MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga sp. RQ2 chromosome

Total Repeats: 41425

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010483	G	6	6	23444	23449	0 %	0 %	100 %	0 %	170287831
502	NC_010483	GGT	3	9	23511	23519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170287831
503	NC_010483	AAG	2	6	23569	23574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170287832
504	NC_010483	GAT	2	6	23642	23647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170287832
505	NC_010483	AGGA	2	8	23655	23662	50 %	0 %	50 %	0 %	170287832
506	NC_010483	TCG	2	6	23664	23669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170287832
507	NC_010483	TCT	2	6	23678	23683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287832
508	NC_010483	A	6	6	23797	23802	100 %	0 %	0 %	0 %	170287832
509	NC_010483	GAT	2	6	23809	23814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170287832
510	NC_010483	GAG	2	6	23837	23842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170287832
511	NC_010483	TTGAA	2	10	23880	23889	40 %	40 %	20 %	0 %	170287832
512	NC_010483	TCGT	2	8	23895	23902	0 %	50 %	25 %	25 %	170287832
513	NC_010483	GAT	2	6	23914	23919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170287832
514	NC_010483	TGG	2	6	24009	24014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170287832
515	NC_010483	GAA	2	6	24022	24027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170287832
516	NC_010483	TC	3	6	24068	24073	0 %	50 %	0 %	50 %	170287832
517	NC_010483	ATCT	2	8	24087	24094	25 %	50 %	0 %	25 %	170287832
518	NC_010483	TAAG	2	8	24150	24157	50 %	25 %	25 %	0 %	170287832
519	NC_010483	AAAG	2	8	24172	24179	75 %	0 %	25 %	0 %	170287832
520	NC_010483	GAT	2	6	24191	24196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170287832
521	NC_010483	TC	3	6	24253	24258	0 %	50 %	0 %	50 %	170287833
522	NC_010483	CAG	2	6	24285	24290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170287833
523	NC_010483	AG	3	6	24344	24349	50 %	0 %	50 %	0 %	170287833
524	NC_010483	GAAG	2	8	24387	24394	50 %	0 %	50 %	0 %	170287833
525	NC_010483	AC	3	6	24420	24425	50 %	0 %	0 %	50 %	170287833
526	NC_010483	GAAAAA	2	12	24434	24445	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	170287833
527	NC_010483	A	7	7	24441	24447	100 %	0 %	0 %	0 %	170287833
528	NC_010483	AGA	2	6	24458	24463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170287833
529	NC_010483	GTT	2	6	24473	24478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170287833
530	NC_010483	AAGA	2	8	24517	24524	75 %	0 %	25 %	0 %	170287834
531	NC_010483	GCT	2	6	24682	24687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170287834
532	NC_010483	GAA	2	6	24688	24693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170287834
533	NC_010483	A	6	6	24701	24706	100 %	0 %	0 %	0 %	170287834
534	NC_010483	GAC	2	6	24749	24754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170287834
535	NC_010483	CTT	2	6	24758	24763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287834
536	NC_010483	AGAA	2	8	24772	24779	75 %	0 %	25 %	0 %	170287834
537	NC_010483	GT	3	6	24804	24809	0 %	50 %	50 %	0 %	170287834
538	NC_010483	TTC	2	6	24822	24827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287834
539	NC_010483	A	6	6	24884	24889	100 %	0 %	0 %	0 %	170287834
540	NC_010483	TCT	2	6	24898	24903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287834
541	NC_010483	TCT	2	6	25008	25013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287835
542	NC_010483	GAA	2	6	25036	25041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170287835
543	NC_010483	CTT	2	6	25049	25054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287835
544	NC_010483	TC	3	6	25106	25111	0 %	50 %	0 %	50 %	170287835
545	NC_010483	AGA	2	6	25116	25121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170287835
546	NC_010483	AAC	2	6	25122	25127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170287835
547	NC_010483	ACA	2	6	25141	25146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170287835
548	NC_010483	TTCAT	2	10	25286	25295	20 %	60 %	0 %	20 %	170287835
549	NC_010483	GATG	2	8	25326	25333	25 %	25 %	50 %	0 %	170287835
550	NC_010483	AG	3	6	25381	25386	50 %	0 %	50 %	0 %	170287835
551	NC_010483	TCG	2	6	25391	25396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170287835
552	NC_010483	A	8	8	25401	25408	100 %	0 %	0 %	0 %	170287835
553	NC_010483	TTA	2	6	25479	25484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170287835
554	NC_010483	CTG	2	6	25496	25501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170287835
555	NC_010483	TCT	2	6	25519	25524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287835
556	NC_010483	TCT	2	6	25527	25532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287835
557	NC_010483	TCG	2	6	25565	25570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170287835
558	NC_010483	AAG	2	6	25597	25602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170287835
559	NC_010483	TTC	2	6	25637	25642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287836
560	NC_010483	AGT	2	6	25711	25716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170287836
561	NC_010483	CTT	2	6	25724	25729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287836
562	NC_010483	TCC	2	6	25800	25805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170287836
563	NC_010483	TCA	2	6	25837	25842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170287836
564	NC_010483	GAAA	2	8	25873	25880	75 %	0 %	25 %	0 %	170287837
565	NC_010483	CAT	2	6	25893	25898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170287837
566	NC_010483	TTC	2	6	25951	25956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287837
567	NC_010483	TCT	2	6	25963	25968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287837
568	NC_010483	TTG	2	6	26075	26080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170287837
