MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga sp. RQ2 chromosome

Total Repeats: 41425

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14002	NC_010483	TCC	2	6	630682	630687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288422
14003	NC_010483	GGA	2	6	630720	630725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288422
14004	NC_010483	GTT	2	6	630783	630788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288422
14005	NC_010483	TCC	2	6	630820	630825	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288422
14006	NC_010483	TGC	2	6	630912	630917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288422
14007	NC_010483	CAC	2	6	630935	630940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288422
14008	NC_010483	TTC	2	6	630979	630984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288422
14009	NC_010483	TCG	2	6	630991	630996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288422
14010	NC_010483	GCA	2	6	631012	631017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288422
14011	NC_010483	CTC	2	6	631065	631070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288422
14012	NC_010483	CTT	2	6	631187	631192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288422
14013	NC_010483	CATC	2	8	631229	631236	25 %	25 %	0 %	50 %	170288422
14014	NC_010483	TCC	2	6	631297	631302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288422
14015	NC_010483	TC	4	8	631307	631314	0 %	50 %	0 %	50 %	170288422
14016	NC_010483	CCTT	2	8	631410	631417	0 %	50 %	0 %	50 %	170288422
14017	NC_010483	GC	3	6	631423	631428	0 %	0 %	50 %	50 %	170288422
14018	NC_010483	CTT	2	6	631447	631452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288422
14019	NC_010483	CGG	2	6	631526	631531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170288422
14020	NC_010483	AC	3	6	631559	631564	50 %	0 %	0 %	50 %	170288422
14021	NC_010483	T	6	6	631584	631589	0 %	100 %	0 %	0 %	170288422
14022	NC_010483	TGA	2	6	631607	631612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288422
14023	NC_010483	TGC	2	6	631649	631654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288422
14024	NC_010483	CGC	2	6	631698	631703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170288422
14025	NC_010483	A	6	6	631748	631753	100 %	0 %	0 %	0 %	170288422
14026	NC_010483	CTT	2	6	631858	631863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288422
14027	NC_010483	TC	3	6	631867	631872	0 %	50 %	0 %	50 %	170288422
14028	NC_010483	TTC	2	6	631932	631937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288422
14029	NC_010483	CT	3	6	632001	632006	0 %	50 %	0 %	50 %	170288422
14030	NC_010483	TGA	2	6	632021	632026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288422
14031	NC_010483	TTC	2	6	632051	632056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288422
14032	NC_010483	CTGT	2	8	632082	632089	0 %	50 %	25 %	25 %	170288423
14033	NC_010483	TC	3	6	632150	632155	0 %	50 %	0 %	50 %	170288423
14034	NC_010483	CTG	2	6	632182	632187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288423
14035	NC_010483	T	6	6	632212	632217	0 %	100 %	0 %	0 %	170288423
14036	NC_010483	CAGA	2	8	632316	632323	50 %	0 %	25 %	25 %	170288423
14037	NC_010483	TCTT	2	8	632378	632385	0 %	75 %	0 %	25 %	170288423
14038	NC_010483	TCC	2	6	632441	632446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288423
14039	NC_010483	GT	3	6	632467	632472	0 %	50 %	50 %	0 %	170288423
14040	NC_010483	AG	3	6	632489	632494	50 %	0 %	50 %	0 %	170288423
14041	NC_010483	AG	3	6	632531	632536	50 %	0 %	50 %	0 %	170288423
14042	NC_010483	TGTT	2	8	632661	632668	0 %	75 %	25 %	0 %	170288423
14043	NC_010483	GTA	3	9	632669	632677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288423
14044	NC_010483	TTCCT	2	10	632699	632708	0 %	60 %	0 %	40 %	170288423
14045	NC_010483	GA	3	6	632823	632828	50 %	0 %	50 %	0 %	170288423
14046	NC_010483	CCT	2	6	632874	632879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288423
14047	NC_010483	AGT	2	6	632881	632886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288423
14048	NC_010483	TC	3	6	632943	632948	0 %	50 %	0 %	50 %	170288423
14049	NC_010483	CT	3	6	632956	632961	0 %	50 %	0 %	50 %	170288423
14050	NC_010483	CAGA	2	8	632996	633003	50 %	0 %	25 %	25 %	170288423
14051	NC_010483	GTG	2	6	633011	633016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288423
14052	NC_010483	T	6	6	633050	633055	0 %	100 %	0 %	0 %	170288423
14053	NC_010483	GAA	2	6	633218	633223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288423
14054	NC_010483	TGAA	2	8	633297	633304	50 %	25 %	25 %	0 %	170288423
14055	NC_010483	TCG	2	6	633321	633326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288423
14056	NC_010483	ACC	2	6	633328	633333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288423
14057	NC_010483	TG	3	6	633341	633346	0 %	50 %	50 %	0 %	170288423
