MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga sp. RQ2 chromosome

Total Repeats: 41425

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_010483	CTC	2	6	653649	653654	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288442
14502	NC_010483	GAA	2	6	653666	653671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288442
14503	NC_010483	TCT	2	6	653684	653689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288442
14504	NC_010483	TAT	2	6	653748	653753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170288442
14505	NC_010483	CTT	2	6	653766	653771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288442
14506	NC_010483	CGA	2	6	653789	653794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288442
14507	NC_010483	TGA	2	6	653858	653863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288442
14508	NC_010483	CCA	2	6	653872	653877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288442
14509	NC_010483	GA	3	6	653893	653898	50 %	0 %	50 %	0 %	170288442
14510	NC_010483	CT	3	6	653901	653906	0 %	50 %	0 %	50 %	170288442
14511	NC_010483	ATC	2	6	653914	653919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288442
14512	NC_010483	ACCCTC	2	12	654148	654159	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	170288442
14513	NC_010483	TCT	2	6	654175	654180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288442
14514	NC_010483	ATC	2	6	654247	654252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288442
14515	NC_010483	TTTCT	2	10	654353	654362	0 %	80 %	0 %	20 %	170288442
14516	NC_010483	TCT	2	6	654386	654391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288442
14517	NC_010483	TCG	3	9	654413	654421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288442
14518	NC_010483	CTT	2	6	654453	654458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288442
14519	NC_010483	GAG	2	6	654468	654473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288442
14520	NC_010483	GGAA	2	8	654506	654513	50 %	0 %	50 %	0 %	170288443
14521	NC_010483	T	6	6	654519	654524	0 %	100 %	0 %	0 %	170288443
14522	NC_010483	TCT	2	6	654544	654549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288443
14523	NC_010483	GAG	2	6	654561	654566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288443
14524	NC_010483	TGT	2	6	654603	654608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288443
14525	NC_010483	TTC	2	6	654613	654618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288443
14526	NC_010483	ATCT	2	8	654636	654643	25 %	50 %	0 %	25 %	170288443
14527	NC_010483	TCG	2	6	654667	654672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288443
14528	NC_010483	CTT	2	6	654674	654679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288443
14529	NC_010483	AGA	2	6	654722	654727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288443
14530	NC_010483	CT	3	6	654792	654797	0 %	50 %	0 %	50 %	170288443
14531	NC_010483	GAA	2	6	654799	654804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288443
14532	NC_010483	GCCA	2	8	654822	654829	25 %	0 %	25 %	50 %	170288443
14533	NC_010483	GAT	2	6	654831	654836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288443
14534	NC_010483	CTT	2	6	654852	654857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288443
14535	NC_010483	TCC	2	6	654865	654870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288443
14536	NC_010483	CTC	2	6	654900	654905	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288443
14537	NC_010483	AT	3	6	654956	654961	50 %	50 %	0 %	0 %	170288443
14538	NC_010483	CCT	2	6	655003	655008	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14539	NC_010483	GCC	2	6	655058	655063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170288444
14540	NC_010483	TTCTG	2	10	655122	655131	0 %	60 %	20 %	20 %	170288444
14541	NC_010483	CT	3	6	655145	655150	0 %	50 %	0 %	50 %	170288444
14542	NC_010483	AC	3	6	655181	655186	50 %	0 %	0 %	50 %	170288444
14543	NC_010483	TGG	2	6	655198	655203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288444
14544	NC_010483	ATT	2	6	655238	655243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170288444
14545	NC_010483	CCTT	2	8	655269	655276	0 %	50 %	0 %	50 %	170288444
14546	NC_010483	ATCT	2	8	655393	655400	25 %	50 %	0 %	25 %	170288444
14547	NC_010483	CTTTTC	2	12	655405	655416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288444
14548	NC_010483	GTG	2	6	655478	655483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288444
14549	NC_010483	ATCT	2	8	655486	655493	25 %	50 %	0 %	25 %	170288444
14550	NC_010483	CT	3	6	655534	655539	0 %	50 %	0 %	50 %	170288444
14551	NC_010483	TCC	2	6	655544	655549	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288444
14552	NC_010483	CT	3	6	655573	655578	0 %	50 %	0 %	50 %	170288444
14553	NC_010483	TCT	2	6	655581	655586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288444
14554	NC_010483	TCC	2	6	655652	655657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288444
14555	NC_010483	AAT	2	6	655744	655749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170288444
14556	NC_010483	CAC	2	6	655786	655791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288444
14557	NC_010483	GAT	2	6	655840	655845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288444
14558	NC_010483	TGG	2	6	655964	655969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288444
14559	NC_010483	TC	3	6	656021	656026	0 %	50 %	0 %	50 %	170288444
14560	NC_010483	ATC	2	6	656027	656032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288444
14561	NC_010483	CTT	2	6	656109	656114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288444
14562	NC_010483	ATC	2	6	656141	656146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288444
14563	NC_010483	TTG	2	6	656340	656345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288445
14564	NC_010483	TTC	2	6	656507	656512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288445
14565	NC_010483	GAA	2	6	656560	656565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288445
14566	NC_010483	CT	3	6	656566	656571	0 %	50 %	0 %	50 %	170288445
14567	NC_010483	TCTT	2	8	656629	656636	0 %	75 %	0 %	25 %	170288445
14568	NC_010483	GAAC	2	8	656656	656663	50 %	0 %	25 %	25 %	170288445
14569	NC_010483	TCT	2	6	656691	656696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288445
