MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga sp. RQ2 chromosome

Total Repeats: 41425

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
34001	NC_010483	GAG	2	6	1540833	1540838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170289316
34002	NC_010483	GGAT	2	8	1540876	1540883	25 %	25 %	50 %	0 %	170289316
34003	NC_010483	GGTGTT	2	12	1540894	1540905	0 %	50 %	50 %	0 %	170289316
34004	NC_010483	CTG	2	6	1540922	1540927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170289316
34005	NC_010483	AGA	2	6	1541151	1541156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34006	NC_010483	A	6	6	1541165	1541170	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34007	NC_010483	AAACAG	2	12	1541180	1541191	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34008	NC_010483	A	6	6	1541217	1541222	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34009	NC_010483	GAA	2	6	1541230	1541235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34010	NC_010483	T	8	8	1541265	1541272	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34011	NC_010483	TC	3	6	1541289	1541294	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34012	NC_010483	TTTG	2	8	1541301	1541308	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
34013	NC_010483	ACCA	2	8	1541594	1541601	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34014	NC_010483	ATC	2	6	1541611	1541616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34015	NC_010483	TTCC	2	8	1541663	1541670	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34016	NC_010483	TCT	2	6	1541755	1541760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34017	NC_010483	GTTC	2	8	1541806	1541813	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
34018	NC_010483	TGG	2	6	1541883	1541888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34019	NC_010483	CAG	2	6	1541924	1541929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34020	NC_010483	T	6	6	1541951	1541956	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34021	NC_010483	AGT	2	6	1541999	1542004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34022	NC_010483	T	6	6	1542035	1542040	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34023	NC_010483	TC	3	6	1542053	1542058	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34024	NC_010483	TTA	2	6	1542065	1542070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34025	NC_010483	CAT	2	6	1542108	1542113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170289317
34026	NC_010483	TAT	2	6	1542121	1542126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170289317
34027	NC_010483	CTG	2	6	1542128	1542133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170289317
34028	NC_010483	T	8	8	1542154	1542161	0 %	100 %	0 %	0 %	170289317
34029	NC_010483	CTT	2	6	1542219	1542224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170289317
34030	NC_010483	CAA	2	6	1542241	1542246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170289317
34031	NC_010483	TTG	2	6	1542273	1542278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170289317
34032	NC_010483	AGAT	2	8	1542348	1542355	50 %	25 %	25 %	0 %	170289317
34033	NC_010483	TCG	2	6	1542366	1542371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170289317
34034	NC_010483	T	6	6	1542403	1542408	0 %	100 %	0 %	0 %	170289317
34035	NC_010483	AT	3	6	1542412	1542417	50 %	50 %	0 %	0 %	170289317
34036	NC_010483	CTTT	2	8	1542464	1542471	0 %	75 %	0 %	25 %	170289317
34037	NC_010483	TCT	2	6	1542483	1542488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170289317
34038	NC_010483	CAT	2	6	1542508	1542513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170289317
34039	NC_010483	CTGTT	2	10	1542583	1542592	0 %	60 %	20 %	20 %	170289317
34040	NC_010483	TGT	2	6	1542607	1542612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170289317
34041	NC_010483	GAAGG	2	10	1542620	1542629	40 %	0 %	60 %	0 %	170289317
34042	NC_010483	AAT	2	6	1542664	1542669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170289317
34043	NC_010483	CTT	2	6	1542682	1542687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170289317
34044	NC_010483	TCA	2	6	1542708	1542713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170289317
34045	NC_010483	ATC	2	6	1542719	1542724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170289317
34046	NC_010483	TGG	2	6	1542734	1542739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170289317
34047	NC_010483	GT	3	6	1542832	1542837	0 %	50 %	50 %	0 %	170289317
34048	NC_010483	TTC	2	6	1542838	1542843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170289317
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34050	NC_010483	TGC	2	6	1542997	1543002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170289317
34051	NC_010483	CT	3	6	1543064	1543069	0 %	50 %	0 %	50 %	170289317
34052	NC_010483	T	6	6	1543095	1543100	0 %	100 %	0 %	0 %	170289317
34053	NC_010483	CTT	2	6	1543130	1543135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170289318
34054	NC_010483	A	6	6	1543166	1543171	100 %	0 %	0 %	0 %	170289318
34055	NC_010483	TCT	2	6	1543271	1543276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170289318
34056	NC_010483	GTT	2	6	1543283	1543288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170289318
34057	NC_010483	A	6	6	1543320	1543325	100 %	0 %	0 %	0 %	170289318
34058	NC_010483	GTT	2	6	1543391	1543396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170289318
34059	NC_010483	TGC	2	6	1543462	1543467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170289318
