MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus onnurineus NA1 chromosome

Total Repeats: 36505

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_011529	GAG	2	6	555923	555928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223751
11002	NC_011529	AGG	2	6	555933	555938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223751
11003	NC_011529	AGA	2	6	555955	555960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223751
11004	NC_011529	GAG	2	6	555968	555973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223751
11005	NC_011529	GAA	3	9	555979	555987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223751
11006	NC_011529	CCA	2	6	555990	555995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212223751
11007	NC_011529	ACC	2	6	556007	556012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212223751
11008	NC_011529	AAG	2	6	556034	556039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223751
11009	NC_011529	AGA	2	6	556056	556061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223751
11010	NC_011529	AGCC	2	8	556068	556075	25 %	0 %	25 %	50 %	212223751
11011	NC_011529	GAG	2	6	556085	556090	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223751
11012	NC_011529	AAG	2	6	556091	556096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223751
11013	NC_011529	TCT	2	6	556126	556131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11014	NC_011529	GGC	2	6	556241	556246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223752
11015	NC_011529	CGT	2	6	556265	556270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223752
11016	NC_011529	ACT	2	6	556423	556428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223752
11017	NC_011529	GAA	2	6	556544	556549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223752
11018	NC_011529	AATG	2	8	556551	556558	50 %	25 %	25 %	0 %	212223752
11019	NC_011529	CTTC	2	8	556682	556689	0 %	50 %	0 %	50 %	212223752
11020	NC_011529	TCC	2	6	556699	556704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223752
11021	NC_011529	ATG	2	6	556859	556864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223753
11022	NC_011529	CTT	2	6	556921	556926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223753
11023	NC_011529	TTCGTC	2	12	556961	556972	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	212223753
11024	NC_011529	AAG	2	6	557012	557017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223753
11025	NC_011529	GTC	2	6	557087	557092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223753
11026	NC_011529	CTT	2	6	557212	557217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223753
11027	NC_011529	CTT	2	6	557264	557269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223753
11028	NC_011529	TTC	2	6	557296	557301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223753
11029	NC_011529	CCT	2	6	557341	557346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223753
11030	NC_011529	CAG	2	6	557355	557360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223753
11031	NC_011529	TCT	2	6	557367	557372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223753
11032	NC_011529	GGCA	2	8	557444	557451	25 %	0 %	50 %	25 %	212223753
11033	NC_011529	AT	3	6	557462	557467	50 %	50 %	0 %	0 %	212223753
11034	NC_011529	CTG	2	6	557483	557488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223753
11035	NC_011529	CGA	2	6	557564	557569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223754
11036	NC_011529	GAG	3	9	557721	557729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223754
11037	NC_011529	GAG	2	6	557745	557750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223754
11038	NC_011529	AG	3	6	557784	557789	50 %	0 %	50 %	0 %	212223754
11039	NC_011529	AAGG	2	8	557911	557918	50 %	0 %	50 %	0 %	212223754
11040	NC_011529	TCC	2	6	557998	558003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223754
11041	NC_011529	CGC	2	6	558015	558020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223754
11042	NC_011529	CAG	2	6	558036	558041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223754
11043	NC_011529	GTC	2	6	558043	558048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223754
11044	NC_011529	CAG	2	6	558162	558167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223754
11045	NC_011529	GCTC	2	8	558203	558210	0 %	25 %	25 %	50 %	212223754
11046	NC_011529	GAAG	2	8	558320	558327	50 %	0 %	50 %	0 %	212223754
11047	NC_011529	AGA	2	6	558365	558370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223754
11048	NC_011529	GAA	2	6	558423	558428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223754
11049	NC_011529	CTA	2	6	558461	558466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223754
11050	NC_011529	TTTC	2	8	558608	558615	0 %	75 %	0 %	25 %	212223754
11051	NC_011529	AGG	2	6	558643	558648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223754
11052	NC_011529	TTC	2	6	558662	558667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223754
11053	NC_011529	CTC	2	6	558684	558689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223754
11054	NC_011529	TCT	2	6	558707	558712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223754
11055	NC_011529	CGG	2	6	558813	558818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223754
11056	NC_011529	CTC	2	6	558855	558860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223754
11057	NC_011529	CGA	2	6	558866	558871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223754
11058	NC_011529	CTGG	2	8	559017	559024	0 %	25 %	50 %	25 %	212223754
11059	NC_011529	TC	3	6	559081	559086	0 %	50 %	0 %	50 %	212223754
11060	NC_011529	CCT	2	6	559148	559153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223754
11061	NC_011529	GTC	2	6	559212	559217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223754
11062	NC_011529	CCTTTA	2	12	559259	559270	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	212223754
11063	NC_011529	TCCT	2	8	559335	559342	0 %	50 %	0 %	50 %	212223754
11064	NC_011529	GAA	2	6	559415	559420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223754
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11066	NC_011529	GAAAT	2	10	559449	559458	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11067	NC_011529	TAA	2	6	559459	559464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11068	NC_011529	CAC	2	6	559496	559501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11069	NC_011529	AAG	2	6	559547	559552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11070	NC_011529	TAT	2	6	559598	559603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11071	NC_011529	CTG	2	6	559651	559656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11072	NC_011529	TTC	2	6	559744	559749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11073	NC_011529	TGT	2	6	559755	559760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11074	NC_011529	GTG	2	6	559772	559777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11075	NC_011529	ACT	2	6	559834	559839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11076	NC_011529	ATG	2	6	559883	559888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11077	NC_011529	A	6	6	559903	559908	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11078	NC_011529	A	6	6	559910	559915	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11079	NC_011529	TCA	2	6	559939	559944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223755
