MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga sp. RQ2 chromosome

Total Repeats: 41425

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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37002	NC_010483	CCCG	2	8	1678580	1678587	0 %	0 %	25 %	75 %	170289434
37003	NC_010483	GTT	2	6	1678599	1678604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170289434
37004	NC_010483	GCT	2	6	1678629	1678634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170289434
37005	NC_010483	CGA	2	6	1678658	1678663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170289434
37006	NC_010483	AG	3	6	1678689	1678694	50 %	0 %	50 %	0 %	170289434
37007	NC_010483	GAC	2	6	1678731	1678736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170289434
37008	NC_010483	ACT	2	6	1678745	1678750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170289434
37009	NC_010483	GTG	2	6	1678770	1678775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170289434
37010	NC_010483	A	6	6	1678776	1678781	100 %	0 %	0 %	0 %	170289434
37011	NC_010483	TCC	2	6	1678796	1678801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170289434
37012	NC_010483	CTT	2	6	1678818	1678823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170289434
37013	NC_010483	GAAA	2	8	1678936	1678943	75 %	0 %	25 %	0 %	170289434
37014	NC_010483	A	6	6	1678941	1678946	100 %	0 %	0 %	0 %	170289434
37015	NC_010483	CT	3	6	1678958	1678963	0 %	50 %	0 %	50 %	170289434
37016	NC_010483	GATA	2	8	1678970	1678977	50 %	25 %	25 %	0 %	170289434
37017	NC_010483	CCGATC	2	12	1679026	1679037	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	170289434
37018	NC_010483	GAA	2	6	1679117	1679122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170289434
37019	NC_010483	TAC	2	6	1679137	1679142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170289434
37020	NC_010483	GGT	2	6	1679144	1679149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170289434
37021	NC_010483	AG	3	6	1679159	1679164	50 %	0 %	50 %	0 %	170289434
37022	NC_010483	CGA	2	6	1679186	1679191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170289434
37023	NC_010483	GAA	2	6	1679208	1679213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170289434
37024	NC_010483	AGA	2	6	1679233	1679238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170289434
37025	NC_010483	CAT	2	6	1679354	1679359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170289434
37026	NC_010483	AGC	2	6	1679399	1679404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170289434
37027	NC_010483	TGG	2	6	1679505	1679510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170289434
37028	NC_010483	TCT	2	6	1679595	1679600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170289434
37029	NC_010483	CAT	2	6	1679660	1679665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170289434
37030	NC_010483	GCT	2	6	1679672	1679677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170289434
37031	NC_010483	CAC	2	6	1679735	1679740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170289434
37032	NC_010483	TCG	2	6	1679743	1679748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170289434
37033	NC_010483	CAT	2	6	1679759	1679764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170289434
37034	NC_010483	AT	3	6	1679766	1679771	50 %	50 %	0 %	0 %	170289434
37035	NC_010483	GTG	2	6	1679778	1679783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170289434
37036	NC_010483	CTT	2	6	1679789	1679794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170289434
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37038	NC_010483	CTT	2	6	1679889	1679894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170289435
37039	NC_010483	A	7	7	1679960	1679966	100 %	0 %	0 %	0 %	170289435
37040	NC_010483	TAT	2	6	1680024	1680029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170289435
37041	NC_010483	AG	5	10	1680040	1680049	50 %	0 %	50 %	0 %	170289435
37042	NC_010483	GGAT	2	8	1680081	1680088	25 %	25 %	50 %	0 %	170289435
37043	NC_010483	CAA	2	6	1680110	1680115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170289435
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37045	NC_010483	GAAG	2	8	1680335	1680342	50 %	0 %	50 %	0 %	170289435
37046	NC_010483	A	7	7	1680344	1680350	100 %	0 %	0 %	0 %	170289435
37047	NC_010483	TCT	2	6	1680392	1680397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170289435
37048	NC_010483	CT	4	8	1680422	1680429	0 %	50 %	0 %	50 %	170289435
37049	NC_010483	GAAA	2	8	1680475	1680482	75 %	0 %	25 %	0 %	170289435
37050	NC_010483	CCA	2	6	1680535	1680540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170289435
37051	NC_010483	GAC	2	6	1680561	1680566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170289435
37052	NC_010483	CATCT	2	10	1680578	1680587	20 %	40 %	0 %	40 %	170289435
37053	NC_010483	GTTC	2	8	1680668	1680675	0 %	50 %	25 %	25 %	170289435
37054	NC_010483	GT	3	6	1680737	1680742	0 %	50 %	50 %	0 %	170289436
37055	NC_010483	ATT	2	6	1680767	1680772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170289436
37056	NC_010483	TCT	2	6	1680878	1680883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170289436
37057	NC_010483	TGA	2	6	1680911	1680916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170289436
37058	NC_010483	TCT	2	6	1680951	1680956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170289436
37059	NC_010483	CTA	2	6	1680966	1680971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170289436
37060	NC_010483	ATT	2	6	1681058	1681063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170289436
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37062	NC_010483	TCT	2	6	1681116	1681121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170289436
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37065	NC_010483	ATC	2	6	1681246	1681251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170289436
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37070	NC_010483	ACAT	2	8	1681442	1681449	50 %	25 %	0 %	25 %	170289436
37071	NC_010483	CGCT	2	8	1681469	1681476	0 %	25 %	25 %	50 %	170289436
37072	NC_010483	CTTCC	2	10	1681621	1681630	0 %	40 %	0 %	60 %	170289436
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37083	NC_010483	GA	3	6	1682254	1682259	50 %	0 %	50 %	0 %	170289437
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37092	NC_010483	T	7	7	1682438	1682444	0 %	100 %	0 %	0 %	170289438
37093	NC_010483	GTCT	2	8	1682628	1682635	0 %	50 %	25 %	25 %	170289438
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37098	NC_010483	TCT	2	6	1682795	1682800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170289438
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37101	NC_010483	GA	3	6	1682878	1682883	50 %	0 %	50 %	0 %	170289438
37102	NC_010483	TTC	2	6	1682948	1682953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170289438
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37108	NC_010483	TCT	2	6	1683201	1683206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170289439
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37113	NC_010483	CA	3	6	1683582	1683587	50 %	0 %	0 %	50 %	170289439
37114	NC_010483	AC	3	6	1683613	1683618	50 %	0 %	0 %	50 %	170289439
37115	NC_010483	TATCAG	2	12	1683683	1683694	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	170289439
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