MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermodesulfovibrio yellowstonii DSM 11347 chromosome

Total Repeats: 49437

< Previous12...87888990919293949596979899Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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45118	NC_011296	TAA	2	6	1831645	1831650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206890228
45119	NC_011296	TCTG	2	8	1831662	1831669	0 %	50 %	25 %	25 %	206890228
45120	NC_011296	CTT	2	6	1831700	1831705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206890228
45121	NC_011296	GAA	2	6	1831727	1831732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206890228
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45123	NC_011296	TCTG	2	8	1831842	1831849	0 %	50 %	25 %	25 %	206890228
45124	NC_011296	ACA	2	6	1831951	1831956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206890228
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45126	NC_011296	AATT	2	8	1832091	1832098	50 %	50 %	0 %	0 %	206890228
45127	NC_011296	AGCG	2	8	1832104	1832111	25 %	0 %	50 %	25 %	206890228
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45130	NC_011296	CTT	2	6	1832225	1832230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206890228
45131	NC_011296	CTTT	2	8	1832264	1832271	0 %	75 %	0 %	25 %	206890228
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45142	NC_011296	TG	3	6	1832605	1832610	0 %	50 %	50 %	0 %	206890228
45143	NC_011296	GGT	2	6	1832650	1832655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206890228
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45146	NC_011296	AAG	2	6	1832847	1832852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206890228
45147	NC_011296	ATT	2	6	1832859	1832864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206890228
45148	NC_011296	T	6	6	1832868	1832873	0 %	100 %	0 %	0 %	206890228
45149	NC_011296	CTT	2	6	1832888	1832893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206890228
45150	NC_011296	CAT	3	9	1832909	1832917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206890228
45151	NC_011296	ATT	2	6	1832949	1832954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206890228
45152	NC_011296	T	6	6	1832990	1832995	0 %	100 %	0 %	0 %	206890228
45153	NC_011296	CTG	2	6	1833009	1833014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206890228
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45156	NC_011296	ATT	2	6	1833069	1833074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206890228
45157	NC_011296	GTT	2	6	1833088	1833093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	206890228
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45159	NC_011296	TCT	2	6	1833230	1833235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206890228
45160	NC_011296	ATA	2	6	1833255	1833260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206890228
45161	NC_011296	TA	3	6	1833295	1833300	50 %	50 %	0 %	0 %	206890228
45162	NC_011296	T	7	7	1833348	1833354	0 %	100 %	0 %	0 %	206890228
45163	NC_011296	AAGA	2	8	1833380	1833387	75 %	0 %	25 %	0 %	206890228
45164	NC_011296	AAACC	2	10	1833416	1833425	60 %	0 %	0 %	40 %	206890228
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45170	NC_011296	TAA	2	6	1833739	1833744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206890228
45171	NC_011296	A	6	6	1833743	1833748	100 %	0 %	0 %	0 %	206890228
45172	NC_011296	AGGCA	2	10	1833806	1833815	40 %	0 %	40 %	20 %	206890228
45173	NC_011296	ATA	2	6	1833852	1833857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206890228
45174	NC_011296	CTT	2	6	1833866	1833871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206890228
45175	NC_011296	TATAAA	2	12	1833975	1833986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206890228
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45178	NC_011296	CAT	2	6	1834079	1834084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206890879
45179	NC_011296	GGT	2	6	1834107	1834112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206890879
45180	NC_011296	GTC	2	6	1834123	1834128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206890879
45181	NC_011296	CAT	2	6	1834132	1834137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206890879
45182	NC_011296	CTTT	2	8	1834183	1834190	0 %	75 %	0 %	25 %	206890879
45183	NC_011296	ATT	2	6	1834212	1834217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206890879
45184	NC_011296	T	6	6	1834250	1834255	0 %	100 %	0 %	0 %	206890879
45185	NC_011296	TCA	2	6	1834323	1834328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206890879
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45188	NC_011296	GCATTA	2	12	1834539	1834550	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	206890879
45189	NC_011296	TTCTT	2	10	1834586	1834595	0 %	80 %	0 %	20 %	206890879
45190	NC_011296	TTC	2	6	1834637	1834642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206890879
45191	NC_011296	TAA	2	6	1834688	1834693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206890879
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45195	NC_011296	CTC	2	6	1834865	1834870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	206890705
45196	NC_011296	T	6	6	1834871	1834876	0 %	100 %	0 %	0 %	206890705
45197	NC_011296	CAA	2	6	1834931	1834936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206890705
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45199	NC_011296	TC	3	6	1834973	1834978	0 %	50 %	0 %	50 %	206890705
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45205	NC_011296	AAG	2	6	1835148	1835153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206890705
45206	NC_011296	TAA	2	6	1835192	1835197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206890705
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45213	NC_011296	GAAG	2	8	1835428	1835435	50 %	0 %	50 %	0 %	206890705
45214	NC_011296	CTG	2	6	1835441	1835446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206890705
45215	NC_011296	CGA	2	6	1835447	1835452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206890705
45216	NC_011296	GTA	2	6	1835488	1835493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206890705
45217	NC_011296	GTT	2	6	1835502	1835507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	206890705
45218	NC_011296	TAAA	2	8	1835588	1835595	75 %	25 %	0 %	0 %	206890705
45219	NC_011296	AAAATA	2	12	1835603	1835614	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	206890705
45220	NC_011296	GATAA	2	10	1835617	1835626	60 %	20 %	20 %	0 %	206890705
45221	NC_011296	T	6	6	1835637	1835642	0 %	100 %	0 %	0 %	206890705
45222	NC_011296	TCC	2	6	1835651	1835656	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45223	NC_011296	TAA	2	6	1835660	1835665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206889741
45224	NC_011296	TGT	2	6	1835809	1835814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	206889741
45225	NC_011296	T	6	6	1835865	1835870	0 %	100 %	0 %	0 %	206889741
45226	NC_011296	CTG	2	6	1835874	1835879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206889741
45227	NC_011296	TAA	2	6	1835886	1835891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206889741
45228	NC_011296	TC	3	6	1835916	1835921	0 %	50 %	0 %	50 %	206889741
45229	NC_011296	AAC	2	6	1835929	1835934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206889741
45230	NC_011296	CTC	2	6	1835935	1835940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	206889741
45231	NC_011296	TCA	2	6	1835969	1835974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206889741
45232	NC_011296	ATT	2	6	1836037	1836042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206889741
45233	NC_011296	CAG	2	6	1836051	1836056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206889741
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45473	NC_011296	TTC	2	6	1845667	1845672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206890329
45474	NC_011296	GAC	2	6	1845688	1845693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206890329
45475	NC_011296	CAT	2	6	1845694	1845699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206890329
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45477	NC_011296	TCA	2	6	1845750	1845755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206890329
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45480	NC_011296	CCT	2	6	1845804	1845809	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	206890329
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45490	NC_011296	CT	3	6	1846216	1846221	0 %	50 %	0 %	50 %	206890329
45491	NC_011296	TCA	2	6	1846248	1846253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206890329
45492	NC_011296	CTG	2	6	1846294	1846299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206890329
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45500	NC_011296	TCA	2	6	1846551	1846556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206890329

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