MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga sp. RQ2 chromosome

Total Repeats: 41425

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_010483	AAG	2	6	497036	497041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288301
11003	NC_010483	TGG	2	6	497064	497069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288301
11004	NC_010483	GAA	2	6	497077	497082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288301
11005	NC_010483	ATTA	2	8	497096	497103	50 %	50 %	0 %	0 %	170288301
11006	NC_010483	AT	3	6	497137	497142	50 %	50 %	0 %	0 %	170288301
11007	NC_010483	GAA	2	6	497160	497165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288301
11008	NC_010483	AAC	2	6	497228	497233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288301
11009	NC_010483	AGA	2	6	497234	497239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288301
11010	NC_010483	CAAAA	2	10	497268	497277	80 %	0 %	0 %	20 %	170288301
11011	NC_010483	T	6	6	497301	497306	0 %	100 %	0 %	0 %	170288301
11012	NC_010483	AT	3	6	497409	497414	50 %	50 %	0 %	0 %	170288301
11013	NC_010483	CTTC	2	8	497427	497434	0 %	50 %	0 %	50 %	170288301
11014	NC_010483	AT	3	6	497462	497467	50 %	50 %	0 %	0 %	170288301
11015	NC_010483	ATT	2	6	497536	497541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170288301
11016	NC_010483	TTA	2	6	497544	497549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170288301
11017	NC_010483	GAAA	2	8	497637	497644	75 %	0 %	25 %	0 %	170288301
11018	NC_010483	TTA	2	6	497648	497653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170288301
11019	NC_010483	TGA	2	6	497789	497794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288301
11020	NC_010483	AGG	2	6	497825	497830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288301
11021	NC_010483	CT	4	8	497873	497880	0 %	50 %	0 %	50 %	170288301
11022	NC_010483	ATT	2	6	497921	497926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170288301
11023	NC_010483	GAA	2	6	497973	497978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288301
11024	NC_010483	TAC	2	6	497980	497985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288301
11025	NC_010483	TAC	2	6	498045	498050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288301
11026	NC_010483	CTT	2	6	498105	498110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288301
11027	NC_010483	AAG	2	6	498139	498144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288301
11028	NC_010483	TTC	2	6	498256	498261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288301
11029	NC_010483	GAA	2	6	498270	498275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288301
11030	NC_010483	GA	3	6	498307	498312	50 %	0 %	50 %	0 %	170288301
11031	NC_010483	ATG	2	6	498366	498371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288301
11032	NC_010483	A	7	7	498416	498422	100 %	0 %	0 %	0 %	170288301
11033	NC_010483	A	6	6	498505	498510	100 %	0 %	0 %	0 %	170288301
11034	NC_010483	A	8	8	498546	498553	100 %	0 %	0 %	0 %	170288301
11035	NC_010483	AGT	2	6	498596	498601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288301
11036	NC_010483	A	6	6	498665	498670	100 %	0 %	0 %	0 %	170288301
11037	NC_010483	TTC	3	9	498687	498695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288301
11038	NC_010483	A	6	6	498696	498701	100 %	0 %	0 %	0 %	170288301
11039	NC_010483	AGGG	2	8	498709	498716	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
11040	NC_010483	GAA	2	6	498725	498730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288302
11041	NC_010483	CTC	2	6	498741	498746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288302
11042	NC_010483	ATT	2	6	498747	498752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170288302
11043	NC_010483	T	6	6	498771	498776	0 %	100 %	0 %	0 %	170288302
11044	NC_010483	CTA	2	6	498814	498819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288302
11045	NC_010483	TTC	2	6	498895	498900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288302
11046	NC_010483	CTT	2	6	498909	498914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288302
11047	NC_010483	AAC	2	6	498993	498998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288302
11048	NC_010483	A	7	7	499023	499029	100 %	0 %	0 %	0 %	170288302
11049	NC_010483	ACG	2	6	499081	499086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288302
11050	NC_010483	GAA	2	6	499145	499150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288302
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11052	NC_010483	AAGAG	2	10	499165	499174	60 %	0 %	40 %	0 %	170288302
11053	NC_010483	TCA	2	6	499186	499191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288302
11054	NC_010483	CAA	2	6	499264	499269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288302
11055	NC_010483	TAC	2	6	499275	499280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288302
11056	NC_010483	GCA	2	6	499287	499292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288302
11057	NC_010483	A	7	7	499314	499320	100 %	0 %	0 %	0 %	170288302
11058	NC_010483	CAG	2	6	499375	499380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288302
11059	NC_010483	TTCG	2	8	499400	499407	0 %	50 %	25 %	25 %	170288302
11060	NC_010483	GAACA	2	10	499410	499419	60 %	0 %	20 %	20 %	170288302
11061	NC_010483	TCA	2	6	499480	499485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288302
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11063	NC_010483	TA	3	6	499554	499559	50 %	50 %	0 %	0 %	170288302
11064	NC_010483	A	6	6	499677	499682	100 %	0 %	0 %	0 %	170288302
11065	NC_010483	TTTTC	2	10	499694	499703	0 %	80 %	0 %	20 %	170288302
11066	NC_010483	ATGG	2	8	499842	499849	25 %	25 %	50 %	0 %	170288302
11067	NC_010483	GA	3	6	499885	499890	50 %	0 %	50 %	0 %	170288302
11068	NC_010483	ATA	2	6	499953	499958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170288302
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11070	NC_010483	AAC	2	6	500050	500055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288302
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11072	NC_010483	CAAA	2	8	500080	500087	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11073	NC_010483	AAG	2	6	500133	500138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11084	NC_010483	GAA	2	6	500613	500618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288303
