MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga sp. RQ2 chromosome

Total Repeats: 41425

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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28502	NC_010483	TAT	2	6	1291442	1291447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170289048
28503	NC_010483	TC	3	6	1291449	1291454	0 %	50 %	0 %	50 %	170289048
28504	NC_010483	ACG	2	6	1291512	1291517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170289048
28505	NC_010483	TTC	2	6	1291633	1291638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170289048
28506	NC_010483	GAT	2	6	1291760	1291765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170289048
28507	NC_010483	GTTC	2	8	1291784	1291791	0 %	50 %	25 %	25 %	170289048
28508	NC_010483	CTT	2	6	1291813	1291818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170289048
28509	NC_010483	TCA	2	6	1291828	1291833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170289048
28510	NC_010483	CTA	2	6	1291863	1291868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28511	NC_010483	AGA	2	6	1291922	1291927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170289049
28512	NC_010483	A	7	7	1291934	1291940	100 %	0 %	0 %	0 %	170289049
28513	NC_010483	AGA	2	6	1291959	1291964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170289049
28514	NC_010483	A	6	6	1292085	1292090	100 %	0 %	0 %	0 %	170289049
28515	NC_010483	ATG	2	6	1292130	1292135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170289049
28516	NC_010483	TTG	2	6	1292143	1292148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170289049
28517	NC_010483	CAT	2	6	1292171	1292176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170289049
28518	NC_010483	AAAG	2	8	1292198	1292205	75 %	0 %	25 %	0 %	170289049
28519	NC_010483	AG	3	6	1292220	1292225	50 %	0 %	50 %	0 %	170289049
28520	NC_010483	AT	4	8	1292247	1292254	50 %	50 %	0 %	0 %	170289049
28521	NC_010483	GTTTG	2	10	1292283	1292292	0 %	60 %	40 %	0 %	170289049
28522	NC_010483	GAA	2	6	1292304	1292309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170289049
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28524	NC_010483	GA	3	6	1292384	1292389	50 %	0 %	50 %	0 %	170289049
28525	NC_010483	A	7	7	1292428	1292434	100 %	0 %	0 %	0 %	170289049
28526	NC_010483	GGAA	2	8	1292682	1292689	50 %	0 %	50 %	0 %	170289049
28527	NC_010483	AG	3	6	1292719	1292724	50 %	0 %	50 %	0 %	170289049
28528	NC_010483	CAG	2	6	1292756	1292761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170289049
28529	NC_010483	GTTCAG	2	12	1292864	1292875	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	170289049
28530	NC_010483	GAG	2	6	1292966	1292971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28531	NC_010483	A	8	8	1292988	1292995	100 %	0 %	0 %	0 %	170289050
28532	NC_010483	AGA	2	6	1293019	1293024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170289050
28533	NC_010483	CGA	2	6	1293097	1293102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170289050
28534	NC_010483	GAT	2	6	1293107	1293112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170289050
28535	NC_010483	GTT	2	6	1293113	1293118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170289050
28536	NC_010483	T	7	7	1293126	1293132	0 %	100 %	0 %	0 %	170289050
28537	NC_010483	AAG	2	6	1293236	1293241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170289050
28538	NC_010483	TCGA	2	8	1293337	1293344	25 %	25 %	25 %	25 %	170289050
28539	NC_010483	CTG	2	6	1293348	1293353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170289050
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28543	NC_010483	AAGA	2	8	1293499	1293506	75 %	0 %	25 %	0 %	170289050
28544	NC_010483	GAA	2	6	1293576	1293581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170289051
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28547	NC_010483	TGA	2	6	1293685	1293690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170289051
28548	NC_010483	A	7	7	1293702	1293708	100 %	0 %	0 %	0 %	170289051
28549	NC_010483	GAA	2	6	1293713	1293718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170289051
28550	NC_010483	CTG	2	6	1293759	1293764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170289051
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28552	NC_010483	TC	3	6	1293796	1293801	0 %	50 %	0 %	50 %	170289051
28553	NC_010483	GTT	2	6	1293813	1293818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170289051
28554	NC_010483	TGT	2	6	1293833	1293838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170289051
28555	NC_010483	AGT	2	6	1293872	1293877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170289051
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28557	NC_010483	GTTTT	2	10	1293919	1293928	0 %	80 %	20 %	0 %	170289052
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28561	NC_010483	GAAA	2	8	1294321	1294328	75 %	0 %	25 %	0 %	170289052
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28589	NC_010483	A	6	6	1295978	1295983	100 %	0 %	0 %	0 %	170289053
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28602	NC_010483	ACA	2	6	1296489	1296494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170289054
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28606	NC_010483	GAA	2	6	1296618	1296623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170289054
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28614	NC_010483	GAA	2	6	1296826	1296831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170289054
28615	NC_010483	A	6	6	1296830	1296835	100 %	0 %	0 %	0 %	170289054
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28971	NC_010483	ATT	2	6	1313024	1313029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170289074
28972	NC_010483	ATC	2	6	1313032	1313037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170289074
28973	NC_010483	CTT	2	6	1313055	1313060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170289074
28974	NC_010483	GTCCA	2	10	1313128	1313137	20 %	20 %	20 %	40 %	170289074
28975	NC_010483	TCG	2	6	1313156	1313161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170289074
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28981	NC_010483	CGA	2	6	1313402	1313407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170289075
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28991	NC_010483	CCT	2	6	1313778	1313783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170289076
28992	NC_010483	CCT	2	6	1313806	1313811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170289076
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28999	NC_010483	T	6	6	1314255	1314260	0 %	100 %	0 %	0 %	170289076
29000	NC_010483	CT	3	6	1314289	1314294	0 %	50 %	0 %	50 %	170289076

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