MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga sp. RQ2 chromosome

Total Repeats: 41425

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
25501	NC_010483	GATC	2	8	1156071	1156078	25 %	25 %	25 %	25 %	170288903
25502	NC_010483	TGC	2	6	1156122	1156127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288903
25503	NC_010483	GAA	2	6	1156131	1156136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288903
25504	NC_010483	GA	3	6	1156160	1156165	50 %	0 %	50 %	0 %	170288903
25505	NC_010483	CCA	2	6	1156169	1156174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288903
25506	NC_010483	TCT	2	6	1156181	1156186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288903
25507	NC_010483	CAC	2	6	1156255	1156260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288904
25508	NC_010483	GAATTC	2	12	1156275	1156286	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	170288904
25509	NC_010483	TTTC	2	8	1156337	1156344	0 %	75 %	0 %	25 %	170288904
25510	NC_010483	TTCA	2	8	1156416	1156423	25 %	50 %	0 %	25 %	170288904
25511	NC_010483	TCGTAT	2	12	1156453	1156464	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	170288904
25512	NC_010483	TTTC	2	8	1156477	1156484	0 %	75 %	0 %	25 %	170288904
25513	NC_010483	TC	3	6	1156493	1156498	0 %	50 %	0 %	50 %	170288904
25514	NC_010483	GGT	2	6	1156668	1156673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288904
25515	NC_010483	AGT	2	6	1156718	1156723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288904
25516	NC_010483	TTC	2	6	1156830	1156835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288904
25517	NC_010483	A	7	7	1156912	1156918	100 %	0 %	0 %	0 %	170288904
25518	NC_010483	TCA	2	6	1157045	1157050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288904
25519	NC_010483	CCGA	2	8	1157058	1157065	25 %	0 %	25 %	50 %	170288904
25520	NC_010483	TTC	2	6	1157073	1157078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288904
25521	NC_010483	GTA	2	6	1157121	1157126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288904
25522	NC_010483	T	6	6	1157136	1157141	0 %	100 %	0 %	0 %	170288904
25523	NC_010483	GAG	2	6	1157150	1157155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288904
25524	NC_010483	GAGG	2	8	1157179	1157186	25 %	0 %	75 %	0 %	170288904
25525	NC_010483	TTC	2	6	1157223	1157228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288904
25526	NC_010483	CATC	2	8	1157279	1157286	25 %	25 %	0 %	50 %	170288904
25527	NC_010483	TGC	2	6	1157382	1157387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288904
25528	NC_010483	ACA	2	6	1157417	1157422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288904
25529	NC_010483	CCT	3	9	1157441	1157449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25530	NC_010483	T	6	6	1157509	1157514	0 %	100 %	0 %	0 %	170288905
25531	NC_010483	ACG	2	6	1157519	1157524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288905
25532	NC_010483	GA	3	6	1157535	1157540	50 %	0 %	50 %	0 %	170288905
25533	NC_010483	AGA	2	6	1157554	1157559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288905
25534	NC_010483	AGA	2	6	1157571	1157576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288905
25535	NC_010483	GAA	3	9	1157593	1157601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288905
25536	NC_010483	AGGA	2	8	1157645	1157652	50 %	0 %	50 %	0 %	170288905
25537	NC_010483	AAGA	2	8	1157676	1157683	75 %	0 %	25 %	0 %	170288905
25538	NC_010483	GAT	2	6	1157686	1157691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288905
25539	NC_010483	GAAG	2	8	1157724	1157731	50 %	0 %	50 %	0 %	170288905
25540	NC_010483	AG	3	6	1157776	1157781	50 %	0 %	50 %	0 %	170288905
25541	NC_010483	GA	3	6	1157832	1157837	50 %	0 %	50 %	0 %	170288905
25542	NC_010483	GA	3	6	1157845	1157850	50 %	0 %	50 %	0 %	170288905
25543	NC_010483	GA	3	6	1157870	1157875	50 %	0 %	50 %	0 %	170288905
25544	NC_010483	TCT	2	6	1157876	1157881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288905
25545	NC_010483	GGT	2	6	1157916	1157921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288905
25546	NC_010483	CTG	2	6	1157991	1157996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288906
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25549	NC_010483	TCG	2	6	1158139	1158144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288906
25550	NC_010483	GAA	2	6	1158180	1158185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288906
25551	NC_010483	TCGAAG	2	12	1158189	1158200	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	170288906
25552	NC_010483	CG	3	6	1158223	1158228	0 %	0 %	50 %	50 %	170288906
25553	NC_010483	AAC	2	6	1158276	1158281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288906
25554	NC_010483	GTT	2	6	1158291	1158296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288906
25555	NC_010483	AGA	2	6	1158299	1158304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288906
25556	NC_010483	GAAGG	2	10	1158305	1158314	40 %	0 %	60 %	0 %	170288906
25557	NC_010483	CTG	2	6	1158393	1158398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288906
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25562	NC_010483	GAT	2	6	1158617	1158622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288906
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25578	NC_010483	GA	4	8	1159218	1159225	50 %	0 %	50 %	0 %	170288906
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25584	NC_010483	AGA	2	6	1159418	1159423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288906
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25598	NC_010483	CACT	2	8	1160027	1160034	25 %	25 %	0 %	50 %	170288906
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25602	NC_010483	GAA	2	6	1160252	1160257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288906
25603	NC_010483	TCAG	2	8	1160278	1160285	25 %	25 %	25 %	25 %	170288906
25604	NC_010483	CT	3	6	1160293	1160298	0 %	50 %	0 %	50 %	170288906
25605	NC_010483	TCG	2	6	1160370	1160375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288907
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25614	NC_010483	CCAT	2	8	1160831	1160838	25 %	25 %	0 %	50 %	170288907
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