MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus onnurineus NA1 chromosome

Total Repeats: 36505

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9501	NC_011529	GCC	2	6	479408	479413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223670
9502	NC_011529	TTA	2	6	479442	479447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212223670
9503	NC_011529	CAT	2	6	479534	479539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223670
9504	NC_011529	GGT	2	6	479657	479662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223670
9505	NC_011529	T	6	6	479676	479681	0 %	100 %	0 %	0 %	212223670
9506	NC_011529	GCTC	2	8	479698	479705	0 %	25 %	25 %	50 %	212223670
9507	NC_011529	AAG	2	6	479937	479942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223670
9508	NC_011529	ACC	2	6	479951	479956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212223670
9509	NC_011529	CAGCTG	2	12	479980	479991	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	212223670
9510	NC_011529	TC	3	6	480074	480079	0 %	50 %	0 %	50 %	212223670
9511	NC_011529	TAT	2	6	480120	480125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9512	NC_011529	GAAG	2	8	480146	480153	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9513	NC_011529	TCT	2	6	480228	480233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223671
9514	NC_011529	GAT	2	6	480247	480252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223671
9515	NC_011529	TC	3	6	480253	480258	0 %	50 %	0 %	50 %	212223671
9516	NC_011529	TCA	2	6	480341	480346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223671
9517	NC_011529	AGA	2	6	480355	480360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223671
9518	NC_011529	CAT	2	6	480429	480434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223671
9519	NC_011529	TC	3	6	480472	480477	0 %	50 %	0 %	50 %	212223671
9520	NC_011529	CG	3	6	480551	480556	0 %	0 %	50 %	50 %	212223671
9521	NC_011529	TTTAT	2	10	480596	480605	20 %	80 %	0 %	0 %	212223671
9522	NC_011529	GGA	2	6	480678	480683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9523	NC_011529	A	7	7	480758	480764	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9524	NC_011529	ATCC	2	8	480786	480793	25 %	25 %	0 %	50 %	212223672
9525	NC_011529	TCC	2	6	480917	480922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223672
9526	NC_011529	AGT	2	6	480968	480973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223672
9527	NC_011529	TCA	2	6	480974	480979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223672
9528	NC_011529	GTC	2	6	481057	481062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223672
9529	NC_011529	CCAGT	2	10	481097	481106	20 %	20 %	20 %	40 %	212223673
9530	NC_011529	GTTC	2	8	481143	481150	0 %	50 %	25 %	25 %	212223673
9531	NC_011529	CTT	2	6	481169	481174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223673
9532	NC_011529	TC	3	6	481176	481181	0 %	50 %	0 %	50 %	212223673
9533	NC_011529	GGT	2	6	481214	481219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223673
9534	NC_011529	AC	3	6	481263	481268	50 %	0 %	0 %	50 %	212223673
9535	NC_011529	CCT	2	6	481370	481375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223673
9536	NC_011529	GGA	2	6	481412	481417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223673
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9538	NC_011529	GTTC	2	8	481442	481449	0 %	50 %	25 %	25 %	212223673
9539	NC_011529	TGC	2	6	481469	481474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223673
9540	NC_011529	TCT	2	6	481584	481589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223674
9541	NC_011529	TCG	2	6	481707	481712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223674
9542	NC_011529	GCA	2	6	481717	481722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223674
9543	NC_011529	GAA	2	6	481733	481738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223674
9544	NC_011529	CTC	2	6	481746	481751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223674
9545	NC_011529	AGG	2	6	481854	481859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223674
9546	NC_011529	AAT	2	6	481911	481916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9547	NC_011529	TC	3	6	482065	482070	0 %	50 %	0 %	50 %	212223675
9548	NC_011529	ACG	2	6	482089	482094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223675
9549	NC_011529	CCG	2	6	482107	482112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223675
9550	NC_011529	ACT	2	6	482122	482127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223675
9551	NC_011529	GCCT	3	12	482231	482242	0 %	25 %	25 %	50 %	212223675
9552	NC_011529	CGA	2	6	482246	482251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223675
9553	NC_011529	AAC	2	6	482298	482303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212223675
9554	NC_011529	AGCGA	2	10	482340	482349	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
9555	NC_011529	TCA	2	6	482386	482391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223676
9556	NC_011529	TCT	2	6	482394	482399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223676
9557	NC_011529	TCT	2	6	482448	482453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223676
9558	NC_011529	CTC	2	6	482488	482493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223676
9559	NC_011529	CCCT	2	8	482498	482505	0 %	25 %	0 %	75 %	212223676
9560	NC_011529	CAA	2	6	482541	482546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212223676
9561	NC_011529	GCTA	2	8	482659	482666	25 %	25 %	25 %	25 %	212223676
9562	NC_011529	TCG	2	6	482699	482704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223676
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9564	NC_011529	CTT	2	6	482842	482847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223676
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9570	NC_011529	GA	3	6	483287	483292	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9571	NC_011529	GGAA	2	8	483302	483309	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9572	NC_011529	GA	3	6	483363	483368	50 %	0 %	50 %	0 %	212223677
9573	NC_011529	GCC	2	6	483476	483481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223677
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9583	NC_011529	GAA	2	6	484102	484107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223677
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9589	NC_011529	AGA	2	6	484404	484409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223677
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9601	NC_011529	CAGC	2	8	484878	484885	25 %	0 %	25 %	50 %	212223677
9602	NC_011529	GAG	2	6	485153	485158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223677
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9606	NC_011529	T	7	7	485224	485230	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9607	NC_011529	GA	3	6	485328	485333	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9608	NC_011529	CGCT	2	8	485458	485465	0 %	25 %	25 %	50 %	212223678
9609	NC_011529	GGA	2	6	485594	485599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223678
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9622	NC_011529	GAG	2	6	486057	486062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223678
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