MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga sp. RQ2 chromosome

Total Repeats: 41425

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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38002	NC_010483	CTC	2	6	1723278	1723283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170289479
38003	NC_010483	CTT	2	6	1723320	1723325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170289479
38004	NC_010483	ATC	2	6	1723438	1723443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170289479
38005	NC_010483	ACC	2	6	1723478	1723483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170289479
38006	NC_010483	AG	3	6	1723498	1723503	50 %	0 %	50 %	0 %	170289479
38007	NC_010483	AAC	2	6	1723504	1723509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170289479
38008	NC_010483	TCC	2	6	1723630	1723635	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170289479
38009	NC_010483	TTTC	2	8	1723680	1723687	0 %	75 %	0 %	25 %	170289479
38010	NC_010483	CT	3	6	1723756	1723761	0 %	50 %	0 %	50 %	170289479
38011	NC_010483	TCCA	2	8	1723774	1723781	25 %	25 %	0 %	50 %	170289479
38012	NC_010483	CAC	2	6	1723894	1723899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170289479
38013	NC_010483	A	7	7	1723934	1723940	100 %	0 %	0 %	0 %	170289479
38014	NC_010483	ATC	2	6	1723961	1723966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170289479
38015	NC_010483	CAAA	2	8	1723998	1724005	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
38016	NC_010483	GGA	2	6	1724019	1724024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38017	NC_010483	TCCT	2	8	1724096	1724103	0 %	50 %	0 %	50 %	170289480
38018	NC_010483	AGTGTG	2	12	1724130	1724141	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	170289480
38019	NC_010483	GTAG	2	8	1724159	1724166	25 %	25 %	50 %	0 %	170289480
38020	NC_010483	GGA	2	6	1724227	1724232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170289480
38021	NC_010483	TTG	2	6	1724262	1724267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170289480
38022	NC_010483	CTT	2	6	1724290	1724295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170289480
38023	NC_010483	CTG	2	6	1724425	1724430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170289480
38024	NC_010483	CTT	2	6	1724638	1724643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170289480
38025	NC_010483	A	6	6	1724651	1724656	100 %	0 %	0 %	0 %	170289480
38026	NC_010483	CAA	2	6	1724687	1724692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170289480
38027	NC_010483	TCT	2	6	1724696	1724701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170289480
38028	NC_010483	CTC	2	6	1724714	1724719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38029	NC_010483	ACA	2	6	1724733	1724738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38030	NC_010483	CTT	2	6	1724795	1724800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170289481
38031	NC_010483	ATAG	2	8	1724900	1724907	50 %	25 %	25 %	0 %	170289481
38032	NC_010483	CCA	2	6	1724939	1724944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170289481
38033	NC_010483	TCG	2	6	1725007	1725012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170289481
38034	NC_010483	GTA	2	6	1725024	1725029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170289481
38035	NC_010483	TCA	2	6	1725076	1725081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170289481
38036	NC_010483	TTGC	2	8	1725112	1725119	0 %	50 %	25 %	25 %	170289481
38037	NC_010483	TAG	2	6	1725145	1725150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170289481
38038	NC_010483	TGT	2	6	1725228	1725233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170289481
38039	NC_010483	TCGT	2	8	1725304	1725311	0 %	50 %	25 %	25 %	170289481
38040	NC_010483	GTG	2	6	1725359	1725364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170289481
38041	NC_010483	AAC	2	6	1725385	1725390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170289481
38042	NC_010483	CCT	2	6	1725434	1725439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38043	NC_010483	TTG	2	6	1725482	1725487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170289482
38044	NC_010483	TAA	2	6	1725498	1725503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170289482
38045	NC_010483	T	6	6	1725552	1725557	0 %	100 %	0 %	0 %	170289482
38046	NC_010483	AG	3	6	1725563	1725568	50 %	0 %	50 %	0 %	170289482
38047	NC_010483	GTC	2	6	1725592	1725597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170289482
38048	NC_010483	GT	4	8	1725694	1725701	0 %	50 %	50 %	0 %	170289482
38049	NC_010483	TTC	2	6	1725743	1725748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170289482
38050	NC_010483	TCT	2	6	1725821	1725826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170289482
38051	NC_010483	GCT	2	6	1725832	1725837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170289482
38052	NC_010483	AGG	2	6	1725854	1725859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170289482
38053	NC_010483	GTA	2	6	1725862	1725867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170289482
38054	NC_010483	TGT	2	6	1725870	1725875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170289482
38055	NC_010483	GA	3	6	1725917	1725922	50 %	0 %	50 %	0 %	170289482
38056	NC_010483	TTC	2	6	1725961	1725966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170289482
38057	NC_010483	TTC	2	6	1726006	1726011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170289482
38058	NC_010483	GA	3	6	1726013	1726018	50 %	0 %	50 %	0 %	170289482
38059	NC_010483	CTT	2	6	1726032	1726037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170289482
38060	NC_010483	TCG	2	6	1726052	1726057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170289482
38061	NC_010483	GACGGT	2	12	1726096	1726107	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	170289482
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38064	NC_010483	GTA	3	9	1726177	1726185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170289482
38065	NC_010483	GAAC	2	8	1726257	1726264	50 %	0 %	25 %	25 %	170289482
38066	NC_010483	TCT	2	6	1726268	1726273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170289482
38067	NC_010483	TGT	2	6	1726305	1726310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170289482