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11090	NC_010483	CTT	2	6	500909	500914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288303
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11092	NC_010483	GTA	2	6	500954	500959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288303
11093	NC_010483	GCTTT	2	10	501026	501035	0 %	60 %	20 %	20 %	170288303
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11101	NC_010483	CCTT	2	8	501369	501376	0 %	50 %	0 %	50 %	170288303
11102	NC_010483	GTG	2	6	501419	501424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288303
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11109	NC_010483	GGA	2	6	501959	501964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288303
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11117	NC_010483	A	7	7	502397	502403	100 %	0 %	0 %	0 %	170288303
11118	NC_010483	GAA	2	6	502445	502450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288303
11119	NC_010483	A	6	6	502488	502493	100 %	0 %	0 %	0 %	170288304
11120	NC_010483	TTTC	2	8	502502	502509	0 %	75 %	0 %	25 %	170288304
11121	NC_010483	TCTT	2	8	502593	502600	0 %	75 %	0 %	25 %	170288304
11122	NC_010483	TAA	2	6	502601	502606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170288304
11123	NC_010483	TCCTT	2	10	502613	502622	0 %	60 %	0 %	40 %	170288304
11124	NC_010483	GAT	2	6	502631	502636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288304
11125	NC_010483	TCC	2	6	502848	502853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288304
11126	NC_010483	CTATT	2	10	502874	502883	20 %	60 %	0 %	20 %	170288304
11127	NC_010483	TCT	2	6	502894	502899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288304
11128	NC_010483	GCAA	2	8	502903	502910	50 %	0 %	25 %	25 %	170288304
11129	NC_010483	AGG	2	6	502966	502971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288304
11130	NC_010483	TTC	2	6	502978	502983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288304
11131	NC_010483	TCG	2	6	503035	503040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288304
11132	NC_010483	CTT	2	6	503045	503050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288304
11133	NC_010483	ATAG	2	8	503053	503060	50 %	25 %	25 %	0 %	170288304
11134	NC_010483	ATT	2	6	503098	503103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170288304
11135	NC_010483	TTC	2	6	503164	503169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288304
11136	NC_010483	CTT	2	6	503205	503210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288304
11137	NC_010483	ATGA	2	8	503224	503231	50 %	25 %	25 %	0 %	170288304
11138	NC_010483	TAA	2	6	503275	503280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170288304
11139	NC_010483	ACA	2	6	503305	503310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288304
11140	NC_010483	CTA	2	6	503378	503383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288304
11141	NC_010483	TTC	2	6	503388	503393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288304
11142	NC_010483	ATA	2	6	503394	503399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170288304
11143	NC_010483	GAA	2	6	503459	503464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288304
11144	NC_010483	GA	4	8	503465	503472	50 %	0 %	50 %	0 %	170288304
11145	NC_010483	TGT	2	6	503522	503527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288304
11146	NC_010483	TTC	2	6	503551	503556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288304
11147	NC_010483	TCC	2	6	503604	503609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288305
11148	NC_010483	AGC	2	6	503690	503695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288305
11149	NC_010483	GCA	2	6	503766	503771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288305
11150	NC_010483	AAT	2	6	503839	503844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170288305
11151	NC_010483	GCC	2	6	503949	503954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170288305
11152	NC_010483	ACG	2	6	503991	503996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288305
11153	NC_010483	TCA	2	6	504141	504146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288305
11154	NC_010483	AGT	2	6	504148	504153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288305
11155	NC_010483	AGA	2	6	504232	504237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288305
11156	NC_010483	TCC	2	6	504260	504265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288305
11157	NC_010483	CTTC	2	8	504304	504311	0 %	50 %	0 %	50 %	170288305
11158	NC_010483	AAC	2	6	504314	504319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288305
11159	NC_010483	CAG	2	6	504395	504400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288305
11160	NC_010483	CTC	2	6	504446	504451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288305
11161	NC_010483	TCC	2	6	504483	504488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288305
11162	NC_010483	TATC	2	8	504492	504499	25 %	50 %	0 %	25 %	170288305
11163	NC_010483	TCC	2	6	504558	504563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288306
11164	NC_010483	AAT	2	6	504569	504574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170288306
11165	NC_010483	TCG	2	6	504613	504618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288306
11166	NC_010483	TGA	2	6	504662	504667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288306
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11168	NC_010483	TGA	2	6	504698	504703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288306
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11170	NC_010483	CTT	2	6	504753	504758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288306
11171	NC_010483	TCT	2	6	504785	504790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288306
11172	NC_010483	CCTT	2	8	504802	504809	0 %	50 %	0 %	50 %	170288306
11173	NC_010483	TTC	2	6	504898	504903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288306
11174	NC_010483	TGA	2	6	504920	504925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288306
11175	NC_010483	TGC	2	6	504934	504939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288306
11176	NC_010483	TGT	2	6	504957	504962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288306
