MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus onnurineus NA1 chromosome

Total Repeats: 36505

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_011529	GAA	2	6	325888	325893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223497
6502	NC_011529	ATC	2	6	325913	325918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223497
6503	NC_011529	TTC	2	6	325924	325929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223497
6504	NC_011529	ACC	2	6	325968	325973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212223497
6505	NC_011529	TGT	3	9	325985	325993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223497
6506	NC_011529	GTA	2	6	326009	326014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223497
6507	NC_011529	TC	3	6	326039	326044	0 %	50 %	0 %	50 %	212223497
6508	NC_011529	TGG	2	6	326073	326078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223497
6509	NC_011529	GAA	2	6	326165	326170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223497
6510	NC_011529	CAG	3	9	326195	326203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223497
6511	NC_011529	CTT	2	6	326293	326298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6512	NC_011529	CAA	2	6	326330	326335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6513	NC_011529	CAAC	2	8	326357	326364	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6514	NC_011529	CGG	2	6	326412	326417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223498
6515	NC_011529	GAC	2	6	326490	326495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223498
6516	NC_011529	ACG	2	6	326525	326530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223498
6517	NC_011529	GACCTC	2	12	326593	326604	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	212223498
6518	NC_011529	CTT	2	6	326619	326624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223498
6519	NC_011529	CAC	2	6	326655	326660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212223498
6520	NC_011529	AGA	2	6	326695	326700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223498
6521	NC_011529	GTC	3	9	326791	326799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223498
6522	NC_011529	GGC	2	6	326850	326855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223498
6523	NC_011529	AGA	2	6	326942	326947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223498
6524	NC_011529	GAG	2	6	327034	327039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223498
6525	NC_011529	AGG	2	6	327046	327051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223498
6526	NC_011529	ACG	2	6	327101	327106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223498
6527	NC_011529	AGG	2	6	327143	327148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223498
6528	NC_011529	TGG	2	6	327221	327226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223498
6529	NC_011529	GTCAAG	2	12	327346	327357	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	212223498
6530	NC_011529	AGA	2	6	327375	327380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223498
6531	NC_011529	ATA	2	6	327424	327429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212223498
6532	NC_011529	GAT	2	6	327468	327473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223498
6533	NC_011529	CGT	2	6	327618	327623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223498
6534	NC_011529	CGG	2	6	327660	327665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223498
6535	NC_011529	CACAGG	2	12	327754	327765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223498
6536	NC_011529	GCG	2	6	327821	327826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223498
6537	NC_011529	GAC	2	6	327835	327840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223498
6538	NC_011529	GAG	2	6	327843	327848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223498
6539	NC_011529	AGC	2	6	327960	327965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223498
6540	NC_011529	AAAAG	2	10	327966	327975	80 %	0 %	20 %	0 %	212223498
6541	NC_011529	TCA	2	6	328018	328023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223499
6542	NC_011529	T	6	6	328026	328031	0 %	100 %	0 %	0 %	212223499
6543	NC_011529	CCG	2	6	328072	328077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223499
6544	NC_011529	GAA	2	6	328086	328091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223499
6545	NC_011529	ATG	2	6	328192	328197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223499
6546	NC_011529	CAG	2	6	328221	328226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223499
6547	NC_011529	GGC	2	6	328284	328289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223499
6548	NC_011529	GGA	2	6	328406	328411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223499
6549	NC_011529	ATG	2	6	328618	328623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223499
6550	NC_011529	ATC	2	6	328630	328635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223499
6551	NC_011529	TCAA	2	8	328651	328658	50 %	25 %	0 %	25 %	212223499
6552	NC_011529	CATCT	2	10	328665	328674	20 %	40 %	0 %	40 %	212223499
6553	NC_011529	TGGA	2	8	328720	328727	25 %	25 %	50 %	0 %	212223499
6554	NC_011529	CAG	2	6	328776	328781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223499
6555	NC_011529	TTG	2	6	328825	328830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223499
6556	NC_011529	ACC	3	9	328878	328886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6557	NC_011529	A	6	6	328913	328918	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6558	NC_011529	TTC	2	6	328919	328924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6559	NC_011529	GAA	2	6	329057	329062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223500
