MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus onnurineus NA1 chromosome

Total Repeats: 36505

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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8003	NC_011529	TGT	2	6	403228	403233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223577
8004	NC_011529	AG	3	6	403282	403287	50 %	0 %	50 %	0 %	212223577
8005	NC_011529	ATA	2	6	403292	403297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212223577
8006	NC_011529	AAG	2	6	403323	403328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223577
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8008	NC_011529	ATA	2	6	403412	403417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212223577
8009	NC_011529	GAA	2	6	403429	403434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223577
8010	NC_011529	GGA	2	6	403456	403461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223577
8011	NC_011529	AAG	2	6	403484	403489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223577
8012	NC_011529	AG	3	6	403615	403620	50 %	0 %	50 %	0 %	212223577
8013	NC_011529	ATG	2	6	403625	403630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223577
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8015	NC_011529	TGGGAC	2	12	403673	403684	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	212223577
8016	NC_011529	CAAGCT	2	12	403717	403728	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	212223577
8017	NC_011529	A	7	7	403882	403888	100 %	0 %	0 %	0 %	212223577
8018	NC_011529	GAGG	2	8	403891	403898	25 %	0 %	75 %	0 %	212223577
8019	NC_011529	AG	4	8	403928	403935	50 %	0 %	50 %	0 %	212223577
8020	NC_011529	ATA	2	6	403966	403971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212223577
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8023	NC_011529	TGA	2	6	404126	404131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223578
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8042	NC_011529	GCCTT	2	10	405358	405367	0 %	40 %	20 %	40 %	212223580
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8243	NC_011529	GA	3	6	414740	414745	50 %	0 %	50 %	0 %	212223589
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8370	NC_011529	TCG	2	6	422065	422070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223596
8371	NC_011529	TCC	2	6	422143	422148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223596
8372	NC_011529	CTC	2	6	422188	422193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223596
8373	NC_011529	GGT	2	6	422198	422203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223596
8374	NC_011529	TAT	2	6	422217	422222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212223596
8375	NC_011529	GCT	2	6	422255	422260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223596
8376	NC_011529	GCT	2	6	422304	422309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223596
8377	NC_011529	ACC	2	6	422326	422331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8378	NC_011529	AGAGA	2	10	422341	422350	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
8379	NC_011529	CGG	2	6	422356	422361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223597
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8382	NC_011529	CTC	2	6	422480	422485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223597
8383	NC_011529	GCCTTG	2	12	422490	422501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223597
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8386	NC_011529	CTT	2	6	422579	422584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223597
8387	NC_011529	CTG	2	6	422618	422623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223597
8388	NC_011529	GAGCTG	2	12	422630	422641	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	212223597
8389	NC_011529	CTG	3	9	422639	422647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223597
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8392	NC_011529	GAG	2	6	422879	422884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223598
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8400	NC_011529	TGTAT	2	10	423175	423184	20 %	60 %	20 %	0 %	212223599
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8402	NC_011529	GGT	2	6	423295	423300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223599
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8413	NC_011529	CTGGGC	2	12	423711	423722	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	212223600
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8427	NC_011529	GTC	2	6	424569	424574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8459	NC_011529	TGG	2	6	426891	426896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223606
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8471	NC_011529	CAA	2	6	427219	427224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212223606
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8479	NC_011529	GCA	2	6	427659	427664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223606
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8481	NC_011529	TCT	2	6	427758	427763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223606
8482	NC_011529	GGAA	2	8	427886	427893	50 %	0 %	50 %	0 %	212223606
8483	NC_011529	GC	3	6	427898	427903	0 %	0 %	50 %	50 %	212223606
8484	NC_011529	GA	3	6	427916	427921	50 %	0 %	50 %	0 %	212223606
8485	NC_011529	GCGGA	2	10	427943	427952	20 %	0 %	60 %	20 %	212223607
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8489	NC_011529	GAGTT	2	10	428225	428234	20 %	40 %	40 %	0 %	212223607
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8493	NC_011529	GCT	2	6	428403	428408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223607
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8496	NC_011529	CTC	2	6	428623	428628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223607
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8500	NC_011529	CGG	2	6	428905	428910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

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