MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus onnurineus NA1 chromosome

Total Repeats: 36505

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_011529	CGA	2	6	531670	531675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223726
10502	NC_011529	AG	3	6	531740	531745	50 %	0 %	50 %	0 %	212223726
10503	NC_011529	CAG	2	6	531764	531769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223726
10504	NC_011529	GGA	2	6	531770	531775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223726
10505	NC_011529	AGGCA	2	10	531856	531865	40 %	0 %	40 %	20 %	212223726
10506	NC_011529	AAG	3	9	531957	531965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223726
10507	NC_011529	CCT	2	6	532029	532034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223727
10508	NC_011529	CGT	2	6	532065	532070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223727
10509	NC_011529	GAG	2	6	532078	532083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223727
10510	NC_011529	CT	3	6	532094	532099	0 %	50 %	0 %	50 %	212223727
10511	NC_011529	CTT	2	6	532111	532116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223727
10512	NC_011529	ACG	2	6	532139	532144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223727
10513	NC_011529	GAG	2	6	532153	532158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223727
10514	NC_011529	GTC	2	6	532159	532164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223727
10515	NC_011529	GTA	2	6	532171	532176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223727
10516	NC_011529	CTT	2	6	532177	532182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223727
10517	NC_011529	CGA	2	6	532191	532196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223727
10518	NC_011529	CAA	2	6	532269	532274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212223727
10519	NC_011529	CCT	2	6	532338	532343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223727
10520	NC_011529	TCT	2	6	532347	532352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223727
10521	NC_011529	CTT	2	6	532363	532368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223727
10522	NC_011529	ACG	2	6	532454	532459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223727
10523	NC_011529	CGTC	2	8	532461	532468	0 %	25 %	25 %	50 %	212223727
10524	NC_011529	GTA	2	6	532471	532476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223727
10525	NC_011529	AGC	2	6	532487	532492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223727
10526	NC_011529	GAA	2	6	532534	532539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223727
10527	NC_011529	TAT	2	6	532540	532545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212223727
10528	NC_011529	TCA	2	6	532550	532555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223727
10529	NC_011529	CTG	2	6	532599	532604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223727
10530	NC_011529	TCT	2	6	532659	532664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223727
10531	NC_011529	GAG	2	6	532690	532695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223727
10532	NC_011529	GTT	2	6	532736	532741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223727
10533	NC_011529	GCCT	2	8	532907	532914	0 %	25 %	25 %	50 %	212223727
10534	NC_011529	ATC	2	6	532921	532926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223727
10535	NC_011529	GAC	2	6	532945	532950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223727
10536	NC_011529	GTT	2	6	533005	533010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223727
10537	NC_011529	CTC	2	6	533017	533022	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223727
10538	NC_011529	CTT	2	6	533170	533175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223727
10539	NC_011529	TCT	2	6	533240	533245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223727
10540	NC_011529	TGT	2	6	533304	533309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223727
10541	NC_011529	CTT	2	6	533362	533367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223727
10542	NC_011529	TC	3	6	533507	533512	0 %	50 %	0 %	50 %	212223727
10543	NC_011529	CTC	2	6	533524	533529	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223727
10544	NC_011529	CTC	2	6	533536	533541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223727
10545	NC_011529	TTA	2	6	533697	533702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212223727
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10547	NC_011529	TGCT	2	8	533834	533841	0 %	50 %	25 %	25 %	212223727
10548	NC_011529	CAGTT	2	10	533914	533923	20 %	40 %	20 %	20 %	212223727
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10550	NC_011529	GTC	2	6	533963	533968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223727
10551	NC_011529	GTA	2	6	533983	533988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223727
10552	NC_011529	TGA	2	6	534066	534071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223727
10553	NC_011529	AT	3	6	534111	534116	50 %	50 %	0 %	0 %	212223727
10554	NC_011529	GCAG	2	8	534119	534126	25 %	0 %	50 %	25 %	212223727
10555	NC_011529	ACC	2	6	534209	534214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10556	NC_011529	CGT	2	6	534222	534227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10559	NC_011529	CGG	2	6	534440	534445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223728
10560	NC_011529	GAG	2	6	534453	534458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223728
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10572	NC_011529	GAG	2	6	534993	534998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223729
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10575	NC_011529	GAAA	2	8	535240	535247	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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10589	NC_011529	GCTC	2	8	535673	535680	0 %	25 %	25 %	50 %	212223730
10590	NC_011529	GCC	2	6	535784	535789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223730
