGT	2	6	620692	620697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12278	NC_011529	GC	3	6	620700	620705	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12279	NC_011529	AGAT	2	8	620710	620717	50 %	25 %	25 %	0 %	212223815
12280	NC_011529	TGAT	2	8	620759	620766	25 %	50 %	25 %	0 %	212223815
12281	NC_011529	GGA	2	6	620820	620825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223815
12282	NC_011529	TGC	2	6	621028	621033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223816
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12285	NC_011529	GGT	2	6	621073	621078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223816
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12296	NC_011529	CT	3	6	621565	621570	0 %	50 %	0 %	50 %	212223817
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12312	NC_011529	AGG	2	6	622125	622130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12313	NC_011529	TAAA	2	8	622147	622154	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12314	NC_011529	TTCCGT	2	12	622227	622238	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
12315	NC_011529	AGA	2	6	622284	622289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12316	NC_011529	CTG	2	6	622315	622320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12317	NC_011529	TTTC	2	8	622376	622383	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12318	NC_011529	TGA	2	6	622454	622459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12319	NC_011529	ACG	2	6	622549	622554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223819
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12329	NC_011529	CTC	2	6	623098	623103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223819
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12343	NC_011529	GGT	2	6	623830	623835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12344	NC_011529	GGA	2	6	623842	623847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223820
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12352	NC_011529	ATC	2	6	624284	624289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223820
12353	NC_011529	AGGA	2	8	624315	624322	50 %	0 %	50 %	0 %	212223820
12354	NC_011529	TTC	2	6	624338	624343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223820
12355	NC_011529	CGT	2	6	624367	624372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223820
12356	NC_011529	GAG	2	6	624400	624405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223820
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12358	NC_011529	CCACT	2	10	624588	624597	20 %	20 %	0 %	60 %	212223820
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12360	NC_011529	CT	3	6	624639	624644	0 %	50 %	0 %	50 %	212223820
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12482	NC_011529	CTGC	2	8	630964	630971	0 %	25 %	25 %	50 %	212223825
12483	NC_011529	GGA	2	6	631017	631022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223825
12484	NC_011529	CTT	2	6	631105	631110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223825
12485	NC_011529	CTC	2	6	631142	631147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223825
12486	NC_011529	TCT	2	6	631176	631181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223825
12487	NC_011529	CTT	2	6	631183	631188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223825
12488	NC_011529	CCTT	2	8	631227	631234	0 %	50 %	0 %	50 %	212223825
12489	NC_011529	CCT	2	6	631236	631241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223825
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