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11087	NC_011529	GTT	2	6	560596	560601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223756
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11089	NC_011529	CTT	2	6	560802	560807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223756
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11091	NC_011529	TTA	2	6	560976	560981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212223756
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11093	NC_011529	CGT	2	6	561066	561071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223756
11094	NC_011529	CGT	2	6	561073	561078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223756
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11097	NC_011529	AAG	2	6	561416	561421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223756
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11099	NC_011529	CTG	2	6	561513	561518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223756
11100	NC_011529	CTCC	2	8	561541	561548	0 %	25 %	0 %	75 %	212223756
11101	NC_011529	CCT	2	6	561589	561594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223756
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11103	NC_011529	CTAG	2	8	561649	561656	25 %	25 %	25 %	25 %	212223757
11104	NC_011529	ATCT	2	8	561660	561667	25 %	50 %	0 %	25 %	212223757
11105	NC_011529	TCA	2	6	561679	561684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223757
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11107	NC_011529	G	6	6	561828	561833	0 %	0 %	100 %	0 %	212223757
11108	NC_011529	CCAT	2	8	561845	561852	25 %	25 %	0 %	50 %	212223757
11109	NC_011529	TTC	2	6	562002	562007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223757
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11111	NC_011529	CAG	2	6	562124	562129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223757
11112	NC_011529	AAT	2	6	562155	562160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212223757
11113	NC_011529	AGG	2	6	562199	562204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223758
11114	NC_011529	GATT	2	8	562222	562229	25 %	50 %	25 %	0 %	212223758
11115	NC_011529	CTT	2	6	562257	562262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223758
11116	NC_011529	AGA	2	6	562317	562322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223758
11117	NC_011529	TTC	2	6	562362	562367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223758
11118	NC_011529	TCAA	2	8	562373	562380	50 %	25 %	0 %	25 %	212223758
11119	NC_011529	ATT	2	6	562490	562495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212223758
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11121	NC_011529	CCG	2	6	562529	562534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223758
11122	NC_011529	CTC	2	6	562540	562545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223758
11123	NC_011529	GAGAA	2	10	562719	562728	60 %	0 %	40 %	0 %	212223758
11124	NC_011529	TA	3	6	562798	562803	50 %	50 %	0 %	0 %	212223758
11125	NC_011529	TGA	2	6	562806	562811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223758
11126	NC_011529	CT	3	6	562872	562877	0 %	50 %	0 %	50 %	212223758
11127	NC_011529	AGTG	2	8	562907	562914	25 %	25 %	50 %	0 %	212223758
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11134	NC_011529	TCAT	2	8	563310	563317	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11135	NC_011529	TGGA	2	8	563357	563364	25 %	25 %	50 %	0 %	212223759
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11152	NC_011529	AAG	2	6	564335	564340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223759
11153	NC_011529	CGA	2	6	564412	564417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223759
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11162	NC_011529	CGA	2	6	564700	564705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223759
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11225	NC_011529	AT	3	6	568181	568186	50 %	50 %	0 %	0 %	212223761
11226	NC_011529	CCCT	2	8	568190	568197	0 %	25 %	0 %	75 %	212223761
11227	NC_011529	GA	3	6	568233	568238	50 %	0 %	50 %	0 %	212223761
11228	NC_011529	T	6	6	568301	568306	0 %	100 %	0 %	0 %	212223761
11229	NC_011529	C	6	6	568479	568484	0 %	0 %	0 %	100 %	212223761
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11232	NC_011529	CTT	2	6	568594	568599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223761
11233	NC_011529	TC	3	6	568637	568642	0 %	50 %	0 %	50 %	212223761
11234	NC_011529	C	6	6	568660	568665	0 %	0 %	0 %	100 %	212223761
11235	NC_011529	GTT	2	6	568669	568674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223761
11236	NC_011529	GAA	2	6	568801	568806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223761
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11238	NC_011529	TTC	2	6	569042	569047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223761
11239	NC_011529	T	6	6	569065	569070	0 %	100 %	0 %	0 %	212223761
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11242	NC_011529	GTG	2	6	569207	569212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223761
11243	NC_011529	CTT	2	6	569246	569251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223761
11244	NC_011529	CT	3	6	569266	569271	0 %	50 %	0 %	50 %	212223761
11245	NC_011529	CGT	2	6	569303	569308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223761
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11353	NC_011529	CCA	2	6	574541	574546	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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11355	NC_011529	TCT	2	6	574636	574641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11485	NC_011529	CGC	2	6	580518	580523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223770
11486	NC_011529	GA	3	6	580528	580533	50 %	0 %	50 %	0 %	212223770
11487	NC_011529	AGG	2	6	580569	580574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223770
11488	NC_011529	TGA	2	6	580595	580600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223770
11489	NC_011529	TAA	2	6	580603	580608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212223770
11490	NC_011529	ACT	2	6	580612	580617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223770
11491	NC_011529	GACCC	2	10	580622	580631	20 %	0 %	20 %	60 %	212223770
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11493	NC_011529	ATG	2	6	580728	580733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223770
11494	NC_011529	ATT	2	6	580752	580757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212223770
11495	NC_011529	CTG	2	6	580807	580812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223770
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11499	NC_011529	CCT	2	6	581129	581134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223770
11500	NC_011529	TGA	2	6	581142	581147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223770

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