MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga sp. RQ2 chromosome

Total Repeats: 41425

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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41002	NC_010483	ATT	2	6	1859817	1859822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41003	NC_010483	TGA	2	6	1859834	1859839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41004	NC_010483	AG	3	6	1859878	1859883	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41005	NC_010483	TGA	2	6	1859922	1859927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41006	NC_010483	G	6	6	1859928	1859933	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
41007	NC_010483	A	6	6	1859942	1859947	100 %	0 %	0 %	0 %	170289607
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41010	NC_010483	AT	3	6	1860080	1860085	50 %	50 %	0 %	0 %	170289607
41011	NC_010483	TTC	2	6	1860147	1860152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170289607
41012	NC_010483	CCTT	2	8	1860180	1860187	0 %	50 %	0 %	50 %	170289607
41013	NC_010483	AGA	2	6	1860211	1860216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170289607
41014	NC_010483	TAC	2	6	1860227	1860232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170289607
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41017	NC_010483	CTT	2	6	1860608	1860613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170289607
41018	NC_010483	TAC	2	6	1860626	1860631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170289607
41019	NC_010483	GGAA	2	8	1860702	1860709	50 %	0 %	50 %	0 %	170289607
41020	NC_010483	GAC	2	6	1860824	1860829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170289607
41021	NC_010483	CCTT	2	8	1860843	1860850	0 %	50 %	0 %	50 %	170289607
41022	NC_010483	GACA	2	8	1860866	1860873	50 %	0 %	25 %	25 %	170289607
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41029	NC_010483	GCA	2	6	1861188	1861193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170289607
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41034	NC_010483	CAGAA	2	10	1861403	1861412	60 %	0 %	20 %	20 %	170289608
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41040	NC_010483	GGA	2	6	1861728	1861733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170289608
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41110	NC_010483	TTCT	2	8	1864893	1864900	0 %	75 %	0 %	25 %	170289611
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41116	NC_010483	A	6	6	1865098	1865103	100 %	0 %	0 %	0 %	170289611
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41119	NC_010483	GAC	2	6	1865174	1865179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170289611
41120	NC_010483	AGA	2	6	1865181	1865186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170289611
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41131	NC_010483	TC	3	6	1865780	1865785	0 %	50 %	0 %	50 %	170289611
41132	NC_010483	TCCA	2	8	1865816	1865823	25 %	25 %	0 %	50 %	170289612
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41421	NC_010483	AGG	2	6	1877433	1877438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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41425	NC_010483	GGGGT	2	10	1877635	1877644	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.