MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga sp. RQ2 chromosome

Total Repeats: 41425

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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26502	NC_010483	TCT	2	6	1200808	1200813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288951
26503	NC_010483	CTC	2	6	1200829	1200834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288951
26504	NC_010483	TCC	2	6	1200870	1200875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288951
26505	NC_010483	TCA	2	6	1201078	1201083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288951
26506	NC_010483	TTC	2	6	1201093	1201098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288951
26507	NC_010483	TGG	2	6	1201142	1201147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288951
26508	NC_010483	TCT	2	6	1201193	1201198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288951
26509	NC_010483	AGA	2	6	1201298	1201303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288951
26510	NC_010483	TCC	2	6	1201314	1201319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288951
26511	NC_010483	TTC	2	6	1201345	1201350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288951
26512	NC_010483	GTC	2	6	1201390	1201395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288951
26513	NC_010483	GCG	2	6	1201396	1201401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170288951
26514	NC_010483	CCA	2	6	1201490	1201495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288951
26515	NC_010483	TTGT	2	8	1201510	1201517	0 %	75 %	25 %	0 %	170288951
26516	NC_010483	CT	3	6	1201518	1201523	0 %	50 %	0 %	50 %	170288951
26517	NC_010483	AG	3	6	1201601	1201606	50 %	0 %	50 %	0 %	170288951
26518	NC_010483	CAT	2	6	1201854	1201859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288951
26519	NC_010483	T	6	6	1201877	1201882	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26520	NC_010483	ATCA	2	8	1201885	1201892	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26521	NC_010483	TA	3	6	1201895	1201900	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26522	NC_010483	T	7	7	1201926	1201932	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26523	NC_010483	AGA	2	6	1201984	1201989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288952
26524	NC_010483	GAA	2	6	1201997	1202002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288952
26525	NC_010483	TGG	2	6	1202004	1202009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288952
26526	NC_010483	A	6	6	1202018	1202023	100 %	0 %	0 %	0 %	170288952
26527	NC_010483	GA	3	6	1202067	1202072	50 %	0 %	50 %	0 %	170288952
26528	NC_010483	GAA	2	6	1202190	1202195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288952
26529	NC_010483	A	6	6	1202202	1202207	100 %	0 %	0 %	0 %	170288952
26530	NC_010483	ACC	2	6	1202239	1202244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288952
26531	NC_010483	TC	3	6	1202251	1202256	0 %	50 %	0 %	50 %	170288952
26532	NC_010483	TCG	2	6	1202415	1202420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288952
26533	NC_010483	CGA	2	6	1202422	1202427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288952
26534	NC_010483	GTT	2	6	1202473	1202478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288952
26535	NC_010483	AGA	2	6	1202485	1202490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288952
26536	NC_010483	AGA	2	6	1202547	1202552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288952
26537	NC_010483	A	6	6	1202742	1202747	100 %	0 %	0 %	0 %	170288952
26538	NC_010483	T	6	6	1202784	1202789	0 %	100 %	0 %	0 %	170288952
26539	NC_010483	CCA	2	6	1202838	1202843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288952
26540	NC_010483	GTG	2	6	1202933	1202938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288952
26541	NC_010483	TTC	2	6	1203017	1203022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288952
26542	NC_010483	AGAA	2	8	1203023	1203030	75 %	0 %	25 %	0 %	170288952
26543	NC_010483	GTC	2	6	1203044	1203049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288952
26544	NC_010483	TCA	2	6	1203073	1203078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288952
26545	NC_010483	GAA	2	6	1203093	1203098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288952
26546	NC_010483	TGG	2	6	1203108	1203113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288952
26547	NC_010483	AGATAG	2	12	1203233	1203244	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	170288953
26548	NC_010483	TCG	2	6	1203269	1203274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288953
26549	NC_010483	GAC	2	6	1203280	1203285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288953
26550	NC_010483	AG	3	6	1203306	1203311	50 %	0 %	50 %	0 %	170288953
26551	NC_010483	CTT	2	6	1203324	1203329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288953
26552	NC_010483	CAC	2	6	1203330	1203335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288953
26553	NC_010483	GGA	2	6	1203403	1203408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288953
26554	NC_010483	AC	3	6	1203420	1203425	50 %	0 %	0 %	50 %	170288953
26555	NC_010483	TTCT	2	8	1203524	1203531	0 %	75 %	0 %	25 %	170288953
26556	NC_010483	CAT	2	6	1203552	1203557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288953
26557	NC_010483	AGAA	2	8	1203559	1203566	75 %	0 %	25 %	0 %	170288953
26558	NC_010483	CTTTT	2	10	1203647	1203656	0 %	80 %	0 %	20 %	170288953
26559	NC_010483	AG	3	6	1203666	1203671	50 %	0 %	50 %	0 %	170288953
26560	NC_010483	GA	4	8	1203676	1203683	50 %	0 %	50 %	0 %	170288953
26561	NC_010483	AGG	2	6	1203690	1203695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288953
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26563	NC_010483	GT	3	6	1203819	1203824	0 %	50 %	50 %	0 %	170288954
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26566	NC_010483	GC	3	6	1203985	1203990	0 %	0 %	50 %	50 %	170288954
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26570	NC_010483	TGGA	2	8	1204130	1204137	25 %	25 %	50 %	0 %	170288954
26571	NC_010483	GAA	2	6	1204166	1204171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288954
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26583	NC_010483	TGG	2	6	1204669	1204674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288955
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26585	NC_010483	GCTC	2	8	1204751	1204758	0 %	25 %	25 %	50 %	170288955
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26587	NC_010483	CCCT	2	8	1204805	1204812	0 %	25 %	0 %	75 %	170288955
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26589	NC_010483	AC	3	6	1204878	1204883	50 %	0 %	0 %	50 %	170288955
26590	NC_010483	GAT	2	6	1204899	1204904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288955
26591	NC_010483	GGA	2	6	1204958	1204963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288955
26592	NC_010483	GA	4	8	1204971	1204978	50 %	0 %	50 %	0 %	170288955
26593	NC_010483	CGA	2	6	1204982	1204987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288955
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26600	NC_010483	AAAG	2	8	1205161	1205168	75 %	0 %	25 %	0 %	170288956
26601	NC_010483	GAA	2	6	1205214	1205219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288956
26602	NC_010483	AG	3	6	1205232	1205237	50 %	0 %	50 %	0 %	170288956
26603	NC_010483	GGT	2	6	1205238	1205243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288956
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26605	NC_010483	TG	3	6	1205275	1205280	0 %	50 %	50 %	0 %	170288956
26606	NC_010483	GTG	2	6	1205330	1205335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288956
26607	NC_010483	ATG	2	6	1205407	1205412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288956
26608	NC_010483	CTC	2	6	1205515	1205520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288956
26609	NC_010483	CTG	2	6	1205552	1205557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288956
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26611	NC_010483	AG	4	8	1205619	1205626	50 %	0 %	50 %	0 %	170288956
26612	NC_010483	TAC	2	6	1205647	1205652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288956
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26614	NC_010483	GAC	2	6	1205677	1205682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288956
26615	NC_010483	ACGA	2	8	1205755	1205762	50 %	0 %	25 %	25 %	170288956
26616	NC_010483	GAA	2	6	1205772	1205777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288956
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