MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus onnurineus NA1 chromosome

Total Repeats: 36505

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_011529	GGA	2	6	428922	428927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8502	NC_011529	GAG	2	6	428949	428954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223608
8503	NC_011529	GCCTCG	2	12	429004	429015	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	212223608
8504	NC_011529	TGG	2	6	429052	429057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223608
8505	NC_011529	GA	3	6	429071	429076	50 %	0 %	50 %	0 %	212223608
8506	NC_011529	TCA	2	6	429100	429105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223608
8507	NC_011529	GGGAA	2	10	429123	429132	40 %	0 %	60 %	0 %	212223608
8508	NC_011529	TCC	2	6	429133	429138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223608
8509	NC_011529	CCG	2	6	429244	429249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223608
8510	NC_011529	AAG	2	6	429255	429260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223608
8511	NC_011529	AGG	2	6	429285	429290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223608
8512	NC_011529	GAG	2	6	429312	429317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223608
8513	NC_011529	ATA	2	6	429408	429413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212223608
8514	NC_011529	GAC	2	6	429429	429434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223608
8515	NC_011529	AGG	3	9	429556	429564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223608
8516	NC_011529	CTT	2	6	429572	429577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223608
8517	NC_011529	CGA	2	6	429719	429724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223608
8518	NC_011529	AG	3	6	429729	429734	50 %	0 %	50 %	0 %	212223608
8519	NC_011529	CGA	2	6	429740	429745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223608
8520	NC_011529	AAG	2	6	429753	429758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223608
8521	NC_011529	GGCAA	2	10	429771	429780	40 %	0 %	40 %	20 %	212223608
8522	NC_011529	CGA	2	6	429806	429811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223608
8523	NC_011529	GATACT	2	12	429878	429889	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	212223608
8524	NC_011529	GCT	2	6	429971	429976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223608
8525	NC_011529	GAAGA	2	10	430041	430050	60 %	0 %	40 %	0 %	212223608
8526	NC_011529	GAG	2	6	430062	430067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223608
8527	NC_011529	CGG	2	6	430091	430096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223608
8528	NC_011529	GCT	2	6	430124	430129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223608
8529	NC_011529	TCG	2	6	430228	430233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223608
8530	NC_011529	GGAA	2	8	430241	430248	50 %	0 %	50 %	0 %	212223608
8531	NC_011529	TCT	2	6	430267	430272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223609
8532	NC_011529	ATT	2	6	430283	430288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212223609
8533	NC_011529	CGA	2	6	430425	430430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223609
8534	NC_011529	GCG	2	6	430442	430447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223609
8535	NC_011529	CCG	2	6	430572	430577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223609
8536	NC_011529	TCG	2	6	430607	430612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223609
8537	NC_011529	TCG	2	6	430640	430645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223609
8538	NC_011529	TTG	2	6	430646	430651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223609
8539	NC_011529	CTT	2	6	430741	430746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223609
8540	NC_011529	CGA	2	6	430872	430877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223609
8541	NC_011529	GGT	2	6	430920	430925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223609
8542	NC_011529	AGA	2	6	430926	430931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223609
8543	NC_011529	TGT	2	6	431007	431012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223609
8544	NC_011529	TGA	2	6	431217	431222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223609
8545	NC_011529	ATT	2	6	431246	431251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212223609
8546	NC_011529	ATC	2	6	431313	431318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223610
8547	NC_011529	CAG	2	6	431348	431353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223610
8548	NC_011529	ACT	2	6	431397	431402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223610
8549	NC_011529	CCTT	2	8	431419	431426	0 %	50 %	0 %	50 %	212223610
8550	NC_011529	CTT	2	6	431492	431497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223610
8551	NC_011529	TGT	2	6	431515	431520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223610
8552	NC_011529	ACG	2	6	431529	431534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223610
8553	NC_011529	TCC	2	6	431619	431624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223610
8554	NC_011529	ACG	2	6	431664	431669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223610
8555	NC_011529	TAG	2	6	431673	431678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223610
8556	NC_011529	TCC	2	6	431814	431819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223611
8557	NC_011529	GGA	2	6	431859	431864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223611
8558	NC_011529	GAG	2	6	431962	431967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223611
8559	NC_011529	CTT	2	6	431989	431994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223611
