MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus onnurineus NA1 chromosome

Total Repeats: 36505

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011529	GAA	2	6	25722	25727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223172
502	NC_011529	CGG	2	6	25761	25766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223172
503	NC_011529	CGA	2	6	25923	25928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223172
504	NC_011529	GAG	2	6	25984	25989	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223172
505	NC_011529	GAA	2	6	26043	26048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223172
506	NC_011529	AGA	2	6	26058	26063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223172
507	NC_011529	GAG	2	6	26092	26097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223172
508	NC_011529	AGG	3	9	26102	26110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223172
509	NC_011529	GAG	2	6	26116	26121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223172
510	NC_011529	ATT	2	6	26132	26137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212223172
511	NC_011529	ACT	2	6	26153	26158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223172
512	NC_011529	GGCG	2	8	26164	26171	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
513	NC_011529	AGG	2	6	26269	26274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223173
514	NC_011529	CCG	2	6	26437	26442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223173
515	NC_011529	AGG	2	6	26448	26453	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223173
516	NC_011529	GAG	2	6	26463	26468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223173
517	NC_011529	GGA	2	6	26561	26566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223173
518	NC_011529	CAT	2	6	26618	26623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223173
519	NC_011529	GAG	2	6	26745	26750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223173
520	NC_011529	CGG	2	6	26792	26797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223173
521	NC_011529	GAG	3	9	26802	26810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223173
522	NC_011529	AG	3	6	26864	26869	50 %	0 %	50 %	0 %	212223173
523	NC_011529	A	6	6	26896	26901	100 %	0 %	0 %	0 %	212223174
524	NC_011529	AGGGA	2	10	26969	26978	40 %	0 %	60 %	0 %	212223174
525	NC_011529	GAG	2	6	27173	27178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223174
526	NC_011529	GACT	2	8	27196	27203	25 %	25 %	25 %	25 %	212223174
527	NC_011529	ACC	2	6	27281	27286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212223174
528	NC_011529	G	7	7	27318	27324	0 %	0 %	100 %	0 %	212223174
529	NC_011529	GAT	2	6	27382	27387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223174
530	NC_011529	TCA	2	6	27393	27398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223174
531	NC_011529	TTG	2	6	27423	27428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223174
532	NC_011529	ATGG	2	8	27435	27442	25 %	25 %	50 %	0 %	212223174
533	NC_011529	AGG	2	6	27462	27467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223174
534	NC_011529	CA	4	8	27518	27525	50 %	0 %	0 %	50 %	212223174
535	NC_011529	GAG	2	6	27596	27601	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223174
536	NC_011529	ATG	2	6	27646	27651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223174
537	NC_011529	GAA	3	9	27689	27697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223175
538	NC_011529	AGAA	2	8	27706	27713	75 %	0 %	25 %	0 %	212223175
539	NC_011529	GAA	2	6	27753	27758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223175
540	NC_011529	TCC	2	6	27866	27871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223175
541	NC_011529	ACA	2	6	27881	27886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212223175
542	NC_011529	GGA	2	6	27903	27908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223175
543	NC_011529	AGG	2	6	27931	27936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223175
544	NC_011529	TAAG	2	8	27947	27954	50 %	25 %	25 %	0 %	212223175
545	NC_011529	TCA	2	6	27956	27961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223175
546	NC_011529	GC	3	6	27965	27970	0 %	0 %	50 %	50 %	212223175
547	NC_011529	CCG	2	6	28070	28075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223175
548	NC_011529	TCGC	2	8	28078	28085	0 %	25 %	25 %	50 %	212223175
549	NC_011529	TGC	2	6	28131	28136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223175
550	NC_011529	CTC	2	6	28243	28248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223175
551	NC_011529	AGC	2	6	28331	28336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223175
552	NC_011529	AGG	2	6	28373	28378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223175
553	NC_011529	GTGA	2	8	28388	28395	25 %	25 %	50 %	0 %	212223175
554	NC_011529	CTC	2	6	28439	28444	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223176
555	NC_011529	TCGC	2	8	28468	28475	0 %	25 %	25 %	50 %	212223176
556	NC_011529	GGA	2	6	28477	28482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223176
557	NC_011529	GATCAA	2	12	28498	28509	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	212223176
558	NC_011529	TAA	2	6	28623	28628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212223176
559	NC_011529	ACC	2	6	28678	28683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212223176
560	NC_011529	GTT	2	6	28712	28717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223176
561	NC_011529	GAGCG	2	10	28735	28744	20 %	0 %	60 %	20 %	212223176
562	NC_011529	GTC	2	6	28790	28795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223176
563	NC_011529	ACG	2	6	28821	28826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223176
564	NC_011529	CGC	2	6	28861	28866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223176
565	NC_011529	GGT	2	6	28891	28896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223176
566	NC_011529	ACG	2	6	28899	28904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223176
567	NC_011529	GCG	2	6	28911	28916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223176
568	NC_011529	CGA	2	6	28930	28935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223176
569	NC_011529	CGG	2	6	28990	28995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223176
570	NC_011529	CGA	2	6	29020	29025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223176
