MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga sp. RQ2 chromosome

Total Repeats: 41425

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_010483	GAAC	2	8	115057	115064	50 %	0 %	25 %	25 %	170287926
2502	NC_010483	GTC	2	6	115079	115084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170287926
2503	NC_010483	CTT	2	6	115094	115099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287926
2504	NC_010483	TTC	2	6	115153	115158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287926
2505	NC_010483	CCT	2	6	115174	115179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2506	NC_010483	AAT	2	6	115220	115225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2507	NC_010483	TCTGT	2	10	115251	115260	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
2508	NC_010483	AC	3	6	115285	115290	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2509	NC_010483	A	6	6	115298	115303	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2510	NC_010483	TC	3	6	115313	115318	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2511	NC_010483	TCT	2	6	115336	115341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287927
2512	NC_010483	TTC	2	6	115356	115361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287927
2513	NC_010483	TTC	2	6	115366	115371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287927
2514	NC_010483	TTTCG	2	10	115392	115401	0 %	60 %	20 %	20 %	170287927
2515	NC_010483	ATC	2	6	115444	115449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170287927
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2517	NC_010483	CCT	2	6	115985	115990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170287927
2518	NC_010483	TAGAA	2	10	116116	116125	60 %	20 %	20 %	0 %	170287927
2519	NC_010483	CT	3	6	116127	116132	0 %	50 %	0 %	50 %	170287927
2520	NC_010483	TTC	2	6	116134	116139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287927
2521	NC_010483	GAA	2	6	116261	116266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170287927
2522	NC_010483	TTG	2	6	116402	116407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170287927
2523	NC_010483	AG	3	6	116446	116451	50 %	0 %	50 %	0 %	170287927
2524	NC_010483	GAG	2	6	116475	116480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170287927
2525	NC_010483	TGA	2	6	116492	116497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170287927
2526	NC_010483	TCT	2	6	116561	116566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287927
2527	NC_010483	ATC	2	6	116595	116600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170287927
2528	NC_010483	A	6	6	116613	116618	100 %	0 %	0 %	0 %	170287927
2529	NC_010483	TCG	2	6	116659	116664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170287927
2530	NC_010483	TTG	2	6	116678	116683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170287927
2531	NC_010483	AAG	2	6	116743	116748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170287927
2532	NC_010483	TAT	2	6	116762	116767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170287927
2533	NC_010483	CTG	2	6	116814	116819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170287927
2534	NC_010483	CTTT	2	8	116842	116849	0 %	75 %	0 %	25 %	170287927
2535	NC_010483	CTT	2	6	116925	116930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287927
2536	NC_010483	TCG	2	6	116935	116940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170287927
2537	NC_010483	AG	3	6	116968	116973	50 %	0 %	50 %	0 %	170287927
2538	NC_010483	CTG	2	6	117000	117005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170287927
2539	NC_010483	TCT	2	6	117031	117036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287927
2540	NC_010483	AGT	2	6	117098	117103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170287927
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2543	NC_010483	CTT	2	6	117165	117170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287927
2544	NC_010483	CTTT	2	8	117185	117192	0 %	75 %	0 %	25 %	170287927
2545	NC_010483	CCG	2	6	117193	117198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170287927
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2547	NC_010483	TCA	2	6	117233	117238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170287927
2548	NC_010483	CAT	2	6	117288	117293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170287927
2549	NC_010483	TGA	2	6	117299	117304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170287927
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2552	NC_010483	ACA	2	6	117403	117408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170287927
2553	NC_010483	GTT	2	6	117474	117479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170287927
2554	NC_010483	TCT	2	6	117505	117510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287927
2555	NC_010483	TG	3	6	117575	117580	0 %	50 %	50 %	0 %	170287927
2556	NC_010483	TTC	2	6	117656	117661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287927
2557	NC_010483	AAC	2	6	117714	117719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170287927
2558	NC_010483	TACTCA	2	12	117761	117772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170287927