8560	NC_011529	AGA	2	6	432021	432026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223611
8561	NC_011529	TAG	2	6	432104	432109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223611
8562	NC_011529	GTC	2	6	432346	432351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223612
8563	NC_011529	CCT	2	6	432399	432404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223612
8564	NC_011529	CTT	2	6	432414	432419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223612
8565	NC_011529	TCT	2	6	432450	432455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223612
8566	NC_011529	ATG	2	6	432491	432496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223612
8567	NC_011529	AAC	2	6	432619	432624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212223612
8568	NC_011529	TC	4	8	432644	432651	0 %	50 %	0 %	50 %	212223612
8569	NC_011529	TGC	2	6	432823	432828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223613
8570	NC_011529	GGTG	2	8	432837	432844	0 %	25 %	75 %	0 %	212223613
8571	NC_011529	CCA	2	6	433015	433020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212223613
8572	NC_011529	CGT	2	6	433047	433052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223613
8573	NC_011529	CAC	2	6	433119	433124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212223614
8574	NC_011529	GAA	2	6	433248	433253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8575	NC_011529	CAC	2	6	433280	433285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212223615
8576	NC_011529	TAT	2	6	433346	433351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212223615
8577	NC_011529	AT	3	6	433358	433363	50 %	50 %	0 %	0 %	212223615
8578	NC_011529	CAG	2	6	433367	433372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223615
8579	NC_011529	T	6	6	433424	433429	0 %	100 %	0 %	0 %	212223615
8580	NC_011529	CAG	2	6	433469	433474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223615
8581	NC_011529	TAT	2	6	433493	433498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212223615
8582	NC_011529	A	6	6	433546	433551	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8583	NC_011529	TCA	2	6	433660	433665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223616
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8585	NC_011529	CTT	2	6	434003	434008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223616
8586	NC_011529	CAA	2	6	434024	434029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212223616
8587	NC_011529	GGA	2	6	434105	434110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8588	NC_011529	GAG	2	6	434174	434179	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223617
8589	NC_011529	TCC	2	6	434200	434205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223617
8590	NC_011529	GCT	2	6	434216	434221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223617
8591	NC_011529	AGAT	2	8	434245	434252	50 %	25 %	25 %	0 %	212223617
8592	NC_011529	CAAA	2	8	434254	434261	75 %	0 %	0 %	25 %	212223617
8593	NC_011529	GAG	2	6	434376	434381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223617
8594	NC_011529	ATA	2	6	434511	434516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212223617
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8596	NC_011529	TTG	2	6	434551	434556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223617
8597	NC_011529	CAT	2	6	434570	434575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223617
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8599	NC_011529	CACAAG	2	12	434693	434704	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	212223617
8600	NC_011529	AAC	2	6	434709	434714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212223617
8601	NC_011529	AAT	2	6	434735	434740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212223617
8602	NC_011529	GAG	2	6	434774	434779	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223617
8603	NC_011529	GAG	2	6	434854	434859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223618
8604	NC_011529	ATC	2	6	434879	434884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223618
8605	NC_011529	CTA	2	6	434885	434890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223618
8606	NC_011529	CTC	2	6	435014	435019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223618
8607	NC_011529	AG	3	6	435035	435040	50 %	0 %	50 %	0 %	212223618
8608	NC_011529	GGA	2	6	435048	435053	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223618
8609	NC_011529	TCAT	2	8	435074	435081	25 %	50 %	0 %	25 %	212223618
8610	NC_011529	TCT	2	6	435106	435111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223618
8611	NC_011529	GCC	2	6	435138	435143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223618
8612	NC_011529	CT	3	6	435147	435152	0 %	50 %	0 %	50 %	212223618
8613	NC_011529	GAA	2	6	435247	435252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223618
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8616	NC_011529	TCCT	2	8	435318	435325	0 %	50 %	0 %	50 %	212223618
8617	NC_011529	ATA	2	6	435356	435361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212223618
8618	NC_011529	CGCT	2	8	435381	435388	0 %	25 %	25 %	50 %	212223618
8619	NC_011529	TGG	2	6	435432	435437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223618
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8987	NC_011529	TGA	2	6	454121	454126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223639
8988	NC_011529	GAGCA	2	10	454140	454149	40 %	0 %	40 %	20 %	212223639
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8990	NC_011529	GGT	2	6	454247	454252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223640
8991	NC_011529	TGA	2	6	454372	454377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223640
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