MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermodesulfovibrio yellowstonii DSM 11347 chromosome

Total Repeats: 49437

< Previous12...6465666768697071727374...9899Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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34002	NC_011296	AT	4	8	1376192	1376199	50 %	50 %	0 %	0 %	206889609
34003	NC_011296	T	6	6	1376253	1376258	0 %	100 %	0 %	0 %	206889609
34004	NC_011296	TCT	2	6	1376273	1376278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206889609
34005	NC_011296	CCT	2	6	1376313	1376318	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	206890369
34006	NC_011296	TTTC	2	8	1376321	1376328	0 %	75 %	0 %	25 %	206890369
34007	NC_011296	TTTTAA	2	12	1376342	1376353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206890369
34008	NC_011296	TCA	2	6	1376358	1376363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206890369
34009	NC_011296	CCTTTA	2	12	1376376	1376387	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	206890369
34010	NC_011296	AGC	2	6	1376420	1376425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206890369
34011	NC_011296	CAA	2	6	1376434	1376439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206890369
34012	NC_011296	GTT	2	6	1376440	1376445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	206890369
34013	NC_011296	TCA	2	6	1376481	1376486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206890369
34014	NC_011296	GAA	2	6	1376509	1376514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206890369
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34016	NC_011296	CTT	2	6	1376652	1376657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206890369
34017	NC_011296	CT	3	6	1376696	1376701	0 %	50 %	0 %	50 %	206890369
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34054	NC_011296	T	6	6	1378338	1378343	0 %	100 %	0 %	0 %	206891011
34055	NC_011296	TCC	2	6	1378364	1378369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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34119	NC_011296	AGCTG	2	10	1381310	1381319	20 %	20 %	40 %	20 %	206891176
34120	NC_011296	CTT	2	6	1381331	1381336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206891176
34121	NC_011296	CCT	2	6	1381346	1381351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	206891176
34122	NC_011296	ATC	2	6	1381379	1381384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206891176
34123	NC_011296	ATT	2	6	1381451	1381456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206891176
34124	NC_011296	AT	3	6	1381490	1381495	50 %	50 %	0 %	0 %	206891176
34125	NC_011296	TCCA	2	8	1381504	1381511	25 %	25 %	0 %	50 %	206891176
34126	NC_011296	ATT	2	6	1381666	1381671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206891176
34127	NC_011296	TCT	2	6	1381759	1381764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206891176
34128	NC_011296	CTG	2	6	1381767	1381772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206891176
34129	NC_011296	TCT	2	6	1381786	1381791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206891176
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34131	NC_011296	T	8	8	1381863	1381870	0 %	100 %	0 %	0 %	206890542
34132	NC_011296	TAA	2	6	1381917	1381922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206890542
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34136	NC_011296	T	7	7	1382062	1382068	0 %	100 %	0 %	0 %	206890542
34137	NC_011296	TAC	2	6	1382139	1382144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206891119
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34139	NC_011296	ACA	2	6	1382191	1382196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206891119
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34147	NC_011296	ATT	2	6	1382643	1382648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206891119
34148	NC_011296	CTT	2	6	1382666	1382671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206891119
34149	NC_011296	T	6	6	1382670	1382675	0 %	100 %	0 %	0 %	206891119
34150	NC_011296	TGT	2	6	1382684	1382689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	206891119
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34154	NC_011296	TACCCT	2	12	1382863	1382874	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	206890251
34155	NC_011296	ACC	2	6	1382951	1382956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	206890251
34156	NC_011296	CCTTT	2	10	1382992	1383001	0 %	60 %	0 %	40 %	206890251
34157	NC_011296	GGA	2	6	1383108	1383113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	206890251
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34159	NC_011296	CAAG	2	8	1383136	1383143	50 %	0 %	25 %	25 %	206890251
34160	NC_011296	T	7	7	1383156	1383162	0 %	100 %	0 %	0 %	206890251
34161	NC_011296	CTT	2	6	1383219	1383224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206890251
