MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga sp. RQ2 chromosome

Total Repeats: 41425

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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27005	NC_010483	ATT	2	6	1223161	1223166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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27013	NC_010483	GGA	2	6	1223622	1223627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27014	NC_010483	TTCG	2	8	1223737	1223744	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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27019	NC_010483	ATCC	2	8	1224093	1224100	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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27123	NC_010483	A	6	6	1229368	1229373	100 %	0 %	0 %	0 %	170288982
27124	NC_010483	A	6	6	1229417	1229422	100 %	0 %	0 %	0 %	170288982
27125	NC_010483	TGAG	2	8	1229479	1229486	25 %	25 %	50 %	0 %	170288982
27126	NC_010483	AAG	2	6	1229641	1229646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288983
27127	NC_010483	GAAG	2	8	1229787	1229794	50 %	0 %	50 %	0 %	170288983
27128	NC_010483	AG	3	6	1229793	1229798	50 %	0 %	50 %	0 %	170288983
27129	NC_010483	TGG	2	6	1229809	1229814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288983
27130	NC_010483	ATA	2	6	1229862	1229867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170288983
27131	NC_010483	CTT	2	6	1229880	1229885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288983
27132	NC_010483	TGG	2	6	1229906	1229911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288983
27133	NC_010483	CAT	2	6	1229927	1229932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288983
27134	NC_010483	CCG	2	6	1229991	1229996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170288983
27135	NC_010483	AG	3	6	1230002	1230007	50 %	0 %	50 %	0 %	170288983
27136	NC_010483	GA	3	6	1230013	1230018	50 %	0 %	50 %	0 %	170288983
27137	NC_010483	AGA	2	6	1230023	1230028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288983
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27141	NC_010483	AG	3	6	1230339	1230344	50 %	0 %	50 %	0 %	170288983
27142	NC_010483	ATA	2	6	1230351	1230356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170288983
27143	NC_010483	AGT	2	6	1230431	1230436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288983
27144	NC_010483	AG	3	6	1230459	1230464	50 %	0 %	50 %	0 %	170288983
27145	NC_010483	A	6	6	1230486	1230491	100 %	0 %	0 %	0 %	170288983
27146	NC_010483	GTC	2	6	1230512	1230517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288984
27147	NC_010483	GAAA	2	8	1230704	1230711	75 %	0 %	25 %	0 %	170288984
27148	NC_010483	CTC	2	6	1230734	1230739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288984
27149	NC_010483	TCA	2	6	1230753	1230758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288984
27150	NC_010483	TGGAA	2	10	1230777	1230786	40 %	20 %	40 %	0 %	170288984
27151	NC_010483	AGG	2	6	1230843	1230848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288984
27152	NC_010483	GTG	2	6	1230929	1230934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288984
27153	NC_010483	AGGA	2	8	1231022	1231029	50 %	0 %	50 %	0 %	170288984
27154	NC_010483	CA	3	6	1231041	1231046	50 %	0 %	0 %	50 %	170288984
27155	NC_010483	TGG	2	6	1231047	1231052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288984
27156	NC_010483	GGT	2	6	1231090	1231095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288984
27157	NC_010483	CTT	2	6	1231142	1231147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288984
27158	NC_010483	A	6	6	1231243	1231248	100 %	0 %	0 %	0 %	170288984
27159	NC_010483	CTT	2	6	1231268	1231273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288984
27160	NC_010483	GAA	2	6	1231282	1231287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288984
27161	NC_010483	ACA	2	6	1231326	1231331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288984
27162	NC_010483	TAC	2	6	1231370	1231375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288984
27163	NC_010483	CGC	2	6	1231486	1231491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170288984
27164	NC_010483	A	6	6	1231533	1231538	100 %	0 %	0 %	0 %	170288984
27165	NC_010483	GAA	2	6	1231543	1231548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288984
27166	NC_010483	ACC	2	6	1231629	1231634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288984
27167	NC_010483	TG	3	6	1231925	1231930	0 %	50 %	50 %	0 %	170288985
27168	NC_010483	TGT	2	6	1231934	1231939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288985
27169	NC_010483	TTGT	2	8	1232019	1232026	0 %	75 %	25 %	0 %	170288985
27170	NC_010483	TATG	2	8	1232101	1232108	25 %	50 %	25 %	0 %	170288986
27171	NC_010483	AGAA	2	8	1232120	1232127	75 %	0 %	25 %	0 %	170288986
27172	NC_010483	TG	3	6	1232135	1232140	0 %	50 %	50 %	0 %	170288986
27173	NC_010483	ACC	2	6	1232165	1232170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288986
27174	NC_010483	CAT	2	6	1232215	1232220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288986
27175	NC_010483	CGT	2	6	1232260	1232265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288986
27176	NC_010483	AGA	2	6	1232287	1232292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288986
27177	NC_010483	AGGA	2	8	1232318	1232325	50 %	0 %	50 %	0 %	170288986
27178	NC_010483	GAA	2	6	1232338	1232343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288986
27179	NC_010483	GCA	2	6	1232362	1232367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288986
27180	NC_010483	CTTT	2	8	1232556	1232563	0 %	75 %	0 %	25 %	170288987
27181	NC_010483	TCT	2	6	1232601	1232606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288987
27182	NC_010483	CTC	2	6	1232640	1232645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288987
27183	NC_010483	ACG	2	6	1232647	1232652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288987
