MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus onnurineus NA1 chromosome

Total Repeats: 36505

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_011529	TA	3	6	378729	378734	50 %	50 %	0 %	0 %	212223552
7502	NC_011529	TGAT	2	8	378766	378773	25 %	50 %	25 %	0 %	212223552
7503	NC_011529	AGG	2	6	378798	378803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223552
7504	NC_011529	AAG	2	6	378825	378830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223552
7505	NC_011529	GAG	3	9	378833	378841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223552
7506	NC_011529	TCC	2	6	378865	378870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223552
7507	NC_011529	GTT	2	6	378966	378971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223552
7508	NC_011529	CGG	2	6	379010	379015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223552
7509	NC_011529	CTT	2	6	379028	379033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223552
7510	NC_011529	AGGA	2	8	379078	379085	50 %	0 %	50 %	0 %	212223553
7511	NC_011529	GAG	2	6	379094	379099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223553
7512	NC_011529	CTC	2	6	379130	379135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223553
7513	NC_011529	GGA	2	6	379159	379164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223553
7514	NC_011529	GGA	2	6	379171	379176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223553
7515	NC_011529	CGA	2	6	379291	379296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223553
7516	NC_011529	AGA	2	6	379330	379335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223553
7517	NC_011529	GAG	2	6	379397	379402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223553
7518	NC_011529	ATA	2	6	379403	379408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212223553
7519	NC_011529	CTC	2	6	379412	379417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223553
7520	NC_011529	GAC	2	6	379418	379423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223553
7521	NC_011529	CTTT	2	8	379439	379446	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7522	NC_011529	GA	3	6	379497	379502	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7523	NC_011529	AGA	2	6	379548	379553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223554
7524	NC_011529	GAG	2	6	379571	379576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223554
7525	NC_011529	GGA	2	6	379702	379707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223554
7526	NC_011529	CAA	2	6	379768	379773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212223554
7527	NC_011529	GAT	2	6	379787	379792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223554
7528	NC_011529	TGT	2	6	379825	379830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223554
7529	NC_011529	TTC	2	6	379871	379876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223554
7530	NC_011529	CCG	2	6	379886	379891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223554
7531	NC_011529	CTT	2	6	379919	379924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223554
7532	NC_011529	AAG	2	6	379937	379942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223554
7533	NC_011529	AAG	2	6	379970	379975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223554
7534	NC_011529	GAT	2	6	380038	380043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223554
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7536	NC_011529	GAAGG	2	10	380069	380078	40 %	0 %	60 %	0 %	212223554
7537	NC_011529	AGG	2	6	380105	380110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223554
7538	NC_011529	TC	3	6	380140	380145	0 %	50 %	0 %	50 %	212223555
7539	NC_011529	TAG	2	6	380198	380203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223555
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7541	NC_011529	GA	3	6	380215	380220	50 %	0 %	50 %	0 %	212223555
7542	NC_011529	TTG	2	6	380348	380353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223555
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7544	NC_011529	TCC	2	6	380467	380472	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223555
7545	NC_011529	TGG	2	6	380549	380554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223555
7546	NC_011529	ACT	2	6	380573	380578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223555
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7550	NC_011529	TGC	2	6	380769	380774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223555
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7553	NC_011529	A	6	6	380864	380869	100 %	0 %	0 %	0 %	212223555
7554	NC_011529	GAG	2	6	380890	380895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223555
7555	NC_011529	AAC	2	6	380926	380931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212223555
7556	NC_011529	ATC	2	6	380932	380937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223555
7557	NC_011529	AAG	2	6	380955	380960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7558	NC_011529	TTC	3	9	380977	380985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223556
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7561	NC_011529	TCG	2	6	381089	381094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223556
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7563	NC_011529	TAA	2	6	381246	381251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212223556
7564	NC_011529	TA	4	8	381318	381325	50 %	50 %	0 %	0 %	212223556
7565	NC_011529	GAA	2	6	381328	381333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223556
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7569	NC_011529	CTT	2	6	381411	381416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223556
7570	NC_011529	T	7	7	381474	381480	0 %	100 %	0 %	0 %	212223556
7571	NC_011529	TC	4	8	381490	381497	0 %	50 %	0 %	50 %	212223556
7572	NC_011529	TTTTG	2	10	381502	381511	0 %	80 %	20 %	0 %	212223556
7573	NC_011529	GGT	2	6	381520	381525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223556
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7575	NC_011529	GATT	2	8	381586	381593	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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7579	NC_011529	TA	3	6	381690	381695	50 %	50 %	0 %	0 %	212223557
7580	NC_011529	GGA	2	6	381976	381981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223557
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7586	NC_011529	GAAGTT	2	12	382345	382356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223557
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7588	NC_011529	CGT	2	6	382611	382616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223557
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7593	NC_011529	GA	3	6	382790	382795	50 %	0 %	50 %	0 %	212223557
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7597	NC_011529	CT	3	6	382904	382909	0 %	50 %	0 %	50 %	212223557
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7600	NC_011529	TACG	2	8	383070	383077	25 %	25 %	25 %	25 %	212223557
7601	NC_011529	CAGA	2	8	383079	383086	50 %	0 %	25 %	25 %	212223557
7602	NC_011529	AAG	2	6	383120	383125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223557
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7605	NC_011529	TCG	2	6	383436	383441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223558
7606	NC_011529	CTG	2	6	383506	383511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223558
7607	NC_011529	CAA	2	6	383527	383532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212223558
7608	NC_011529	GGT	2	6	383533	383538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223558
7609	NC_011529	TGT	2	6	383647	383652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223558
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7612	NC_011529	TGTAA	2	10	383870	383879	40 %	40 %	20 %	0 %	212223558
7613	NC_011529	G	7	7	383916	383922	0 %	0 %	100 %	0 %	212223558
7614	NC_011529	TGA	2	6	384034	384039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223558
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7616	NC_011529	TACAT	2	10	384063	384072	40 %	40 %	0 %	20 %	212223558
7617	NC_011529	GAG	2	6	384095	384100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223558
7618	NC_011529	AGA	2	6	384150	384155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7619	NC_011529	GA	3	6	384154	384159	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7620	NC_011529	GCA	2	6	384216	384221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223559
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7622	NC_011529	CGA	2	6	384250	384255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223559
7623	NC_011529	CGT	2	6	384262	384267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223559
7624	NC_011529	CCA	2	6	384270	384275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212223559
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7662	NC_011529	CCT	2	6	386048	386053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7663	NC_011529	TGT	2	6	386090	386095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7665	NC_011529	TA	4	8	386120	386127	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7666	NC_011529	TTAA	2	8	386196	386203	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7667	NC_011529	ATA	2	6	386232	386237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7740	NC_011529	TGT	2	6	390405	390410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223564
7741	NC_011529	GA	3	6	390425	390430	50 %	0 %	50 %	0 %	212223564
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