569	NC_010483	GTTCGA	2	12	26083	26094	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	170287837
570	NC_010483	TCC	2	6	26124	26129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
571	NC_010483	TC	3	6	26201	26206	0 %	50 %	0 %	50 %	170287838
572	NC_010483	AGC	2	6	26215	26220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170287838
573	NC_010483	TCT	2	6	26222	26227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287838
574	NC_010483	TAA	2	6	26315	26320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170287838
575	NC_010483	GCG	2	6	26384	26389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170287838
576	NC_010483	TTC	2	6	26408	26413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287838
577	NC_010483	GAA	2	6	26481	26486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170287838
578	NC_010483	TC	3	6	26557	26562	0 %	50 %	0 %	50 %	170287838
579	NC_010483	CT	3	6	26564	26569	0 %	50 %	0 %	50 %	170287838
580	NC_010483	TTC	2	6	26570	26575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287838
581	NC_010483	TTC	2	6	26644	26649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287838
582	NC_010483	ATG	2	6	26666	26671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170287838
583	NC_010483	GA	3	6	26704	26709	50 %	0 %	50 %	0 %	170287838
584	NC_010483	GTAT	2	8	26745	26752	25 %	50 %	25 %	0 %	170287838
585	NC_010483	TC	3	6	26758	26763	0 %	50 %	0 %	50 %	170287838
586	NC_010483	GCT	2	6	26775	26780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170287838
587	NC_010483	CTT	2	6	26808	26813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287838
588	NC_010483	AAC	2	6	26968	26973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170287838
589	NC_010483	CACC	2	8	26977	26984	25 %	0 %	0 %	75 %	170287838
590	NC_010483	GT	3	6	26991	26996	0 %	50 %	50 %	0 %	170287838
591	NC_010483	GGT	2	6	27035	27040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170287838
592	NC_010483	GTG	2	6	27041	27046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170287838
593	NC_010483	CTT	2	6	27087	27092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287838
594	NC_010483	CT	3	6	27129	27134	0 %	50 %	0 %	50 %	170287838
595	NC_010483	TCCT	2	8	27170	27177	0 %	50 %	0 %	50 %	170287838
596	NC_010483	T	6	6	27218	27223	0 %	100 %	0 %	0 %	170287839
597	NC_010483	TTC	2	6	27292	27297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287839
598	NC_010483	GTA	2	6	27317	27322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170287839
599	NC_010483	CTT	2	6	27371	27376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287839
600	NC_010483	TTCC	2	8	27391	27398	0 %	50 %	0 %	50 %	170287839
601	NC_010483	TCT	2	6	27550	27555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287839
602	NC_010483	AAC	2	6	27659	27664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170287839
603	NC_010483	CATCA	2	10	27695	27704	40 %	20 %	0 %	40 %	170287839
604	NC_010483	TTC	2	6	27788	27793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287839
605	NC_010483	AG	3	6	28106	28111	50 %	0 %	50 %	0 %	170287839
606	NC_010483	AGA	2	6	28303	28308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170287839
607	NC_010483	GAA	2	6	28405	28410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170287839
608	NC_010483	TA	3	6	28419	28424	50 %	50 %	0 %	0 %	170287839
609	NC_010483	AG	3	6	28457	28462	50 %	0 %	50 %	0 %	170287839
610	NC_010483	T	7	7	28506	28512	0 %	100 %	0 %	0 %	170287839
611	NC_010483	TTC	2	6	28560	28565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287839
612	NC_010483	TCC	2	6	28601	28606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170287839
613	NC_010483	TAC	2	6	28643	28648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170287839
614	NC_010483	T	6	6	28654	28659	0 %	100 %	0 %	0 %	170287839
615	NC_010483	CGT	2	6	28680	28685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170287840
616	NC_010483	GATC	2	8	28701	28708	25 %	25 %	25 %	25 %	170287840
617	NC_010483	TAG	2	6	28769	28774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170287840
618	NC_010483	GAA	2	6	28836	28841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170287840
619	NC_010483	CT	3	6	28852	28857	0 %	50 %	0 %	50 %	170287840
620	NC_010483	CAC	2	6	28924	28929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170287840
621	NC_010483	TTC	2	6	28931	28936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287840
622	NC_010483	TTC	2	6	28962	28967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287840
623	NC_010483	AAAG	2	8	28982	28989	75 %	0 %	25 %	0 %	170287840
624	NC_010483	TTC	2	6	28994	28999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287840
625	NC_010483	ATC	2	6	29098	29103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170287840
626	NC_010483	TTC	2	6	29131	29136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287840
627	NC_010483	AGA	2	6	29149	29154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170287840
628	NC_010483	GAT	3	9	29170	29178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170287840
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630	NC_010483	TCC	2	6	29251	29256	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170287840
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752	NC_010483	CTC	2	6	34749	34754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170287846
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754	NC_010483	CTC	2	6	34843	34848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
755	NC_010483	AGG	2	6	34881	34886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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862	NC_010483	ACG	2	6	39656	39661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170287851
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