MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga sp. RQ2 chromosome

Total Repeats: 41425

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_010483	TCA	2	6	450730	450735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288260
10002	NC_010483	CAC	2	6	450760	450765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10003	NC_010483	GTTTT	2	10	450795	450804	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
10004	NC_010483	CTTTT	2	10	450925	450934	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
10005	NC_010483	CTT	2	6	450958	450963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288261
10006	NC_010483	GTG	2	6	450964	450969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288261
10007	NC_010483	GATC	2	8	451032	451039	25 %	25 %	25 %	25 %	170288261
10008	NC_010483	CAT	2	6	451083	451088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288261
10009	NC_010483	CAC	2	6	451089	451094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288261
10010	NC_010483	A	8	8	451228	451235	100 %	0 %	0 %	0 %	170288261
10011	NC_010483	ACA	2	6	451253	451258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288261
10012	NC_010483	AC	3	6	451321	451326	50 %	0 %	0 %	50 %	170288261
10013	NC_010483	TG	3	6	451330	451335	0 %	50 %	50 %	0 %	170288261
10014	NC_010483	AAT	2	6	451380	451385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170288261
10015	NC_010483	CTT	2	6	451400	451405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288261
10016	NC_010483	GAAA	2	8	451443	451450	75 %	0 %	25 %	0 %	170288261
10017	NC_010483	TAC	2	6	451541	451546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288262
10018	NC_010483	TAC	2	6	451691	451696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288262
10019	NC_010483	GCT	2	6	451760	451765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288262
10020	NC_010483	AGA	2	6	451785	451790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288262
10021	NC_010483	CTCA	2	8	451799	451806	25 %	25 %	0 %	50 %	170288262
10022	NC_010483	ACG	2	6	451884	451889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288262
10023	NC_010483	AAG	2	6	451902	451907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288262
10024	NC_010483	CCA	2	6	451989	451994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288262
10025	NC_010483	GTG	2	6	452018	452023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288262
10026	NC_010483	ACT	2	6	452073	452078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288262
10027	NC_010483	ACGG	2	8	452090	452097	25 %	0 %	50 %	25 %	170288262
10028	NC_010483	ACT	2	6	452151	452156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288262
10029	NC_010483	TGC	2	6	452224	452229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288262
10030	NC_010483	GACA	2	8	452240	452247	50 %	0 %	25 %	25 %	170288262
10031	NC_010483	GAA	2	6	452252	452257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288262
10032	NC_010483	AAC	2	6	452305	452310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288262
10033	NC_010483	TGA	2	6	452343	452348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288262
10034	NC_010483	GA	3	6	452446	452451	50 %	0 %	50 %	0 %	170288262
10035	NC_010483	TCC	2	6	452477	452482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288262
10036	NC_010483	GT	3	6	452489	452494	0 %	50 %	50 %	0 %	170288262
10037	NC_010483	GTC	2	6	452558	452563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288262
10038	NC_010483	CGG	2	6	452566	452571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170288262
10039	NC_010483	CGA	2	6	452575	452580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288262
10040	NC_010483	GAA	2	6	452581	452586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288262
10041	NC_010483	CTG	2	6	452645	452650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288262
10042	NC_010483	A	6	6	452744	452749	100 %	0 %	0 %	0 %	170288262
10043	NC_010483	GGA	2	6	452767	452772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288262
10044	NC_010483	GAG	2	6	452778	452783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288262
10045	NC_010483	AAG	2	6	452823	452828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288263
10046	NC_010483	TCA	2	6	452857	452862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288263
10047	NC_010483	CTG	2	6	452875	452880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288263
10048	NC_010483	AGA	2	6	452897	452902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288263
10049	NC_010483	ATCC	2	8	453017	453024	25 %	25 %	0 %	50 %	170288263
10050	NC_010483	GGA	2	6	453074	453079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288263
10051	NC_010483	CGA	2	6	453098	453103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288263
10052	NC_010483	GAC	2	6	453126	453131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288263
10053	NC_010483	CAA	2	6	453143	453148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288263
10054	NC_010483	AGA	2	6	453204	453209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288263
10055	NC_010483	GAA	2	6	453333	453338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288263
10056	NC_010483	TCG	2	6	453340	453345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288263
10057	NC_010483	AG	3	6	453384	453389	50 %	0 %	50 %	0 %	170288263
10058	NC_010483	CGT	2	6	453413	453418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288263
10059	NC_010483	GTG	2	6	453433	453438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288263
10060	NC_010483	ATG	3	9	453465	453473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288263
10061	NC_010483	AAGA	2	8	453527	453534	75 %	0 %	25 %	0 %	170288263
10062	NC_010483	CTC	2	6	453585	453590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288263
10063	NC_010483	GAA	2	6	453636	453641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288263
10064	NC_010483	GA	3	6	453660	453665	50 %	0 %	50 %	0 %	170288263
10065	NC_010483	GGT	2	6	453667	453672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288263
10066	NC_010483	AGC	2	6	453775	453780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288264
10067	NC_010483	TGG	2	6	453787	453792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288264
10068	NC_010483	CCTG	2	8	453803	453810	0 %	25 %	25 %	50 %	170288264
10069	NC_010483	ACC	2	6	453822	453827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288264
