MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga sp. RQ2 chromosome

Total Repeats: 41425

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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24502	NC_010483	CTT	2	6	1110398	1110403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288856
24503	NC_010483	TTCG	2	8	1110411	1110418	0 %	50 %	25 %	25 %	170288856
24504	NC_010483	CAA	2	6	1110464	1110469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288856
24505	NC_010483	AGA	2	6	1110471	1110476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288856
24506	NC_010483	ACC	2	6	1110492	1110497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288856
24507	NC_010483	TCA	2	6	1110521	1110526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288856
24508	NC_010483	GAT	2	6	1110560	1110565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288856
24509	NC_010483	CCT	2	6	1110622	1110627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288856
24510	NC_010483	GAAG	2	8	1110646	1110653	50 %	0 %	50 %	0 %	170288856
24511	NC_010483	ATT	2	6	1110694	1110699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170288856
24512	NC_010483	TAT	3	9	1110738	1110746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170288856
24513	NC_010483	CAA	2	6	1110780	1110785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288857
24514	NC_010483	CCA	2	6	1110885	1110890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288857
24515	NC_010483	CTTT	2	8	1110927	1110934	0 %	75 %	0 %	25 %	170288857
24516	NC_010483	T	7	7	1110940	1110946	0 %	100 %	0 %	0 %	170288857
24517	NC_010483	TGC	2	6	1111051	1111056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288857
24518	NC_010483	GTG	2	6	1111076	1111081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288857
24519	NC_010483	GTG	2	6	1111100	1111105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288857
24520	NC_010483	GTT	2	6	1111141	1111146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288857
24521	NC_010483	CGC	2	6	1111180	1111185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170288857
24522	NC_010483	T	6	6	1111377	1111382	0 %	100 %	0 %	0 %	170288857
24523	NC_010483	TAT	2	6	1111426	1111431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170288857
24524	NC_010483	TGG	2	6	1111436	1111441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288857
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24536	NC_010483	CT	3	6	1111944	1111949	0 %	50 %	0 %	50 %	170288858
24537	NC_010483	TC	3	6	1112002	1112007	0 %	50 %	0 %	50 %	170288858
24538	NC_010483	CAT	2	6	1112031	1112036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288858
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24540	NC_010483	AAT	2	6	1112195	1112200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170288858
24541	NC_010483	CCT	2	6	1112297	1112302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288858
24542	NC_010483	AGATGT	2	12	1112325	1112336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288858
24543	NC_010483	GCT	2	6	1112359	1112364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288858
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24545	NC_010483	TCT	2	6	1112433	1112438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288858
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24551	NC_010483	AC	3	6	1112739	1112744	50 %	0 %	0 %	50 %	170288859
24552	NC_010483	C	6	6	1112813	1112818	0 %	0 %	0 %	100 %	170288860
24553	NC_010483	TTTTC	2	10	1112828	1112837	0 %	80 %	0 %	20 %	170288860
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24555	NC_010483	GAT	2	6	1112849	1112854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288860
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24560	NC_010483	CTT	2	6	1113202	1113207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288860
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24565	NC_010483	TC	3	6	1113463	1113468	0 %	50 %	0 %	50 %	170288861
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24590	NC_010483	GAAA	2	8	1114598	1114605	75 %	0 %	25 %	0 %	170288862
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24602	NC_010483	CTTC	2	8	1115325	1115332	0 %	50 %	0 %	50 %	170288862
24603	NC_010483	ACA	2	6	1115378	1115383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288862
24604	NC_010483	TCCTC	2	10	1115470	1115479	0 %	40 %	0 %	60 %	170288863
24605	NC_010483	ATC	2	6	1115572	1115577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288863
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24607	NC_010483	T	6	6	1115781	1115786	0 %	100 %	0 %	0 %	170288863
24608	NC_010483	TTC	2	6	1115793	1115798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288863
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24613	NC_010483	TC	3	6	1116005	1116010	0 %	50 %	0 %	50 %	170288863
24614	NC_010483	TC	3	6	1116063	1116068	0 %	50 %	0 %	50 %	170288863
24615	NC_010483	TCA	2	6	1116097	1116102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288863
24616	NC_010483	CA	3	6	1116101	1116106	50 %	0 %	0 %	50 %	170288863
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24976	NC_010483	CCT	2	6	1131831	1131836	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288879
24977	NC_010483	TAT	2	6	1131877	1131882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170288879
24978	NC_010483	CTTT	2	8	1131941	1131948	0 %	75 %	0 %	25 %	170288879
24979	NC_010483	CAC	2	6	1132013	1132018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288880
24980	NC_010483	TAT	2	6	1132097	1132102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170288880
24981	NC_010483	GCTT	2	8	1132129	1132136	0 %	50 %	25 %	25 %	170288880
24982	NC_010483	T	6	6	1132148	1132153	0 %	100 %	0 %	0 %	170288880
24983	NC_010483	TCC	2	6	1132167	1132172	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288880
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24987	NC_010483	CAC	2	6	1132295	1132300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288880
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24991	NC_010483	GAG	2	6	1132475	1132480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288880
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24995	NC_010483	GCT	2	6	1132734	1132739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288880
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