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34061	NC_010483	AAT	2	6	1543542	1543547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170289318
34062	NC_010483	TGA	2	6	1543600	1543605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170289318
34063	NC_010483	TTA	2	6	1543701	1543706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170289318
34064	NC_010483	A	6	6	1543708	1543713	100 %	0 %	0 %	0 %	170289318
34065	NC_010483	TC	3	6	1543729	1543734	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34066	NC_010483	TTATTT	2	12	1543748	1543759	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34067	NC_010483	T	6	6	1543780	1543785	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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34069	NC_010483	ACC	2	6	1543865	1543870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34070	NC_010483	AT	3	6	1543923	1543928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34071	NC_010483	ACC	2	6	1543934	1543939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34072	NC_010483	TAA	2	6	1543969	1543974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34073	NC_010483	CCG	2	6	1544017	1544022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34074	NC_010483	GAA	2	6	1544035	1544040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34075	NC_010483	TCA	2	6	1544123	1544128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34076	NC_010483	T	6	6	1544140	1544145	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34077	NC_010483	GCC	2	6	1544182	1544187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34078	NC_010483	AATC	2	8	1544353	1544360	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34079	NC_010483	CAA	2	6	1544382	1544387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34080	NC_010483	CTT	2	6	1544403	1544408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34081	NC_010483	T	6	6	1544498	1544503	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34082	NC_010483	TCA	2	6	1544594	1544599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34083	NC_010483	TAT	2	6	1544686	1544691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34084	NC_010483	A	7	7	1544756	1544762	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34085	NC_010483	GA	3	6	1544781	1544786	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34086	NC_010483	ATT	2	6	1544824	1544829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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34089	NC_010483	TCGT	2	8	1544977	1544984	0 %	50 %	25 %	25 %	170289319
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34094	NC_010483	ATAC	2	8	1545196	1545203	50 %	25 %	0 %	25 %	170289319
34095	NC_010483	GCC	2	6	1545205	1545210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170289319
34096	NC_010483	TTC	2	6	1545223	1545228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170289319
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34098	NC_010483	TCA	2	6	1545279	1545284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170289319
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34108	NC_010483	CTGAA	2	10	1545839	1545848	40 %	20 %	20 %	20 %	170289319
34109	NC_010483	TGA	2	6	1545894	1545899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170289319
34110	NC_010483	ACG	2	6	1545941	1545946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170289319
34111	NC_010483	TCG	2	6	1545962	1545967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170289319
34112	NC_010483	AGA	2	6	1545975	1545980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170289319
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34118	NC_010483	ACA	2	6	1546160	1546165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170289320
34119	NC_010483	GAAGG	2	10	1546244	1546253	40 %	0 %	60 %	0 %	170289320
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34121	NC_010483	GAT	2	6	1546329	1546334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170289320
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34123	NC_010483	GA	3	6	1546371	1546376	50 %	0 %	50 %	0 %	170289320
34124	NC_010483	CT	3	6	1546421	1546426	0 %	50 %	0 %	50 %	170289320
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34134	NC_010483	CGT	2	6	1546730	1546735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170289320
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34148	NC_010483	CGT	2	6	1547343	1547348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170289321
34149	NC_010483	T	6	6	1547352	1547357	0 %	100 %	0 %	0 %	170289321
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34152	NC_010483	GAA	2	6	1547534	1547539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170289322
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34218	NC_010483	TGA	2	6	1550230	1550235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170289323
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34223	NC_010483	GAAG	2	8	1550381	1550388	50 %	0 %	50 %	0 %	170289323
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34231	NC_010483	TGT	2	6	1550654	1550659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170289323
34232	NC_010483	TGG	2	6	1550662	1550667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170289323
34233	NC_010483	CGG	3	9	1550669	1550677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170289323
34234	NC_010483	TTG	2	6	1550770	1550775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170289323
34235	NC_010483	TC	3	6	1550863	1550868	0 %	50 %	0 %	50 %	170289323
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