38068	NC_010483	GAAAAA	2	12	1726328	1726339	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	170289482
38069	NC_010483	GAAAA	2	10	1726342	1726351	80 %	0 %	20 %	0 %	170289482
38070	NC_010483	CCT	2	6	1726391	1726396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38071	NC_010483	ATGA	2	8	1726417	1726424	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38072	NC_010483	TTGAAA	2	12	1726432	1726443	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38073	NC_010483	A	6	6	1726468	1726473	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38074	NC_010483	TAC	2	6	1726612	1726617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170289483
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38078	NC_010483	G	6	6	1726834	1726839	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
38079	NC_010483	CCG	2	6	1726864	1726869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38080	NC_010483	TCGGG	2	10	1726901	1726910	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
38081	NC_010483	AGC	2	6	1726988	1726993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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38083	NC_010483	GGTG	2	8	1727076	1727083	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
38084	NC_010483	GTG	2	6	1727085	1727090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38085	NC_010483	TCTGCA	2	12	1727137	1727148	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	170289484
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38089	NC_010483	CGA	2	6	1727231	1727236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170289484
38090	NC_010483	TTCTGT	2	12	1727294	1727305	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	170289484
38091	NC_010483	TCGT	2	8	1727398	1727405	0 %	50 %	25 %	25 %	170289484
38092	NC_010483	AAC	2	6	1727427	1727432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170289484
38093	NC_010483	A	6	6	1727447	1727452	100 %	0 %	0 %	0 %	170289484
38094	NC_010483	AGGA	2	8	1727470	1727477	50 %	0 %	50 %	0 %	170289484
38095	NC_010483	TGA	2	6	1727491	1727496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170289484
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38098	NC_010483	GAT	2	6	1727562	1727567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170289485
38099	NC_010483	ACC	2	6	1727596	1727601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170289485
38100	NC_010483	TTC	2	6	1727624	1727629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170289485
38101	NC_010483	AAC	2	6	1727643	1727648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170289485
38102	NC_010483	GAAAA	2	10	1727652	1727661	80 %	0 %	20 %	0 %	170289485
38103	NC_010483	ATG	2	6	1727668	1727673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170289485
38104	NC_010483	TC	3	6	1727712	1727717	0 %	50 %	0 %	50 %	170289485
38105	NC_010483	TCT	2	6	1727731	1727736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170289485
38106	NC_010483	AGCG	2	8	1727751	1727758	25 %	0 %	50 %	25 %	170289485
38107	NC_010483	CCGC	2	8	1727764	1727771	0 %	0 %	25 %	75 %	170289485
38108	NC_010483	CAG	2	6	1727777	1727782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170289485
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38110	NC_010483	GAG	2	6	1727838	1727843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170289485
38111	NC_010483	GGAG	2	8	1727930	1727937	25 %	0 %	75 %	0 %	170289485
38112	NC_010483	GCGA	2	8	1727950	1727957	25 %	0 %	50 %	25 %	170289485
38113	NC_010483	TTC	2	6	1728022	1728027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170289485
38114	NC_010483	CAG	2	6	1728075	1728080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170289485
38115	NC_010483	CAAAA	2	10	1728086	1728095	80 %	0 %	0 %	20 %	170289485
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38475	NC_010483	GCG	2	6	1744040	1744045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170289504
38476	NC_010483	CGAT	2	8	1744052	1744059	25 %	25 %	25 %	25 %	170289504
38477	NC_010483	TTC	2	6	1744114	1744119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170289504
38478	NC_010483	AAT	2	6	1744126	1744131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170289504
38479	NC_010483	CTG	2	6	1744154	1744159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170289504
38480	NC_010483	ATG	2	6	1744193	1744198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170289504
38481	NC_010483	TCCACA	2	12	1744199	1744210	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	170289504
38482	NC_010483	CTTT	2	8	1744218	1744225	0 %	75 %	0 %	25 %	170289504
38483	NC_010483	CCAT	2	8	1744250	1744257	25 %	25 %	0 %	50 %	170289504
38484	NC_010483	TC	3	6	1744348	1744353	0 %	50 %	0 %	50 %	170289504
38485	NC_010483	ACC	2	6	1744357	1744362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170289504
38486	NC_010483	CCA	2	6	1744424	1744429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170289504
38487	NC_010483	CCTCA	2	10	1744465	1744474	20 %	20 %	0 %	60 %	170289504
38488	NC_010483	GTA	2	6	1744489	1744494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170289504
38489	NC_010483	CTT	2	6	1744564	1744569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170289504
38490	NC_010483	AG	3	6	1744622	1744627	50 %	0 %	50 %	0 %	170289504
38491	NC_010483	GTC	2	6	1744690	1744695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170289504
38492	NC_010483	AAG	2	6	1744817	1744822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170289504
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38494	NC_010483	GTA	3	9	1744951	1744959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170289504
38495	NC_010483	CTG	2	6	1744963	1744968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170289504
38496	NC_010483	GAC	2	6	1745008	1745013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170289504
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38498	NC_010483	CA	3	6	1745177	1745182	50 %	0 %	0 %	50 %	170289504
38499	NC_010483	GAA	2	6	1745294	1745299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170289505
38500	NC_010483	GAC	2	6	1745337	1745342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170289505

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