MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga sp. RQ2 chromosome

Total Repeats: 41425

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
40001	NC_010483	ACC	2	6	1809621	1809626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170289568
40002	NC_010483	GTA	2	6	1809698	1809703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170289568
40003	NC_010483	ATTTC	2	10	1809705	1809714	20 %	60 %	0 %	20 %	170289568
40004	NC_010483	TTCT	2	8	1809764	1809771	0 %	75 %	0 %	25 %	170289568
40005	NC_010483	GTA	2	6	1809782	1809787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170289568
40006	NC_010483	ATT	2	6	1809825	1809830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170289568
40007	NC_010483	GTTCA	2	10	1809875	1809884	20 %	40 %	20 %	20 %	170289568
40008	NC_010483	GTTT	2	8	1809899	1809906	0 %	75 %	25 %	0 %	170289568
40009	NC_010483	TTC	2	6	1809924	1809929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170289568
40010	NC_010483	CAA	2	6	1809943	1809948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170289568
40011	NC_010483	TCG	2	6	1809981	1809986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170289568
40012	NC_010483	CGTGA	2	10	1809989	1809998	20 %	20 %	40 %	20 %	170289568
40013	NC_010483	GTT	2	6	1810017	1810022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170289568
40014	NC_010483	TCGTA	2	10	1810033	1810042	20 %	40 %	20 %	20 %	170289568
40015	NC_010483	TTC	2	6	1810154	1810159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170289568
40016	NC_010483	AG	3	6	1810163	1810168	50 %	0 %	50 %	0 %	170289568
40017	NC_010483	TCT	2	6	1810177	1810182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170289568
40018	NC_010483	CTT	2	6	1810231	1810236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170289568
40019	NC_010483	T	6	6	1810268	1810273	0 %	100 %	0 %	0 %	170289568
40020	NC_010483	GATC	2	8	1810339	1810346	25 %	25 %	25 %	25 %	170289568
40021	NC_010483	T	6	6	1810362	1810367	0 %	100 %	0 %	0 %	170289568
40022	NC_010483	GA	3	6	1810409	1810414	50 %	0 %	50 %	0 %	170289568
40023	NC_010483	CG	3	6	1810441	1810446	0 %	0 %	50 %	50 %	170289568
40024	NC_010483	GTA	2	6	1810592	1810597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170289568
40025	NC_010483	GTC	2	6	1810616	1810621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170289568
40026	NC_010483	AGT	2	6	1810669	1810674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170289568
40027	NC_010483	GAA	2	6	1810691	1810696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170289568
40028	NC_010483	CCA	2	6	1810759	1810764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170289568
40029	NC_010483	AGG	2	6	1810925	1810930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170289568
40030	NC_010483	GAAA	2	8	1810957	1810964	75 %	0 %	25 %	0 %	170289568
40031	NC_010483	ACA	2	6	1811118	1811123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170289568
40032	NC_010483	CAA	2	6	1811164	1811169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170289568
40033	NC_010483	ACG	2	6	1811178	1811183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170289568
40034	NC_010483	A	6	6	1811186	1811191	100 %	0 %	0 %	0 %	170289568
40035	NC_010483	CCTT	2	8	1811216	1811223	0 %	50 %	0 %	50 %	170289569
40036	NC_010483	TAAT	2	8	1811435	1811442	50 %	50 %	0 %	0 %	170289569
40037	NC_010483	T	6	6	1811462	1811467	0 %	100 %	0 %	0 %	170289569
40038	NC_010483	GAA	2	6	1811473	1811478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170289569
40039	NC_010483	CTT	2	6	1811534	1811539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170289569
40040	NC_010483	GTCG	2	8	1811639	1811646	0 %	25 %	50 %	25 %	170289569
40041	NC_010483	GAA	2	6	1811657	1811662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170289569
40042	NC_010483	ATC	2	6	1811683	1811688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170289569
40043	NC_010483	TGATA	2	10	1811814	1811823	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
40044	NC_010483	AGAGAA	2	12	1811890	1811901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170289570
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40046	NC_010483	TCT	2	6	1812009	1812014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170289570
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40049	NC_010483	CAT	2	6	1812073	1812078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170289570
40050	NC_010483	GAG	2	6	1812097	1812102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170289570
40051	NC_010483	AGTG	2	8	1812165	1812172	25 %	25 %	50 %	0 %	170289570
40052	NC_010483	TCT	2	6	1812216	1812221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170289570
40053	NC_010483	GAA	2	6	1812252	1812257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170289570
40054	NC_010483	TCT	2	6	1812269	1812274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170289570
40055	NC_010483	TAC	2	6	1812298	1812303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170289570