10591	NC_011529	TCCT	2	8	535809	535816	0 %	50 %	0 %	50 %	212223730
10592	NC_011529	TTC	2	6	535819	535824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223730
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10608	NC_011529	CGTCAC	2	12	536355	536366	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	212223731
10609	NC_011529	TG	3	6	536443	536448	0 %	50 %	50 %	0 %	212223731
10610	NC_011529	GGA	2	6	536482	536487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223731
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10614	NC_011529	CGC	2	6	536706	536711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223732
10615	NC_011529	CTCC	2	8	536751	536758	0 %	25 %	0 %	75 %	212223732
10616	NC_011529	GGT	2	6	536766	536771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223732
10617	NC_011529	TCT	2	6	536805	536810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223732
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10619	NC_011529	GTG	2	6	536945	536950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223732
10620	NC_011529	ATT	2	6	536951	536956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212223732
10621	NC_011529	CAT	2	6	536967	536972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223732
10622	NC_011529	TTG	2	6	537008	537013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223732
10623	NC_011529	TCC	2	6	537033	537038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223732
10624	NC_011529	TGA	2	6	537039	537044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223732
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10626	NC_011529	TC	3	6	537214	537219	0 %	50 %	0 %	50 %	212223732
10627	NC_011529	AGG	2	6	537290	537295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223732
10628	NC_011529	TCA	2	6	537507	537512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223732
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10630	NC_011529	TCC	2	6	537626	537631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223732
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10632	NC_011529	TCGC	2	8	537689	537696	0 %	25 %	25 %	50 %	212223732
10633	NC_011529	GCT	2	6	537743	537748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223732
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10639	NC_011529	CTC	2	6	538074	538079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223733
10640	NC_011529	AGCCG	2	10	538094	538103	20 %	0 %	40 %	40 %	212223733
10641	NC_011529	GAT	2	6	538164	538169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223733
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10648	NC_011529	CTGT	2	8	538400	538407	0 %	50 %	25 %	25 %	212223734
10649	NC_011529	GAT	2	6	538421	538426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223734
10650	NC_011529	TCT	2	6	538456	538461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223734
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10652	NC_011529	GGACA	2	10	538546	538555	40 %	0 %	40 %	20 %	212223734
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10654	NC_011529	CT	3	6	538611	538616	0 %	50 %	0 %	50 %	212223734
10655	NC_011529	GCA	2	6	538671	538676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223734
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10664	NC_011529	GAC	3	9	539018	539026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223734
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10676	NC_011529	CTT	2	6	539712	539717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223735
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10685	NC_011529	GTA	2	6	540163	540168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223735
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10695	NC_011529	CAC	2	6	540797	540802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212223737
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10699	NC_011529	CTT	2	6	540910	540915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223737
10700	NC_011529	TCTG	2	8	540930	540937	0 %	50 %	25 %	25 %	212223737
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10703	NC_011529	TC	3	6	541093	541098	0 %	50 %	0 %	50 %	212223737
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10711	NC_011529	TCT	2	6	541445	541450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223737
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10714	NC_011529	GGCCT	2	10	541663	541672	0 %	20 %	40 %	40 %	212223737
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10719	NC_011529	GCGAGG	2	12	542235	542246	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	212223738
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10721	NC_011529	GAG	2	6	542395	542400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223738
10722	NC_011529	GAG	2	6	542420	542425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223738
10723	NC_011529	TAC	2	6	542450	542455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223738
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10726	NC_011529	GTG	2	6	542661	542666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10727	NC_011529	T	6	6	542730	542735	0 %	100 %	0 %	0 %	212223739
10728	NC_011529	ACT	2	6	542767	542772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223739
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10732	NC_011529	TCA	2	6	542950	542955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223739
10733	NC_011529	CTGC	2	8	542961	542968	0 %	25 %	25 %	50 %	212223739
10734	NC_011529	ACA	2	6	543070	543075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212223739
10735	NC_011529	CCTT	2	8	543088	543095	0 %	50 %	0 %	50 %	212223739
10736	NC_011529	GTG	2	6	543111	543116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223739
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10738	NC_011529	GTC	2	6	543253	543258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223740
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