2559	NC_010483	TCTG	2	8	117780	117787	0 %	50 %	25 %	25 %	170287927
2560	NC_010483	CTT	2	6	117801	117806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287927
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2562	NC_010483	GAT	2	6	117849	117854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170287927
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2564	NC_010483	GATA	2	8	117980	117987	50 %	25 %	25 %	0 %	170287927
2565	NC_010483	GA	3	6	118006	118011	50 %	0 %	50 %	0 %	170287927
2566	NC_010483	CCG	2	6	118102	118107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170287927
2567	NC_010483	TTCT	2	8	118178	118185	0 %	75 %	0 %	25 %	170287927
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2570	NC_010483	A	7	7	118329	118335	100 %	0 %	0 %	0 %	170287927
2571	NC_010483	TCCT	2	8	118372	118379	0 %	50 %	0 %	50 %	170287927
2572	NC_010483	TCA	2	6	118388	118393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170287927
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2576	NC_010483	GAA	2	6	118551	118556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170287928
2577	NC_010483	TGA	2	6	118569	118574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170287928
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2582	NC_010483	T	6	6	118759	118764	0 %	100 %	0 %	0 %	170287928
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2589	NC_010483	AGAA	2	8	119018	119025	75 %	0 %	25 %	0 %	170287928
2590	NC_010483	CCAT	2	8	119066	119073	25 %	25 %	0 %	50 %	170287928
2591	NC_010483	CAT	2	6	119080	119085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170287928
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2594	NC_010483	A	6	6	119207	119212	100 %	0 %	0 %	0 %	170287928
2595	NC_010483	AG	3	6	119219	119224	50 %	0 %	50 %	0 %	170287928
2596	NC_010483	ATC	2	6	119230	119235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170287928
2597	NC_010483	CGAT	2	8	119256	119263	25 %	25 %	25 %	25 %	170287928
2598	NC_010483	AGA	2	6	119270	119275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170287928
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2601	NC_010483	TC	3	6	119345	119350	0 %	50 %	0 %	50 %	170287928
2602	NC_010483	TTC	2	6	119406	119411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287928
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2605	NC_010483	T	6	6	119492	119497	0 %	100 %	0 %	0 %	170287929
2606	NC_010483	CGA	3	9	119503	119511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170287929
2607	NC_010483	CTT	2	6	119548	119553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287929
2608	NC_010483	AGT	2	6	119644	119649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170287929
2609	NC_010483	GGGTT	2	10	119652	119661	0 %	40 %	60 %	0 %	170287929
2610	NC_010483	GT	3	6	119803	119808	0 %	50 %	50 %	0 %	170287929
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2614	NC_010483	CGT	2	6	120130	120135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170287929
2615	NC_010483	GGTGC	2	10	120210	120219	0 %	20 %	60 %	20 %	170287930
2616	NC_010483	CAA	2	6	120258	120263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170287930
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2618	NC_010483	ACG	2	6	120317	120322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170287930
2619	NC_010483	T	6	6	120346	120351	0 %	100 %	0 %	0 %	170287930
2620	NC_010483	CCT	2	6	120369	120374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170287930
2621	NC_010483	CTGTGC	2	12	120389	120400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170287930
2622	NC_010483	CCG	2	6	120422	120427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170287930
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2624	NC_010483	TCT	2	6	120510	120515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287930
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2627	NC_010483	TGCG	2	8	120597	120604	0 %	25 %	50 %	25 %	170287930
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2633	NC_010483	CTT	2	6	120762	120767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287930
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2654	NC_010483	TCA	2	6	121656	121661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170287930
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2727	NC_010483	TGT	2	6	125216	125221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170287935
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2741	NC_010483	CGTT	2	8	126102	126109	0 %	50 %	25 %	25 %	170287936
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2743	NC_010483	TCT	2	6	126131	126136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287936
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2997	NC_010483	TG	3	6	137060	137065	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2998	NC_010483	AGA	2	6	137201	137206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170287947
2999	NC_010483	CAC	2	6	137243	137248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170287947
3000	NC_010483	ACA	2	6	137281	137286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170287947

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