MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga sp. RQ2 chromosome

Total Repeats: 41425

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_010483	CAC	2	6	701385	701390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288479
15502	NC_010483	TGG	2	6	701466	701471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288479
15503	NC_010483	AGA	2	6	701472	701477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288479
15504	NC_010483	A	6	6	701494	701499	100 %	0 %	0 %	0 %	170288479
15505	NC_010483	ACAG	2	8	701510	701517	50 %	0 %	25 %	25 %	170288479
15506	NC_010483	GAA	2	6	701567	701572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288479
15507	NC_010483	TC	3	6	701618	701623	0 %	50 %	0 %	50 %	170288479
15508	NC_010483	GAAG	2	8	701695	701702	50 %	0 %	50 %	0 %	170288479
15509	NC_010483	AG	3	6	701734	701739	50 %	0 %	50 %	0 %	170288479
15510	NC_010483	TCT	2	6	701749	701754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288479
15511	NC_010483	AGGA	2	8	701767	701774	50 %	0 %	50 %	0 %	170288479
15512	NC_010483	CTG	2	6	701789	701794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288479
15513	NC_010483	ATGA	2	8	701827	701834	50 %	25 %	25 %	0 %	170288479
15514	NC_010483	TCCCCT	2	12	701846	701857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15515	NC_010483	CTTT	2	8	701907	701914	0 %	75 %	0 %	25 %	170288480
15516	NC_010483	TTC	2	6	702079	702084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288480
15517	NC_010483	CTTT	2	8	702092	702099	0 %	75 %	0 %	25 %	170288480
15518	NC_010483	CTT	2	6	702120	702125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288480
15519	NC_010483	CCT	2	6	702139	702144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15520	NC_010483	TAC	2	6	702347	702352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288481
15521	NC_010483	TTTC	2	8	702426	702433	0 %	75 %	0 %	25 %	170288481
15522	NC_010483	TTCT	2	8	702480	702487	0 %	75 %	0 %	25 %	170288481
15523	NC_010483	CTTC	2	8	702611	702618	0 %	50 %	0 %	50 %	170288481
15524	NC_010483	AGC	2	6	702672	702677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288481
15525	NC_010483	TCC	2	6	702693	702698	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288481
15526	NC_010483	AGA	2	6	702709	702714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288481
15527	NC_010483	TCT	2	6	702738	702743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288481
15528	NC_010483	ATC	2	6	702771	702776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288481
15529	NC_010483	GAT	2	6	702779	702784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288481
15530	NC_010483	ACC	2	6	702841	702846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288481
15531	NC_010483	TCA	2	6	702932	702937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288481
15532	NC_010483	TTC	2	6	702939	702944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288481
15533	NC_010483	CTTC	2	8	702950	702957	0 %	50 %	0 %	50 %	170288481
15534	NC_010483	AAG	2	6	703008	703013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288481
15535	NC_010483	TCT	3	9	703015	703023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288481
15536	NC_010483	GTG	2	6	703024	703029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288481
15537	NC_010483	GA	3	6	703059	703064	50 %	0 %	50 %	0 %	170288481
15538	NC_010483	GTA	2	6	703134	703139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288481
15539	NC_010483	TGA	2	6	703145	703150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288481
15540	NC_010483	CCA	2	6	703193	703198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288481
15541	NC_010483	TTC	2	6	703269	703274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288481
15542	NC_010483	AAG	2	6	703317	703322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288481
15543	NC_010483	TCTTT	2	10	703376	703385	0 %	80 %	0 %	20 %	170288481
15544	NC_010483	CTT	2	6	703400	703405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288481
15545	NC_010483	GA	3	6	703417	703422	50 %	0 %	50 %	0 %	170288481
15546	NC_010483	CT	3	6	703425	703430	0 %	50 %	0 %	50 %	170288481
15547	NC_010483	CTT	2	6	703445	703450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288481
15548	NC_010483	ATT	2	6	703558	703563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170288481
15549	NC_010483	CAG	2	6	703578	703583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288481
15550	NC_010483	CTT	2	6	703740	703745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288481
15551	NC_010483	TCA	2	6	703784	703789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288481
15552	NC_010483	CTT	2	6	703814	703819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288481
15553	NC_010483	CGA	2	6	703820	703825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288481
15554	NC_010483	CTC	2	6	703861	703866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288481
15555	NC_010483	TTC	2	6	703941	703946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288481
15556	NC_010483	GAG	2	6	703953	703958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288481
15557	NC_010483	TCT	2	6	703961	703966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288481
15558	NC_010483	TCT	2	6	703973	703978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288481
