MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga sp. RQ2 chromosome

Total Repeats: 41425

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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9502	NC_010483	A	6	6	427896	427901	100 %	0 %	0 %	0 %	170288239
9503	NC_010483	AGT	2	6	427943	427948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288239
9504	NC_010483	GAA	2	6	427965	427970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288239
9505	NC_010483	GAA	2	6	427977	427982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288239
9506	NC_010483	CGA	2	6	428000	428005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288239
9507	NC_010483	AG	3	6	428185	428190	50 %	0 %	50 %	0 %	170288239
9508	NC_010483	GAA	2	6	428193	428198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288239
9509	NC_010483	GCC	2	6	428226	428231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170288239
9510	NC_010483	TGG	2	6	428272	428277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288239
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9512	NC_010483	T	6	6	428361	428366	0 %	100 %	0 %	0 %	170288239
9513	NC_010483	GGT	2	6	428372	428377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288239
9514	NC_010483	TCG	2	6	428452	428457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288239
9515	NC_010483	GAG	2	6	428494	428499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288239
9516	NC_010483	T	6	6	428527	428532	0 %	100 %	0 %	0 %	170288240
9517	NC_010483	CGT	2	6	428534	428539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288240
9518	NC_010483	CT	3	6	428645	428650	0 %	50 %	0 %	50 %	170288240
9519	NC_010483	ATG	2	6	428823	428828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288240
9520	NC_010483	AC	3	6	428872	428877	50 %	0 %	0 %	50 %	170288240
9521	NC_010483	AGA	2	6	428888	428893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288240
9522	NC_010483	TC	3	6	428913	428918	0 %	50 %	0 %	50 %	170288240
9523	NC_010483	TTG	2	6	429010	429015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288240
9524	NC_010483	TAA	2	6	429066	429071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170288240
9525	NC_010483	TCT	2	6	429128	429133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288241
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9527	NC_010483	AGAA	2	8	429256	429263	75 %	0 %	25 %	0 %	170288241
9528	NC_010483	CGG	2	6	429297	429302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170288241
9529	NC_010483	ACA	2	6	429374	429379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288241
9530	NC_010483	CCA	2	6	429425	429430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288241
9531	NC_010483	CT	3	6	429471	429476	0 %	50 %	0 %	50 %	170288241
9532	NC_010483	CGAT	2	8	429504	429511	25 %	25 %	25 %	25 %	170288241
9533	NC_010483	CGA	3	9	429549	429557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288241
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9535	NC_010483	TTG	2	6	429776	429781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288241
9536	NC_010483	TCTCGC	2	12	429807	429818	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	170288241
9537	NC_010483	A	6	6	429856	429861	100 %	0 %	0 %	0 %	170288241
9538	NC_010483	GAAAA	2	10	429925	429934	80 %	0 %	20 %	0 %	170288241
9539	NC_010483	TCT	2	6	429979	429984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288241
9540	NC_010483	TGGAAG	2	12	430028	430039	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	170288241
9541	NC_010483	TCA	2	6	430049	430054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288241
9542	NC_010483	TCA	3	9	430079	430087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288241
9543	NC_010483	CCA	2	6	430304	430309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288241
9544	NC_010483	GCT	2	6	430312	430317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288241
9545	NC_010483	CAA	2	6	430365	430370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288242
9546	NC_010483	CTTT	2	8	430405	430412	0 %	75 %	0 %	25 %	170288242
9547	NC_010483	GAG	2	6	430442	430447	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288242
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9549	NC_010483	CCA	2	6	430524	430529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288242
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9551	NC_010483	A	6	6	430610	430615	100 %	0 %	0 %	0 %	170288242
9552	NC_010483	CT	3	6	430633	430638	0 %	50 %	0 %	50 %	170288242
9553	NC_010483	AAC	2	6	430642	430647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288242
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9556	NC_010483	CCT	2	6	430805	430810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288243
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9558	NC_010483	GATCTC	2	12	430922	430933	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	170288243
9559	NC_010483	TCA	2	6	430944	430949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288243
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9561	NC_010483	CAT	2	6	430961	430966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288243
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9563	NC_010483	TTC	2	6	431021	431026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288243
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9569	NC_010483	CTT	2	6	431215	431220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288243
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9572	NC_010483	AGA	2	6	431415	431420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288243
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9582	NC_010483	CCGT	2	8	431889	431896	0 %	25 %	25 %	50 %	170288244
9583	NC_010483	TTCTGG	2	12	431930	431941	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	170288244
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9586	NC_010483	GTGG	2	8	432317	432324	0 %	25 %	75 %	0 %	170288244
9587	NC_010483	CTT	2	6	432367	432372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288244
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9589	NC_010483	GAG	2	6	432511	432516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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9592	NC_010483	TCG	2	6	432579	432584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288245
9593	NC_010483	TTTC	2	8	432595	432602	0 %	75 %	0 %	25 %	170288245
9594	NC_010483	GGA	2	6	432605	432610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288245
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9602	NC_010483	AAG	2	6	432792	432797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288245
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9605	NC_010483	TCG	2	6	432966	432971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288245
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9607	NC_010483	TGAA	2	8	433095	433102	50 %	25 %	25 %	0 %	170288245
9608	NC_010483	TCT	2	6	433121	433126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288245
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9610	NC_010483	AAGG	2	8	433290	433297	50 %	0 %	50 %	0 %	170288246
9611	NC_010483	TGC	2	6	433339	433344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288246
9612	NC_010483	GAA	2	6	433356	433361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288246
9613	NC_010483	CA	3	6	433385	433390	50 %	0 %	0 %	50 %	170288246
9614	NC_010483	AGAC	2	8	433397	433404	50 %	0 %	25 %	25 %	170288246
9615	NC_010483	AG	3	6	433411	433416	50 %	0 %	50 %	0 %	170288246
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9619	NC_010483	A	6	6	433482	433487	100 %	0 %	0 %	0 %	170288246
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9621	NC_010483	TGA	2	6	433645	433650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288246
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9993	NC_010483	ACT	2	6	450280	450285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288260
9994	NC_010483	AAC	2	6	450312	450317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288260
9995	NC_010483	GCA	2	6	450460	450465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288260
9996	NC_010483	CTT	2	6	450498	450503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288260
9997	NC_010483	CTC	2	6	450606	450611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288260
9998	NC_010483	TTC	2	6	450654	450659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288260
9999	NC_010483	ACA	2	6	450699	450704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288260
10000	NC_010483	TGA	2	6	450707	450712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288260

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