MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga sp. RQ2 chromosome

Total Repeats: 41425

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_010483	GAC	2	6	587210	587215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288380
13003	NC_010483	AAAG	2	8	587218	587225	75 %	0 %	25 %	0 %	170288380
13004	NC_010483	CAAA	2	8	587294	587301	75 %	0 %	0 %	25 %	170288380
13005	NC_010483	CGA	2	6	587308	587313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288380
13006	NC_010483	CCA	2	6	587364	587369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288380
13007	NC_010483	AGA	2	6	587383	587388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288380
13008	NC_010483	AAAG	2	8	587410	587417	75 %	0 %	25 %	0 %	170288380
13009	NC_010483	AGAAA	2	10	587428	587437	80 %	0 %	20 %	0 %	170288380
13010	NC_010483	TTC	2	6	587445	587450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288380
13011	NC_010483	GAAA	2	8	587549	587556	75 %	0 %	25 %	0 %	170288380
13012	NC_010483	AGAAA	2	10	587568	587577	80 %	0 %	20 %	0 %	170288380
13013	NC_010483	GGA	2	6	587707	587712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288380
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13015	NC_010483	GAA	2	6	587759	587764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288380
13016	NC_010483	CT	3	6	587772	587777	0 %	50 %	0 %	50 %	170288380
13017	NC_010483	GGAA	2	8	587794	587801	50 %	0 %	50 %	0 %	170288380
13018	NC_010483	GAAA	2	8	587809	587816	75 %	0 %	25 %	0 %	170288380
13019	NC_010483	AAGG	2	8	587891	587898	50 %	0 %	50 %	0 %	170288380
13020	NC_010483	CTG	2	6	587926	587931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288381
13021	NC_010483	TGG	2	6	587945	587950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288381
13022	NC_010483	CCG	2	6	588095	588100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170288381
13023	NC_010483	GAA	2	6	588105	588110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288381
13024	NC_010483	AGGT	2	8	588173	588180	25 %	25 %	50 %	0 %	170288381
13025	NC_010483	GAC	2	6	588199	588204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288381
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13027	NC_010483	AGT	2	6	588336	588341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288381
13028	NC_010483	ATGTGG	2	12	588353	588364	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	170288381
13029	NC_010483	GT	3	6	588371	588376	0 %	50 %	50 %	0 %	170288381
13030	NC_010483	AAG	2	6	588464	588469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288381
13031	NC_010483	TTTC	2	8	588584	588591	0 %	75 %	0 %	25 %	170288381
13032	NC_010483	ATC	2	6	588646	588651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288381
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13034	NC_010483	TTCT	2	8	588666	588673	0 %	75 %	0 %	25 %	170288381
13035	NC_010483	GTCA	2	8	588691	588698	25 %	25 %	25 %	25 %	170288381
13036	NC_010483	TAC	2	6	588712	588717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288381
13037	NC_010483	TGA	2	6	588719	588724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288381
13038	NC_010483	AACA	2	8	588725	588732	75 %	0 %	0 %	25 %	170288381
13039	NC_010483	GGTG	2	8	588762	588769	0 %	25 %	75 %	0 %	170288381
13040	NC_010483	CAG	2	6	588841	588846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288381
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13042	NC_010483	TG	3	6	588938	588943	0 %	50 %	50 %	0 %	170288382
13043	NC_010483	AT	3	6	588948	588953	50 %	50 %	0 %	0 %	170288382
13044	NC_010483	GGTGA	2	10	588960	588969	20 %	20 %	60 %	0 %	170288382
13045	NC_010483	GTG	2	6	588985	588990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288382
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13047	NC_010483	ATA	2	6	589026	589031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170288382
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13050	NC_010483	AGG	2	6	589278	589283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288382
13051	NC_010483	GGTC	2	8	589304	589311	0 %	25 %	50 %	25 %	170288382
13052	NC_010483	AGG	2	6	589349	589354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288382
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13054	NC_010483	GTT	2	6	589503	589508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288382
13055	NC_010483	TGG	2	6	589528	589533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288382
13056	NC_010483	CTT	2	6	589633	589638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288383
13057	NC_010483	CAA	2	6	589641	589646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288383
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13059	NC_010483	GAAA	2	8	589728	589735	75 %	0 %	25 %	0 %	170288383
13060	NC_010483	AG	3	6	589743	589748	50 %	0 %	50 %	0 %	170288383
13061	NC_010483	CAT	3	9	589770	589778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288383
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13073	NC_010483	CAA	2	6	590276	590281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288383
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13078	NC_010483	ATC	2	6	590419	590424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288383
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13085	NC_010483	TTG	2	6	590714	590719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288383
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13087	NC_010483	T	6	6	590869	590874	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13088	NC_010483	ATT	2	6	590971	590976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13089	NC_010483	TGC	2	6	591058	591063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13090	NC_010483	GAT	3	9	591115	591123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13091	NC_010483	GTA	2	6	591140	591145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13092	NC_010483	GTC	2	6	591200	591205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13093	NC_010483	AC	3	6	591345	591350	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13094	NC_010483	T	6	6	591366	591371	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13095	NC_010483	TCC	2	6	591383	591388	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13096	NC_010483	AC	3	6	591408	591413	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13097	NC_010483	AG	3	6	591415	591420	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13098	NC_010483	AAT	2	6	591449	591454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13099	NC_010483	AAGAA	2	10	591468	591477	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
13100	NC_010483	A	6	6	591485	591490	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13101	NC_010483	AGA	2	6	591492	591497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13102	NC_010483	AAG	2	6	591579	591584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13103	NC_010483	GT	3	6	591595	591600	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13104	NC_010483	ACT	2	6	591610	591615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13105	NC_010483	ATC	2	6	591684	591689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13106	NC_010483	ATT	2	6	591691	591696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13107	NC_010483	T	6	6	591699	591704	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13108	NC_010483	TTC	2	6	591775	591780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13109	NC_010483	ATA	2	6	591849	591854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13110	NC_010483	AT	3	6	591866	591871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13111	NC_010483	GAT	3	9	591934	591942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13112	NC_010483	TTC	2	6	591950	591955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13113	NC_010483	ATG	2	6	592004	592009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13114	NC_010483	GTT	2	6	592070	592075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13115	NC_010483	CTG	2	6	592097	592102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13116	NC_010483	TCT	2	6	592156	592161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13117	NC_010483	GGA	2	6	592163	592168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13118	NC_010483	A	8	8	592233	592240	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13119	NC_010483	TCT	2	6	592301	592306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13120	NC_010483	TGG	2	6	592308	592313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13121	NC_010483	CTGG	2	8	592359	592366	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13122	NC_010483	TC	3	6	592394	592399	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13123	NC_010483	CT	3	6	592415	592420	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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13125	NC_010483	TTC	2	6	592543	592548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288384
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13492	NC_010483	GAA	2	6	608263	608268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288399
13493	NC_010483	AG	3	6	608302	608307	50 %	0 %	50 %	0 %	170288399
13494	NC_010483	TC	3	6	608417	608422	0 %	50 %	0 %	50 %	170288400
13495	NC_010483	CTC	2	6	608435	608440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288400
13496	NC_010483	GAA	2	6	608499	608504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288400
13497	NC_010483	AGT	2	6	608540	608545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288400
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13499	NC_010483	CGT	2	6	608579	608584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288400
13500	NC_010483	GTT	2	6	608609	608614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288400

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