MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga sp. RQ2 chromosome

Total Repeats: 41425

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_010483	TCT	2	6	677599	677604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288460
15003	NC_010483	CA	3	6	677607	677612	50 %	0 %	0 %	50 %	170288460
15004	NC_010483	GATG	2	8	677673	677680	25 %	25 %	50 %	0 %	170288460
15005	NC_010483	TAG	2	6	677743	677748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288460
15006	NC_010483	AAC	2	6	677797	677802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288460
15007	NC_010483	GA	3	6	677862	677867	50 %	0 %	50 %	0 %	170288460
15008	NC_010483	AGT	2	6	677927	677932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288460
15009	NC_010483	A	6	6	677958	677963	100 %	0 %	0 %	0 %	170288460
15010	NC_010483	AGA	2	6	678023	678028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288460
15011	NC_010483	TTGTTT	2	12	678075	678086	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	170288461
15012	NC_010483	TTG	2	6	678103	678108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288461
15013	NC_010483	CAA	2	6	678128	678133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288461
15014	NC_010483	CT	3	6	678140	678145	0 %	50 %	0 %	50 %	170288461
15015	NC_010483	CTT	2	6	678309	678314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288461
15016	NC_010483	CAA	2	6	678368	678373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288461
15017	NC_010483	CAA	2	6	678388	678393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288461
15018	NC_010483	CT	3	6	678451	678456	0 %	50 %	0 %	50 %	170288461
15019	NC_010483	AAC	2	6	678462	678467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288461
15020	NC_010483	AGG	2	6	678686	678691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288461
15021	NC_010483	TGA	2	6	678743	678748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288461
15022	NC_010483	CTG	2	6	678841	678846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288462
15023	NC_010483	ATCC	2	8	678935	678942	25 %	25 %	0 %	50 %	170288462
15024	NC_010483	AAC	3	9	679045	679053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288462
15025	NC_010483	AT	3	6	679067	679072	50 %	50 %	0 %	0 %	170288462
15026	NC_010483	GAAA	2	8	679083	679090	75 %	0 %	25 %	0 %	170288462
15027	NC_010483	AAAC	2	8	679106	679113	75 %	0 %	0 %	25 %	170288462
15028	NC_010483	CT	3	6	679115	679120	0 %	50 %	0 %	50 %	170288462
15029	NC_010483	GGTA	2	8	679150	679157	25 %	25 %	50 %	0 %	170288462
15030	NC_010483	CTA	2	6	679164	679169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288462
15031	NC_010483	TG	3	6	679292	679297	0 %	50 %	50 %	0 %	170288462
15032	NC_010483	AAG	2	6	679298	679303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288462
15033	NC_010483	ATCC	2	8	679324	679331	25 %	25 %	0 %	50 %	170288462
15034	NC_010483	TGT	2	6	679335	679340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288462
15035	NC_010483	T	6	6	679352	679357	0 %	100 %	0 %	0 %	170288462
15036	NC_010483	AAG	2	6	679364	679369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288462
15037	NC_010483	GAAA	2	8	679466	679473	75 %	0 %	25 %	0 %	170288462
15038	NC_010483	AGG	2	6	679479	679484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288462
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15040	NC_010483	TTA	2	6	679536	679541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170288462
15041	NC_010483	AGG	2	6	679578	679583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288462
15042	NC_010483	ACA	2	6	679586	679591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288462
15043	NC_010483	GGAA	2	8	679680	679687	50 %	0 %	50 %	0 %	170288462
15044	NC_010483	TGG	2	6	679721	679726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288462
15045	NC_010483	GAAG	2	8	679744	679751	50 %	0 %	50 %	0 %	170288462
15046	NC_010483	CG	3	6	679765	679770	0 %	0 %	50 %	50 %	170288462
15047	NC_010483	TCT	2	6	679835	679840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288462
15048	NC_010483	GA	3	6	679865	679870	50 %	0 %	50 %	0 %	170288462
15049	NC_010483	CCA	2	6	679887	679892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288462
15050	NC_010483	GGTT	2	8	679912	679919	0 %	50 %	50 %	0 %	170288462
15051	NC_010483	GAA	2	6	679957	679962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288462
15052	NC_010483	AGG	2	6	679973	679978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288462
15053	NC_010483	ACGA	2	8	680020	680027	50 %	0 %	25 %	25 %	170288462
15054	NC_010483	CGGA	2	8	680060	680067	25 %	0 %	50 %	25 %	170288462
15055	NC_010483	AAG	2	6	680101	680106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288462
15056	NC_010483	TA	3	6	680113	680118	50 %	50 %	0 %	0 %	170288462
15057	NC_010483	GA	3	6	680135	680140	50 %	0 %	50 %	0 %	170288462
15058	NC_010483	ACT	2	6	680171	680176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288462
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15060	NC_010483	GAA	2	6	680275	680280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288463
15061	NC_010483	CTC	2	6	680306	680311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288463
15062	NC_010483	TAC	2	6	680313	680318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288463
15063	NC_010483	CAG	2	6	680339	680344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288463
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15065	NC_010483	A	7	7	680500	680506	100 %	0 %	0 %	0 %	170288463
15066	NC_010483	AGT	2	6	680539	680544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288463
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15069	NC_010483	ATC	2	6	680845	680850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288463
15070	NC_010483	GCCACC	2	12	680888	680899	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	170288463
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15073	NC_010483	CGA	2	6	680947	680952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288463
15074	NC_010483	CAG	2	6	680977	680982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288463
15075	NC_010483	AGG	2	6	681028	681033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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15078	NC_010483	CAGA	2	8	681138	681145	50 %	0 %	25 %	25 %	170288464
15079	NC_010483	GAT	2	6	681332	681337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288464
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15082	NC_010483	TGGC	2	8	681471	681478	0 %	25 %	50 %	25 %	170288464
15083	NC_010483	ACT	2	6	681507	681512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288464
