MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga sp. RQ2 chromosome

Total Repeats: 41425

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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30002	NC_010483	ATC	2	6	1359432	1359437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170289118
30003	NC_010483	T	6	6	1359446	1359451	0 %	100 %	0 %	0 %	170289118
30004	NC_010483	TTTC	2	8	1359605	1359612	0 %	75 %	0 %	25 %	170289118
30005	NC_010483	CTTC	2	8	1359640	1359647	0 %	50 %	0 %	50 %	170289118
30006	NC_010483	TGT	2	6	1359712	1359717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170289118
30007	NC_010483	AC	3	6	1359730	1359735	50 %	0 %	0 %	50 %	170289118
30008	NC_010483	TCTT	2	8	1359812	1359819	0 %	75 %	0 %	25 %	170289118
30009	NC_010483	GAA	2	6	1359820	1359825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170289118
30010	NC_010483	TTC	2	6	1359884	1359889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170289118
30011	NC_010483	CCA	3	9	1359919	1359927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170289118
30012	NC_010483	CTATC	2	10	1359970	1359979	20 %	40 %	0 %	40 %	170289118
30013	NC_010483	GAAA	2	8	1359984	1359991	75 %	0 %	25 %	0 %	170289118
30014	NC_010483	T	6	6	1360007	1360012	0 %	100 %	0 %	0 %	170289118
30015	NC_010483	GTA	2	6	1360114	1360119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170289119
30016	NC_010483	TTC	2	6	1360140	1360145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170289119
30017	NC_010483	CT	3	6	1360273	1360278	0 %	50 %	0 %	50 %	170289119
30018	NC_010483	TGT	2	6	1360320	1360325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170289119
30019	NC_010483	TC	3	6	1360351	1360356	0 %	50 %	0 %	50 %	170289119
30020	NC_010483	ATC	2	6	1360358	1360363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170289119
30021	NC_010483	TCGT	2	8	1360388	1360395	0 %	50 %	25 %	25 %	170289119
30022	NC_010483	GTA	2	6	1360414	1360419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170289119
30023	NC_010483	TCC	2	6	1360420	1360425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170289119
30024	NC_010483	CGG	2	6	1360443	1360448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170289119
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30031	NC_010483	TTC	2	6	1360684	1360689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170289119
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30033	NC_010483	TC	3	6	1360827	1360832	0 %	50 %	0 %	50 %	170289119
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30043	NC_010483	TC	3	6	1361365	1361370	0 %	50 %	0 %	50 %	170289119
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30051	NC_010483	CAT	2	6	1361684	1361689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170289120
30052	NC_010483	GGAA	2	8	1361699	1361706	50 %	0 %	50 %	0 %	170289120
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30057	NC_010483	TCTCT	2	10	1362190	1362199	0 %	60 %	0 %	40 %	170289120
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30073	NC_010483	A	7	7	1362876	1362882	100 %	0 %	0 %	0 %	170289121
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30103	NC_010483	CAC	2	6	1364624	1364629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170289122
30104	NC_010483	TGA	2	6	1364662	1364667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170289122
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30107	NC_010483	AGA	2	6	1364747	1364752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170289122
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30461	NC_010483	A	6	6	1380468	1380473	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30462	NC_010483	CCTT	2	8	1380487	1380494	0 %	50 %	0 %	50 %	170289140
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30474	NC_010483	ACC	2	6	1381241	1381246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170289141
30475	NC_010483	TTTC	2	8	1381277	1381284	0 %	75 %	0 %	25 %	170289141
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30477	NC_010483	T	6	6	1381402	1381407	0 %	100 %	0 %	0 %	170289141
30478	NC_010483	TCC	2	6	1381427	1381432	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170289141
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30480	NC_010483	C	6	6	1381470	1381475	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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30488	NC_010483	GTA	2	6	1381806	1381811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170289142
30489	NC_010483	TGA	2	6	1381814	1381819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170289142
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30493	NC_010483	CTT	3	9	1381944	1381952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170289142
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30500	NC_010483	CTTT	2	8	1382201	1382208	0 %	75 %	0 %	25 %	170289142

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