MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus onnurineus NA1 chromosome

Total Repeats: 36505

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_011529	GCT	2	6	271984	271989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223451
5502	NC_011529	CCA	2	6	271990	271995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212223451
5503	NC_011529	TCT	2	6	272012	272017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223451
5504	NC_011529	A	6	6	272056	272061	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_011529	CTT	2	6	272087	272092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223452
5506	NC_011529	CCA	2	6	272122	272127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212223452
5507	NC_011529	CCCT	2	8	272274	272281	0 %	25 %	0 %	75 %	212223452
5508	NC_011529	CCG	2	6	272505	272510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223452
5509	NC_011529	TCC	2	6	272580	272585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223452
5510	NC_011529	TGAA	2	8	272601	272608	50 %	25 %	25 %	0 %	212223452
5511	NC_011529	TCC	2	6	272646	272651	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223452
5512	NC_011529	CCTT	2	8	272668	272675	0 %	50 %	0 %	50 %	212223452
5513	NC_011529	CCTGA	2	10	272705	272714	20 %	20 %	20 %	40 %	212223452
5514	NC_011529	CCG	2	6	272733	272738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223452
5515	NC_011529	TTA	2	6	272857	272862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212223452
5516	NC_011529	CTA	2	6	272905	272910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223452
5517	NC_011529	TTC	2	6	272948	272953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223452
5518	NC_011529	ACT	2	6	272961	272966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223452
5519	NC_011529	CTC	2	6	272973	272978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223452
5520	NC_011529	CTC	2	6	273005	273010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223452
5521	NC_011529	CTC	2	6	273044	273049	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223452
5522	NC_011529	CTT	2	6	273086	273091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223452
5523	NC_011529	TC	3	6	273127	273132	0 %	50 %	0 %	50 %	212223452
5524	NC_011529	ACCA	2	8	273182	273189	50 %	0 %	0 %	50 %	212223452
5525	NC_011529	CTCGCT	2	12	273203	273214	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	212223452
5526	NC_011529	CTCA	2	8	273239	273246	25 %	25 %	0 %	50 %	212223452
5527	NC_011529	GAA	2	6	273261	273266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5528	NC_011529	A	6	6	273283	273288	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5529	NC_011529	AAG	2	6	273532	273537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223453
5530	NC_011529	CTC	2	6	273538	273543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223453
5531	NC_011529	TGC	2	6	273550	273555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223453
5532	NC_011529	GAGAA	2	10	273611	273620	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
5533	NC_011529	TGG	2	6	273626	273631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5534	NC_011529	AG	3	6	273658	273663	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_011529	CCT	2	6	273710	273715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223454
5536	NC_011529	GT	3	6	273722	273727	0 %	50 %	50 %	0 %	212223454
5537	NC_011529	TC	3	6	273788	273793	0 %	50 %	0 %	50 %	212223454
5538	NC_011529	CTT	2	6	273810	273815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223454
5539	NC_011529	GTA	2	6	273825	273830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223454
5540	NC_011529	TCG	2	6	273832	273837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223454
5541	NC_011529	CCT	2	6	273860	273865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223454
5542	NC_011529	TTG	2	6	273874	273879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223454
5543	NC_011529	GCGG	2	8	273981	273988	0 %	0 %	75 %	25 %	212223454
5544	NC_011529	GGTGAC	2	12	274002	274013	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	212223454
5545	NC_011529	TGA	2	6	274034	274039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223454
5546	NC_011529	TAG	2	6	274072	274077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223454
5547	NC_011529	ATG	2	6	274081	274086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223454
5548	NC_011529	TCG	2	6	274189	274194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223454
5549	NC_011529	GTG	2	6	274195	274200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223454
5550	NC_011529	TAG	2	6	274454	274459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223454
5551	NC_011529	TTG	2	6	274643	274648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223454
5552	NC_011529	GTA	2	6	274731	274736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223454
5553	NC_011529	CAC	2	6	274788	274793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212223454
5554	NC_011529	ATAG	2	8	274860	274867	50 %	25 %	25 %	0 %	212223454
5555	NC_011529	TGA	2	6	274967	274972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223454
5556	NC_011529	GTAG	2	8	274974	274981	25 %	25 %	50 %	0 %	212223454
5557	NC_011529	CGG	2	6	275081	275086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223454
5558	NC_011529	GTT	2	6	275106	275111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223454
5559	NC_011529	TGA	2	6	275187	275192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223454
5560	NC_011529	GTA	3	9	275346	275354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223454
5561	NC_011529	CG	3	6	275477	275482	0 %	0 %	50 %	50 %	212223454
5562	NC_011529	AGT	2	6	275495	275500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223454
5563	NC_011529	GTC	2	6	275616	275621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223454
5564	NC_011529	AGT	2	6	275666	275671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223454
5565	NC_011529	TTAA	2	8	275677	275684	50 %	50 %	0 %	0 %	212223454
5566	NC_011529	GTC	2	6	275700	275705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223454
5567	NC_011529	GTG	2	6	275743	275748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223454
5568	NC_011529	ATC	2	6	275965	275970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223454
5569	NC_011529	GGT	2	6	276003	276008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223454
5570	NC_011529	GGT	2	6	276024	276029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223454
