MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga sp. RQ2 chromosome

Total Repeats: 41425

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_010483	TGT	2	6	815874	815879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288589
18002	NC_010483	T	6	6	815907	815912	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18003	NC_010483	A	6	6	815934	815939	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18004	NC_010483	CTG	2	6	816007	816012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288590
18005	NC_010483	T	6	6	816023	816028	0 %	100 %	0 %	0 %	170288590
18006	NC_010483	GAAG	2	8	816103	816110	50 %	0 %	50 %	0 %	170288590
18007	NC_010483	AC	3	6	816154	816159	50 %	0 %	0 %	50 %	170288590
18008	NC_010483	GCA	2	6	816187	816192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288590
18009	NC_010483	AAC	2	6	816226	816231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288590
18010	NC_010483	GGT	2	6	816261	816266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288590
18011	NC_010483	GTT	2	6	816316	816321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288590
18012	NC_010483	GCT	2	6	816349	816354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288590
18013	NC_010483	G	6	6	816438	816443	0 %	0 %	100 %	0 %	170288590
18014	NC_010483	TTC	2	6	816458	816463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288590
18015	NC_010483	TTGA	2	8	816502	816509	25 %	50 %	25 %	0 %	170288590
18016	NC_010483	TA	4	8	816529	816536	50 %	50 %	0 %	0 %	170288590
18017	NC_010483	AG	3	6	816547	816552	50 %	0 %	50 %	0 %	170288590
18018	NC_010483	CT	3	6	816593	816598	0 %	50 %	0 %	50 %	170288590
18019	NC_010483	AGC	2	6	816638	816643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288590
18020	NC_010483	TGG	2	6	816659	816664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288590
18021	NC_010483	GAT	2	6	816691	816696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288590
18022	NC_010483	CTT	2	6	816702	816707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288590
18023	NC_010483	TGG	2	6	816713	816718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288590
18024	NC_010483	AAG	2	6	816773	816778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288590
18025	NC_010483	TTC	2	6	816885	816890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288590
18026	NC_010483	A	7	7	816931	816937	100 %	0 %	0 %	0 %	170288590
18027	NC_010483	TGA	2	6	817026	817031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288590
18028	NC_010483	ACC	2	6	817114	817119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288590
18029	NC_010483	ACA	2	6	817120	817125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288590
18030	NC_010483	ACA	2	6	817193	817198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288590
18031	NC_010483	CT	3	6	817236	817241	0 %	50 %	0 %	50 %	170288590
18032	NC_010483	TCA	2	6	817323	817328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288591
18033	NC_010483	AC	3	6	817330	817335	50 %	0 %	0 %	50 %	170288591
18034	NC_010483	CTT	2	6	817384	817389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288591
18035	NC_010483	CTT	2	6	817578	817583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288591
18036	NC_010483	ATG	2	6	817584	817589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288591
18037	NC_010483	TTCTT	2	10	817605	817614	0 %	80 %	0 %	20 %	170288591
18038	NC_010483	CTC	2	6	817629	817634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288591
18039	NC_010483	GCA	2	6	817662	817667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288591
18040	NC_010483	CT	3	6	817668	817673	0 %	50 %	0 %	50 %	170288591
18041	NC_010483	ATG	2	6	817677	817682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288591
18042	NC_010483	AGG	2	6	817701	817706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288591
18043	NC_010483	TCG	2	6	817720	817725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288591
18044	NC_010483	AAG	2	6	817726	817731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288591
18045	NC_010483	TGA	2	6	817765	817770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288591
18046	NC_010483	T	6	6	817835	817840	0 %	100 %	0 %	0 %	170288591
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18051	NC_010483	TCTGT	2	10	818193	818202	0 %	60 %	20 %	20 %	170288591
18052	NC_010483	TCT	2	6	818218	818223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288591
18053	NC_010483	TTC	2	6	818225	818230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288591
18054	NC_010483	GTCT	2	8	818255	818262	0 %	50 %	25 %	25 %	170288591
18055	NC_010483	TTTTC	2	10	818263	818272	0 %	80 %	0 %	20 %	170288591
18056	NC_010483	TC	3	6	818300	818305	0 %	50 %	0 %	50 %	170288591
18057	NC_010483	TC	3	6	818376	818381	0 %	50 %	0 %	50 %	170288591
18058	NC_010483	AGC	2	6	818384	818389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288591
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18060	NC_010483	CTT	2	6	818455	818460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288591
18061	NC_010483	TCC	2	6	818490	818495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288591
18062	NC_010483	AAGA	2	8	818497	818504	75 %	0 %	25 %	0 %	170288591
18063	NC_010483	GATC	2	8	818518	818525	25 %	25 %	25 %	25 %	170288591
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18066	NC_010483	CAA	2	6	818680	818685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288591
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18070	NC_010483	TC	3	6	818979	818984	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18071	NC_010483	ACA	2	6	818995	819000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18072	NC_010483	ATC	2	6	819012	819017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18073	NC_010483	CA	3	6	819080	819085	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18074	NC_010483	ATT	2	6	819088	819093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18075	NC_010483	ATG	2	6	819099	819104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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18089	NC_010483	CGCA	2	8	819854	819861	25 %	0 %	25 %	50 %	170288592
18090	NC_010483	CATG	2	8	819906	819913	25 %	25 %	25 %	25 %	170288592
