MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga sp. RQ2 chromosome

Total Repeats: 41425

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_010483	TCT	2	6	564532	564537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288358
12502	NC_010483	GTG	2	6	564560	564565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288358
12503	NC_010483	TTC	2	6	564645	564650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288358
12504	NC_010483	TCA	2	6	564696	564701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288358
12505	NC_010483	TGG	2	6	564717	564722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288358
12506	NC_010483	TGGC	2	8	564815	564822	0 %	25 %	50 %	25 %	170288358
12507	NC_010483	TTC	2	6	564858	564863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288358
12508	NC_010483	TTC	2	6	564872	564877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288358
12509	NC_010483	TCT	2	6	564935	564940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288358
12510	NC_010483	GTC	2	6	564959	564964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288358
12511	NC_010483	AAG	2	6	564994	564999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288358
12512	NC_010483	AGAA	2	8	565061	565068	75 %	0 %	25 %	0 %	170288358
12513	NC_010483	CTT	2	6	565118	565123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288358
12514	NC_010483	GTC	2	6	565195	565200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288358
12515	NC_010483	A	6	6	565206	565211	100 %	0 %	0 %	0 %	170288358
12516	NC_010483	AGA	2	6	565234	565239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288358
12517	NC_010483	AACA	2	8	565247	565254	75 %	0 %	0 %	25 %	170288358
12518	NC_010483	TCT	2	6	565274	565279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288358
12519	NC_010483	AAT	2	6	565318	565323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170288358
12520	NC_010483	AAT	2	6	565348	565353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170288358
12521	NC_010483	GGA	2	6	565364	565369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288358
12522	NC_010483	AGG	2	6	565373	565378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288358
12523	NC_010483	AG	3	6	565394	565399	50 %	0 %	50 %	0 %	170288358
12524	NC_010483	GAA	2	6	565405	565410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288358
12525	NC_010483	CAG	2	6	565466	565471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288358
12526	NC_010483	GAG	2	6	565512	565517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288358
12527	NC_010483	GTG	2	6	565667	565672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288358
12528	NC_010483	ACCT	2	8	565700	565707	25 %	25 %	0 %	50 %	170288358
12529	NC_010483	GAA	2	6	565714	565719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288358
12530	NC_010483	GAA	2	6	565739	565744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288358
12531	NC_010483	TC	3	6	565833	565838	0 %	50 %	0 %	50 %	170288358
12532	NC_010483	CTTC	2	8	565871	565878	0 %	50 %	0 %	50 %	170288358
12533	NC_010483	GTT	2	6	565907	565912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288358
12534	NC_010483	AAAG	2	8	565957	565964	75 %	0 %	25 %	0 %	170288358
12535	NC_010483	TGT	2	6	566062	566067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288358
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12537	NC_010483	TTG	2	6	566220	566225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288358
12538	NC_010483	TCT	2	6	566227	566232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288358
12539	NC_010483	AAC	2	6	566255	566260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288358
12540	NC_010483	TGA	2	6	566358	566363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288358
12541	NC_010483	CAC	2	6	566371	566376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288358
12542	NC_010483	GTGG	2	8	566443	566450	0 %	25 %	75 %	0 %	170288358
12543	NC_010483	TTTG	2	8	566485	566492	0 %	75 %	25 %	0 %	170288358
12544	NC_010483	AGA	2	6	566519	566524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288358
12545	NC_010483	TCT	2	6	566558	566563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288359
12546	NC_010483	GTCT	2	8	566642	566649	0 %	50 %	25 %	25 %	170288359
12547	NC_010483	CCCTG	2	10	566706	566715	0 %	20 %	20 %	60 %	170288359
12548	NC_010483	GATC	2	8	566765	566772	25 %	25 %	25 %	25 %	170288359
12549	NC_010483	CGGT	2	8	566861	566868	0 %	25 %	50 %	25 %	170288359
12550	NC_010483	T	6	6	566889	566894	0 %	100 %	0 %	0 %	170288359
12551	NC_010483	TTC	2	6	566898	566903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288359
12552	NC_010483	T	7	7	566927	566933	0 %	100 %	0 %	0 %	170288359
12553	NC_010483	TCT	2	6	566964	566969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288359
12554	NC_010483	CTT	2	6	566970	566975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288359