5571	NC_011529	CTC	2	6	276054	276059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223454
5572	NC_011529	GC	3	6	276139	276144	0 %	0 %	50 %	50 %	212223454
5573	NC_011529	TGC	2	6	276175	276180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223454
5574	NC_011529	ATC	2	6	276193	276198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223454
5575	NC_011529	CGT	2	6	276353	276358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223454
5576	NC_011529	CTG	2	6	276370	276375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223454
5577	NC_011529	TGG	2	6	276500	276505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223454
5578	NC_011529	CT	3	6	276586	276591	0 %	50 %	0 %	50 %	212223454
5579	NC_011529	CGT	2	6	276596	276601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223454
5580	NC_011529	CCA	2	6	276613	276618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212223454
5581	NC_011529	CCG	2	6	276670	276675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223454
5582	NC_011529	TCCAAA	2	12	276693	276704	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	212223454
5583	NC_011529	GAA	2	6	276713	276718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223454
5584	NC_011529	AC	3	6	276758	276763	50 %	0 %	0 %	50 %	212223454
5585	NC_011529	GTC	2	6	276777	276782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223454
5586	NC_011529	CCGTGA	2	12	276823	276834	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	212223454
5587	NC_011529	GTA	2	6	276855	276860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223454
5588	NC_011529	ATC	2	6	276951	276956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223454
5589	NC_011529	TTG	2	6	277006	277011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223454
5590	NC_011529	ACG	2	6	277015	277020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223454
5591	NC_011529	GAG	2	6	277080	277085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223454
5592	NC_011529	TA	3	6	277089	277094	50 %	50 %	0 %	0 %	212223454
5593	NC_011529	GTA	2	6	277167	277172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223454
5594	NC_011529	GTG	2	6	277234	277239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223454
5595	NC_011529	TGG	2	6	277241	277246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223454
5596	NC_011529	AGT	2	6	277247	277252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223454
5597	NC_011529	TCA	2	6	277270	277275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223454
5598	NC_011529	CGT	2	6	277280	277285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223454
5599	NC_011529	GGA	2	6	277325	277330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223454
5600	NC_011529	CTC	2	6	277512	277517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223454
5601	NC_011529	CAA	2	6	277598	277603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212223454
5602	NC_011529	GCT	2	6	277722	277727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223454
5603	NC_011529	CTG	2	6	277800	277805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223454
5604	NC_011529	CTG	2	6	277818	277823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223454
5605	NC_011529	AG	3	6	277872	277877	50 %	0 %	50 %	0 %	212223454
5606	NC_011529	CCT	2	6	277930	277935	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5607	NC_011529	CTA	2	6	278011	278016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5608	NC_011529	CAG	2	6	278029	278034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5609	NC_011529	CTT	2	6	278124	278129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5610	NC_011529	CAG	2	6	278180	278185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223455
5611	NC_011529	CAG	2	6	278204	278209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223455
5612	NC_011529	A	6	6	278330	278335	100 %	0 %	0 %	0 %	212223455
5613	NC_011529	A	6	6	278493	278498	100 %	0 %	0 %	0 %	212223455
5614	NC_011529	GAA	2	6	278675	278680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223455
5615	NC_011529	TAG	2	6	278702	278707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223455
5616	NC_011529	AAG	2	6	278852	278857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223455
5617	NC_011529	TGT	2	6	278887	278892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223455
5618	NC_011529	ATA	2	6	278909	278914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212223455
5619	NC_011529	CT	3	6	279113	279118	0 %	50 %	0 %	50 %	212223455
5620	NC_011529	AGT	2	6	279133	279138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223455
5621	NC_011529	GAG	2	6	279155	279160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223455
5622	NC_011529	ACC	2	6	279206	279211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5623	NC_011529	CTC	2	6	279296	279301	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223456
5624	NC_011529	CTG	2	6	279344	279349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223456
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5632	NC_011529	GC	3	6	279607	279612	0 %	0 %	50 %	50 %	212223456
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5867	NC_011529	GCC	2	6	291469	291474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223462
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5870	NC_011529	GTA	2	6	291550	291555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223462
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5886	NC_011529	TCG	2	6	292490	292495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223464
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5893	NC_011529	TTTAC	2	10	293039	293048	20 %	60 %	0 %	20 %	212223464
5894	NC_011529	CAC	2	6	293155	293160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5895	NC_011529	TA	3	6	293182	293187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5896	NC_011529	GATT	2	8	293288	293295	25 %	50 %	25 %	0 %	212223465
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5911	NC_011529	AGA	2	6	294107	294112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5932	NC_011529	GGT	2	6	295650	295655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5972	NC_011529	TCT	2	6	297967	297972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5973	NC_011529	TCC	2	6	297982	297987	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5974	NC_011529	GTA	2	6	298016	298021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5984	NC_011529	ATC	2	6	298579	298584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223469
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