571	NC_011529	CAC	2	6	29056	29061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212223176
572	NC_011529	CGA	2	6	29062	29067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223176
573	NC_011529	ATC	2	6	29080	29085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223176
574	NC_011529	AGA	2	6	29091	29096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223176
575	NC_011529	T	7	7	29215	29221	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_011529	GGT	2	6	29237	29242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
577	NC_011529	GTC	2	6	29280	29285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223177
578	NC_011529	TAT	2	6	29300	29305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212223177
579	NC_011529	TTC	2	6	29310	29315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223177
580	NC_011529	CTT	2	6	29408	29413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223177
581	NC_011529	TCC	2	6	29470	29475	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223177
582	NC_011529	GAAG	2	8	29504	29511	50 %	0 %	50 %	0 %	212223177
583	NC_011529	G	6	6	29582	29587	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
584	NC_011529	AAG	2	6	29620	29625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223178
585	NC_011529	CCAC	2	8	29647	29654	25 %	0 %	0 %	75 %	212223178
586	NC_011529	AAG	2	6	29662	29667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223178
587	NC_011529	TGC	2	6	29673	29678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223178
588	NC_011529	GAG	2	6	29710	29715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223178
589	NC_011529	CAGGT	2	10	29746	29755	20 %	20 %	40 %	20 %	212223178
590	NC_011529	AAG	2	6	29761	29766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223178
591	NC_011529	TCG	2	6	29768	29773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223178
592	NC_011529	CGG	2	6	29916	29921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223178
593	NC_011529	TTC	2	6	30047	30052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_011529	GGT	2	6	30053	30058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
595	NC_011529	TGAG	2	8	30065	30072	25 %	25 %	50 %	0 %	212223179
596	NC_011529	AG	4	8	30071	30078	50 %	0 %	50 %	0 %	212223179
597	NC_011529	GA	3	6	30080	30085	50 %	0 %	50 %	0 %	212223179
598	NC_011529	GCG	2	6	30119	30124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223179
599	NC_011529	ATG	2	6	30235	30240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223179
600	NC_011529	GCC	2	6	30252	30257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223179
601	NC_011529	GGA	3	9	30279	30287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223179
602	NC_011529	CG	3	6	30302	30307	0 %	0 %	50 %	50 %	212223179
603	NC_011529	CGA	2	6	30339	30344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223179
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606	NC_011529	CGA	2	6	30465	30470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223179
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608	NC_011529	TGA	2	6	30489	30494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223179
609	NC_011529	AG	3	6	30520	30525	50 %	0 %	50 %	0 %	212223179
610	NC_011529	AGG	2	6	30614	30619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223179
611	NC_011529	AGG	2	6	30683	30688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223179
612	NC_011529	GAG	2	6	30720	30725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223180
613	NC_011529	TCT	2	6	30727	30732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223180
614	NC_011529	TCC	2	6	30817	30822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223180
615	NC_011529	AAGG	2	8	30843	30850	50 %	0 %	50 %	0 %	212223180
616	NC_011529	TTC	2	6	30904	30909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223180
617	NC_011529	CTC	2	6	31041	31046	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223180
618	NC_011529	CCT	2	6	31059	31064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223180
619	NC_011529	CG	3	6	31094	31099	0 %	0 %	50 %	50 %	212223180
620	NC_011529	GCTCT	2	10	31135	31144	0 %	40 %	20 %	40 %	212223180
621	NC_011529	TGG	2	6	31195	31200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223180
622	NC_011529	A	6	6	31253	31258	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_011529	CAT	2	6	31277	31282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223181
624	NC_011529	GCC	2	6	31287	31292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223181
625	NC_011529	TCAC	2	8	31302	31309	25 %	25 %	0 %	50 %	212223181
626	NC_011529	GAG	2	6	31367	31372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223181
627	NC_011529	TTC	2	6	31425	31430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223181
628	NC_011529	TCC	2	6	31456	31461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223181
629	NC_011529	CGA	2	6	31477	31482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223181
630	NC_011529	TC	3	6	31519	31524	0 %	50 %	0 %	50 %	212223181
631	NC_011529	CGA	2	6	31537	31542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223181
632	NC_011529	GGA	2	6	31594	31599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223181
633	NC_011529	AT	3	6	31630	31635	50 %	50 %	0 %	0 %	212223181
634	NC_011529	CGC	2	6	31636	31641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223181
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643	NC_011529	TC	3	6	31932	31937	0 %	50 %	0 %	50 %	212223181
644	NC_011529	TCGT	2	8	31971	31978	0 %	50 %	25 %	25 %	212223181
645	NC_011529	CCT	2	6	32017	32022	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223181
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650	NC_011529	AGA	2	6	32301	32306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
651	NC_011529	GCT	2	6	32389	32394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223182
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654	NC_011529	TCC	2	6	32553	32558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223182
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755	NC_011529	AGC	2	6	36912	36917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
756	NC_011529	CAC	2	6	36977	36982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212223187
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