6560	NC_011529	AGA	3	9	329122	329130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223500
6561	NC_011529	CGG	2	6	329144	329149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223500
6562	NC_011529	GGCAAG	2	12	329202	329213	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	212223500
6563	NC_011529	AGG	2	6	329265	329270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223500
6564	NC_011529	CAT	2	6	329273	329278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223500
6565	NC_011529	CAT	2	6	329291	329296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223500
6566	NC_011529	CAG	2	6	329327	329332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223500
6567	NC_011529	CGT	2	6	329348	329353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223500
6568	NC_011529	TCA	2	6	329365	329370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223500
6569	NC_011529	AGG	2	6	329371	329376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223500
6570	NC_011529	CTT	2	6	329394	329399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6571	NC_011529	TATGG	2	10	329484	329493	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
6572	NC_011529	GAAT	2	8	329525	329532	50 %	25 %	25 %	0 %	212223501
6573	NC_011529	TCC	2	6	329575	329580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223501
6574	NC_011529	TTC	2	6	329599	329604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223501
6575	NC_011529	CTC	2	6	329673	329678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223501
6576	NC_011529	CTGA	2	8	329748	329755	25 %	25 %	25 %	25 %	212223501
6577	NC_011529	GAG	2	6	329784	329789	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223501
6578	NC_011529	GGA	2	6	329822	329827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223501
6579	NC_011529	GGC	2	6	329888	329893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223501
6580	NC_011529	CAG	2	6	329919	329924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223501
6581	NC_011529	TGG	2	6	329926	329931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223501
6582	NC_011529	CTC	2	6	330027	330032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223501
6583	NC_011529	CTG	2	6	330120	330125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223501
6584	NC_011529	GAT	2	6	330167	330172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223501
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6586	NC_011529	CTA	2	6	330215	330220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223501
6587	NC_011529	AGGA	2	8	330225	330232	50 %	0 %	50 %	0 %	212223501
6588	NC_011529	GCG	2	6	330409	330414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223501
6589	NC_011529	AG	3	6	330437	330442	50 %	0 %	50 %	0 %	212223501
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6594	NC_011529	TCT	2	6	330628	330633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223502
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6599	NC_011529	AT	3	6	330760	330765	50 %	50 %	0 %	0 %	212223502
6600	NC_011529	TGCC	2	8	330803	330810	0 %	25 %	25 %	50 %	212223502
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6605	NC_011529	AGCG	2	8	331236	331243	25 %	0 %	50 %	25 %	212223502
6606	NC_011529	CTC	2	6	331379	331384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223502
6607	NC_011529	GGC	2	6	331433	331438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223502
6608	NC_011529	CAG	2	6	331477	331482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223502
6609	NC_011529	TCT	2	6	331498	331503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223502
6610	NC_011529	TTC	2	6	331512	331517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223502
6611	NC_011529	TC	4	8	331519	331526	0 %	50 %	0 %	50 %	212223502
6612	NC_011529	TC	3	6	331538	331543	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6613	NC_011529	GGT	2	6	331546	331551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6614	NC_011529	TCA	2	6	331715	331720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223503
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6617	NC_011529	GTC	2	6	331882	331887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223503
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6620	NC_011529	TC	3	6	331954	331959	0 %	50 %	0 %	50 %	212223503
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6622	NC_011529	TG	3	6	332076	332081	0 %	50 %	50 %	0 %	212223503
6623	NC_011529	TTC	2	6	332094	332099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223503
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6625	NC_011529	TGA	2	6	332196	332201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223503
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6743	NC_011529	TCGT	2	8	338433	338440	0 %	50 %	25 %	25 %	212223509
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6989	NC_011529	TCT	2	6	350649	350654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223522
6990	NC_011529	CTC	2	6	350656	350661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223522
6991	NC_011529	ACC	3	9	350748	350756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6992	NC_011529	A	6	6	350826	350831	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6993	NC_011529	AAAG	2	8	350871	350878	75 %	0 %	25 %	0 %	212223523
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6999	NC_011529	AG	3	6	351216	351221	50 %	0 %	50 %	0 %	212223523
7000	NC_011529	TA	3	6	351324	351329	50 %	50 %	0 %	0 %	212223523

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