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15086	NC_010483	AAC	2	6	681578	681583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288464
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15089	NC_010483	AGT	2	6	681742	681747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288464
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15093	NC_010483	TTG	2	6	681965	681970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288465
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15095	NC_010483	A	6	6	682050	682055	100 %	0 %	0 %	0 %	170288465
15096	NC_010483	GTT	2	6	682060	682065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288465
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15098	NC_010483	TTTC	2	8	682103	682110	0 %	75 %	0 %	25 %	170288465
15099	NC_010483	CA	3	6	682131	682136	50 %	0 %	0 %	50 %	170288465
15100	NC_010483	GAA	2	6	682171	682176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288465
15101	NC_010483	ACT	2	6	682178	682183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288465
15102	NC_010483	TCC	2	6	682275	682280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288465
15103	NC_010483	GGT	2	6	682301	682306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288465
15104	NC_010483	TAA	2	6	682316	682321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170288465
15105	NC_010483	TGG	2	6	682440	682445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288465
15106	NC_010483	T	6	6	682588	682593	0 %	100 %	0 %	0 %	170288466
15107	NC_010483	T	6	6	682595	682600	0 %	100 %	0 %	0 %	170288466
15108	NC_010483	T	6	6	682672	682677	0 %	100 %	0 %	0 %	170288466
15109	NC_010483	CTTC	2	8	682789	682796	0 %	50 %	0 %	50 %	170288466
15110	NC_010483	CT	3	6	682800	682805	0 %	50 %	0 %	50 %	170288466
15111	NC_010483	TC	3	6	682905	682910	0 %	50 %	0 %	50 %	170288466
15112	NC_010483	TG	3	6	682964	682969	0 %	50 %	50 %	0 %	170288466
15113	NC_010483	TTTCC	2	10	682971	682980	0 %	60 %	0 %	40 %	170288466
15114	NC_010483	GTC	2	6	683054	683059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288466
15115	NC_010483	AGGA	2	8	683065	683072	50 %	0 %	50 %	0 %	170288466
15116	NC_010483	TTC	2	6	683096	683101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288466
15117	NC_010483	CGT	2	6	683230	683235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288466
15118	NC_010483	GCA	2	6	683294	683299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288466
15119	NC_010483	TCT	2	6	683321	683326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288466
15120	NC_010483	TCC	2	6	683340	683345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288466
15121	NC_010483	GA	3	6	683391	683396	50 %	0 %	50 %	0 %	170288466
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15239	NC_010483	GTCTT	2	10	689057	689066	0 %	60 %	20 %	20 %	170288470
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15241	NC_010483	ATCG	2	8	689097	689104	25 %	25 %	25 %	25 %	170288470
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15245	NC_010483	CACAC	2	10	689258	689267	40 %	0 %	0 %	60 %	170288470
15246	NC_010483	CGT	2	6	689334	689339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288470
15247	NC_010483	A	6	6	689371	689376	100 %	0 %	0 %	0 %	170288470
15248	NC_010483	GAAC	2	8	689388	689395	50 %	0 %	25 %	25 %	170288470
15249	NC_010483	T	7	7	689443	689449	0 %	100 %	0 %	0 %	170288471
15250	NC_010483	CT	3	6	689464	689469	0 %	50 %	0 %	50 %	170288471
15251	NC_010483	ATC	2	6	689519	689524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288471
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15253	NC_010483	CTT	2	6	689556	689561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288471
15254	NC_010483	GGT	2	6	689578	689583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288471
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15256	NC_010483	TCG	2	6	689615	689620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288471
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15261	NC_010483	GTC	2	6	689959	689964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288471
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15264	NC_010483	T	7	7	690028	690034	0 %	100 %	0 %	0 %	170288471
15265	NC_010483	TCT	2	6	690041	690046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288471
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15270	NC_010483	CTG	2	6	690250	690255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288471
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15275	NC_010483	TTTC	2	8	690536	690543	0 %	75 %	0 %	25 %	170288472
15276	NC_010483	CTC	2	6	690564	690569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288472
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15283	NC_010483	CTT	2	6	690956	690961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288472
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15289	NC_010483	GTA	2	6	691221	691226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288472
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15298	NC_010483	TTTC	2	8	691784	691791	0 %	75 %	0 %	25 %	170288473
15299	NC_010483	ATCT	2	8	691827	691834	25 %	50 %	0 %	25 %	170288473
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15315	NC_010483	TTC	2	6	692553	692558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288473
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15318	NC_010483	CCT	2	6	692686	692691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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15334	NC_010483	TCTT	2	8	693273	693280	0 %	75 %	0 %	25 %	170288474
15335	NC_010483	ATT	2	6	693300	693305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170288474
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15350	NC_010483	ACG	2	6	693891	693896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288474
15351	NC_010483	CGA	2	6	693949	693954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288474
15352	NC_010483	CTG	2	6	693955	693960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288474
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15356	NC_010483	GAC	2	6	694133	694138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288474
15357	NC_010483	CTTTT	2	10	694199	694208	0 %	80 %	0 %	20 %	170288474
15358	NC_010483	TGA	2	6	694279	694284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288474
15359	NC_010483	CT	3	6	694372	694377	0 %	50 %	0 %	50 %	170288474
15360	NC_010483	ATT	2	6	694431	694436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170288474
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15362	NC_010483	CAA	2	6	694510	694515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288474
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