MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus onnurineus NA1 chromosome

Total Repeats: 36505

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_011529	GAG	2	6	351363	351368	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223523
7002	NC_011529	GAA	2	6	351464	351469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223524
7003	NC_011529	TAA	2	6	351472	351477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212223524
7004	NC_011529	GAT	2	6	351492	351497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223524
7005	NC_011529	AG	3	6	351498	351503	50 %	0 %	50 %	0 %	212223524
7006	NC_011529	AGG	2	6	351505	351510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223524
7007	NC_011529	AGG	2	6	351604	351609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223524
7008	NC_011529	CTC	2	6	351750	351755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223524
7009	NC_011529	CTC	2	6	351768	351773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223524
7010	NC_011529	GA	3	6	351775	351780	50 %	0 %	50 %	0 %	212223524
7011	NC_011529	GGA	2	6	351824	351829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223524
7012	NC_011529	AT	3	6	351871	351876	50 %	50 %	0 %	0 %	212223524
7013	NC_011529	GAC	2	6	351884	351889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223524
7014	NC_011529	CAGA	2	8	351890	351897	50 %	0 %	25 %	25 %	212223524
7015	NC_011529	GGT	2	6	351923	351928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223524
7016	NC_011529	ATCC	2	8	351940	351947	25 %	25 %	0 %	50 %	212223524
7017	NC_011529	GAA	2	6	352019	352024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223524
7018	NC_011529	TCA	2	6	352088	352093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223525
7019	NC_011529	GAG	2	6	352288	352293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223525
7020	NC_011529	GCG	2	6	352294	352299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223525
7021	NC_011529	AGA	2	6	352301	352306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223525
7022	NC_011529	TCC	2	6	352473	352478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223526
7023	NC_011529	CGGC	2	8	352541	352548	0 %	0 %	50 %	50 %	212223526
7024	NC_011529	CTATGC	2	12	352608	352619	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	212223526
7025	NC_011529	TTG	2	6	352715	352720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223526
7026	NC_011529	TAC	2	6	352756	352761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223526
7027	NC_011529	CCT	2	6	352842	352847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223526
7028	NC_011529	CAG	2	6	352925	352930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223526
7029	NC_011529	CTC	2	6	352957	352962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223526
7030	NC_011529	TTC	2	6	352963	352968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223526
7031	NC_011529	GA	3	6	352995	353000	50 %	0 %	50 %	0 %	212223526
7032	NC_011529	CCT	2	6	353049	353054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223526
7033	NC_011529	CTT	2	6	353086	353091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223526
7034	NC_011529	TTC	2	6	353128	353133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223526
7035	NC_011529	CTTT	2	8	353147	353154	0 %	75 %	0 %	25 %	212223526
7036	NC_011529	AGG	2	6	353205	353210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223526
7037	NC_011529	TTA	3	9	353477	353485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212223526
7038	NC_011529	CTTC	2	8	353570	353577	0 %	50 %	0 %	50 %	212223526
7039	NC_011529	TGG	2	6	353615	353620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223526
7040	NC_011529	CGA	2	6	353655	353660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223526
7041	NC_011529	GGGT	2	8	353767	353774	0 %	25 %	75 %	0 %	212223526
7042	NC_011529	TCG	2	6	354197	354202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223528
7043	NC_011529	CAG	2	6	354237	354242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223528
7044	NC_011529	GAA	2	6	354360	354365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223528
7045	NC_011529	GAG	2	6	354429	354434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223528
7046	NC_011529	CGA	2	6	354515	354520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223528
7047	NC_011529	CTG	2	6	354597	354602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223528
7048	NC_011529	TAG	2	6	354721	354726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223528
7049	NC_011529	CGC	2	6	354782	354787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223528
7050	NC_011529	CTT	2	6	354813	354818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223528
7051	NC_011529	CGA	3	9	354821	354829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223528
7052	NC_011529	ACC	2	6	354972	354977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7053	NC_011529	GTGA	2	8	355055	355062	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7054	NC_011529	TTC	2	6	355103	355108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223529
7055	NC_011529	GTT	2	6	355132	355137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223529
7056	NC_011529	ACC	2	6	355327	355332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212223529
7057	NC_011529	CGA	2	6	355362	355367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223529
7058	NC_011529	TAT	2	6	355383	355388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212223529
7059	NC_011529	CGT	2	6	355431	355436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223529
7060	NC_011529	AG	3	6	355446	355451	50 %	0 %	50 %	0 %	212223529
7061	NC_011529	AAG	2	6	355498	355503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223529
7062	NC_011529	CTA	2	6	355560	355565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223529
7063	NC_011529	GGA	2	6	355581	355586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223529
7064	NC_011529	CAG	2	6	355651	355656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223529
7065	NC_011529	GAA	2	6	355741	355746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223529
7066	NC_011529	ACTT	2	8	355777	355784	25 %	50 %	0 %	25 %	212223529
7067	NC_011529	TCC	2	6	355793	355798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223529
7068	NC_011529	AACC	2	8	355953	355960	50 %	0 %	0 %	50 %	212223529
7069	NC_011529	CTT	2	6	356026	356031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223529