40056	NC_010483	TCT	2	6	1812324	1812329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170289570
40057	NC_010483	TCA	3	9	1812374	1812382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170289570
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40060	NC_010483	GA	3	6	1812533	1812538	50 %	0 %	50 %	0 %	170289570
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40062	NC_010483	GA	3	6	1812567	1812572	50 %	0 %	50 %	0 %	170289570
40063	NC_010483	AGA	2	6	1812626	1812631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170289570
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40065	NC_010483	CTCC	2	8	1812825	1812832	0 %	25 %	0 %	75 %	170289570
40066	NC_010483	A	6	6	1812863	1812868	100 %	0 %	0 %	0 %	170289570
40067	NC_010483	TTCC	2	8	1812944	1812951	0 %	50 %	0 %	50 %	170289571
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40075	NC_010483	TG	3	6	1813237	1813242	0 %	50 %	50 %	0 %	170289571
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40079	NC_010483	AAT	2	6	1813363	1813368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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40083	NC_010483	ATC	2	6	1813526	1813531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170289572
40084	NC_010483	CT	4	8	1813532	1813539	0 %	50 %	0 %	50 %	170289572
40085	NC_010483	TGAG	2	8	1813574	1813581	25 %	25 %	50 %	0 %	170289572
40086	NC_010483	CGAT	2	8	1813626	1813633	25 %	25 %	25 %	25 %	170289572
40087	NC_010483	T	6	6	1813658	1813663	0 %	100 %	0 %	0 %	170289572
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40091	NC_010483	TGA	2	6	1813910	1813915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170289572
40092	NC_010483	TAGA	2	8	1813918	1813925	50 %	25 %	25 %	0 %	170289572
40093	NC_010483	TTC	2	6	1813949	1813954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170289572
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40105	NC_010483	GAA	2	6	1814407	1814412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170289573
40106	NC_010483	AGAA	2	8	1814421	1814428	75 %	0 %	25 %	0 %	170289573
40107	NC_010483	TAC	2	6	1814447	1814452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170289573
40108	NC_010483	AGAA	2	8	1814501	1814508	75 %	0 %	25 %	0 %	170289573
40109	NC_010483	AGA	2	6	1814525	1814530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170289573
40110	NC_010483	CCA	2	6	1814543	1814548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170289573
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40112	NC_010483	AAAAG	2	10	1814593	1814602	80 %	0 %	20 %	0 %	170289573
40113	NC_010483	ACA	2	6	1814701	1814706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170289573
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40116	NC_010483	GAAA	2	8	1814859	1814866	75 %	0 %	25 %	0 %	170289573
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40118	NC_010483	TCC	2	6	1814976	1814981	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170289573
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40473	NC_010483	TCT	2	6	1833754	1833759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170289585
40474	NC_010483	CTGGCT	2	12	1833763	1833774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170289585
40475	NC_010483	CTT	2	6	1833789	1833794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170289585
40476	NC_010483	ACC	2	6	1833807	1833812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170289585
40477	NC_010483	TTC	2	6	1833873	1833878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170289585
40478	NC_010483	CTC	2	6	1833911	1833916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170289585
40479	NC_010483	ACG	2	6	1834003	1834008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170289585
40480	NC_010483	AGA	2	6	1834015	1834020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170289585
40481	NC_010483	CAA	2	6	1834035	1834040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170289585
40482	NC_010483	TCCA	2	8	1834154	1834161	25 %	25 %	0 %	50 %	170289586
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40484	NC_010483	T	6	6	1834232	1834237	0 %	100 %	0 %	0 %	170289586
40485	NC_010483	TG	3	6	1834294	1834299	0 %	50 %	50 %	0 %	170289586
40486	NC_010483	ATC	2	6	1834439	1834444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170289586
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40489	NC_010483	TCC	2	6	1834752	1834757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170289587
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40491	NC_010483	ACC	2	6	1834845	1834850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170289587
40492	NC_010483	CT	3	6	1834899	1834904	0 %	50 %	0 %	50 %	170289587
40493	NC_010483	TCCCA	2	10	1834918	1834927	20 %	20 %	0 %	60 %	170289587
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40497	NC_010483	CAG	2	6	1835006	1835011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170289587
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