10070	NC_010483	ATGGAT	2	12	453849	453860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288264
10071	NC_010483	TGG	2	6	453868	453873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288264
10072	NC_010483	AAC	2	6	453882	453887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288264
10073	NC_010483	ACT	2	6	453946	453951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288264
10074	NC_010483	GAAA	2	8	453987	453994	75 %	0 %	25 %	0 %	170288264
10075	NC_010483	AAG	2	6	454156	454161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288264
10076	NC_010483	CGA	2	6	454199	454204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288264
10077	NC_010483	TGAAA	2	10	454237	454246	60 %	20 %	20 %	0 %	170288264
10078	NC_010483	AGGT	2	8	454305	454312	25 %	25 %	50 %	0 %	170288265
10079	NC_010483	T	6	6	454312	454317	0 %	100 %	0 %	0 %	170288265
10080	NC_010483	CGG	2	6	454329	454334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170288265
10081	NC_010483	ATC	2	6	454340	454345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288265
10082	NC_010483	CGA	2	6	454348	454353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288265
10083	NC_010483	GGTG	2	8	454371	454378	0 %	25 %	75 %	0 %	170288265
10084	NC_010483	GATC	2	8	454432	454439	25 %	25 %	25 %	25 %	170288265
10085	NC_010483	CTG	2	6	454457	454462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288265
10086	NC_010483	AGA	2	6	454463	454468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288265
10087	NC_010483	ATG	2	6	454478	454483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288265
10088	NC_010483	TATC	2	8	454573	454580	25 %	50 %	0 %	25 %	170288265
10089	NC_010483	TCT	2	6	454643	454648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288265
10090	NC_010483	AAT	2	6	454678	454683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170288265
10091	NC_010483	TTC	2	6	454689	454694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288265
10092	NC_010483	AAG	2	6	454707	454712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288265
10093	NC_010483	CTC	2	6	454724	454729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288265
10094	NC_010483	GATTG	2	10	454755	454764	20 %	40 %	40 %	0 %	170288265
10095	NC_010483	TGGA	2	8	454811	454818	25 %	25 %	50 %	0 %	170288265
10096	NC_010483	TCT	2	6	454850	454855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288265
10097	NC_010483	GAG	2	6	454858	454863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288265
10098	NC_010483	A	6	6	454881	454886	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10099	NC_010483	T	6	6	454935	454940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10100	NC_010483	TC	3	6	454992	454997	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10101	NC_010483	TCC	2	6	455008	455013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288266
10102	NC_010483	T	6	6	455029	455034	0 %	100 %	0 %	0 %	170288266
10103	NC_010483	CT	3	6	455048	455053	0 %	50 %	0 %	50 %	170288266
10104	NC_010483	TCGT	2	8	455073	455080	0 %	50 %	25 %	25 %	170288266
10105	NC_010483	TTCT	2	8	455108	455115	0 %	75 %	0 %	25 %	170288266
10106	NC_010483	CAA	2	6	455117	455122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288266
10107	NC_010483	GGA	2	6	455166	455171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288266
10108	NC_010483	CTTCT	2	10	455310	455319	0 %	60 %	0 %	40 %	170288266
10109	NC_010483	TCA	2	6	455362	455367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288266
10110	NC_010483	TCC	2	6	455408	455413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288266
10111	NC_010483	TCA	2	6	455467	455472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288266
10112	NC_010483	AGA	2	6	455489	455494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288266
10113	NC_010483	AAAG	2	8	455532	455539	75 %	0 %	25 %	0 %	170288266
10114	NC_010483	GGA	2	6	455733	455738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288266
10115	NC_010483	T	6	6	455761	455766	0 %	100 %	0 %	0 %	170288266
10116	NC_010483	TTC	2	6	455780	455785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288266
10117	NC_010483	A	6	6	455788	455793	100 %	0 %	0 %	0 %	170288266
10118	NC_010483	GGA	2	6	455815	455820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288266
10119	NC_010483	TAT	2	6	455829	455834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170288266
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10121	NC_010483	GAAG	2	8	455882	455889	50 %	0 %	50 %	0 %	170288266
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10242	NC_010483	GAT	2	6	461530	461535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288274
10243	NC_010483	TTC	2	6	461704	461709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288274
10244	NC_010483	ATGG	2	8	461727	461734	25 %	25 %	50 %	0 %	170288274
10245	NC_010483	AAG	2	6	461765	461770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288274
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10248	NC_010483	GGC	2	6	461997	462002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170288275
10249	NC_010483	TCG	2	6	462010	462015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288275
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10251	NC_010483	TAC	2	6	462051	462056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288275
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10253	NC_010483	CGA	2	6	462179	462184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288275
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10255	NC_010483	AAAG	2	8	462373	462380	75 %	0 %	25 %	0 %	170288275
10256	NC_010483	GGTT	2	8	462470	462477	0 %	50 %	50 %	0 %	170288275
10257	NC_010483	CTT	2	6	462545	462550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288275
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10260	NC_010483	GATGTG	2	12	462582	462593	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	170288275
10261	NC_010483	GAA	2	6	462604	462609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288275
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10273	NC_010483	ATGTT	2	10	463138	463147	20 %	60 %	20 %	0 %	170288275
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10359	NC_010483	TTTC	3	12	467228	467239	0 %	75 %	0 %	25 %	170288277
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