7070	NC_011529	GAG	2	6	356092	356097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223530
7071	NC_011529	AGA	2	6	356173	356178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223530
7072	NC_011529	CTG	2	6	356182	356187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223530
7073	NC_011529	CAT	2	6	356190	356195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223530
7074	NC_011529	TTA	2	6	356446	356451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212223530
7075	NC_011529	GAA	2	6	356460	356465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223530
7076	NC_011529	CAAGC	2	10	356508	356517	40 %	0 %	20 %	40 %	212223530
7077	NC_011529	GA	3	6	356520	356525	50 %	0 %	50 %	0 %	212223530
7078	NC_011529	TGGA	2	8	356552	356559	25 %	25 %	50 %	0 %	212223530
7079	NC_011529	ATC	2	6	356642	356647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223531
7080	NC_011529	AAG	2	6	356698	356703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223531
7081	NC_011529	ATA	2	6	356768	356773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212223531
7082	NC_011529	GCTTT	2	10	356775	356784	0 %	60 %	20 %	20 %	212223531
7083	NC_011529	ATGA	2	8	356789	356796	50 %	25 %	25 %	0 %	212223531
7084	NC_011529	CTCG	2	8	356806	356813	0 %	25 %	25 %	50 %	212223531
7085	NC_011529	CTT	2	6	356830	356835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223531
7086	NC_011529	CTC	2	6	356843	356848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223531
7087	NC_011529	GAG	2	6	356918	356923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223531
7088	NC_011529	CT	4	8	356957	356964	0 %	50 %	0 %	50 %	212223531
7089	NC_011529	CT	3	6	357037	357042	0 %	50 %	0 %	50 %	212223531
7090	NC_011529	CTT	2	6	357077	357082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223531
7091	NC_011529	CCT	2	6	357109	357114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223531
7092	NC_011529	TGGC	2	8	357118	357125	0 %	25 %	50 %	25 %	212223531
7093	NC_011529	TGC	3	9	357154	357162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223531
7094	NC_011529	GTG	2	6	357195	357200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223531
7095	NC_011529	CTC	2	6	357236	357241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223531
7096	NC_011529	GGT	2	6	357259	357264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223531
7097	NC_011529	TCA	2	6	357288	357293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223531
7098	NC_011529	CGC	2	6	357351	357356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223531
7099	NC_011529	GA	3	6	357395	357400	50 %	0 %	50 %	0 %	212223531
7100	NC_011529	TCG	2	6	357459	357464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223531
7101	NC_011529	CAT	2	6	357466	357471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223531
7102	NC_011529	CCT	2	6	357493	357498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223531
7103	NC_011529	GGA	2	6	357511	357516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223531
7104	NC_011529	AAG	2	6	357522	357527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223531
7105	NC_011529	TTTC	2	8	357584	357591	0 %	75 %	0 %	25 %	212223532
7106	NC_011529	GT	3	6	357597	357602	0 %	50 %	50 %	0 %	212223532
7107	NC_011529	GCC	2	6	357643	357648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223532
7108	NC_011529	GGC	2	6	357796	357801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223532
7109	NC_011529	CTC	2	6	357879	357884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223532
7110	NC_011529	CGT	2	6	358013	358018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223532
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7112	NC_011529	TGG	2	6	358067	358072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223532
7113	NC_011529	CT	3	6	358101	358106	0 %	50 %	0 %	50 %	212223532
7114	NC_011529	CTT	2	6	358132	358137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223532
7115	NC_011529	CTCC	2	8	358211	358218	0 %	25 %	0 %	75 %	212223532
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7117	NC_011529	TTC	2	6	358251	358256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223532
7118	NC_011529	TGA	2	6	358301	358306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223532
7119	NC_011529	C	6	6	358479	358484	0 %	0 %	0 %	100 %	212223533
7120	NC_011529	GAG	2	6	358556	358561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223533
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7122	NC_011529	CCA	2	6	358603	358608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212223533
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7244	NC_011529	CTT	2	6	365375	365380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223540
7245	NC_011529	TTC	2	6	365426	365431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223540
7246	NC_011529	GTA	2	6	365475	365480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223540
7247	NC_011529	TGA	2	6	365492	365497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223540
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7249	NC_011529	TCA	2	6	365608	365613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223540
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7257	NC_011529	TAA	2	6	366096	366101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7260	NC_011529	TGG	2	6	366233	366238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7261	NC_011529	TCA	2	6	366279	366284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7315	NC_011529	GCT	2	6	368843	368848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223542
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7320	NC_011529	CTT	2	6	369107	369112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223542
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7331	NC_011529	CTT	2	6	369635	369640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223543
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7354	NC_011529	TAGC	2	8	371634	371641	25 %	25 %	25 %	25 %	212223545
7355	NC_011529	AAG	2	6	371687	371692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223545
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7358	NC_011529	GGAA	2	8	371789	371796	50 %	0 %	50 %	0 %	212223545
7359	NC_011529	CGT	2	6	371815	371820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223545
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7364	NC_011529	ACA	2	6	371972	371977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212223545
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