27184	NC_010483	AGC	2	6	1232717	1232722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288987
27185	NC_010483	T	6	6	1232801	1232806	0 %	100 %	0 %	0 %	170288987
27186	NC_010483	AGA	2	6	1232876	1232881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288987
27187	NC_010483	TGA	2	6	1233017	1233022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288987
27188	NC_010483	CAT	2	6	1233023	1233028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288987
27189	NC_010483	TGGAA	2	10	1233038	1233047	40 %	20 %	40 %	0 %	170288987
27190	NC_010483	CTT	2	6	1233091	1233096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288987
27191	NC_010483	CAGA	2	8	1233134	1233141	50 %	0 %	25 %	25 %	170288987
27192	NC_010483	GA	3	6	1233182	1233187	50 %	0 %	50 %	0 %	170288987
27193	NC_010483	GAA	2	6	1233233	1233238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288987
27194	NC_010483	ATA	2	6	1233243	1233248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170288987
27195	NC_010483	GA	3	6	1233263	1233268	50 %	0 %	50 %	0 %	170288987
27196	NC_010483	AAAATC	2	12	1233288	1233299	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	170288987
27197	NC_010483	GAG	2	6	1233307	1233312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288987
27198	NC_010483	TGTT	2	8	1233322	1233329	0 %	75 %	25 %	0 %	170288988
27199	NC_010483	TGT	2	6	1233356	1233361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288988
27200	NC_010483	GCG	2	6	1233444	1233449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170288988
27201	NC_010483	CTT	2	6	1233540	1233545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288988
27202	NC_010483	CGC	2	6	1233563	1233568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170288988
27203	NC_010483	GGGAT	2	10	1233587	1233596	20 %	20 %	60 %	0 %	170288988
27204	NC_010483	ACG	2	6	1233606	1233611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288988
27205	NC_010483	CAT	2	6	1233659	1233664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288988
27206	NC_010483	TGTGG	2	10	1233743	1233752	0 %	40 %	60 %	0 %	170288988
27207	NC_010483	CTT	2	6	1233810	1233815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288988
27208	NC_010483	A	8	8	1233904	1233911	100 %	0 %	0 %	0 %	170288988
27209	NC_010483	CTT	2	6	1233925	1233930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27210	NC_010483	CTC	2	6	1233972	1233977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288989
27211	NC_010483	TAC	3	9	1233999	1234007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288989
27212	NC_010483	TCC	2	6	1234025	1234030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288989
27213	NC_010483	TCC	2	6	1234053	1234058	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288989
27214	NC_010483	TGG	2	6	1234147	1234152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288989
27215	NC_010483	AAG	2	6	1234200	1234205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288989
27216	NC_010483	GGT	2	6	1234226	1234231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288989
27217	NC_010483	CTA	2	6	1234256	1234261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288989
27218	NC_010483	CGT	2	6	1234295	1234300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288989
27219	NC_010483	GGAGAA	2	12	1234305	1234316	50 %	0 %	50 %	0 %	170288989
27220	NC_010483	AG	3	6	1234337	1234342	50 %	0 %	50 %	0 %	170288989
27221	NC_010483	AGCA	2	8	1234346	1234353	50 %	0 %	25 %	25 %	170288989
27222	NC_010483	AG	3	6	1234461	1234466	50 %	0 %	50 %	0 %	170288989
27223	NC_010483	GA	3	6	1234500	1234505	50 %	0 %	50 %	0 %	170288989
27224	NC_010483	CGA	2	6	1234507	1234512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288989
27225	NC_010483	TCT	2	6	1234657	1234662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288989
27226	NC_010483	TG	3	6	1234705	1234710	0 %	50 %	50 %	0 %	170288989
27227	NC_010483	ATG	2	6	1234716	1234721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288989
27228	NC_010483	GTG	2	6	1234742	1234747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288989
27229	NC_010483	TGA	2	6	1234763	1234768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288989
27230	NC_010483	TGG	2	6	1234789	1234794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288989
27231	NC_010483	TGA	2	6	1234906	1234911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288989
27232	NC_010483	GAA	2	6	1234919	1234924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288989
27233	NC_010483	A	6	6	1235010	1235015	100 %	0 %	0 %	0 %	170288989
27234	NC_010483	GAG	2	6	1235171	1235176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288989
27235	NC_010483	CTA	2	6	1235192	1235197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288989
27236	NC_010483	CT	4	8	1235279	1235286	0 %	50 %	0 %	50 %	170288989
27237	NC_010483	TTTC	2	8	1235303	1235310	0 %	75 %	0 %	25 %	170288990
27238	NC_010483	GCTCT	2	10	1235345	1235354	0 %	40 %	20 %	40 %	170288990
27239	NC_010483	GCG	2	6	1235355	1235360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170288990
27240	NC_010483	GTT	2	6	1235409	1235414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288990
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27329	NC_010483	ATC	2	6	1239131	1239136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288995
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27340	NC_010483	CCTG	2	8	1239421	1239428	0 %	25 %	25 %	50 %	170288995
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27347	NC_010483	AAG	2	6	1239825	1239830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288996
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27353	NC_010483	T	6	6	1240014	1240019	0 %	100 %	0 %	0 %	170288996
27354	NC_010483	CAC	2	6	1240080	1240085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288996
27355	NC_010483	GCC	2	6	1240089	1240094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170288996
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