MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus onnurineus NA1 chromosome

Total Repeats: 36505

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_011529	TGG	2	6	454809	454814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223641
9002	NC_011529	CTC	2	6	454815	454820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223641
9003	NC_011529	TCC	2	6	454828	454833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223641
9004	NC_011529	TGAA	2	8	454853	454860	50 %	25 %	25 %	0 %	212223641
9005	NC_011529	AGC	2	6	454895	454900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223641
9006	NC_011529	TC	3	6	454945	454950	0 %	50 %	0 %	50 %	212223641
9007	NC_011529	CTT	2	6	454951	454956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223641
9008	NC_011529	TCT	2	6	454957	454962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223641
9009	NC_011529	GAC	3	9	455041	455049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223641
9010	NC_011529	CTG	2	6	455077	455082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223641
9011	NC_011529	CGA	2	6	455109	455114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223641
9012	NC_011529	AGCC	2	8	455155	455162	25 %	0 %	25 %	50 %	212223641
9013	NC_011529	ATG	2	6	455171	455176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223641
9014	NC_011529	ATT	2	6	455186	455191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212223641
9015	NC_011529	GC	3	6	455198	455203	0 %	0 %	50 %	50 %	212223641
9016	NC_011529	CACC	2	8	455217	455224	25 %	0 %	0 %	75 %	212223642
9017	NC_011529	TCT	2	6	455236	455241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223642
9018	NC_011529	TCC	2	6	455242	455247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223642
9019	NC_011529	GCA	2	6	455302	455307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223642
9020	NC_011529	TGC	2	6	455313	455318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223642
9021	NC_011529	GAA	3	9	455349	455357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223642
9022	NC_011529	CAG	2	6	455358	455363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223642
9023	NC_011529	CGG	2	6	455396	455401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223642
9024	NC_011529	CAC	2	6	455497	455502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212223643
9025	NC_011529	TCA	2	6	455514	455519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223643
9026	NC_011529	TTC	2	6	455522	455527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223643
9027	NC_011529	CGA	2	6	455578	455583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223643
9028	NC_011529	TGC	2	6	455584	455589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223643
9029	NC_011529	AGG	2	6	455661	455666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223643
9030	NC_011529	TGT	2	6	455797	455802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223643
9031	NC_011529	AGA	2	6	455845	455850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223643
9032	NC_011529	CAG	2	6	455858	455863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223643
9033	NC_011529	CCTC	2	8	455903	455910	0 %	25 %	0 %	75 %	212223644
9034	NC_011529	GC	3	6	455917	455922	0 %	0 %	50 %	50 %	212223644
9035	NC_011529	GTA	2	6	455992	455997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223644
9036	NC_011529	GGT	2	6	456022	456027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223644
9037	NC_011529	GAG	2	6	456100	456105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223644
9038	NC_011529	GCTATC	2	12	456110	456121	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	212223644
9039	NC_011529	ATC	2	6	456146	456151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223644
9040	NC_011529	ATC	2	6	456216	456221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223645
9041	NC_011529	CAA	2	6	456350	456355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212223645
9042	NC_011529	GAA	2	6	456383	456388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223645
9043	NC_011529	TGG	2	6	456494	456499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223645
9044	NC_011529	CGA	2	6	456524	456529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223645
9045	NC_011529	CTTG	2	8	456636	456643	0 %	50 %	25 %	25 %	212223645
9046	NC_011529	GAA	2	6	456748	456753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9047	NC_011529	ATG	2	6	456801	456806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9048	NC_011529	AAG	2	6	456809	456814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9049	NC_011529	TCAA	2	8	456897	456904	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9050	NC_011529	AG	3	6	456919	456924	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9051	NC_011529	TGA	2	6	457005	457010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223646
9052	NC_011529	AAT	2	6	457060	457065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212223646
9053	NC_011529	TCT	2	6	457086	457091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223646
9054	NC_011529	CTCGG	2	10	457121	457130	0 %	20 %	40 %	40 %	212223646
9055	NC_011529	GAC	2	6	457255	457260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223646
9056	NC_011529	GTC	2	6	457333	457338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223646
9057	NC_011529	TCA	2	6	457397	457402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223646
9058	NC_011529	ATCA	2	8	457430	457437	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9059	NC_011529	AAT	2	6	457471	457476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9060	NC_011529	ATG	2	6	457499	457504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9061	NC_011529	CAT	2	6	457555	457560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9062	NC_011529	T	6	6	457569	457574	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9063	NC_011529	CGA	2	6	457581	457586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9065	NC_011529	ATT	2	6	457800	457805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212223647
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9074	NC_011529	ACTCC	2	10	458305	458314	20 %	20 %	0 %	60 %	212223647
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9082	NC_011529	TGA	2	6	458914	458919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9084	NC_011529	TTTA	2	8	458976	458983	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9085	NC_011529	GTT	3	9	459092	459100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9086	NC_011529	ATG	2	6	459155	459160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9090	NC_011529	TC	3	6	459356	459361	0 %	50 %	0 %	50 %	212223648
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9094	NC_011529	CTC	2	6	459650	459655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223648
9095	NC_011529	GAG	2	6	459719	459724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223648
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9118	NC_011529	CTTC	2	8	460758	460765	0 %	50 %	0 %	50 %	212223649
9119	NC_011529	GGCA	2	8	460796	460803	25 %	0 %	50 %	25 %	212223649
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9121	NC_011529	GGGT	2	8	460847	460854	0 %	25 %	75 %	0 %	212223649
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9123	NC_011529	CT	3	6	461120	461125	0 %	50 %	0 %	50 %	212223649
9124	NC_011529	TCC	2	6	461147	461152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223649
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9232	NC_011529	CTA	2	6	466168	466173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223654
9233	NC_011529	ACT	2	6	466206	466211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223654
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9238	NC_011529	TTCGG	2	10	466607	466616	0 %	40 %	40 %	20 %	212223654
9239	NC_011529	ATC	2	6	466679	466684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223654
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9243	NC_011529	CTG	2	6	466789	466794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223655
9244	NC_011529	CT	3	6	466838	466843	0 %	50 %	0 %	50 %	212223655
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