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34163	NC_011296	CTT	2	6	1383280	1383285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206890251
34164	NC_011296	T	7	7	1383310	1383316	0 %	100 %	0 %	0 %	206890251
34165	NC_011296	TATC	2	8	1383414	1383421	25 %	50 %	0 %	25 %	206889610
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34167	NC_011296	TTG	2	6	1383474	1383479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	206889610
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34171	NC_011296	TGT	2	6	1383594	1383599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	206889610
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34173	NC_011296	TTC	2	6	1383676	1383681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206889937
34174	NC_011296	TAAAA	2	10	1383823	1383832	80 %	20 %	0 %	0 %	206889937
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34176	NC_011296	CT	3	6	1383957	1383962	0 %	50 %	0 %	50 %	206889937
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34178	NC_011296	CTTC	2	8	1384014	1384021	0 %	50 %	0 %	50 %	206889937
34179	NC_011296	ATT	2	6	1384113	1384118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206889937
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34186	NC_011296	TC	3	6	1384371	1384376	0 %	50 %	0 %	50 %	206889937
34187	NC_011296	CTA	2	6	1384387	1384392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206889937
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34189	NC_011296	TGTC	2	8	1384420	1384427	0 %	50 %	25 %	25 %	206889937
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34192	NC_011296	CT	3	6	1384484	1384489	0 %	50 %	0 %	50 %	206889937
34193	NC_011296	CAT	2	6	1384507	1384512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206889937
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34195	NC_011296	ACT	2	6	1384521	1384526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206889937
34196	NC_011296	CCAT	2	8	1384536	1384543	25 %	25 %	0 %	50 %	206889937
34197	NC_011296	TGC	2	6	1384547	1384552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206889937
34198	NC_011296	TA	3	6	1384571	1384576	50 %	50 %	0 %	0 %	206889937
34199	NC_011296	TGTC	2	8	1384618	1384625	0 %	50 %	25 %	25 %	206889937
34200	NC_011296	GCT	2	6	1384746	1384751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206889937
34201	NC_011296	CTT	2	6	1384808	1384813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206889937
34202	NC_011296	TCC	2	6	1384843	1384848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34203	NC_011296	TATT	2	8	1384870	1384877	25 %	75 %	0 %	0 %	206889494
34204	NC_011296	TGTA	2	8	1384952	1384959	25 %	50 %	25 %	0 %	206889494
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34207	NC_011296	AAC	3	9	1385124	1385132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206889494
34208	NC_011296	T	6	6	1385172	1385177	0 %	100 %	0 %	0 %	206889494
34209	NC_011296	AGC	2	6	1385202	1385207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206889494
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34218	NC_011296	CAA	2	6	1385570	1385575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206889494
34219	NC_011296	TGTC	2	8	1385613	1385620	0 %	50 %	25 %	25 %	206889494
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34221	NC_011296	AAC	2	6	1385766	1385771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206889494
34222	NC_011296	GCA	2	6	1385830	1385835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206889494
34223	NC_011296	TCT	2	6	1385863	1385868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206889494
34224	NC_011296	CTTT	2	8	1385905	1385912	0 %	75 %	0 %	25 %	206889494
34225	NC_011296	TA	5	10	1385930	1385939	50 %	50 %	0 %	0 %	206889494
34226	NC_011296	CTC	2	6	1386086	1386091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	206889494
34227	NC_011296	AGG	2	6	1386096	1386101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	206889494
34228	NC_011296	ATA	2	6	1386123	1386128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206889494
34229	NC_011296	AAG	2	6	1386141	1386146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206889494
34230	NC_011296	TCA	2	6	1386238	1386243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206889494
34231	NC_011296	T	7	7	1386327	1386333	0 %	100 %	0 %	0 %	206889494
34232	NC_011296	AT	3	6	1386343	1386348	50 %	50 %	0 %	0 %	206889494
34233	NC_011296	TCT	2	6	1386364	1386369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206889494
34234	NC_011296	TCA	3	9	1386391	1386399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206889494
34235	NC_011296	ATA	2	6	1386402	1386407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206889494
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