MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga sp. RQ2 chromosome

Total Repeats: 41425

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_010483	TGA	2	6	608635	608640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288400
13502	NC_010483	AGC	2	6	608678	608683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288400
13503	NC_010483	GTG	2	6	608697	608702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288400
13504	NC_010483	GGT	2	6	608709	608714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288400
13505	NC_010483	GAAG	2	8	608720	608727	50 %	0 %	50 %	0 %	170288400
13506	NC_010483	GTG	2	6	608760	608765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288400
13507	NC_010483	TG	4	8	608764	608771	0 %	50 %	50 %	0 %	170288400
13508	NC_010483	CAT	2	6	608777	608782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288400
13509	NC_010483	CGG	2	6	608792	608797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170288400
13510	NC_010483	TCT	2	6	608828	608833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288400
13511	NC_010483	ATA	2	6	608927	608932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170288400
13512	NC_010483	TGGAA	2	10	608948	608957	40 %	20 %	40 %	0 %	170288401
13513	NC_010483	TCG	2	6	609000	609005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288401
13514	NC_010483	CACACG	2	12	609069	609080	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	170288401
13515	NC_010483	TGG	2	6	609165	609170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288401
13516	NC_010483	GAA	2	6	609185	609190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288401
13517	NC_010483	GTT	2	6	609203	609208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288401
13518	NC_010483	AAG	2	6	609247	609252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288401
13519	NC_010483	CAA	2	6	609274	609279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288401
13520	NC_010483	A	6	6	609278	609283	100 %	0 %	0 %	0 %	170288401
13521	NC_010483	GAA	2	6	609305	609310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288401
13522	NC_010483	CTT	2	6	609461	609466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288401
13523	NC_010483	CAA	2	6	609547	609552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288401
13524	NC_010483	ACG	3	9	609630	609638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288401
13525	NC_010483	AGA	2	6	609664	609669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288401
13526	NC_010483	GAA	2	6	609677	609682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288401
13527	NC_010483	CGA	2	6	609697	609702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288401
13528	NC_010483	ATC	2	6	609791	609796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288401
13529	NC_010483	TCT	2	6	609867	609872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288401
13530	NC_010483	GAA	2	6	609892	609897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288401
13531	NC_010483	TCTCTT	2	12	609957	609968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288401
13532	NC_010483	AT	3	6	610000	610005	50 %	50 %	0 %	0 %	170288401
13533	NC_010483	AGA	2	6	610039	610044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288401
13534	NC_010483	TGA	2	6	610056	610061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288401
13535	NC_010483	GA	3	6	610139	610144	50 %	0 %	50 %	0 %	170288401
13536	NC_010483	CTT	2	6	610151	610156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288401
13537	NC_010483	GAT	2	6	610163	610168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288401
13538	NC_010483	AG	3	6	610247	610252	50 %	0 %	50 %	0 %	170288402
13539	NC_010483	GAAG	2	8	610293	610300	50 %	0 %	50 %	0 %	170288402
13540	NC_010483	GAT	2	6	610343	610348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288402
13541	NC_010483	AAGAA	2	10	610349	610358	80 %	0 %	20 %	0 %	170288402
13542	NC_010483	AGAA	2	8	610400	610407	75 %	0 %	25 %	0 %	170288402
13543	NC_010483	GAC	2	6	610434	610439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288402
13544	NC_010483	CAA	2	6	610441	610446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288402
13545	NC_010483	AAC	2	6	610463	610468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288402
13546	NC_010483	GGAT	2	8	610499	610506	25 %	25 %	50 %	0 %	170288402
13547	NC_010483	CCAA	2	8	610509	610516	50 %	0 %	0 %	50 %	170288402
13548	NC_010483	AT	3	6	610549	610554	50 %	50 %	0 %	0 %	170288402
13549	NC_010483	ATA	2	6	610581	610586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170288402
13550	NC_010483	GA	3	6	610613	610618	50 %	0 %	50 %	0 %	170288402
13551	NC_010483	AG	3	6	610624	610629	50 %	0 %	50 %	0 %	170288402
13552	NC_010483	A	7	7	610636	610642	100 %	0 %	0 %	0 %	170288402
13553	NC_010483	GGA	2	6	610655	610660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288402
13554	NC_010483	TAC	2	6	610662	610667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288402
13555	NC_010483	AGC	2	6	610677	610682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288402
13556	NC_010483	A	7	7	610745	610751	100 %	0 %	0 %	0 %	170288402
13557	NC_010483	AGA	2	6	610814	610819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288402
13558	NC_010483	TTC	2	6	610919	610924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288403
13559	NC_010483	T	6	6	610929	610934	0 %	100 %	0 %	0 %	170288403
13560	NC_010483	CAA	2	6	610960	610965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288403
13561	NC_010483	CA	3	6	610991	610996	50 %	0 %	0 %	50 %	170288403
13562	NC_010483	GTT	2	6	610998	611003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288403
13563	NC_010483	CT	3	6	611104	611109	0 %	50 %	0 %	50 %	170288403
13564	NC_010483	TGG	2	6	611120	611125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288403
13565	NC_010483	CA	3	6	611133	611138	50 %	0 %	0 %	50 %	170288403
13566	NC_010483	TTC	2	6	611159	611164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288403