14570	NC_010483	CAC	2	6	656722	656727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288445
14571	NC_010483	GAA	2	6	656845	656850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288445
14572	NC_010483	AGA	2	6	656865	656870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288445
14573	NC_010483	TC	4	8	656885	656892	0 %	50 %	0 %	50 %	170288445
14574	NC_010483	CAT	2	6	656897	656902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288445
14575	NC_010483	GTA	2	6	656903	656908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288445
14576	NC_010483	GTA	2	6	656972	656977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288445
14577	NC_010483	CCAT	2	8	657045	657052	25 %	25 %	0 %	50 %	170288445
14578	NC_010483	TCA	2	6	657135	657140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288445
14579	NC_010483	CT	3	6	657146	657151	0 %	50 %	0 %	50 %	170288445
14580	NC_010483	TTC	2	6	657176	657181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288445
14581	NC_010483	TTC	2	6	657230	657235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288445
14582	NC_010483	GTA	2	6	657278	657283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288445
14583	NC_010483	AGG	2	6	657411	657416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14584	NC_010483	AGGGG	2	10	657564	657573	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
14585	NC_010483	AAC	2	6	657666	657671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288446
14586	NC_010483	A	6	6	657738	657743	100 %	0 %	0 %	0 %	170288446
14587	NC_010483	GAA	2	6	657825	657830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288446
14588	NC_010483	GAC	2	6	657897	657902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288446
14589	NC_010483	GT	3	6	657924	657929	0 %	50 %	50 %	0 %	170288446
14590	NC_010483	GGT	2	6	657953	657958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288446
14591	NC_010483	CCTC	2	8	657986	657993	0 %	25 %	0 %	75 %	170288446
14592	NC_010483	AAC	2	6	658079	658084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288446
14593	NC_010483	ATG	2	6	658107	658112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288446
14594	NC_010483	GGAAG	2	10	658113	658122	40 %	0 %	60 %	0 %	170288446
14595	NC_010483	AGC	2	6	658151	658156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288446
14596	NC_010483	ACGATC	2	12	658164	658175	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	170288446
14597	NC_010483	GAA	2	6	658209	658214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288446
14598	NC_010483	AAT	2	6	658280	658285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170288446
14599	NC_010483	CCA	2	6	658396	658401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288446
14600	NC_010483	GAG	2	6	658421	658426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288446
14601	NC_010483	TCG	2	6	658456	658461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288446
14602	NC_010483	ATT	2	6	658564	658569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170288446
14603	NC_010483	TGGT	2	8	658597	658604	0 %	50 %	50 %	0 %	170288446
14604	NC_010483	TTC	2	6	658618	658623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288446
14605	NC_010483	GTG	2	6	658671	658676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288446
14606	NC_010483	AAAG	2	8	658730	658737	75 %	0 %	25 %	0 %	170288446
14607	NC_010483	GAA	2	6	658794	658799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288446
14608	NC_010483	TAA	2	6	658911	658916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170288447
14609	NC_010483	GAT	2	6	658982	658987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288447
14610	NC_010483	T	6	6	658998	659003	0 %	100 %	0 %	0 %	170288447
14611	NC_010483	ATG	3	9	659025	659033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288447
14612	NC_010483	TGG	2	6	659104	659109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288447
14613	NC_010483	AAG	2	6	659162	659167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288447
14614	NC_010483	CAGG	2	8	659227	659234	25 %	0 %	50 %	25 %	170288447
14615	NC_010483	GCT	2	6	659268	659273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288447
14616	NC_010483	TCG	2	6	659286	659291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288447
14617	NC_010483	GGT	2	6	659330	659335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288447
14618	NC_010483	CTC	2	6	659388	659393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288447
14619	NC_010483	CGT	2	6	659443	659448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288447
14620	NC_010483	TCA	2	6	659455	659460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288447
14621	NC_010483	TCG	2	6	659473	659478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288447
14622	NC_010483	CCA	2	6	659500	659505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288447
14623	NC_010483	TC	3	6	659613	659618	0 %	50 %	0 %	50 %	170288447
14624	NC_010483	TCC	2	6	659649	659654	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288447
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14668	NC_010483	TCG	2	6	661819	661824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288448
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14695	NC_010483	AT	3	6	662848	662853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14696	NC_010483	CAA	2	6	662872	662877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14701	NC_010483	AAG	2	6	663201	663206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288450
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14703	NC_010483	AGT	2	6	663230	663235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288450
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14705	NC_010483	ATC	2	6	663301	663306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288450
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14722	NC_010483	CT	3	6	664158	664163	0 %	50 %	0 %	50 %	170288451
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14986	NC_010483	GAT	2	6	676634	676639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288460
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14988	NC_010483	TTA	2	6	676720	676725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170288460
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