15559	NC_010483	CTT	2	6	703990	703995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288482
15560	NC_010483	CCT	2	6	703998	704003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288482
15561	NC_010483	TGA	2	6	704123	704128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288482
15562	NC_010483	A	6	6	704198	704203	100 %	0 %	0 %	0 %	170288482
15563	NC_010483	TCT	2	6	704246	704251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288482
15564	NC_010483	TCGT	2	8	704333	704340	0 %	50 %	25 %	25 %	170288482
15565	NC_010483	TAT	2	6	704341	704346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170288482
15566	NC_010483	GGAG	2	8	704402	704409	25 %	0 %	75 %	0 %	170288482
15567	NC_010483	ATG	2	6	704417	704422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288482
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15569	NC_010483	CAC	2	6	704503	704508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288482
15570	NC_010483	CGT	2	6	704529	704534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288482
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15572	NC_010483	CCCTG	2	10	704586	704595	0 %	20 %	20 %	60 %	170288482
15573	NC_010483	T	6	6	704605	704610	0 %	100 %	0 %	0 %	170288482
15574	NC_010483	CTT	2	6	704613	704618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288482
15575	NC_010483	CAC	2	6	704631	704636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288482
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15579	NC_010483	GA	3	6	704788	704793	50 %	0 %	50 %	0 %	170288483
15580	NC_010483	CGT	2	6	704804	704809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288483
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15583	NC_010483	CTT	2	6	705084	705089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288483
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15586	NC_010483	GAG	2	6	705329	705334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288483
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15588	NC_010483	CTT	2	6	705392	705397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288483
15589	NC_010483	ACCTG	2	10	705418	705427	20 %	20 %	20 %	40 %	170288483
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15591	NC_010483	ATC	2	6	705556	705561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288483
15592	NC_010483	TCC	2	6	705613	705618	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288483
15593	NC_010483	CTTC	2	8	705625	705632	0 %	50 %	0 %	50 %	170288483
15594	NC_010483	TCTTTG	2	12	705658	705669	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	170288483
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15596	NC_010483	GTTC	2	8	705792	705799	0 %	50 %	25 %	25 %	170288483
15597	NC_010483	CAGC	2	8	705804	705811	25 %	0 %	25 %	50 %	170288483
15598	NC_010483	AAG	2	6	705847	705852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288483
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15600	NC_010483	TGT	2	6	706071	706076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288483
15601	NC_010483	CTTT	2	8	706203	706210	0 %	75 %	0 %	25 %	170288483
15602	NC_010483	CTG	2	6	706219	706224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288483
15603	NC_010483	ATC	2	6	706300	706305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288483
15604	NC_010483	TCG	2	6	706309	706314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288483
15605	NC_010483	TC	3	6	706328	706333	0 %	50 %	0 %	50 %	170288483
15606	NC_010483	ACC	2	6	706377	706382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288483
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15608	NC_010483	CAT	2	6	706511	706516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288483
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15610	NC_010483	CTT	2	6	706722	706727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288484
15611	NC_010483	TCA	2	6	706742	706747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288484
15612	NC_010483	TCT	2	6	706796	706801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288484
15613	NC_010483	ATCACC	2	12	706838	706849	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	170288484
15614	NC_010483	ACC	2	6	706883	706888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288484
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15616	NC_010483	CAT	2	6	706968	706973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288484
15617	NC_010483	CTT	2	6	706991	706996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288484
15618	NC_010483	GTTGT	2	10	707027	707036	0 %	60 %	40 %	0 %	170288484
15619	NC_010483	CTT	2	6	707052	707057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288484
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15989	NC_010483	ATC	2	6	724044	724049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288506
15990	NC_010483	T	6	6	724092	724097	0 %	100 %	0 %	0 %	170288507
15991	NC_010483	TC	3	6	724139	724144	0 %	50 %	0 %	50 %	170288507
15992	NC_010483	CTT	2	6	724188	724193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288507
15993	NC_010483	ATG	3	9	724211	724219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288507
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16000	NC_010483	AT	3	6	724425	724430	50 %	50 %	0 %	0 %	170288507

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