11177	NC_010483	TCG	2	6	504995	505000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288306
11178	NC_010483	CTT	2	6	505013	505018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288306
11179	NC_010483	TCC	2	6	505095	505100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288306
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11181	NC_010483	CTC	2	6	505159	505164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288306
11182	NC_010483	GCA	2	6	505213	505218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288306
11183	NC_010483	TTC	2	6	505267	505272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288306
11184	NC_010483	TTC	2	6	505371	505376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288306
11185	NC_010483	GTA	2	6	505587	505592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288306
11186	NC_010483	GTA	2	6	505632	505637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288306
11187	NC_010483	TGA	2	6	505721	505726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288306
11188	NC_010483	GTC	2	6	505762	505767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288306
11189	NC_010483	CTT	2	6	505806	505811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288306
11190	NC_010483	TCG	2	6	505843	505848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288306
11191	NC_010483	CCT	2	6	505969	505974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11192	NC_010483	CCT	2	6	506080	506085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288307
11193	NC_010483	AAC	2	6	506125	506130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288307
11194	NC_010483	CACCT	2	10	506156	506165	20 %	20 %	0 %	60 %	170288307
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11196	NC_010483	CAG	2	6	506212	506217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288307
11197	NC_010483	AAG	2	6	506219	506224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288307
11198	NC_010483	GAA	2	6	506250	506255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288307
11199	NC_010483	CCA	2	6	506329	506334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288307
11200	NC_010483	TCA	2	6	506445	506450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288307
11201	NC_010483	CA	3	6	506449	506454	50 %	0 %	0 %	50 %	170288307
11202	NC_010483	TCTCTG	2	12	506498	506509	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	170288307
11203	NC_010483	TCC	2	6	506598	506603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288307
11204	NC_010483	GTTT	2	8	506617	506624	0 %	75 %	25 %	0 %	170288307
11205	NC_010483	ACA	2	6	506625	506630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288307
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11207	NC_010483	ATC	2	6	506697	506702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288307
11208	NC_010483	GAAC	2	8	506704	506711	50 %	0 %	25 %	25 %	170288307
11209	NC_010483	TC	4	8	506736	506743	0 %	50 %	0 %	50 %	170288307
11210	NC_010483	TC	3	6	506767	506772	0 %	50 %	0 %	50 %	170288307
11211	NC_010483	AAT	2	6	506786	506791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170288307
11212	NC_010483	ATG	2	6	506820	506825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288307
11213	NC_010483	CT	3	6	506856	506861	0 %	50 %	0 %	50 %	170288307
11214	NC_010483	CAA	2	6	506863	506868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288307
11215	NC_010483	GAAA	2	8	506897	506904	75 %	0 %	25 %	0 %	170288307
11216	NC_010483	CAA	2	6	506929	506934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288307
11217	NC_010483	CCTT	2	8	506935	506942	0 %	50 %	0 %	50 %	170288307
11218	NC_010483	CTT	2	6	506972	506977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288307
11219	NC_010483	AAG	2	6	506993	506998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288307
11220	NC_010483	TCT	2	6	507004	507009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288307
11221	NC_010483	AAC	2	6	507026	507031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288308
11222	NC_010483	ACCTCA	2	12	507052	507063	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	170288308
11223	NC_010483	TCA	2	6	507076	507081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288308
11224	NC_010483	TGGA	2	8	507111	507118	25 %	25 %	50 %	0 %	170288308
11225	NC_010483	AAG	2	6	507216	507221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288308
11226	NC_010483	CTC	2	6	507255	507260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288308
11227	NC_010483	CCA	2	6	507275	507280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288308
11228	NC_010483	CAC	2	6	507297	507302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288308
11229	NC_010483	TGT	2	6	507335	507340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288308
11230	NC_010483	GT	3	6	507339	507344	0 %	50 %	50 %	0 %	170288308
11231	NC_010483	ATC	2	6	507346	507351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288308
11232	NC_010483	TGT	2	6	507362	507367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288308
11233	NC_010483	ATC	2	6	507484	507489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288308
11234	NC_010483	ACC	2	6	507504	507509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288308
11235	NC_010483	ATC	2	6	507535	507540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288308
11236	NC_010483	CTT	2	6	507565	507570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288308
11237	NC_010483	CT	3	6	507588	507593	0 %	50 %	0 %	50 %	170288308
11238	NC_010483	GA	3	6	507665	507670	50 %	0 %	50 %	0 %	170288308
11239	NC_010483	ATC	2	6	507694	507699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288308
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11241	NC_010483	CCA	2	6	507755	507760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288308
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11357	NC_010483	AAG	2	6	513238	513243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288312
11358	NC_010483	TCCC	2	8	513282	513289	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
11359	NC_010483	AC	4	8	513375	513382	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11360	NC_010483	AAT	2	6	513383	513388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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