MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga sp. RQ2 chromosome

Total Repeats: 41425

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12003	NC_010483	TTC	2	6	541483	541488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288340
12004	NC_010483	TCT	2	6	541508	541513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288340
12005	NC_010483	TGA	2	6	541521	541526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288340
12006	NC_010483	AATC	2	8	541536	541543	50 %	25 %	0 %	25 %	170288340
12007	NC_010483	GAA	2	6	541580	541585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288340
12008	NC_010483	CTGT	2	8	541602	541609	0 %	50 %	25 %	25 %	170288340
12009	NC_010483	GAA	2	6	541631	541636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288340
12010	NC_010483	TGA	2	6	541661	541666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288340
12011	NC_010483	ATGCCG	2	12	541697	541708	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	170288340
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12013	NC_010483	CT	3	6	541737	541742	0 %	50 %	0 %	50 %	170288340
12014	NC_010483	AG	3	6	541758	541763	50 %	0 %	50 %	0 %	170288340
12015	NC_010483	TCA	2	6	541836	541841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288340
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12052	NC_010483	CAACA	2	10	543512	543521	60 %	0 %	0 %	40 %	170288341
12053	NC_010483	TCCC	2	8	543532	543539	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
12054	NC_010483	T	6	6	543606	543611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12059	NC_010483	TCT	2	6	544000	544005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12065	NC_010483	GGA	2	6	544109	544114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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12125	NC_010483	CCT	2	6	546914	546919	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288343
12126	NC_010483	GAA	2	6	546997	547002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288343
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12133	NC_010483	CAGA	2	8	547459	547466	50 %	0 %	25 %	25 %	170288343
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12230	NC_010483	CCAA	2	8	551782	551789	50 %	0 %	0 %	50 %	170288349
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12497	NC_010483	GA	3	6	564451	564456	50 %	0 %	50 %	0 %	170288358
12498	NC_010483	AAAT	2	8	564462	564469	75 %	25 %	0 %	0 %	170288358
12499	NC_010483	TTA	2	6	564493	564498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170288358
12500	NC_010483	TCT	2	6	564520	564525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288358

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