12555	NC_010483	GAA	2	6	567002	567007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12556	NC_010483	TA	5	10	567028	567037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12557	NC_010483	ATG	2	6	567077	567082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12558	NC_010483	A	6	6	567091	567096	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12559	NC_010483	A	8	8	567120	567127	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12560	NC_010483	G	9	9	567147	567155	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12561	NC_010483	AAG	2	6	567165	567170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288360
12562	NC_010483	CGG	2	6	567209	567214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170288360
12563	NC_010483	GA	3	6	567222	567227	50 %	0 %	50 %	0 %	170288360
12564	NC_010483	GGA	2	6	567246	567251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288360
12565	NC_010483	TCT	2	6	567271	567276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288360
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12569	NC_010483	TGG	2	6	567437	567442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288360
12570	NC_010483	GAAA	2	8	567461	567468	75 %	0 %	25 %	0 %	170288360
12571	NC_010483	CGT	2	6	567473	567478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288360
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12573	NC_010483	AG	3	6	567520	567525	50 %	0 %	50 %	0 %	170288360
12574	NC_010483	CT	3	6	567574	567579	0 %	50 %	0 %	50 %	170288360
12575	NC_010483	AAG	2	6	567602	567607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288360
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12584	NC_010483	GAG	2	6	567977	567982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288361
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12589	NC_010483	ACT	4	12	568232	568243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288361
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12591	NC_010483	GAA	2	6	568283	568288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288361
12592	NC_010483	AATC	2	8	568335	568342	50 %	25 %	0 %	25 %	170288362
12593	NC_010483	AGA	2	6	568359	568364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288362
12594	NC_010483	TCC	2	6	568373	568378	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288362
12595	NC_010483	AG	3	6	568413	568418	50 %	0 %	50 %	0 %	170288362
12596	NC_010483	TCT	2	6	568526	568531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288362
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12599	NC_010483	T	6	6	568687	568692	0 %	100 %	0 %	0 %	170288362
12600	NC_010483	A	6	6	568710	568715	100 %	0 %	0 %	0 %	170288362
12601	NC_010483	TAGA	2	8	568793	568800	50 %	25 %	25 %	0 %	170288362
12602	NC_010483	TTC	2	6	568888	568893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288362
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12604	NC_010483	TCT	2	6	568927	568932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288362
12605	NC_010483	CTT	2	6	568933	568938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288362
12606	NC_010483	GAAAA	2	10	568980	568989	80 %	0 %	20 %	0 %	170288362
12607	NC_010483	CAG	2	6	569018	569023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288362
12608	NC_010483	TGC	2	6	569110	569115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288362
12609	NC_010483	GGA	2	6	569133	569138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288362
12610	NC_010483	GAA	2	6	569150	569155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288362
12611	NC_010483	ATG	2	6	569247	569252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288362
12612	NC_010483	CTTT	2	8	569258	569265	0 %	75 %	0 %	25 %	170288362
12613	NC_010483	TTC	2	6	569284	569289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288362
12614	NC_010483	AG	3	6	569353	569358	50 %	0 %	50 %	0 %	170288362
12615	NC_010483	TTTC	2	8	569368	569375	0 %	75 %	0 %	25 %	170288362
12616	NC_010483	AGA	2	6	569391	569396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288362
12617	NC_010483	ATT	2	6	569481	569486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12618	NC_010483	CAA	2	6	569493	569498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12619	NC_010483	AGA	2	6	569532	569537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12620	NC_010483	TGT	2	6	569680	569685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288363
12621	NC_010483	GCT	2	6	569757	569762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288363
12622	NC_010483	GCC	2	6	569773	569778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170288363
12623	NC_010483	GCTCT	2	10	569781	569790	0 %	40 %	20 %	40 %	170288363
12624	NC_010483	TGC	2	6	569799	569804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288363
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