14058	NC_010483	TCC	2	6	633398	633403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288424
14059	NC_010483	TTCAC	2	10	633404	633413	20 %	40 %	0 %	40 %	170288424
14060	NC_010483	GAT	2	6	633418	633423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288424
14061	NC_010483	CTTC	2	8	633428	633435	0 %	50 %	0 %	50 %	170288424
14062	NC_010483	ATTC	2	8	633459	633466	25 %	50 %	0 %	25 %	170288424
14063	NC_010483	ATGTA	2	10	633479	633488	40 %	40 %	20 %	0 %	170288424
14064	NC_010483	TCCA	2	8	633489	633496	25 %	25 %	0 %	50 %	170288424
14065	NC_010483	GTT	2	6	633511	633516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288424
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14067	NC_010483	TCCAT	2	10	633703	633712	20 %	40 %	0 %	40 %	170288424
14068	NC_010483	CCA	2	6	633778	633783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288424
14069	NC_010483	GAAG	2	8	633794	633801	50 %	0 %	50 %	0 %	170288424
14070	NC_010483	TCC	2	6	633826	633831	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288424
14071	NC_010483	CTGGAA	2	12	633924	633935	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	170288424
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14073	NC_010483	CCG	2	6	634049	634054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170288424
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14075	NC_010483	GTAT	2	8	634135	634142	25 %	50 %	25 %	0 %	170288424
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14079	NC_010483	G	6	6	634300	634305	0 %	0 %	100 %	0 %	170288424
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14083	NC_010483	CA	3	6	634409	634414	50 %	0 %	0 %	50 %	170288424
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14090	NC_010483	ACC	2	6	634596	634601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288424
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14097	NC_010483	T	6	6	634991	634996	0 %	100 %	0 %	0 %	170288424
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14107	NC_010483	ACA	2	6	635471	635476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288424
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14109	NC_010483	CAC	2	6	635554	635559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288425
14110	NC_010483	GGA	2	6	635582	635587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288425
14111	NC_010483	A	6	6	635650	635655	100 %	0 %	0 %	0 %	170288425
14112	NC_010483	TTC	2	6	635656	635661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288425
14113	NC_010483	TCAGGA	2	12	635705	635716	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	170288425
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14118	NC_010483	ATCA	2	8	635938	635945	50 %	25 %	0 %	25 %	170288425
14119	NC_010483	CCA	2	6	635964	635969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288425
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14123	NC_010483	CATTT	2	10	636238	636247	20 %	60 %	0 %	20 %	170288425
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14126	NC_010483	GTT	2	6	636329	636334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288425
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14229	NC_010483	GTTTT	2	10	641284	641293	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
14230	NC_010483	TTCA	2	8	641331	641338	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14231	NC_010483	A	6	6	641346	641351	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14232	NC_010483	ATT	2	6	641356	641361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14233	NC_010483	T	6	6	641400	641405	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14234	NC_010483	TGAA	2	8	641458	641465	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14235	NC_010483	AAGAG	2	10	641472	641481	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
14236	NC_010483	CAA	2	6	641492	641497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14237	NC_010483	A	6	6	641502	641507	100 %	0 %	0 %	0 %	170288430
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14243	NC_010483	TGTGAA	2	12	641873	641884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288430
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14245	NC_010483	ACA	2	6	641902	641907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288430
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14368	NC_010483	TCC	2	6	647622	647627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288435
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14491	NC_010483	AGCG	2	8	652789	652796	25 %	0 %	50 %	25 %	170288441
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14494	NC_010483	AG	3	6	653022	653027	50 %	0 %	50 %	0 %	170288441
14495	NC_010483	TGA	2	6	653103	653108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288441
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14499	NC_010483	TCAG	2	8	653449	653456	25 %	25 %	25 %	25 %	170288442
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