18091	NC_010483	GGA	3	9	819925	819933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288592
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18094	NC_010483	TCA	2	6	820310	820315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288592
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18098	NC_010483	CTTCT	2	10	820557	820566	0 %	60 %	0 %	40 %	170288592
18099	NC_010483	TTC	2	6	820592	820597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288592
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18121	NC_010483	CGG	2	6	821312	821317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170288593
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18123	NC_010483	TCC	2	6	821431	821436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288593
18124	NC_010483	ACC	2	6	821523	821528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288593
18125	NC_010483	CT	3	6	821567	821572	0 %	50 %	0 %	50 %	170288593
18126	NC_010483	TCACGA	2	12	821584	821595	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	170288593
18127	NC_010483	T	6	6	821617	821622	0 %	100 %	0 %	0 %	170288593
18128	NC_010483	GTT	2	6	821628	821633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288593
18129	NC_010483	T	6	6	821658	821663	0 %	100 %	0 %	0 %	170288593
18130	NC_010483	CCATAG	2	12	821664	821675	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	170288593
18131	NC_010483	CT	3	6	821679	821684	0 %	50 %	0 %	50 %	170288593
18132	NC_010483	CCT	2	6	821703	821708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18133	NC_010483	TG	3	6	821721	821726	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18134	NC_010483	TTA	2	6	821743	821748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18135	NC_010483	TGG	2	6	821771	821776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18136	NC_010483	GTA	2	6	821796	821801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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18138	NC_010483	GCAAA	2	10	821869	821878	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
18139	NC_010483	ACC	2	6	821882	821887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18140	NC_010483	GGT	2	6	821922	821927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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18143	NC_010483	ACC	2	6	822035	822040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18144	NC_010483	TACC	2	8	822083	822090	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
18145	NC_010483	TACC	2	8	822094	822101	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
18146	NC_010483	GGT	2	6	822107	822112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18147	NC_010483	ATT	2	6	822124	822129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18148	NC_010483	TCA	2	6	822137	822142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18149	NC_010483	ACC	2	6	822177	822182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18150	NC_010483	TAT	2	6	822192	822197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18151	NC_010483	TAC	3	9	822199	822207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18152	NC_010483	TAA	2	6	822208	822213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18153	NC_010483	GGT	2	6	822239	822244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18154	NC_010483	A	7	7	822245	822251	100 %	0 %	0 %	0 %	170288594
18155	NC_010483	A	7	7	822282	822288	100 %	0 %	0 %	0 %	170288594
18156	NC_010483	TTCT	2	8	822296	822303	0 %	75 %	0 %	25 %	170288594
18157	NC_010483	A	6	6	822526	822531	100 %	0 %	0 %	0 %	170288594
18158	NC_010483	AGA	2	6	822538	822543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288594
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18166	NC_010483	CA	3	6	822921	822926	50 %	0 %	0 %	50 %	170288595
18167	NC_010483	GTCT	2	8	822929	822936	0 %	50 %	25 %	25 %	170288595
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18190	NC_010483	CA	3	6	824169	824174	50 %	0 %	0 %	50 %	170288597
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18222	NC_010483	GGCG	2	8	825432	825439	0 %	0 %	75 %	25 %	170288597
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18226	NC_010483	GA	3	6	825832	825837	50 %	0 %	50 %	0 %	170288598
18227	NC_010483	GATC	2	8	825941	825948	25 %	25 %	25 %	25 %	170288598
18228	NC_010483	CTA	2	6	825977	825982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288598
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18230	NC_010483	GCAG	2	8	826020	826027	25 %	0 %	50 %	25 %	170288598
18231	NC_010483	TGT	2	6	826028	826033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288598
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18234	NC_010483	CAG	2	6	826168	826173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288599
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18241	NC_010483	GTT	2	6	826582	826587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288599
18242	NC_010483	GCT	2	6	826593	826598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288599
18243	NC_010483	AGC	2	6	826602	826607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288599
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18245	NC_010483	ATC	2	6	826639	826644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288599
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18484	NC_010483	GGAG	2	8	835439	835446	25 %	0 %	75 %	0 %	170288607
18485	NC_010483	GAA	2	6	835480	835485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288607
18486	NC_010483	GAA	2	6	835566	835571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288607
18487	NC_010483	GTC	2	6	835591	835596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288607
18488	NC_010483	GCG	2	6	835616	835621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170288607
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18491	NC_010483	TGA	2	6	835915	835920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288608
18492	NC_010483	GAAAA	2	10	835954	835963	80 %	0 %	20 %	0 %	170288608
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18495	NC_010483	ACCTG	2	10	836009	836018	20 %	20 %	20 %	40 %	170288608
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