13567	NC_010483	TTG	2	6	611173	611178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288403
13568	NC_010483	TTC	2	6	611203	611208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288403
13569	NC_010483	TA	3	6	611237	611242	50 %	50 %	0 %	0 %	170288403
13570	NC_010483	GAA	2	6	611301	611306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288403
13571	NC_010483	TC	3	6	611338	611343	0 %	50 %	0 %	50 %	170288403
13572	NC_010483	CAAA	2	8	611368	611375	75 %	0 %	0 %	25 %	170288403
13573	NC_010483	TTC	2	6	611410	611415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288403
13574	NC_010483	CTT	2	6	611470	611475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288403
13575	NC_010483	TCT	2	6	611484	611489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288403
13576	NC_010483	TCA	2	6	611505	611510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288403
13577	NC_010483	T	7	7	611590	611596	0 %	100 %	0 %	0 %	170288403
13578	NC_010483	CTA	2	6	611712	611717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288403
13579	NC_010483	TTG	2	6	611773	611778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288403
13580	NC_010483	TCT	2	6	611783	611788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288403
13581	NC_010483	GGC	2	6	611873	611878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13582	NC_010483	AC	3	6	611925	611930	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13583	NC_010483	CTT	2	6	611952	611957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288404
13584	NC_010483	CTT	2	6	611988	611993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288404
13585	NC_010483	CAC	2	6	611998	612003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288404
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13587	NC_010483	AGC	2	6	612046	612051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288404
13588	NC_010483	CAT	2	6	612052	612057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288404
13589	NC_010483	ATTC	2	8	612058	612065	25 %	50 %	0 %	25 %	170288404
13590	NC_010483	GGAT	2	8	612069	612076	25 %	25 %	50 %	0 %	170288404
13591	NC_010483	TGA	2	6	612108	612113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288404
13592	NC_010483	AGA	2	6	612162	612167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288404
13593	NC_010483	GCA	2	6	612176	612181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288404
13594	NC_010483	TTC	2	6	612189	612194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288404
13595	NC_010483	CTT	2	6	612219	612224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288404
13596	NC_010483	TCC	2	6	612235	612240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288404
13597	NC_010483	A	6	6	612257	612262	100 %	0 %	0 %	0 %	170288404
13598	NC_010483	TGAG	2	8	612276	612283	25 %	25 %	50 %	0 %	170288404
13599	NC_010483	CT	3	6	612350	612355	0 %	50 %	0 %	50 %	170288404
13600	NC_010483	ATC	2	6	612373	612378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288404
13601	NC_010483	CAC	2	6	612499	612504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288404
13602	NC_010483	TTCC	2	8	612540	612547	0 %	50 %	0 %	50 %	170288404
13603	NC_010483	TTTC	2	8	612551	612558	0 %	75 %	0 %	25 %	170288404
13604	NC_010483	TGT	2	6	612570	612575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288404
13605	NC_010483	T	6	6	612676	612681	0 %	100 %	0 %	0 %	170288404
13606	NC_010483	TGT	2	6	612702	612707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288404
13607	NC_010483	CTG	2	6	612762	612767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288404
13608	NC_010483	GT	3	6	612775	612780	0 %	50 %	50 %	0 %	170288404
13609	NC_010483	CTTC	2	8	612801	612808	0 %	50 %	0 %	50 %	170288404
13610	NC_010483	TTA	2	6	612837	612842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170288404
13611	NC_010483	CTT	2	6	612852	612857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288404
13612	NC_010483	T	6	6	612856	612861	0 %	100 %	0 %	0 %	170288404
13613	NC_010483	T	6	6	612919	612924	0 %	100 %	0 %	0 %	170288404
13614	NC_010483	TGC	2	6	613011	613016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288405
13615	NC_010483	TATCG	2	10	613029	613038	20 %	40 %	20 %	20 %	170288405
13616	NC_010483	CATCG	2	10	613068	613077	20 %	20 %	20 %	40 %	170288405
13617	NC_010483	TGG	2	6	613103	613108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288405
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13619	NC_010483	CAA	2	6	613163	613168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288405
13620	NC_010483	T	6	6	613191	613196	0 %	100 %	0 %	0 %	170288405
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13622	NC_010483	CAG	2	6	613245	613250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288405
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13989	NC_010483	CAG	2	6	629908	629913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288421
13990	NC_010483	GAA	2	6	629957	629962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288421
13991	NC_010483	TA	3	6	630014	630019	50 %	50 %	0 %	0 %	170288421
13992	NC_010483	GACA	2	8	630113	630120	50 %	0 %	25 %	25 %	170288421
13993	NC_010483	CTA	2	6	630181	630186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288421
13994	NC_010483	AGG	2	6	630235	630240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288421
13995	NC_010483	ACT	2	6	630264	630269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288421
13996	NC_010483	GATTAC	2	12	630335	630346	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	170288421
13997	NC_010483	CAAA	2	8	630381	630388	75 %	0 %	0 %	25 %	170288421
13998	NC_010483	ACA	2	6	630402	630407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288421
13999	NC_010483	AG	3	6	630439	630444	50 %	0 %	50 %	0 %	170288421
14000	NC_010483	GCT	2	6	630499	630504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288421

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